Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I3 R1
|
143 |
109.6 |
3434427 |
98.5% |
3382910 |
150.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
630,669 |
T→A |
M259K (ATG→AAG) |
cstA → |
carbon starvation protein involved in peptide utilization; APC peptide transporter family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 630,669 | 0 | T | A | 97.2%
| 407.1
/ 1.8
| 106 | M259K (ATG→AAG) | cstA | carbon starvation protein involved in peptide utilization; APC peptide transporter family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/1); new base A (54/49); total (56/50) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CTGCGCTATCTGCGTCCGGGGCGTATTGGCGAAGTGTCGGTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATGCGCCCGACGCTGACCATGCC > NC_000913/630521‑630816
|
cTGCGCTATCTGCGTCCGGGGCGTATTGGCGAAGTGTCGGTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGc > 2:533470/1‑151 (MQ=255)
gcgcTATCTGCGTCCGGGGCGTATTGGCGAAGTGTCGGTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCtg > 2:172654/1‑151 (MQ=255)
aTCTGCGTCCGGGGCGTATTGGCGAAGTGTCGGTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCtggtg < 2:1259815/149‑1 (MQ=255)
aTCTGCGTCCGGGGCGTATTGGCGAAGTGTCGGTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTggg > 2:632782/1‑151 (MQ=255)
tGCGTCCGGGGCGTATTGGCGAAGTGTCGGTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGtt > 2:129628/1‑150 (MQ=255)
gCGTCCGGGGCGTATTGGCGAAGTGTCGGTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGtt < 2:1557767/149‑1 (MQ=255)
gCGTCCGGGGCGTATTGGCGAAGTGTCGGTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTa < 2:408121/150‑1 (MQ=255)
gTCCGGGGCGTATTGGCGAAGTGTCGGTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGGAGCTGGTGGGTTACgg > 1:918066/1‑151 (MQ=255)
gTCCGGGGCGTATTGGCGAAGTGTCGGTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACgg > 2:1512859/1‑151 (MQ=255)
tCCGGGGCGTATTGGCGAAGTGTCGGTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGt > 1:181495/1‑151 (MQ=255)
gCGTATTGGCGAAGTGTCGGTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTtgt > 2:348661/1‑150 (MQ=255)
gTATTGGCGAAGTGTCGGTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTgg > 2:1418508/1‑150 (MQ=255)
aTTGGCGAAGTGTCGGTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTggcgg > 1:1102781/1‑151 (MQ=255)
ttGGCGAAGTGTCGGTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGACACCGTACTATGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTggcgg > 1:151891/1‑150 (MQ=255)
tGGCGAAGTGTCGGTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTggcggc < 2:582437/150‑1 (MQ=255)
tGGCGAAGTGTCGGTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTggcgg > 2:579125/1‑149 (MQ=255)
ggCGAAGTGTCGGTCATCGGTCTGGTATTCCCGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGcggcgg < 1:788960/151‑1 (MQ=255)
gCGAAGTGTCGGTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGGTACGGTTTTGTGGcggcgg > 2:1132713/1‑150 (MQ=255)
aaGTGTCGGTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGtgct < 2:1364280/151‑1 (MQ=255)
gtgtCGGTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGtgctg < 1:1410449/150‑1 (MQ=255)
gtgtCGGTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGtgct < 1:166814/149‑1 (MQ=255)
cGGTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCgg < 2:71423/150‑1 (MQ=255)
gTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGGTGCCGgtg > 2:645750/1‑150 (MQ=255)
tCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTGCCGGGGTGGtt > 2:1600580/1‑151 (MQ=255)
cGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGtt < 2:214594/150‑1 (MQ=255)
cGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTGCCGGTGTgggt > 2:36134/1‑148 (MQ=255)
tCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTGCCGGGGGGGGTAc > 2:118188/1‑149 (MQ=255)
ggTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTTCCGGGGTGGGTActgc > 2:323174/1‑149 (MQ=255)
gTATTCCTGATTTGCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGGCCTGCGCACCGTGCTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGGCCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTActgct < 1:48951/149‑1 (MQ=255)
tATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTgg > 2:407243/1‑150 (MQ=255)
tATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGGGTGGTTTct > 1:624050/1‑145 (MQ=255)
tATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGGGTGGGTACTGCTgg > 1:550591/1‑150 (MQ=255)
ttCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTTCCGGGGTGGTTACTGCTGGccc > 2:369153/1‑151 (MQ=255)
cTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTTCCGGGGTGGGTACTGCTGGCCCcgc > 2:1395919/1‑151 (MQ=255)
gATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCcgc < 1:879264/149‑1 (MQ=255)
gATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGGGTGGGTACTGCTGGcccc > 2:1379958/1‑147 (MQ=255)
aTTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTGCCGGTGGGGGTACTGCTGGGCCcgc > 1:825992/1‑148 (MQ=255)
aTTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGGTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTGCCGGGGTGGGTACTGCTGGgccccc > 1:1080893/1‑146 (MQ=255)
tttCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGa < 2:532992/150‑1 (MQ=255)
tttCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGGGGGGTTACTGCTGGcccc > 2:1706669/1‑144 (MQ=255)
tCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTGCCGGGGTGGGTACTGCTGGCCCCCCGTGACt > 1:1583982/1‑150 (MQ=255)
cATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCCGGGGTGCCGGTGTGGGTACTGCTGGCCCCGCGGGACttac > 1:757518/1‑146 (MQ=255)
ttATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGGTGCCGGGGTGGGTACTGCTGGGCCCCCGGGGCTACctc > 1:1241592/1‑149 (MQ=255)
tATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACctctc < 1:1046279/150‑1 (MQ=255)
ctGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGGGGGGGTACTGCTGGGCCCCCGGGGCTACCTCTCTAcc > 1:906374/1‑149 (MQ=255)
ctGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTGCCGGTGGGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCtt > 2:430694/1‑151 (MQ=255)
ggcggcTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCt < 2:683985/148‑1 (MQ=255)
gcggcTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCt < 1:1198993/151‑1 (MQ=255)
gggTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAAt < 2:658909/151‑1 (MQ=255)
ggCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCgg < 2:364366/150‑1 (MQ=255)
aGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACt < 1:1238619/151‑1 (MQ=255)
aGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCGGCCGGTGTGGGTACTTCGTGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTTCTGAAAATCGGGACt > 1:47960/1‑151 (MQ=255)
aaaGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAt < 2:1080978/151‑1 (MQ=255)
aaaGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGGGTTGTTTCTGCCTGCCCCGCGGGGCTACCTCTCTTCCTTCCTGAAAAACgggtata > 1:272188/1‑146 (MQ=255)
gTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCCGTGGGGGTTCTGCTTGCCCCCGGTGGGTACCTCTCTACCTTCCTGGAAAACCGGACt > 1:82070/1‑146 (MQ=255)
gTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTGCCGGTGTGGGTTCTGCTGGCCCCCCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAtcgt > 1:1359512/1‑151 (MQ=255)
ccGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAtcgtcg < 1:93922/151‑1 (MQ=255)
ccGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAtcgtcg < 1:1132625/151‑1 (MQ=255)
ccGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAtcgtc < 2:376211/150‑1 (MQ=255)
ccTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCt < 1:1134427/151‑1 (MQ=255)
cTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTGCCGGGGTGGGTACTGCTGGCCCCGCGTGGCTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCgg > 1:520065/1‑147 (MQ=255)
tGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGGGTGGGTACTGCTGGGCCCGCGGGACTACCCCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGGCTATCGTCgg > 1:776290/1‑146 (MQ=255)
gggCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTGCCCGGGTGGTTACTGCTGGGCCCGCGGGGCTACCTCTCTACCCTCCTGAAAAACGGGGCTATCGTCGGTCTgg > 1:1465860/1‑150 (MQ=255)
gCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCgg < 1:1659705/151‑1 (MQ=255)
cACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGt < 1:836745/151‑1 (MQ=255)
ccGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGATTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTGCCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTa < 1:371548/150‑1 (MQ=255)
aCTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCAt < 2:1200274/151‑1 (MQ=255)
aCTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGGGGGTACTTCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTTCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCAt > 2:1373283/1‑151 (MQ=255)
ttGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCAttt < 2:826056/150‑1 (MQ=255)
tGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGGGTGGGTTCTGCTGGCCCCGCGGGGCTACCTCTCTACCCTCCTGGAAATCGGGACCATCGTCGGGCTGGCGGGAGGCCtttt > 1:325147/1‑150 (MQ=255)
tGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGGGTGGTTAATGCTGGCCCCGCGTGGCTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGGCGGTCTGGCGGGAGGGAtttt > 1:226881/1‑150 (MQ=255)
gACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTg < 1:129754/150‑1 (MQ=255)
ttACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGAtt < 1:369126/149‑1 (MQ=255)
ttACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGAtt < 2:181508/149‑1 (MQ=255)
ttACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGAtt < 1:645693/149‑1 (MQ=255)
ttACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTAGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGAtt < 1:1361707/149‑1 (MQ=255)
tACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTAt < 2:1426393/150‑1 (MQ=255)
tACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGGTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCCCGGGACTACCTCTCTACCCTCCCGAAAAACGGGACCATCGTCGGGCTGGCGGGAGGCATTTTGAtt > 2:791242/1‑148 (MQ=255)
tACCGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTTCCGGTGGGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGGCTGGCGGTAGGCATTTTtattat > 2:1182286/1‑150 (MQ=255)
cGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATgcgc < 1:856057/151‑1 (MQ=255)
cGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGGAGGCAtttttgtttttcg > 1:512426/1‑141 (MQ=255)
cGGCGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGGGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGGGGGCATTTTTTTTATgc > 1:1144967/1‑149 (MQ=255)
cGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATGCGCCCg < 2:437727/151‑1 (MQ=255)
cGTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATGCGCCCg < 1:348634/151‑1 (MQ=255)
gTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATGCGCCCGa < 1:96257/151‑1 (MQ=255)
gTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGGTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGGAGGCATTTTGATTATGCGccc > 2:590060/1‑149 (MQ=255)
gTGCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCCGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCCCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCCGGACTATCGTCGGGCTGGCGGGAAGCATTTTGATTATTGGccc > 2:1389374/1‑149 (MQ=255)
gCAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATGCGCCCGAc < 1:1685820/150‑1 (MQ=255)
gCAGTTGACCTGGAAGCTGGCGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGGTGCCGGTGTGGTTAATGCCGGCCCCCCGTGACTACCCCTCTCCCTTCCTGTAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGGAGGCCtttttttttttcccccga > 1:653965/1‑135 (MQ=255)
cAGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGGGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATGCGCCCGACGc > 2:1352963/1‑151 (MQ=255)
aGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATGCGCCCGACGCt < 2:889225/151‑1 (MQ=255)
aGTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGGGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGGCTGGCGGGAGGCATTTTTGTTATGCGccc > 2:777618/1‑145 (MQ=255)
gTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATGCGCCCGACGCTg < 1:443225/151‑1 (MQ=255)
gTTGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATGCGCCCGACGCTg < 2:1667285/151‑1 (MQ=255)
tGACCTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATGCGCCCGACGCTGa < 2:1396936/150‑1 (MQ=255)
ccTGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATGCGCCCGACGCTGACCa < 1:1535390/150‑1 (MQ=255)
tGGAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGGGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCCTTTTTATTTTGCGCCCGGCGCTGAcc > 1:463323/1‑147 (MQ=255)
ggAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTTATTATGCGCCCGACGCTGACCATGcc > 1:76809/1‑151 (MQ=255)
ggAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATGCGCCCGACGCTGACCATg < 2:550641/149‑1 (MQ=255)
ggAAGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATGCGCCCGACGCTGACCATGcc < 2:696438/151‑1 (MQ=255)
|
CTGCGCTATCTGCGTCCGGGGCGTATTGGCGAAGTGTCGGTCATCGGTCTGGTATTCCTGATTTTCGCCATTATCTCTGGCGGCTGGGTGGCAGAAAGTCCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATGCGCCCGACGCTGACCATGCC > NC_000913/630521‑630816
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
