Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I2 R1
|
121 |
82.0 |
2593086 |
97.7% |
2533445 |
150.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,931,721 |
T→C |
S281P (TCC→CCC) |
purT → |
phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,931,721 | 0 | T | C | 97.1%
| 236.1
/ ‑1.0
| 71 | S281P (TCC→CCC) | purT | phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base C (27/41); total (28/43) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.17e-01 |
TGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACA > NC_000913/1931573‑1931866
|
tGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTcccc > 2:828430/1‑151 (MQ=255)
tGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTcccc > 1:950064/1‑151 (MQ=255)
aaTCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTcccccc < 2:922160/151‑1 (MQ=255)
aaTCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTcccccc > 1:312200/1‑151 (MQ=255)
aaTCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTcccccc > 1:310493/1‑151 (MQ=255)
aaTCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTcccccc > 1:1286971/1‑151 (MQ=255)
aTCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCt < 2:900978/151‑1 (MQ=255)
ggCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTTGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGCGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTcc < 1:954686/151‑1 (MQ=255)
ggCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTcc < 2:1180977/151‑1 (MQ=255)
aCCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACAt < 1:1189255/151‑1 (MQ=255)
acaGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGAt < 2:588769/151‑1 (MQ=255)
gCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATAcc > 1:1006899/1‑151 (MQ=255)
gCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATAcc > 2:1079828/1‑151 (MQ=255)
aTGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGa < 2:265143/151‑1 (MQ=255)
aTGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGa < 1:224386/151‑1 (MQ=255)
aTGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGCGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGCGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATAACggg > 1:612319/1‑150 (MQ=255)
gAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGAt < 1:1198098/150‑1 (MQ=255)
gAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATg > 2:144707/1‑151 (MQ=255)
cccGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTg > 1:1210185/1‑151 (MQ=255)
cGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGAc < 1:1194195/151‑1 (MQ=255)
gCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATTATACCGGGATGGTGACg > 1:681651/1‑151 (MQ=255)
cTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACg < 1:1295758/150‑1 (MQ=255)
ttGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGtt > 2:42521/1‑151 (MQ=255)
gCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTa > 1:1106720/1‑150 (MQ=255)
ccTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAAtt > 2:354224/1‑151 (MQ=255)
tGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTtc < 1:93971/150‑1 (MQ=255)
gAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTtct < 1:108784/150‑1 (MQ=255)
gAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTtct < 2:95270/150‑1 (MQ=255)
aaCGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCa < 2:220398/151‑1 (MQ=255)
gttcgcAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGTTGGCACTGTGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAg < 1:259451/147‑1 (MQ=255)
gTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCa > 2:551457/1‑148 (MQ=255)
gTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCa > 2:686599/1‑148 (MQ=255)
gTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCa > 2:1177978/1‑148 (MQ=255)
gcAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGAtctc > 1:1210876/1‑151 (MQ=255)
gcAGGAGATTGCCCGTAAAGTAGTGCAGGCACTGAGCGGTTATGGGTTGTTTTGTGCCGTGCTATTTGTCTGGGGTGATGAGGGGCTTATCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGAGACGTTAATTTCTCATGAtctc > 1:1044624/1‑151 (MQ=255)
aGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGAtctctc > 1:747469/1‑151 (MQ=255)
gagaTTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCag < 2:365467/151‑1 (MQ=255)
aGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCAt > 2:579371/1‑151 (MQ=255)
ggtgCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGt < 2:887645/150‑1 (MQ=255)
ggtgCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTa < 2:168328/151‑1 (MQ=255)
ggtgCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTa < 2:1042944/151‑1 (MQ=255)
tgCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGGGAAGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACg > 1:1236292/1‑151 (MQ=255)
gCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTGATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGt < 2:6160/151‑1 (MQ=255)
gCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGt < 2:511936/151‑1 (MQ=255)
tGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGc > 2:692689/1‑151 (MQ=255)
ggCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGc < 1:328775/150‑1 (MQ=255)
gggCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTcc < 2:440104/149‑1 (MQ=255)
gggCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTc > 1:7937/1‑151 (MQ=255)
gggCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTc < 2:906997/151‑1 (MQ=255)
cGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTC‑CCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGAc < 1:677121/151‑1 (MQ=255)
ggTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGAc > 2:578000/1‑151 (MQ=255)
tATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACtt < 1:708741/150‑1 (MQ=255)
gggTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCgg > 2:93636/1‑151 (MQ=255)
ggTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGt < 2:337032/151‑1 (MQ=255)
gttgttTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGtt < 1:1147522/151‑1 (MQ=255)
ttGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCg < 1:1250534/150‑1 (MQ=255)
ggTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCggg < 2:401069/150‑1 (MQ=255)
gtCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATcc < 1:108753/151‑1 (MQ=255)
gtCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATc < 1:841554/150‑1 (MQ=255)
tCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCg > 2:1166843/1‑151 (MQ=255)
aGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCa < 2:231133/151‑1 (MQ=255)
aGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCa < 1:44154/151‑1 (MQ=255)
aGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTGTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCa < 1:82086/151‑1 (MQ=255)
tATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGt > 2:1022420/1‑150 (MQ=255)
ttGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATg < 1:835835/150‑1 (MQ=255)
tGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATgg < 1:1000709/150‑1 (MQ=255)
tCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTcc > 1:1133135/1‑151 (MQ=255)
ggtgATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCa < 2:73142/150‑1 (MQ=255)
aGGTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGc > 1:962973/1‑151 (MQ=255)
gTGATTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCg < 1:1177944/151‑1 (MQ=255)
aTTTTCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGtt > 1:137779/1‑150 (MQ=255)
tCAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCt > 1:634396/1‑151 (MQ=255)
cAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTg < 1:577968/151‑1 (MQ=255)
cAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCt < 2:477901/150‑1 (MQ=255)
cAGTGAGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTg < 2:957177/151‑1 (MQ=255)
aGGTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCcaca < 1:788570/151‑1 (MQ=255)
ggTCCCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCcaca > 2:1191581/1‑150 (MQ=255)
|
TGAATCCTGGCAACCACAGCAAATGAGCCCGCTTGCCCTTGAACGTGCGCAGGAGATTGCCCGTAAAGTGGTGCTGGCACTGGGCGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTGCCTTCCTCGGACTTCCGGTTGGCGGGATCCGTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACA > NC_000913/1931573‑1931866
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
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