Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F210 I1 R1
|
4930 |
262.8 |
3829204 |
96.6% |
3699011 |
272.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
562,510 |
3 bp→CGA |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 562,510 | 0 | G | C | 99.7%
| 679.1
/ NA
| 289 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base C (149/138); total (151/138) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 562,511 | 0 | C | G | 99.3%
| 666.7
/ NA
| 289 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base G (149/137); total (151/138) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 562,512 | 0 | T | A | 98.6%
| 673.2
/ NA
| 289 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); major base A (146/137); minor base C (3/1); total (151/138) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.23e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
TCGGCAGATCAAAGAACGGTGCTAACGGACGCAGAATGCTCTCCAGCGGGACAAACTCGCCAAACGGCACCAGATGGTTTTTGTTATAGCGATCGGCACTTTCGTAGCTGTACGGCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGGCTGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCGCTCTCCGGCCAGATAATCAAGCTACTTTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGGCTTTGCGGAATATCGCCCTGAACCATGCTAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGCAAACAGCACGACGGCCACCACCAGCGGACGCCAGTTGCGTTTGACCAACGCCAGTGCCAGCAGGCCACTAACCATCATCAGCA > CP042583/562230‑562790
|||
tCGGCAGATCAAAGAACGGTGCTAACGGACGCAGAATCGACTCCAGCGGGACAAACTCGCCAAACGGCACCAGCTGGTTTTTGTTATAGCGATCGGCTGATTCGTAGCTGTACGGCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATAGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGTGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATGACGCAACTACTCGTCTAGTGCTTTGAGGAACGGGTGCCGGTTAATTTCCAGTTTGGTTAACGCCCTCTcct > 2:1157096/1‑287 (MQ=255)
gTGCTAACGGACGCAGAATCGACTCCAGCGGGACAAACTCGCCAAACGGCACCAGATGGTTTTTGTTATAGCGATCGGCTGATTCGTAGCTGTACGGCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGcc > 1:799565/1‑273 (MQ=255)
tGCTAACGGACGCAGAATCGACTCCAGCGGGACAAACTCGCCAAACGGCACCAGATGGTTTTTGTTATAGCGATCGGCTGATTCGTAGCTGTACGGCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCaacgatgat > 1:1056271/1‑282 (MQ=255)
tAACGGACGCAGAATCGACTCCAGCGGGACAAACTCGCCAAACGGCACCAGATGGTTTTTGTTATAGCGATCGGCTGATTCGTAGCTGTACGGCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCaacgatgatttg < 1:1734470/289‑11 (MQ=255)
tAACCGACGCAGAATCGACTCCAGCGGGACAAACTCGCCAAACGGCACCAGATGGTTTTTGTTATGGCGATCGCCTGATTCGTAGCTGTACGGCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCaacgatgatttg < 2:481559/289‑11 (MQ=255)
gacgccAGCGGGACAAACTCGCCAAACGGCACCGGATGGTTTTTGTTATAGCGATCGGCTGATTCGTAGCTGTACGGCGCGCCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCcg < 1:1872627/285‑1 (MQ=255)
ctcCAGCGGGACAAACTCGCCAAACGGCACCAGATGGTTTTTGTTATAGCGATCGGCTGATTCGTAGCTGTACGGCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCcgtt < 1:437514/289‑1 (MQ=255)
ccccgggcggACGAACTAGCCAACCGGTACCAGATGGTTGTTGTTATAGCGTTCGGATGATTCGTAGCTGTACGGCGCAGCTTTACCCGGCGTGATGATGGTGTTGTATGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCcgtt < 2:1452599/281‑1 (MQ=255)
cAAACTCGCCAAACGGCACCAGATGGTTTTTGTTATAGCGATCGGCTGATTCGTAGCTGTACGGCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTgtagt < 1:1647992/288‑1 (MQ=255)
ccAAACGGCACCAGCTGGTTTTTGTTATAGCGATCGGCTGATTCGTAGCTGTACGGCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGCTAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCcg > 2:1184995/1‑268 (MQ=255)
ccAAACGGCACCAGATGGTTTTTGTTATAGCGATCGGCTGATTCGTAGCTGTACGGCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCa < 1:1500133/289‑1 (MQ=255)
cAACCGGAACCAGATGGTTTTTGTTATCGCGATCGGCTGATTCGTAGCTGTACGGCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCa < 1:1148952/288‑1 (MQ=255)
cAAACGGCACCAGATGGTTTTTGTTATAGCGATCGGCTGATTCGTAGCTGTACGGCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCa < 2:707872/288‑1 (MQ=255)
cAAACGGCACCAGATGGTTTTTGTTATAGCGATCGGCTGATTCGTAGCTGTACGGCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCa < 1:1635644/288‑1 (MQ=255)
