Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
4926 |
296.4 |
4517418 |
96.8% |
4372860 |
264.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
634,313 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 634,313 | 0 | A | T | 99.7%
| 716.6
/ NA
| 300 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (156/143); minor base G (1/0); total (157/143) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
| * | CP042583 | 634,314 | 0 | G | C | 99.7%
| 709.3
/ NA
| 300 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (157/142); total (157/143) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 634,315 | 0 | C | G | 99.3%
| 712.8
/ NA
| 300 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (156/142); minor base T (1/1); total (157/143) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 300 total aligned reads displayed.
TAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGAGCCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGCGCCGCTGGCAATCGAAGGTCTGA > CP042583/634037‑634595
|||
tCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGa > 1:2186881/1‑284 (MQ=255)
aaTGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTAc < 1:1309775/289‑1 (MQ=255)
tGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGcc > 1:19910/1‑272 (MQ=255)
cTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCttttt > 2:1508224/1‑289 (MQ=255)
caacaaAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTtgtg < 2:2205634/289‑1 (MQ=255)
cTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGc < 2:1019286/289‑1 (MQ=255)
cTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGc < 1:1635746/289‑1 (MQ=255)
tGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCt < 2:966477/289‑1 (MQ=255)
tAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCT‑ACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACcgcg < 2:91732/247‑1 (MQ=255)
tAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCT‑ACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACcgcg > 1:91732/1‑247 (MQ=255)
taagttgtaTCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGaaa < 2:234120/281‑1 (MQ=255)
aCGTGTGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGGTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAAc < 2:182227/289‑1 (MQ=255)
aCGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAAc > 2:1349212/1‑289 (MQ=255)
tGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAAAATGATTGCATCCTTTTTTTACGCTGTTTTTGTTGGCATTCACATGGTATTATTAAGGTGTTCAATCAAATTTCTATTGGGGCATTCGTGTGACCTTTTCTACCGGTGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGGGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACTGt < 2:1722552/289‑1 (MQ=255)
ggATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGCTGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTCACAGTTTGCCTTGACAGCGATGTACCACTTCCTTTTGGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCCTTCCTGCTGGCCATTATGGATACGGTcc > 2:33403/1‑288 (MQ=255)
ggATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACcg < 1:750368/217‑1 (MQ=255)
ggATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGAc < 2:744894/248‑1 (MQ=255)
ggATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATCATGGAAACGGtta > 2:76637/1‑287 (MQ=255)
gATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACgg > 1:1920849/1‑285 (MQ=255)
gATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACgg < 2:1920849/285‑1 (MQ=255)
tattaACAGTTTTGAAACCTTTCTTTACGCATTTTTTGTTGGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCCAACAAATGTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACTGTTTGCCTTGACAGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCaaa < 2:1038344/289‑1 (MQ=255)
tcATGTTTTCATACTTTTATTACGCATTTTTTGTGGGTATTTATATGTTTTGCTGAAAGTGTTCAATCAAATTTCTATTGGTGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCTCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGAt < 2:846055/288‑1 (MQ=255)
aCATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGAt < 1:1731749/289‑1 (MQ=255)
tttGCAACCTTTCTTTACGACGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACACTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCGGGCCATTATGGAAACGGTCTACGGCCTCTCCGGCAAACAGATTtata > 1:945529/1‑289 (MQ=255)
ttGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTACTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAAGGGTCTACGTCCTCTCCGGCAACGAGATTTATaa > 2:636248/1‑289 (MQ=255)
tGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGa < 1:716414/185‑1 (MQ=255)
tGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGa > 2:716414/1‑185 (MQ=255)
ttctttACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGc < 1:1103754/213‑1 (MQ=255)
tctttACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGACACGGTCTACGTCCTCTCCGGCCACCCGATTTCTCACGCTATGAc > 1:1837407/1‑288 (MQ=255)
tttttGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCTTGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATaaa > 1:1348361/1‑269 (MQ=255)
tgCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCaaa < 1:733861/249‑1 (MQ=255)
tATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACtt > 2:582032/1‑289 (MQ=255)
tgatgaAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCaaa > 1:1180002/1‑234 (MQ=255)
tgatgaAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCaaa < 2:1412022/234‑1 (MQ=255)
tgatgaAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCaaa < 1:1407434/234‑1 (MQ=255)
tgaAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTtat < 1:1791322/240‑1 (MQ=255)
tgaAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTAt > 1:1944425/1‑278 (MQ=255)
aaGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTg < 1:1809289/288‑1 (MQ=255)
gtgtTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACcgcg < 1:1770591/139‑1 (MQ=255)
gtgtTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACcgcg > 2:1770591/1‑139 (MQ=255)
gtgtTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGc > 1:373316/1‑192 (MQ=255)
gtgtTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGaaa > 2:1947751/1‑203 (MQ=255)
gtgtTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTGTACGTCCTCTCCGGCCAACAGATTTCTAAAGATTTGACCAATCTCGGGGGCAAGTTGTTTGGTATCCACTTTGCTCTGGgt > 2:1494985/1‑289 (MQ=255)
ttCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCt < 1:757716/168‑1 (MQ=255)
ttCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCt > 2:757716/1‑168 (MQ=255)
ttCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGtgtg > 1:489530/1‑289 (MQ=255)
tCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGATTCATGATGTTCGATATAGTCGAACTGTCTCGCTTACAGTTTTCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGTCGCTCGGTATGGCGTTTCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATCTATTACGATATGACCGAGTTCTTGGGCAAGTTGTTTGGTAACAATCTCGCTCTGGgttgg > 2:2168236/1‑285 (MQ=255)
tCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGgt < 1:1874034/285‑1 (MQ=255)
tCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGgt > 2:1874034/1‑285 (MQ=255)
ggggCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATg < 1:675469/289‑1 (MQ=255)
ggggCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATg < 2:1390259/289‑1 (MQ=255)
gggCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATgg > 2:1979434/1‑289 (MQ=255)
tGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATCTAGTCGACCTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTc < 2:784030/289‑1 (MQ=255)
tGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGtt > 2:1754564/1‑288 (MQ=255)
tGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGtt > 2:34730/1‑288 (MQ=255)
tGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCAGGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTCTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTGTCCGTCATCTCAGGCAAACCGGTTACTATAGAGATGACCATGTTCTCGCGCAAGTTGTTTGGTATCACCTTGGACCTGTGTCTGGCGTCCGCACTTACCAAGGAGtg > 2:477379/1‑287 (MQ=255)
gtgACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGGACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACtt < 2:289242/247‑1 (MQ=255)
gtgACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACtt > 1:289242/1‑247 (MQ=255)
ttaCCCTTTCTAACAGGGTTGACTCTCGGGGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGTAGTAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGtt < 2:2046927/286‑1 (MQ=255)
tgACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGc > 1:1423160/1‑249 (MQ=255)
tgACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGc < 2:1423160/249‑1 (MQ=255)
tttCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAgttgt < 2:183929/227‑1 (MQ=255)
ttCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTa > 1:444540/1‑289 (MQ=255)
ttCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATAAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGTGGTTCCAGTTCGGGACTa > 2:434912/1‑289 (MQ=255)
tCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACt < 1:780900/237‑1 (MQ=255)
tCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTaa < 1:2059476/289‑1 (MQ=255)
cTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAAc < 1:228273/289‑1 (MQ=255)
cTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAAc < 1:636248/289‑1 (MQ=255)
aCGGGGTTCATTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTTTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTgg < 1:1017675/289‑1 (MQ=255)
gacaggtttcGGGGTTTTCATGGGATGGGCAAGGAGTAATGATGTTAGTTATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCtt < 2:1107982/280‑1 (MQ=255)
gTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCtt < 2:707507/288‑1 (MQ=255)
ttCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGAcc > 2:1589475/1‑196 (MQ=255)
ttCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGAcc < 1:1589475/196‑1 (MQ=255)
aCTCTCGGAGTCTTCATGCGATGTGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTAt < 1:59212/289‑1 (MQ=255)
aCTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTAt < 2:1693147/289‑1 (MQ=255)
tcGGAGTCTTCATGCGATGACCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTccc < 1:1485265/289‑1 (MQ=255)
cGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCa < 1:1375527/289‑1 (MQ=255)
cGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCa < 1:333007/289‑1 (MQ=255)
cGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCAGGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCa < 1:544207/289‑1 (MQ=255)
ttCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTa > 2:2003836/1‑289 (MQ=255)
ttCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGGTGTTTGGTAACAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCTCAATATGTa > 1:884771/1‑289 (MQ=255)
ttCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGGCGCGCTCACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCCCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCTGCAAACAGACTTATAAACATCTGACCAATTTATCGTGCTAGTTGTATGGTATCAACTTCGCTATCGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGACTTCCAGTTCGGGCCTAACTGGACCTACCATTTCCACTATGTa > 2:669203/1‑289 (MQ=255)
aTGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTc < 1:814854/248‑1 (MQ=255)
aGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGt > 2:1214664/1‑224 (MQ=255)
aGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGt < 2:1645534/243‑1 (MQ=255)
cATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCCTGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc > 2:214267/1‑288 (MQ=255)
cATGATGTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTa < 2:1545176/252‑1 (MQ=255)
tgatgTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc > 1:252314/1‑286 (MQ=255)
tgatgTTAGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGcgcc > 2:81435/1‑286 (MQ=255)
aGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGaaa < 1:1246374/107‑1 (MQ=255)
aGATATAGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATCAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGTTCTTACTATTCCCACTATGTCTGGGATATCTGCTGGGCGCCGCTgtccat > 2:1305290/1‑283 (MQ=255)
aGATATAGTAGAACTGTCGCGATTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACTATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGCGCCGCTGGCAATc > 1:695396/1‑289 (MQ=255)
aGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATg < 1:2207277/208‑1 (MQ=255)
aGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTAt > 1:980971/1‑241 (MQ=255)
aGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTTCGCCCCTGGCAATGGAGGGt > 2:2192957/1‑289 (MQ=255)
aGTCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTCGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTcc < 2:728026/244‑1 (MQ=255)
tCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCa < 2:1073075/244‑1 (MQ=255)
tCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCa > 1:1073075/1‑244 (MQ=255)
tCGAACTGTCGCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGCGCCGCTGGCACTCGAAGGtat > 1:1520293/1‑287 (MQ=255)
gAACTGTGGCGCTTACACTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACGTCCTTTTTGTGCCACTGACACTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGAGATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGAACATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGCGCCGCTGGCAATCGAAGGTCTGa < 2:945529/289‑1 (MQ=255)
|||
TAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTTGCTTCAACAAAAACCTGTTTATTGTAAGGATTTTGCGGCGTAATATATACGTGGGATCAATTTGAGTTTTTATTAACATGTTTGCAACCTTTCTTTACGCCGTTTTTGTGTGCATTCACATGGTATGATGAAAGTGTTCAAACAAATTTCTATTGGGGCATGCGTGTGACCCTTTCTAACGGGGTTCACTCTCGGAGTCTTCATGCGATGAGCAAGGAGTCATGATGTTAGATATAGTCGAACTGAGCCGCTTACAGTTTGCCTTGACCGCGATGTACCACTTCCTTTTTGTGCCACTGACGCTCGGTATGGCGTTCCTGCTGGCCATTATGGAAACGGTCTACGTCCTCTCCGGCAAACAGATTTATAAAGATATGACCAAGTTCTGGGGCAAGTTGTTTGGTATCAACTTCGCTCTGGGTGTGGCTACCGGTCTGACCATGGAGTTCCAGTTCGGGACTAACTGGTCTTACTATTCCCACTATGTAGGGGATATCTTCGGTGCGCCGCTGGCAATCGAAGGTCTGA > CP042583/634037‑634595
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
