Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F210 I1 R1
|
4930 |
262.8 |
3829204 |
96.6% |
3699011 |
272.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
625,953 |
3 bp→TCA |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 625,953 | 0 | A | T | 99.6%
| 664.4
/ NA
| 281 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (165/115); minor base G (1/0); total (166/115) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 625,954 | 0 | G | C | 99.6%
| 660.0
/ NA
| 281 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (166/113); total (166/115) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.07e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 625,955 | 0 | T | A | 99.6%
| 666.1
/ NA
| 281 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base A (165/114); total (166/115) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 |
Only 100 of 281 total aligned reads displayed.
CCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTAGTAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGTCGTGTGGTCTTTATGGCCTCCACCGA > CP042583/625677‑626230
|||
ccaccaATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGt > 1:599427/1‑288 (MQ=255)
ccaccaATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGt > 2:360483/1‑288 (MQ=255)
ccaccaATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGt > 2:1424250/1‑288 (MQ=255)
accaATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGcc < 1:274516/289‑1 (MQ=255)
gTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCg < 1:1803167/289‑1 (MQ=255)
ggTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTgg > 1:1501172/1‑289 (MQ=255)
gTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTggg > 2:482843/1‑289 (MQ=255)
gTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGCCCGTggg > 2:1408969/1‑289 (MQ=255)
gggAGAAGGCGCAAGCGGCGCAGCCGACAAGCGATGACTGATTTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGGGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAAAGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGAAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGt < 2:529022/287‑1 (MQ=255)
cGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCAGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTa > 2:1479978/1‑289 (MQ=255)
cGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGGTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGCACAGCACACATGAACTTACATGAATATCATGCAAAACAAGTTTTTGCACGATATGGCTTCCCAGCACCGGTGGGTGATGCATGTACTACTCCGCGCGAAGAAGCAGAAGACGCTTCTAAAATTGGTGCCCTTCCGGGGGtc > 2:1557406/1‑288 (MQ=255)
aTAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGc < 1:541214/273‑1 (MQ=255)
aGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGt < 2:1501852/285‑1 (MQ=255)
aGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAgg > 1:482586/1‑289 (MQ=255)
cAAGCGATGCCTGTGTTGACGTTTAACATGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGGCAATGCCCGGAAGGGATACGAAAGATTCGGTCTAAGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTCCATGAATATCAGGCAAAACAACTGTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGGACTACGCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGTCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGc < 2:841365/289‑1 (MQ=255)
aTGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGTTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAACCGGTGCCGGTCAGTGGGTAGTGAAATGGCAGGTTAACGCTGGTGGCCGCGGt > 2:231616/1‑289 (MQ=255)
gCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTaa > 2:168127/1‑289 (MQ=255)
aTGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAgcgg > 1:995933/1‑289 (MQ=255)
aTGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAgcgg > 1:69572/1‑289 (MQ=255)
tgtgACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAgcggg < 1:1424250/289‑1 (MQ=255)
gtgACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAgcggg < 2:714554/288‑1 (MQ=255)
tataCGTGTATTATAAGGCCTACGGGTGAACGACAAGGACCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGa < 2:813685/286‑1 (MQ=255)
tACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAaagaa > 1:12922/1‑289 (MQ=255)
tACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAaagaa > 1:584162/1‑289 (MQ=255)
cGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGTACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGTAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAagaaga > 1:878852/1‑289 (MQ=255)
cGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAaagaag > 1:1111634/1‑288 (MQ=255)
gACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATcc > 1:1761550/1‑289 (MQ=255)
aCCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCg > 1:1192465/1‑289 (MQ=255)
aCCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGGGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCg > 1:711760/1‑289 (MQ=255)
aTGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCtttt > 1:83180/1‑289 (MQ=255)
tGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTg < 1:1730963/289‑1 (MQ=255)
tGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAAAGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGACCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCAGCTTCAAAAATCGGCGCCGGTCCGTGGGTAGTGCAAGGTCCGGTTCACGCTGGTGGACGCGGGAAAGCGGGCGGCGGGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCGGTGCtttt > 2:1269683/1‑288 (MQ=255)
cGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCCGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGAGGCGTGAAAGTTGTAAACAGACAAGAAGACTTCCGTGCTTTTGCAgt > 2:1242891/1‑288 (MQ=255)
gATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAActgg < 1:1750277/289‑1 (MQ=255)
tACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAActg > 2:937822/1‑286 (MQ=255)
aCGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTaaa < 1:1283310/249‑1 (MQ=255)
aaaGATTCGGTCTACGGTGTAAAAGATAACGATTCCTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCCAAACAACTTATTGCTCGCTATGGCTTACCAGCACCGGGGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGc < 2:1906328/289‑1 (MQ=255)
aaaatTCGGTTAACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATAAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGc < 2:1897891/285‑1 (MQ=255)
tatTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGATGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCaa > 1:1778264/1‑288 (MQ=255)
tCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCCATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCCGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGGGACATGTCCGGGTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGGGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCGCGGCCTGTGGCGAAAActggcgaggggagcg > 2:922370/1‑278 (MQ=255)
tACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTa > 2:385586/1‑289 (MQ=255)
aaaaGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAgcggg < 1:841938/208‑1 (MQ=255)
aaaaGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGAGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCAGCGGTAAAGCGGTCGGTGTGACAGTTGTAAACAGACAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGTCAAGCGTCTGGtctatctcgt > 2:1591546/1‑280 (MQ=255)
aaGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAgcggg < 2:1008500/206‑1 (MQ=255)
aaGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAgcggg > 1:1366928/1‑206 (MQ=255)
aaGATAACGAATACAGAAGGATTGACAAAAACCCTGAAATTACATAAATATCAGGCAAAACAACTGTTTGCCCGCTAGGGCTAACCAGCACCGGTGGGTTAGGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCaaa < 2:1761550/289‑1 (MQ=255)
aaCGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGAt > 1:38977/1‑289 (MQ=255)
aTTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAACATAGGTGCCGGTCCGTGGGTAGGGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTAGCCGCGGTAAGGCGGGCGGGGTGAAGGTTGTAAACAGCAAAGAAGAAACCCGTCCTTTTGCAGAACACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTAGCAAACAGATGCCa > 2:1333397/1‑289 (MQ=255)
aCTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATg < 1:937822/289‑1 (MQ=255)
ggATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCaa > 1:1826514/1‑288 (MQ=255)
tGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCgg > 1:688488/1‑289 (MQ=255)
ggACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGt < 1:1235397/289‑1 (MQ=255)
gACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTa < 2:706522/256‑1 (MQ=255)
gACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGATGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGt < 2:1778264/288‑1 (MQ=255)
aCAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGCGCTTTTGCAGAAACCTGGATGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTa > 1:1013286/1‑289 (MQ=255)
aGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGTCCAACCGGTTaa > 2:69478/1‑288 (MQ=255)
aCATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGaa > 1:1563888/1‑289 (MQ=255)
tGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAagca < 1:360483/289‑1 (MQ=255)
aaTATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAagcagc > 1:100389/1‑289 (MQ=255)
atCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGAc < 1:78702/289‑1 (MQ=255)
cAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCg > 2:205430/1‑289 (MQ=255)
aGGCAAAAGAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGAACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGa < 2:438493/289‑1 (MQ=255)
cAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGa < 2:12922/286‑1 (MQ=255)
aaaaCAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGatat < 2:1076011/288‑1 (MQ=255)
aaaaCAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGatat < 2:587270/288‑1 (MQ=255)
aacaacTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCg > 1:41947/1‑288 (MQ=255)
aacTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTaa < 1:225980/289‑1 (MQ=255)
aacTTGTGGCCCGCTATGGCTGACCCGCAACGGTGGGTTATGCCTGGACTGCTCCGCGGGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAGTCGGGGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTaa < 2:599427/289‑1 (MQ=255)
ttttGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAagag < 2:54185/289‑1 (MQ=255)
tGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATAACGCTAAaga > 2:1574394/1‑285 (MQ=255)
gCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGt < 1:1457720/289‑1 (MQ=255)
ggCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTg < 1:170999/289‑1 (MQ=255)
gCTTACCAGGACCGGTGGGTTATGCCTGTACTCCTCGGGGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTg < 2:1192465/288‑1 (MQ=255)
ttACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCg < 1:1574394/289‑1 (MQ=255)
aCCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGAtt < 2:1722821/232‑1 (MQ=255)
aCCGGGTGGTTATGCCTGTGCTAGTGCGGGCGAAGCAGAGGGAGCCGCTTAGAGAATCGGGGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAGTGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGGGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACAGCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCgttgtt < 2:1826514/286‑1 (MQ=255)
cGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCg > 1:1592597/1‑289 (MQ=255)
ggTGGGTTATGCCTGTACTAATCCGCGAGAAGCAGAAGGAGCCGCGTCAAAAATCGGGGCCGGTCCGTGGGAAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGTCCGCAGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACAGCCGTGCTTTTGCAGAAATCTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGt < 2:1111634/289‑1 (MQ=255)
gTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAagca < 1:885453/240‑1 (MQ=255)
gTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGGGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGATAAAGAGCTGTATCTCGGTTCGGTGGTTGaaggta > 1:921933/1‑284 (MQ=255)
tATGCCTGTACTACCCGGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTccc < 1:196193/289‑1 (MQ=255)
gTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTTCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGGATCTCGGTTGCGTTGTTGACCGGAGTTCCcgtcgttc > 2:644992/1‑287 (MQ=255)
gTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGTCgtgt < 1:1479978/289‑1 (MQ=255)
tactacTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAAACGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATCTAGCTAAAGAGCTGTATGTCGGAGACGGTTTTGCACGTAGTTCGTGTCgggtt > 2:760509/1‑288 (MQ=255)
tactacTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGGGCAAGTTGTAAACATCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCAGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTACATCTCGGTGCCGTTGTTGACAGTAGTTCCCGTCGtgtg > 2:1348680/1‑289 (MQ=255)
actCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGTCGTGTGGTCt > 1:505026/1‑289 (MQ=255)
actCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTAGCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAATTCCCGTCGTTGGGTCt > 2:844095/1‑289 (MQ=255)
ctCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCCCGGTGCCGTTGTTGACCGGAGTTCCCGTAGTGTGGTCtt > 2:1368673/1‑289 (MQ=255)
ctCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCCACCGATATCGCCAAAGAGCTGCATCCCGGTGCCCTGGTTGACCGTAGTTCCCGCCGGGTGCTCtt > 2:1664567/1‑289 (MQ=255)
tCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGGCGTTGGGTtttt > 2:874796/1‑289 (MQ=255)
cgcgcgAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGTCGtgtg > 2:880502/1‑281 (MQ=255)
cgcgAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTa > 1:21113/1‑162 (MQ=255)
cgcgAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGTCGTGTGGTCTTTATg > 1:1671950/1‑288 (MQ=255)
cgcgAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGTCGTGTGGTCTTTATg > 1:1052192/1‑288 (MQ=255)
cgcgAAGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTACCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGTCGTGTGGTCTTTATg > 1:95638/1‑288 (MQ=255)
ggAAGCAGGAGGAGGCGCTTCAAAAATCGGGGCCGGTGCTTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGTGGTGGAAGTTGTAAACAGCGAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGTGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTAGACCGTAGTTCCCGTCGTGTGGTCTTTATGGc < 2:1173800/287‑1 (MQ=255)
aaGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGTCGTGTGGTCTTTATGGCCt < 1:495656/288‑1 (MQ=255)
aaGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGTCGTGTGGTCTTTATGGCCt < 1:1898/288‑1 (MQ=255)
aGCAGAAGAAGCCGCTTCAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCa > 1:1334056/1‑183 (MQ=255)
agaagCCGCTTGAAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTTTAAACAGCAAAGAAGACATCCTTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAATCGGTTAACCAGATGCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGTCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGTCGTGTGGTCTTTATGGCCTCCACCg < 1:140764/287‑1 (MQ=255)
|||
CCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCGGTCTACGGTTTAAAAGATAACGATTACTGAAGGATGGACAGAACACATGAACTTACATGAATATCAGGCAAAACAACTTTTTGCCCGCTATGGCTTACCAGCACCGGTGGGTTATGCCTGTACTACTCCGCGCGAAGCAGAAGAAGCCGCTAGTAAAATCGGTGCCGGTCCGTGGGTAGTGAAATGTCAGGTTCACGCTGGTGGCCGCGGTAAAGCGGGCGGTGTGAAAGTTGTAAACAGCAAAGAAGACATCCGTGCTTTTGCAGAAAACTGGCTGGGCAAGCGTCTGGTAACGTATCAAACAGATGCCAATGGCCAACCGGTTAACCAGATTCTGGTTGAAGCAGCGACCGATATCGCTAAAGAGCTGTATCTCGGTGCCGTTGTTGACCGTAGTTCCCGTCGTGTGGTCTTTATGGCCTCCACCGA > CP042583/625677‑626230
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