tttttGTTATAGCGATCGGCTGATTCGTAGCTGTACGGCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTgg > 1:385511/1‑288 (MQ=255)
atcggctgattCGTAGCTGTACGGCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTgtag < 2:114085/238‑1 (MQ=255)
atcggctgattCGTAGCTGTACGGCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTaa > 2:454821/10‑250 (MQ=255)
ctgattCGTAGCTGTACGGCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTTAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTGAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAgcga > 1:903820/5‑286 (MQ=255)
tgattCGTAGCTGTACGGCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAgcga < 1:958800/285‑4 (MQ=255)
tCGTGGCTGTACGGCGAACCTTTACCCCGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAgcgattgcg < 2:1339265/289‑9 (MQ=255)
tCGTAGGTGTACGGCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGGTTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAgcgattgcg < 2:1814634/289‑9 (MQ=255)
gCTGTACGGCTCCCCTTTACCCGGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGCGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCCACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCCGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAata < 2:893666/289‑1 (MQ=255)
tGTACGGCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAata < 1:124069/287‑1 (MQ=255)
tGTACGGCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAata < 1:1580752/287‑1 (MQ=255)
ttACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCAtcg > 2:1515549/1‑287 (MQ=255)
tACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCAtcga < 2:1868233/289‑4 (MQ=255)
cccAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCAtcgaa > 1:77809/1‑284 (MQ=255)
cGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGa > 2:827954/1‑289 (MQ=255)
gTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTCACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGaa < 1:1098983/289‑1 (MQ=255)
tgatgaTGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAAt > 1:215627/1‑289 (MQ=255)
gtgtTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTtc > 1:481482/1‑288 (MQ=255)
gtgtTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTtc > 1:1026829/1‑288 (MQ=255)
gttgtGGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGCGCCGCGCGTCGACAATCCAGGTTACCGGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCGCCGTCCCGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTtctc < 2:1051690/288‑1 (MQ=255)
gttgtAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTtctc < 2:1469798/288‑1 (MQ=255)
gttgtAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTtctc < 1:1376150/288‑1 (MQ=255)
ttgtAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCg > 1:1001200/1‑289 (MQ=255)
ttgtAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTAGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCTTCGAAACCTGAATGCTTTtctcgg > 2:1727685/1‑287 (MQ=255)
ttgtAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACAGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCg > 2:960076/1‑289 (MQ=255)
tAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGtt < 2:385511/289‑1 (MQ=255)
aGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTtg < 1:948401/289‑1 (MQ=255)
aTCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTTAATGGTTTTCTCCGGTTGTggg > 1:248256/1‑289 (MQ=255)
aTCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTggg > 1:278970/1‑289 (MQ=255)
aTCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTggg > 2:57588/1‑289 (MQ=255)
aTCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTCCTCCGGTTGTggg > 1:726568/1‑289 (MQ=255)
cGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCTATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAATCTGCATTGTTTTCGCCTGTTGTGGGGt > 2:493087/1‑289 (MQ=255)
cGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGt > 1:817611/1‑289 (MQ=255)
tgtacGGGTCTGGTTATTGGGGCGCGCGTCGACACTCCCCGGTTCCAGCGAGCTACCTTTATCACCGAAATCCACGGTCAGGGCCTTGGGGGACAGTTGATGATTAATTTTCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTa < 2:786866/285‑1 (MQ=255)
