Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I3 R1
|
143 |
109.6 |
3434427 |
98.5% |
3382910 |
150.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,326,144 |
C→T |
P467S (CCA→TCA) |
yciQ → |
enhancer of membrane protein expression; putative inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,326,144 | 0 | C | T | 99.2%
| 495.0
/ ‑4.2
| 125 | P467S (CCA→TCA) | yciQ | enhancer of membrane protein expression; putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (60/64); total (61/64) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.88e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.15e-01 |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
GTAGGCTGGGCAGGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGTATATTTTTCTGCCAA > NC_000913/1325997‑1326288
|
gTAGGCTGGGCAGGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCAc > 2:1647877/1‑151 (MQ=255)
tAGGCTGGGCAGGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACt > 1:569837/1‑151 (MQ=255)
aGGCTGGGCAGGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACt < 2:699801/150‑1 (MQ=255)
aGGCTGGGCAGGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTg < 1:671592/151‑1 (MQ=255)
aGGCTGGGCAGGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTg < 1:1362479/151‑1 (MQ=255)
ggCTGGGCAGGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGa < 2:148845/151‑1 (MQ=255)
gggCAGGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTg < 1:462540/151‑1 (MQ=255)
gCAGGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGtt < 2:1341589/151‑1 (MQ=255)
aGGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTc > 1:93982/1‑150 (MQ=255)
aGGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCa < 2:414049/151‑1 (MQ=255)
aaTGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGc < 1:894519/151‑1 (MQ=255)
gTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTgg > 2:1297389/1‑150 (MQ=255)
gTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGc > 1:651530/1‑151 (MQ=255)
cTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCt > 2:622851/1‑151 (MQ=255)
ggtggGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCtt > 1:1643866/1‑150 (MQ=255)
ggtggGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCt < 2:339858/149‑1 (MQ=255)
ggtggGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTc < 1:873380/151‑1 (MQ=255)
gtggGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCt < 2:1662531/151‑1 (MQ=255)
ggCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTAtt > 2:1467320/1‑151 (MQ=255)
cGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTAtt > 2:980051/1‑149 (MQ=255)
gATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATtctc > 2:1691109/1‑151 (MQ=255)
gATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATtctc < 2:709665/151‑1 (MQ=255)
tatGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATtctctc > 1:850741/1‑151 (MQ=255)
atGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATtctctc < 1:979976/150‑1 (MQ=255)
atGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTctctct > 2:594619/1‑151 (MQ=255)
tattatGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACAt < 1:57446/150‑1 (MQ=255)
ttatGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCa > 2:1671650/1‑150 (MQ=255)
ttatGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCa < 1:875623/150‑1 (MQ=255)
tatGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGGGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAAt > 2:385648/1‑151 (MQ=255)
atGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAAt < 2:522146/150‑1 (MQ=255)
gATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTc > 1:554757/1‑151 (MQ=255)
aTCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCg > 1:834502/1‑151 (MQ=255)
tgctgGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCgg > 1:1033896/1‑149 (MQ=255)
tgctgGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCgg > 2:311270/1‑149 (MQ=255)
ggATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTGTCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGt < 1:831054/151‑1 (MQ=255)
attCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTc < 1:222908/150‑1 (MQ=255)
tacTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCttt > 1:1063636/3‑151 (MQ=255)
ccTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCtttt < 2:1165773/151‑1 (MQ=255)
ccTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCtttt < 1:80730/151‑1 (MQ=255)
ccTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCtttt < 2:1487236/151‑1 (MQ=255)
ttttttATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTTTTCTTTTAc > 2:228981/1‑151 (MQ=255)
tttttATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTAc < 2:1680721/150‑1 (MQ=255)
ttttATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTAc < 2:1020729/149‑1 (MQ=255)
ttttATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTg > 2:222144/1‑151 (MQ=255)
tttATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTg < 2:1161693/150‑1 (MQ=255)
ttATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGt > 2:1173002/1‑151 (MQ=255)
aTTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGtat > 2:926442/1‑151 (MQ=255)
ttGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTatat < 2:1421759/150‑1 (MQ=255)
ttGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATg > 2:219740/1‑151 (MQ=255)
tGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATg < 1:717243/150‑1 (MQ=255)
gTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGc < 2:1569662/150‑1 (MQ=255)
ttCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGcc > 2:181076/1‑150 (MQ=255)
ttCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGcc > 1:623565/1‑150 (MQ=255)
tCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCa < 1:1633188/150‑1 (MQ=255)
tCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCa < 1:489712/150‑1 (MQ=255)
cccTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGc > 2:1041443/1‑151 (MQ=255)
gAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGtt < 1:176245/151‑1 (MQ=255)
aGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGtt > 2:248117/1‑150 (MQ=255)
aGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGtt > 1:89043/1‑150 (MQ=255)
gCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTAt > 2:143541/1‑151 (MQ=255)
tttgtttgCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTAtttt > 1:236228/1‑151 (MQ=255)
tttgtttgCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTAtt < 1:1422650/149‑1 (MQ=255)
ttgtttgCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTAtttt < 1:1453671/150‑1 (MQ=255)
tgtttgCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTa < 2:122528/150‑1 (MQ=255)
tgtttgCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTAc > 2:1379029/1‑151 (MQ=255)
gtttgCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTa < 1:669106/149‑1 (MQ=255)
gtttgCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTAc < 1:1327105/150‑1 (MQ=255)
tttgCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCg > 1:996580/1‑151 (MQ=255)
tgCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGc < 2:569888/150‑1 (MQ=255)
gCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTg < 1:723497/151‑1 (MQ=255)
cgcgATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGttt > 1:1536145/1‑151 (MQ=255)
gcgATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTg > 1:1229341/1‑151 (MQ=255)
cgATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGc > 2:195124/1‑151 (MQ=255)
tgatgaCAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTg > 2:1427363/1‑151 (MQ=255)
gatgaCAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTg < 2:1063718/150‑1 (MQ=255)
gatgaCAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGa < 1:16752/151‑1 (MQ=255)
atgaCAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGa < 1:1007327/150‑1 (MQ=255)
atgaCAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGAc > 1:1475549/1‑151 (MQ=255)
tgaCAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGAcc > 2:972086/1‑151 (MQ=255)
aCAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCgg > 1:80605/1‑151 (MQ=255)
aaGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGtt < 1:1013140/151‑1 (MQ=255)
tGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTAtctc < 2:304695/150‑1 (MQ=255)
gCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCAc > 2:17389/1‑151 (MQ=255)
gCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCAc > 1:560954/1‑151 (MQ=255)
gCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCAc < 2:48599/151‑1 (MQ=255)
gTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTg < 1:15824/151‑1 (MQ=255)
ttAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTgg > 2:748332/1‑151 (MQ=255)
tAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGc > 1:1268217/1‑151 (MQ=255)
tCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATg > 1:276782/1‑151 (MQ=255)
tgtAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATgggg > 1:448516/1‑151 (MQ=255)
tAATCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGt > 1:37482/1‑150 (MQ=255)
aaTCATCACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGta < 1:1671538/150‑1 (MQ=255)
atcatcACTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGtat > 2:531179/1‑150 (MQ=255)
catcaCTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGTATAtt < 1:155440/151‑1 (MQ=255)
catcaCTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGTATAtt > 1:1195679/1‑151 (MQ=255)
catcaCTTTGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGTATAtt > 2:822106/1‑151 (MQ=255)
ttGTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGTATATTTTTCt < 2:1643972/149‑1 (MQ=255)
gTTTTTATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGTATATTTTTCTGcc > 2:1445154/1‑150 (MQ=255)
ttttATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGTATATTTTTCTGCCaa < 2:149697/150‑1 (MQ=255)
ttttATCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGTATATTTTTCTGCCaa < 1:1555801/150‑1 (MQ=255)
|
GTAGGCTGGGCAGGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTGGATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCATGGGGTATATTTTTCTGCCAA > NC_000913/1325997‑1326288
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
