Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
4926 |
296.4 |
4517418 |
96.8% |
4372860 |
264.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
1,954,328 |
3 bp→TCA |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 1,954,328 | 0 | A | T | 99.6%
| 590.9
/ NA
| 249 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base T (126/121); total (127/122) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.92e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 1,954,329 | 0 | G | C | 100.0%
| 596.8
/ NA
| 249 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (127/122); total (127/122) |
| * | CP042583 | 1,954,330 | 0 | T | A | 100.0%
| 601.7
/ NA
| 249 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (127/122); total (127/122) |
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
CATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTT‑AAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTAAGCATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAAAGTCATGATAGTGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTAGCAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGAGCCTTAGTAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAG > CP042583/1954059‑1954599
|||
cATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTT‑AAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCa < 2:2171306/288‑1 (MQ=255)
cATTAGCAGAAAAATGTGCTGAGACGCAGGAAGTACAGCAGACTTT‑AAAAAAAGCAGCGTTATCCTGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATTATATTGCGTTAGGTTATGATGAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGGACCCCGAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAAGCTGGCACA‑TATCTCAACCAACTCCCCCCTCAAGTCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCa < 2:1494089/288‑1 (MQ=255)
ttGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTT‑AAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCaaaaa > 1:1062693/1‑289 (MQ=255)
aGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTT‑AAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTa < 2:2243842/289‑1 (MQ=255)
aCCGAGGAATTACTGCAGTCTTT‑AAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCttcgaaat > 2:1548667/1‑282 (MQ=255)
aTTACTGGAGTCTTTAAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATg < 1:852892/287‑1 (MQ=255)
cTTT‑AAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCgg < 1:213261/286‑1 (MQ=255)
aaaaaCATCGTTATCCGGAGATGAACAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAACTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCTACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAAtt < 2:605752/289‑1 (MQ=255)
cGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTtat > 1:201572/1‑289 (MQ=255)
gTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTtat < 2:1447426/288‑1 (MQ=255)
gTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTtat < 1:814580/288‑1 (MQ=255)
agaTGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTTAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGaaaa > 1:1737436/1‑288 (MQ=255)
aagaaAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACagtc < 2:2049131/289‑3 (MQ=255)
aagaaAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACagtc > 1:1557543/1‑287 (MQ=255)
aagaaAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACagtc > 1:277617/1‑287 (MQ=255)
aagaaAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACagt < 1:1243644/288‑2 (MQ=255)
aagaaAGCATTGAGTTAATGCAGCATATTGCATTAGGTTATGATAAATTTGGGCAAGAAGCTGTAGGTATTCTTTACCATATTGTTAGAAACCCAAC‑AAATGAGACCCTATAGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGATTAAAATTATAGAATCTGGCACA‑TATCGCAATCAACGCCCCCCTCCGATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTAGTCTCCCCGTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATTTCTGAAAAACagtc < 2:2145426/289‑3 (MQ=255)
agaaAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACagtc < 1:539416/288‑3 (MQ=255)
cATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACagtcgctttca > 1:1618427/1‑280 (MQ=255)
aGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACagtcgctttcaaaggt < 2:1618427/289‑15 (MQ=255)
cTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCttt > 2:911201/1‑289 (MQ=255)
taataTTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACagtc > 2:1142010/1‑265 (MQ=255)
taataTTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACagtc < 1:1142010/267‑3 (MQ=255)
taataTTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAat > 2:126600/1‑289 (MQ=255)
taataTTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAat > 1:1190088/1‑289 (MQ=255)
tatTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAatgat < 1:438951/289‑1 (MQ=255)
tatTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAatgat < 1:148444/289‑1 (MQ=255)
ttGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAAtgatga < 1:2250304/289‑1 (MQ=255)
tGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAAATGCTGGTTTAAAATATTATAATCT‑GCACATTATCGAAACCAACT‑CCCCCTCAAATCACAAGATTCAAATGAACTCCTGTTCAAAACACTATTCCCCCCTTCGAAATTAATGACCATTATCCGTGATGAAATTCCTCTTATATTTGAAAAACAATCCATTTTAAAGGTGCTTTTAAATTATgag > 2:1834300/1‑289 (MQ=255)
cGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTaaa > 1:617937/1‑280 (MQ=255)
ttAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGaata > 1:1874250/1‑289 (MQ=255)
ggTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAAtgatga < 1:347023/281‑1 (MQ=255)
ggTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAAtgatga > 2:347023/1‑281 (MQ=255)
ggTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAAtgatga < 1:517910/281‑1 (MQ=255)
ggTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATg > 1:1221356/1‑289 (MQ=255)
tGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTg > 2:268849/1‑289 (MQ=255)
tGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTg > 1:678301/1‑289 (MQ=255)
aTAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTTAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAg < 2:1737436/289‑1 (MQ=255)
aTAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAg > 2:178955/1‑289 (MQ=255)
aaTTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAatgat > 2:2196133/1‑269 (MQ=255)
aaTTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAatgat < 1:2196133/269‑1 (MQ=255)
aaTTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGa < 1:1905831/289‑1 (MQ=255)
gggAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTG‑AAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTAc > 1:683963/1‑289 (MQ=255)
