Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
4926 |
296.4 |
4517418 |
96.8% |
4372860 |
264.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
675,781 |
A→G |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 675,781 | 0 | A | G | 100.0%
| 590.1
/ NA
| 248 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (128/120); total (128/120) |
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
TGCAGATTGGGTAACACAGGAACAACTGCCGGTGATACTGGTAGTTGGTGTGAAACTCGGCTGTATTAATCACGCGATGTTGACTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAACCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGATAGGGGCTGGAGACAGTTATCCACTATTCCTGTGGATAACCATGTGTATTAGAGTTAGAAAACACGAGGCAAGCGAGAGAATACGCGGCTTGCACGCGAATTGGCGTTAAAGACGGCTCAAAGAAATATCTTTTATTTTTT > CP042583/675496‑676065
|
acacAGGAACAACGGCCGGTGATACTGGTAGTTGGTGTGAAACTCGGCTGTATTAATCACGCGATGTTGACTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGt < 2:502681/289‑1 (MQ=255)
gAACAACTGCCGGTGATACTGGTAGTTGGTGTGAAACTCGGCTGTATTAATCACGCGATGTTGACTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAAtt > 2:1129155/1‑289 (MQ=255)
gAACAACTGCCGGTGATACTGGTAGTTGGTGTGAAACTCGGCTGTATTAATCACGCGATGTTGACTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAAtt > 2:1589028/1‑289 (MQ=255)
acTGCCGGTGATACTGGTAGTTGGTGTGAAACTCGGCTGTATTAATCACGCGATGTTGACTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGcc > 2:774854/1‑264 (MQ=255)
acTGCCGGTGATACTGGTAGTTGGTGTGAAACTCGGCTGTATTAATCACGCGATGTTGACTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGcc < 1:774854/264‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTGATACTGGTAGTTGGTGTGAAACTCGGCTGTATTAATCACGCGATGTTGACTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGCAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTCTGGTAGCCATTCTGTATTTGTCTAAATTtcga > 2:322324/1‑287 (MQ=255)
cTGCCGGTGATACTGGTAGTTGGTGTGAAACTCGGCTGTATTAATCACGCGATGTTGACTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTgcgagc > 1:1523888/1‑289 (MQ=255)
cTGCCGGTGATACTGGTAGTTGGTGTGAAACTCGGCTGTATTAATCACGCGATGTTGACTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGAGCCCCCGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAAACGGAAAGCACATAAACCTTGCCTTGATGTAGGCATTCTTTATTTTGCTAAAtttcaa > 2:912533/1‑283 (MQ=255)
gttACTGGTAGTTGGTGTGAAACTCGGCGGTATTAAGCACGCTATGTTGACTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATcgc < 2:52282/287‑1 (MQ=255)
ggTGTGAAACTCGGCTGTATTAATCACGCGATGTTGACTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTg > 2:2031514/1‑287 (MQ=255)
ggTGTGAAACTCGGCTGTATTAATCACGCGATGTTGACTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGAACGCGTATTCGATTGaa > 1:539096/1‑288 (MQ=255)
tgAAACTCGGCTGTATTAATCACGCGATGTTGACTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTTCGAGCGAGATGCCGTCTCCCATTCACTCCa > 2:1690706/1‑289 (MQ=255)
ggCTGTATTAATCACGCGATGTTGACTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAAc < 2:1621339/288‑1 (MQ=255)
tATTAATCACGCGATGTTGACTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTa > 1:1145367/1‑289 (MQ=255)
aTTAATCACGCGATGTTGACTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTa < 1:682142/288‑1 (MQ=255)
gcgATGTTGACTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTaaaa > 1:1954638/1‑289 (MQ=255)
cTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGaa < 1:1082557/289‑1 (MQ=255)
cacaGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGaaaaa > 1:1008385/1‑289 (MQ=255)
acaGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGaaaaaa > 2:1011107/1‑289 (MQ=255)
acaGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGaaaaaa > 1:58151/1‑289 (MQ=255)
acaGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGaaaaaa > 1:334677/1‑289 (MQ=255)
tAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAAttt < 1:1316626/288‑1 (MQ=255)
acacaccGCCGGACGGACTCCGGCGGGTTGGGTGGCGACCGATGTTACGCCTCCGGAAAAACGTCACGCTGAATATATGCCCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACtt < 2:601145/283‑1 (MQ=255)
acaacaCGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACtt < 2:1564631/289‑1 (MQ=255)
acGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTGCGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTgcgagc < 2:271644/213‑1 (MQ=255)
acGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGtt < 2:1947637/202‑1 (MQ=255)
acGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAACTAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCg > 1:321703/1‑287 (MQ=255)
acGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCg > 1:1131002/1‑287 (MQ=255)
acGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGc > 2:1481958/1‑288 (MQ=255)
acGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGc > 1:2083236/1‑288 (MQ=255)
acGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGc > 2:41787/1‑288 (MQ=255)
ctgactCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATgcgg < 1:1284195/289‑1 (MQ=255)
ttGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAAtt > 1:1698949/1‑289 (MQ=255)
gTGGCGAACGAGGTTACGCCTACGGGAAAGAGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGcc < 2:1828387/288‑1 (MQ=255)
tGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCa > 1:1411524/1‑289 (MQ=255)
gcGAAGTTACGACTACGGGCAACCGTCACGCGGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGGGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGATTGCAGAAAATCCTGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAggcggc < 2:1442215/288‑1 (MQ=255)
aCGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACG‑AAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGgcggcg < 2:1329352/289‑1 (MQ=255)
cGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGgcggcg < 2:1411524/289‑1 (MQ=255)
tACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGAt < 2:1523888/289‑1 (MQ=255)
tACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGAt < 2:198324/289‑1 (MQ=255)
cTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAggcgg < 1:226910/276‑1 (MQ=255)
cTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGATAgggg < 2:882101/289‑1 (MQ=255)
ccGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGCATGTGGGAATTGCCCAGGCGGACGGGGATAggg > 2:729335/1‑286 (MQ=255)
cGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCCAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGATAGGGGCTg > 1:1877949/1‑289 (MQ=255)
gAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGATAGGGGCTGga < 1:2123567/288‑1 (MQ=255)
tatatGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGATAGGGGCTGGAGACAGTTATCCACTATTc < 1:41787/289‑1 (MQ=255)
tatatGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGATAGGGGCTGGAGACAGTTATCCACTATTc < 1:1021496/289‑1 (MQ=255)
ttagACCCCGCTCACCCGCATGCTTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGATAGGGGCTGGAGACAGTTATCCACTATTCCt < 2:637346/286‑1 (MQ=255)
tatGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGATAGGGGCTGGAGACAGTTATCCACTATTCCt < 2:1954638/289‑1 (MQ=255)
atGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGATAGGGGCTGga < 1:632469/268‑1 (MQ=255)
tGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGATAGGGGCTGGAGACAGTTATCCACTATTCCtgt < 1:1801827/289‑1 (MQ=255)
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|
TGCAGATTGGGTAACACAGGAACAACTGCCGGTGATACTGGTAGTTGGTGTGAAACTCGGCTGTATTAATCACGCGATGTTGACTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAACCTTGCCTTGTTGTAACCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGATAGGGGCTGGAGACAGTTATCCACTATTCCTGTGGATAACCATGTGTATTAGAGTTAGAAAACACGAGGCAAGCGAGAGAATACGCGGCTTGCACGCGAATTGGCGTTAAAGACGGCTCAAAGAAATATCTTTTATTTTTT > CP042583/675496‑676065
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A