gTAGCGGTTCTGCTTTTTGAGACCCGCGTCGACGATCCCGGTTCCCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTa < 2:588599/289‑1 (MQ=255)
cgCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTaaa < 1:262907/288‑1 (MQ=255)
aGCGGTTCTGCTTATTGGGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTaa < 2:352698/288‑1 (MQ=255)
aGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTaaa > 1:1705798/1‑289 (MQ=255)
aGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTaa > 1:887321/1‑288 (MQ=255)
ggTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGACCCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAAcc > 1:1717252/1‑288 (MQ=255)
ggTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCa < 1:113982/289‑1 (MQ=255)
gTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAAcc > 1:524153/1‑287 (MQ=255)
gTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCa > 2:730459/1‑288 (MQ=255)
ttgtGCTTATTGAACCCCGCCTCGCCAACCCCGGTTCCCAGGTGGCTTCCTTTATCCCGCAACTCACCGTCCAGGTCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACt < 2:1354146/286‑1 (MQ=255)
cTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCt < 1:364908/200‑1 (MQ=255)
cTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCt > 2:364908/1‑200 (MQ=255)
cTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGCTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCCTTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAAACATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTTTGGGGTACACCACTgg > 1:712360/1‑289 (MQ=255)
aTTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACt < 2:156377/281‑1 (MQ=255)
aTTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACt > 1:156377/1‑281 (MQ=255)
aCGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGCATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGGGGGGAAAACCACTGGATGTAAagcagc > 2:64829/1‑289 (MQ=255)
aCGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGCATATCGCACTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGCGGTAAACCCTTGGATGTAACGCAGc > 2:1266169/1‑289 (MQ=255)
cgcgcgTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGTTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGGATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCAGTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTGTCTTCGGTTGTTGTGTAAACCCCTTGATGTAACGCAGCg > 2:519210/1‑289 (MQ=255)
cgcgcgTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCg > 1:1188693/1‑289 (MQ=255)
cgcgcgTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAAATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGc < 2:236827/288‑1 (MQ=255)
cgcgTCGACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCggg > 1:313463/1‑289 (MQ=255)
cgtgcaCAATCCCGGTTACCAGCGCGCTCCCTTTATAACCCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCgggaa < 2:817611/284‑1 (MQ=255)
gACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCgggaaggga < 2:1082414/289‑1 (MQ=255)
gACAATCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCgggaaggga < 1:996221/289‑1 (MQ=255)
tCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGACCCATCGAAACCTGAATGGTTCTCCCCGGTTGTGGGGTAACCCAATGGACGTAACGCCGCGGGAagggcagggc > 2:1415327/1‑289 (MQ=255)
tCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGc > 1:661138/1‑289 (MQ=255)
tCCCGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGc > 1:415123/1‑289 (MQ=255)
ccGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGCaa > 1:329433/1‑289 (MQ=255)
ccGGTTACCAGCGAGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGCaa > 1:1789188/1‑289 (MQ=255)
taccagcgagctACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTtg < 1:542147/231‑1 (MQ=255)
taccagcgagctACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTtg > 2:542147/10‑240 (MQ=255)
gagctACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGCAAACAGCacga < 1:1310155/284‑1 (MQ=255)
gagctACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGCAAACAGCacga < 1:1347812/284‑1 (MQ=255)
ccTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCCGCGGGAAGGGAAGGGCAAACAGCACGACGGccacc > 1:220293/1‑288 (MQ=255)
gCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCGCCGGTTGTGGGGTAAACCAATGAATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGCAAACAGCACGCCGGCGCCCCCCAGCGGag > 2:1710014/1‑287 (MQ=255)
cAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGCAAACAGCACACCGGCACCCACCACCGGACg > 2:1620849/1‑288 (MQ=255)
cTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGCAAACAGCACGACGGCCACCACCAGCGGACGCCAg > 1:575844/1‑289 (MQ=255)
aCCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGCAAACAGCACGACGGCCACCACCAGCGGACGCCAGtt > 1:304553/1‑288 (MQ=255)
cGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGCAAACAGCACGACGGCCACCACCAGCGGACGCCAGTTGCg > 2:194114/1‑289 (MQ=255)
aGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAACTCTTCAGCGTATTAAGACGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATCTCGACCTGAACCATCGAAACCGTACTGGTTTTCTTCGGTTGTGGGGTACACCACTGGATGTCACCCAACGGGAAGGGAAGGGACAACAGCACGACGGCCACCACCAGCGTACGCCAGtcgtgcgtg > 2:1769823/1‑280 (MQ=255)
aGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCCAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGCAGGGCCAACAGCACGCCGGCCACCACCGGCGGACCCCCGTTGCGttcg > 2:995223/1‑286 (MQ=255)
ttcaGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCGGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCCGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTGAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCGGCGATGGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGCAAACAGCACGACGGCCACCACCAGCGGACGCCAGTTGCGTTTGACCAACg < 2:275577/286‑1 (MQ=255)
tGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGCAAACAGCACGACGGCCACCACCAGCGGACGCCAGTTGCGTTTGACCAACg > 1:1458317/1‑288 (MQ=255)
gAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGCAAACAGCACGACGGCCACCACCAGCGGACGCCAGTTGCGTTTGACCAACGcc < 1:1684548/289‑1 (MQ=255)
cGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACt < 2:170180/203‑1 (MQ=255)
ggTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGCCAACAGCCAGACGCGCACCACCAGCGGACGCCAGTTGCGTTGGACCAACGCCAGTGTca > 2:1019449/1‑289 (MQ=255)
tGCTGATTAATTTCCAGTTCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGCAAACAGCACGACGGCCACCACCAGCGGACGCCAGTTGCGTTTGACCAACGCCAGTGCcagca < 1:1809140/289‑1 (MQ=255)
tGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGCAAACAGCACGACGGCCACCACCAGCGGACGCCAGTTGCGTTTGACCAACGCCAGTGCcagca < 1:1355108/289‑1 (MQ=255)
tGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAAGCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGCAAACAGCACGACGGCCACCACCAGCGGACGCCAGTTGCGTTTGACCAACGCCAGTGCcagca < 2:1297488/289‑1 (MQ=255)
ttAATTTCCAGATCGGTTTTCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTTAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGCAAACAGCACGACGGCCACCACCAGCGGACGCCAGTTGCGTTTGACCAACGCCAGTGCCAGCAGGCCAc < 1:580361/289‑1 (MQ=255)
ttAATTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGCAAACAGCACGACGGCCACCACCAGCGGACGCCAGTTGCGTTTGACCAACGCCAGTGCCAGCAGGCCa < 1:1168014/288‑1 (MQ=255)
aTTTCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGCAAACAGCACGACGGCCACCACCAGCGGACGCCAGTTGCGTTTGACCAACGCCAGTGCCAGCAGGCCACTaa < 1:1261191/289‑1 (MQ=255)
ttCCAGATCGGTTATCGCCGACTCCGGCCAGATAATCAACGATGATTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGCGATTGCGGAATATCGCCCTGAACCATCGAAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGCAAACAGCACGACGGCCACCACCAGCGGACGCCAGTTGCGTTTGACCAACGCCAGTGCCAGCAGGCCACTAAcc < 2:313463/289‑1 (MQ=255)
|||
TCGGCAGATCAAAGAACGGTGCTAACGGACGCAGAATGCTCTCCAGCGGGACAAACTCGCCAAACGGCACCAGATGGTTTTTGTTATAGCGATCGGCACTTTCGTAGCTGTACGGCGCACCTTTACCCAGCGTGATGATGGTGTTGTAGGTATCGTAGCGGTTCTGCTTATTGAGACGCGCGTCGACAATCCCGGTTACCAGGCTGCTACCTTTATCACGCAACTCACCGTCCAGTGCTTTGAGGAACGGTTGCTGATTAATTTCCAGATCGGTTATCGCGCTCTCCGGCCAGATAATCAAGCTACTTTTGCCCATCAGCGGTGCCGTTGCGTTGTAGTAAATCTTCAGCGTATTAAGAAGCTGGCCTTCGTCCCATTTCAGGCTTTGCGGAATATCGCCCTGAACCATGCTAACCTGAATGGTTTTCTCCGGTTGTGGGGTAAACCACTGGATGTAACGCAGCGGGAAGGGAAGGGCAAACAGCACGACGGCCACCACCAGCGGACGCCAGTTGCGTTTGACCAACGCCAGTGCCAGCAGGCCACTAACCATCATCAGCA > CP042583/562230‑562790
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A