Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F50 I1 R1
|
141 |
76.7 |
2402765 |
98.4% |
2364320 |
150.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,011,526 |
C→T |
G521G (GGC→GGT) |
uup → |
replication regulatory ABC‑F family DNA‑binding ATPase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,011,526 | 0 | C | T | 98.9%
| 341.6
/ NA
| 92 | G521G (GGC→GGT) | uup | replication regulatory ABC‑F family DNA‑binding ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (48/43); minor base G (1/0); total (49/43) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
ATGTCGAAACGCTGGAACTGCTGGAAGAACTGATCGACAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAACTAAGCTATAAATTGCAGCGCGAA > NC_000913/1011378‑1011670
|
aTGTCGAAACGCTGGAACTGCTGGAAGAACTGATCGACAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTcggtgg > 1:691954/1‑151 (MQ=255)
gTCGAAACGCTGGAACTGCTGGAAGAACTGATCGACAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGtt < 2:679792/151‑1 (MQ=255)
gAAACGCTGGAACTGCTGGAAGAACTGATCGACAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATc < 2:1119322/151‑1 (MQ=255)
gAAACGCTGGAACTGCTGGAAGAACTGATCGACAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATc < 2:793386/151‑1 (MQ=255)
aCGCTGGAACTGCTGGAAGAACTGATCGACAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCatg > 2:631589/1‑151 (MQ=255)
aCGCTGGAACTGCTGGAAGAACTGATCGACAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCatg > 1:497516/1‑151 (MQ=255)
gCTGGAACTGCTGGAAGAACTGATCGACAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCatgat > 2:322996/1‑151 (MQ=255)
cTGGAACTGCTGGAAGAACTGATCGACAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCatgatg > 2:1158390/1‑151 (MQ=255)
ggAACTGCTGGAAGAACTGATCGACAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCatgatg < 2:641136/149‑1 (MQ=255)
tgctgGAAGAACTGATCGACAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTgg > 2:718376/1‑151 (MQ=255)
gctgGAAGAACTGATCGACAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTg < 1:869612/149‑1 (MQ=255)
gctgGAAGAACTGATCGACAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGt > 2:465653/1‑151 (MQ=255)
aagaaCTGATCGACAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCa < 2:769378/151‑1 (MQ=255)
agaaCTGATCGACAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCa > 1:752950/1‑150 (MQ=255)
aCTGATCGACAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAag > 2:591830/1‑149 (MQ=255)
aCTGATCGACAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAag > 2:131035/1‑149 (MQ=255)
tGATCGACAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGc > 2:278539/1‑150 (MQ=255)
tCGACAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGt > 1:664781/1‑150 (MQ=255)
cGACAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTAt < 1:259922/151‑1 (MQ=255)
cGACAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTAt < 1:23796/151‑1 (MQ=255)
gACAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTAtg < 2:58219/151‑1 (MQ=255)
aCAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTAtgt > 1:455415/1‑151 (MQ=255)
aCAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTAtgt < 1:465650/151‑1 (MQ=255)
aCAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTAtg > 2:1056300/1‑150 (MQ=255)
aGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTgg > 1:982151/1‑151 (MQ=255)
tATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGgcgc > 2:1056533/1‑151 (MQ=255)
aGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCaa < 2:17817/151‑1 (MQ=255)
gCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACa < 1:733665/151‑1 (MQ=255)
cACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAg < 1:527924/151‑1 (MQ=255)
tATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGc > 1:653878/1‑151 (MQ=255)
aTTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGc < 1:129699/150‑1 (MQ=255)
aTTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCg > 1:540006/1‑151 (MQ=255)
ggTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGaa > 1:1005726/1‑150 (MQ=255)
aGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGaaaaaaa < 2:1044953/151‑1 (MQ=255)
ccACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAAcc > 1:316822/1‑151 (MQ=255)
ccACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAAcc > 2:434716/1‑151 (MQ=255)
cGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCgaa < 2:657000/151‑1 (MQ=255)
aTCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGGTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCga > 2:1017744/1‑148 (MQ=255)
cGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCgaaga > 1:1053803/1‑149 (MQ=255)
gTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAgc > 2:1157988/1‑151 (MQ=255)
cAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAgccg < 2:470698/151‑1 (MQ=255)
ttGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGccgccg < 1:493187/150‑1 (MQ=255)
tGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCcgccgc < 1:503007/150‑1 (MQ=255)
tGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCcgcg > 1:366244/1‑151 (MQ=255)
tCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGc > 2:83693/1‑151 (MQ=255)
tCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGACAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGc > 2:1138551/1‑151 (MQ=255)
cGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGc > 2:604076/1‑150 (MQ=255)
cGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGCCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGc > 2:450456/1‑150 (MQ=255)
aaCACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCaaaa < 1:119567/150‑1 (MQ=255)
tACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAAc < 2:653887/150‑1 (MQ=255)
cAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGt > 2:64386/1‑151 (MQ=255)
cAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGt < 1:827337/151‑1 (MQ=255)
aGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGt > 1:514040/1‑150 (MQ=255)
aGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTAATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGAAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCTTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGt < 2:863320/150‑1 (MQ=255)
gAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTa > 2:290470/1‑150 (MQ=255)
aaTGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTaa > 1:63726/1‑150 (MQ=255)
gTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAAc < 1:651911/150‑1 (MQ=255)
gTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACg < 1:174120/151‑1 (MQ=255)
ttGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACgc > 2:186494/1‑151 (MQ=255)
tGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACgc < 1:1075078/150‑1 (MQ=255)
ggATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGGGGTTATCATAATGCCCGGGGTCAGCAAGGGCAGTATGTGGCGCTCAAAAAGCCTGCGGGGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACg > 2:852200/1‑148 (MQ=255)
cTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGcagcag > 1:1083221/1‑150 (MQ=255)
tCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGt < 2:329199/149‑1 (MQ=255)
cGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGc < 2:311988/151‑1 (MQ=255)
gAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGc > 2:134768/1‑150 (MQ=255)
aaGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCaa < 1:697487/151‑1 (MQ=255)
aaGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCa > 1:952458/1‑150 (MQ=255)
aGGCGGCAGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCAGGAGGCGCGTGGTCAGCAAGAGCGGAATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCaaa < 1:141281/151‑1 (MQ=255)
ggcggcGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAAc < 1:580062/151‑1 (MQ=255)
ggcggcGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAAc < 2:408889/151‑1 (MQ=255)
ggcggcGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAAc < 1:491550/151‑1 (MQ=255)
cggcggTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAACt > 2:1100327/1‑150 (MQ=255)
cggcggTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAACTa < 1:935128/151‑1 (MQ=255)
ggcggTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAACTaa < 1:454516/151‑1 (MQ=255)
ggcggTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAACTaa < 1:870755/151‑1 (MQ=255)
ggcggTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAACTa > 1:1137883/1‑150 (MQ=255)
gcggTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAACTa > 2:1019658/1‑149 (MQ=255)
gcggTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAACTa > 2:614375/1‑149 (MQ=255)
cggTAAAATTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAACTAAGc < 1:1017481/151‑1 (MQ=255)
aaaaTTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAACTAAGCtat > 1:786610/1‑150 (MQ=255)
aaaaTTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAACTAAGCtat < 1:737913/150‑1 (MQ=255)
aaTTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAACTAAGCTATaa > 2:111128/1‑150 (MQ=255)
aaTTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAACTAAGCTATaa > 1:1166337/1‑150 (MQ=255)
aTTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAACTAAGCTATAAAt < 2:707206/151‑1 (MQ=255)
aTTGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAACTAAGCTATAAAt < 1:898266/151‑1 (MQ=255)
tGGTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAACTAAGCTATAAAtt < 2:911550/150‑1 (MQ=255)
gTCGTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAACCGCAGCAGTAGCAAACTAAGCTATAAATTGc > 1:83135/1‑150 (MQ=255)
gTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAACTAAGCTATAAATTGCAgcg < 2:353984/151‑1 (MQ=255)
gTTATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAACTAAGCTATAAATTGCAgcg > 2:165934/1‑151 (MQ=255)
tATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAACTAAGCTATAAATTGCAGcgcg > 2:1181266/1‑151 (MQ=255)
tATGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAACTAAGCTATAAATTGCAGcgcg > 1:790130/1‑151 (MQ=255)
aTGTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAACTAAGCTATAAATTGCAGcgcg > 2:696653/1‑150 (MQ=255)
gTCGGTGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAACTAAGCTATAAATTGCAGCGCGaa < 2:537020/150‑1 (MQ=255)
|
ATGTCGAAACGCTGGAACTGCTGGAAGAACTGATCGACAGCTATCAGGGCACGGTATTGCTGGTTAGCCACGATCGTCAGTTTGTCGATAACACCGTTACAGAATGTTGGATCTTCGAAGGCGGCGGTAAAATTGGTCGTTATGTCGGCGGTTATCATGATGCCCGTGGTCAGCAAGAGCAGTATGTGGCGCTCAAACAGCCTGCGGTGAAAAAAACCGAAGAAGCCGCCGCGGCAAAAGCAGAAACTGTAAAACGCAGCAGTAGCAAACTAAGCTATAAATTGCAGCGCGAA > NC_000913/1011378‑1011670
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
