Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
4926 |
296.4 |
4517418 |
96.8% |
4372860 |
264.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
632,414 |
3 bp→TCA |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 632,414 | 0 | A | T | 99.3%
| 679.9
/ NA
| 289 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); major base T (144/141); minor base G (0/2); total (144/145) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.47e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 632,415 | 0 | G | C | 99.7%
| 665.2
/ NA
| 289 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (144/142); total (144/145) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 632,416 | 0 | T | A | 99.0%
| 679.7
/ ‑3.7
| 289 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); major base A (142/142); minor base C (1/2); total (144/145) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
TTACGGTAATTACGATCCCTTTATGGAGTTTGATATACAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATAGTCCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGAGTGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCGTGTCCTGGTCCCTACACCTTTTAACACCGACAGT > CP042583/632140‑632698
|||
ttACGGTAATTACGATCCCTTTATGGAGTTTGATATACAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAaagaa < 1:1807369/289‑1 (MQ=255)
cGGTAATTACGATCCCTTTATGGAGTTTGATATACAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAagag < 1:1394598/289‑1 (MQ=255)
cgTAATTACGATCCCGTTGAGGAGTTTGATATACAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGt < 2:1166461/288‑1 (MQ=255)
aTCCCTTTATGGAGTTTGATATACAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTTCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGAAAAAGAAGAGTGGGTAATTAc > 2:1253725/1‑289 (MQ=255)
cccTTTATGGAGTTTGATATACAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTAcc > 1:2076096/1‑288 (MQ=255)
ttATGGAGTTTGATATACAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGc > 2:2159217/1‑289 (MQ=255)
tGATATACAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTCTTCACCCGCAAACGCAGAGGGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGaaa > 2:824729/1‑289 (MQ=255)
aTCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCg > 1:1598836/1‑289 (MQ=255)
tCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATg < 1:1655517/286‑1 (MQ=255)
aaCCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTTCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCg > 2:1036208/1‑279 (MQ=255)
aaCCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCg < 1:1036208/279‑1 (MQ=255)
ttGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCa < 1:264883/289‑1 (MQ=255)
tCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGa < 1:331919/264‑1 (MQ=255)
tCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGa > 2:331919/1‑264 (MQ=255)
tCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAg > 2:803225/1‑286 (MQ=255)
aTCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAg < 2:213787/289‑1 (MQ=255)
aTCGCACGCGTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAg < 2:1065473/289‑1 (MQ=255)
tCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTgg < 1:479032/226‑1 (MQ=255)
tCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAgg > 2:718168/1‑289 (MQ=255)
tCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTACTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAgg > 1:1281218/1‑289 (MQ=255)
cgactgCTTTATATCGAGGGGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAggg < 2:181042/284‑1 (MQ=255)
gCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCCGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAg > 2:1513562/1‑269 (MQ=255)
tttATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTAt < 1:718168/289‑1 (MQ=255)
tCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTa < 2:1598836/289‑1 (MQ=255)
tCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTa < 1:565101/289‑1 (MQ=255)
aaGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGa < 2:1902409/289‑1 (MQ=255)
aGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATg > 2:1672387/1‑240 (MQ=255)
aGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGa < 1:2159217/288‑1 (MQ=255)
ccTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTg > 1:493749/1‑288 (MQ=255)
gCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGc > 2:201227/1‑269 (MQ=255)
cAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGa > 1:2255624/1‑273 (MQ=255)
gTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAAtt < 1:903885/289‑1 (MQ=255)
tAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAAttt > 1:1255917/1‑289 (MQ=255)
tACTGTATAATGCTTTCAGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGGTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTgg < 2:911822/289‑1 (MQ=255)
tACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCCATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGa < 2:973822/238‑1 (MQ=255)
tACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTgg < 2:2076096/289‑1 (MQ=255)
tACTGAAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCTCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAACGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTgg < 1:782195/289‑1 (MQ=255)
tGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCag < 1:824729/289‑1 (MQ=255)
tGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCag < 1:989301/289‑1 (MQ=255)
tGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATc < 2:1284166/220‑1 (MQ=255)
ggtttCTGGGAAATTGCGCTGAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTAACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAgg < 2:2145470/285‑1 (MQ=255)
ggCAAATTGCGCTGAATGAGGATTGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTgtt < 1:705075/289‑1 (MQ=255)
ttggggtCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGGGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGt < 2:2001776/283‑1 (MQ=255)
ttGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGt < 2:508902/289‑1 (MQ=255)
ttGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGt < 2:655625/289‑1 (MQ=255)
ttGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGt < 1:1094806/289‑1 (MQ=255)
ttGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGt < 1:1011957/289‑1 (MQ=255)
ttGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAAGTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGt < 1:1351037/289‑1 (MQ=255)
aaTGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTa < 1:1683495/289‑1 (MQ=255)
gTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCa > 1:1541203/1‑177 (MQ=255)
gTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGa < 1:644889/196‑1 (MQ=255)
gTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGt > 1:534559/1‑271 (MQ=255)
gTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAAca > 1:629589/1‑288 (MQ=255)
gTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGACTGGCAGAGCAGGGCTGTTATACGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGGCCCCGGTCATCCACTGGCAGGTGAGGGGTGGTGTGGTGTGTCACGCTTAGTCacaaca > 2:1724928/1‑288 (MQ=255)
ttCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTAT‑TCACCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAAcagc < 1:1445640/288‑1 (MQ=255)
tctGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGCAGGGGTGGGGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAAcagcag > 1:729051/1‑288 (MQ=255)
gCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGt > 1:615280/1‑289 (MQ=255)
aaCTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTa < 2:2250330/288‑1 (MQ=255)
aaCTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCCCCCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGCAGGGGTGGTGGTGGTTGTCACCCTTAGTCATAAACGCAGGCGTAt > 2:1299507/1‑289 (MQ=255)
cTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTc < 2:134927/271‑1 (MQ=255)
ggTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGAt < 1:1897133/289‑1 (MQ=255)
gTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGAtg > 1:2005785/1‑289 (MQ=255)
aGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGTGTATTGAtgtg < 1:1922101/289‑1 (MQ=255)
aGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCag < 1:1952104/228‑1 (MQ=255)
cAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGt > 2:865353/1‑228 (MQ=255)
cAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGt < 1:865353/228‑1 (MQ=255)
cAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAAt > 1:661686/1‑289 (MQ=255)
cGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTgg > 2:589598/1‑142 (MQ=255)
cGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTa > 1:1131296/1‑158 (MQ=255)
cGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGt < 2:260113/243‑1 (MQ=255)
cGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAAcagcag > 2:641891/1‑264 (MQ=255)
cGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCtt > 1:437984/1‑289 (MQ=255)
cGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCtt > 1:709288/1‑289 (MQ=255)
gtgtGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGa > 2:893572/1‑289 (MQ=255)
tGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCa < 2:1836776/272‑1 (MQ=255)
tGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAg > 1:2025171/1‑286 (MQ=255)
tGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAg > 1:7624/1‑286 (MQ=255)
tGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGGAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAggat > 1:1559857/1‑287 (MQ=255)
gACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTg > 2:711891/1‑289 (MQ=255)
ggTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCCGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGa > 1:1965966/1‑288 (MQ=255)
gTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTa > 1:1203786/1‑139 (MQ=255)
tATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGatca < 2:1116779/289‑1 (MQ=255)
ttGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGatcatc > 1:2133620/1‑289 (MQ=255)
tGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCg < 2:546145/289‑1 (MQ=255)
cAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAggg > 1:1303907/1‑204 (MQ=255)
aTTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTc < 2:15513/289‑1 (MQ=255)
aaGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCGTGTCCt < 1:950661/288‑1 (MQ=255)
aaGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCGTGTCCTg < 1:689775/289‑1 (MQ=255)
gatgctGGTGAGGAATATGACTATTGACCCGCAAAGGATGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCGTGTCCTGGTCCCTa < 2:7449/289‑1 (MQ=255)
gaggatgGTGAGGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAGGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGGGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCGTGTCCTGGTCCCTa < 2:697415/286‑1 (MQ=255)
tgatgGTGATGAATATGACTATTCACCAGCAAAAGAAGAGTGTGTAATGACCGCAGCGAACGGTAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGGTCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGTCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCGTGTCCTGGTCCCTaca < 2:1559857/289‑1 (MQ=255)
ggTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCgt < 1:2185423/270‑1 (MQ=255)
ggTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCgt > 2:2185423/1‑270 (MQ=255)
ggTGATGAATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCGTGTCCTGGTCCCTaca < 1:1715012/285‑1 (MQ=255)
gatgaATATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCGTGTCCTGGTCCCTACACCtttt < 2:194982/288‑1 (MQ=255)
aaTATGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCGTGTCCTGGTCCCTACACCTTTTAacac < 1:799389/289‑1 (MQ=255)
tatGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCGTGTCCTGGTCCCTaca < 2:1384745/276‑1 (MQ=255)
tGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCGTGTCCt < 2:463725/264‑1 (MQ=255)
tGACTATTCACCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCGTGTCCTAGTCCCTACACCTTTTAACACCGAc < 2:788531/289‑1 (MQ=255)
cTATACACCCGCAAAAGAAGGGTGGGTAAATACCGCAGCGAACTGGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGTCAGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCGTGTCCTGGTCCCTACACCTTTTAACACCGACAgt < 2:1963628/289‑1 (MQ=255)
|||
TTACGGTAATTACGATCCCTTTATGGAGTTTGATATACAGATCAACCAGATTGTCCCTTCTATGGGCTATCGCACGCTTTATATCGAAGCGAATCAGCCTGGCAACGTAATTGCGGCAAAAAGTGACGCTGAAGGGATACTGGAAAATGCTTTCTGGCAAATTGCGCTCAATGAGGATGGTTCTCTGCAACTGGTAGATAAAGACAGCGGTGTGCGCTATGACCGGGTATTGCAAATTGAAGAAAGCTCTGATGATGGTGATGAATATGACTATAGTCCCGCAAAAGAAGAGTGGGTAATTACCGCAGCGAACGCGAAACCGCAATGCGATATTATTCATGAAGCCTGGCAGAGCAGGGCTGTTATCCGCTATGACATGGCAGTGCCGCTCAATTTGAGTGAACGCAGCGCCCGGCAATCCACTGGCAGAGTAGGGGTGGTGTTGGTTGTCACTCTTAGTCATAACAGCAGGCGTATTGATGTGGATATCAATCTTGATAACCAGGCTGACGATCATCGCCTTCGTGTCCTGGTCCCTACACCTTTTAACACCGACAGT > CP042583/632140‑632698
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