tGAAGATATTCTTGAACATATTGTTCAAACCCCACC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATAATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAATCTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTg < 2:1904195/288‑1 (MQ=255)
aGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGa < 1:2067378/288‑1 (MQ=255)
atatTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATaa < 1:1548667/289‑1 (MQ=255)
atTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCt < 2:321489/281‑1 (MQ=255)
ttACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGt > 2:2034562/1‑289 (MQ=255)
cATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACCTCTGGGATAAAAATCGTCAAt > 2:1508270/1‑289 (MQ=255)
tatTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCttt < 2:1282346/227‑1 (MQ=255)
tatTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCttt > 1:1282346/1‑227 (MQ=255)
tatTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTa > 1:1487485/1‑289 (MQ=255)
atTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTa > 1:1307238/1‑288 (MQ=255)
tGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAAcc < 2:397557/289‑1 (MQ=255)
ttAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAAc > 1:1453005/1‑286 (MQ=255)
ttAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACcac < 2:1576344/289‑1 (MQ=255)
tAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTTGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACcac < 2:557508/288‑1 (MQ=255)
aGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCCCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATTGTCAATTAACCAAAg > 1:907534/1‑289 (MQ=255)
gAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGTTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGa > 1:1407760/1‑289 (MQ=255)
aCCCCAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAAtgatga > 1:1515804/1‑227 (MQ=255)
cccAAC‑AAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAatgat > 2:463766/1‑223 (MQ=255)
caac‑aaATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAATTGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTAAAAACTTCTGGTATAAAAATCGTAATTAAACCACAGATGaatt > 2:1379494/1‑287 (MQ=255)
aac‑aaATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGaa < 2:672604/286‑1 (MQ=255)
aTGAGACACTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTg < 2:1221356/289‑1 (MQ=255)
gagaCCCTATCGATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCt < 1:1685480/289‑1 (MQ=255)
atcgaTTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTg > 1:2094093/5‑279 (MQ=255)
atcgaTTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCag < 1:1578449/285‑1 (MQ=255)
tCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTg > 1:1701192/1‑271 (MQ=255)
tCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTg < 2:1701192/271‑1 (MQ=255)
tCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATcg > 2:774999/1‑288 (MQ=255)
ccGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATg > 2:1026008/1‑127 (MQ=255)
tATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAAt > 2:952705/1‑289 (MQ=255)
tATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAAt > 2:1599105/1‑289 (MQ=255)
tttAAAATTATATAATCCGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCaa < 2:1190088/289‑1 (MQ=255)
ttAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCaa < 1:588377/288‑1 (MQ=255)
aaaaTTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTc < 2:1557543/289‑1 (MQ=255)
aaaaTTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTc < 2:1481067/289‑1 (MQ=255)
tatataATACGGCACA‑TATCACAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGAGGAGCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCGTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATAACTGACAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTa < 2:1931881/289‑1 (MQ=255)
tataATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTAt > 2:714872/1‑288 (MQ=255)
aaTCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTa < 1:1599105/289‑1 (MQ=255)
aaTCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTACAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTa < 1:1009366/289‑1 (MQ=255)
aTCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTAc < 2:431488/289‑1 (MQ=255)
tCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTc > 2:1149698/1‑272 (MQ=255)
tCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTc < 1:1149698/272‑1 (MQ=255)
tCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCaa < 2:1527578/279‑1 (MQ=255)
gCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGa > 2:1368078/1‑176 (MQ=255)
caca‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGtc > 2:2097072/1‑288 (MQ=255)
ca‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTctct < 2:841667/289‑1 (MQ=255)
ca‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTctct < 1:409743/289‑1 (MQ=255)
tatCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTAc < 1:37552/289‑1 (MQ=255)
atCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACg > 2:969604/1‑289 (MQ=255)
atCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACg > 1:1787843/1‑289 (MQ=255)
aaccaacTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTcccc < 1:961290/289‑1 (MQ=255)
aaccaacTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTcccc < 2:2086146/289‑1 (MQ=255)
acTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGa < 1:938228/160‑1 (MQ=255)
acTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACt > 2:1075000/1‑288 (MQ=255)
ccccTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTAc < 1:76668/273‑1 (MQ=255)
ccccTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTAc > 2:76668/1‑273 (MQ=255)
ccccTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTccacca > 1:446011/1‑289 (MQ=255)
cccTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAg > 2:1003960/1‑289 (MQ=255)
|||
CATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTT‑AAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAAC‑AAATGAGACCCTAAGCATTATCCGACTTATC‑AAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACA‑TATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAAAGTCATGATAGTGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTAGCAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGAGCCTTAGTAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAG > CP042583/1954059‑1954599
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
