Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F210 I1 R1
|
4929 |
268.4 |
3907572 |
96.3% |
3762991 |
273.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
790,950 |
3 bp→TGA |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 790,950 | 0 | A | T | 100.0%
| 696.8
/ NA
| 292 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (148/144); total (148/144) |
| * | CP042583 | 790,951 | 0 | C | G | 99.7%
| 687.2
/ NA
| 292 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (146/144); total (148/144) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 790,952 | 0 | T | A | 99.7%
| 684.8
/ NA
| 292 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (148/142); minor base G (0/1); total (148/144) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.91e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
GCGTCCGCCTTCACCTAACCAACTGTTGAGACCTGCATCCTCGAGCAGCTTTTCCAGGCCAACGCGACGCAAGATCTCGCTCAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGGCTGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTACTTTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGGCTAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGTTACTGGTGCCAGTGCTTCAAACGCGGCTAAC > CP042583/790671‑791229
|||
cGCCTTCACCTAACCAACTGTTGAGACCTGCATCCTCGAGCAGCTTTTCCAGGCCAACGCGACGCAAGATCTCCGACAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTGGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATcc > 1:1643076/1‑289 (MQ=255)
aCCAACTGTTGAGACCTGCATCCTCGAGCAGCTTTTCCAGGCCAACGCGACGCAAGATCTCCGACAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTTTTCATTTGCCTCCTCCGGTTCGCCCgag > 2:1812500/1‑289 (MQ=255)
aCCAACTGTTGAGACCTGCATCCTCGAGCAGCTTTTCCAGGCCAACGCGACGCAAGATCTCCGACAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCgag > 2:1177947/1‑289 (MQ=255)
accaCTGTTGAGACCTGCATCCTCGAGCAGCTTTGCCAGGCCAACGCGACGCAAGATCTCCGACCGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCgaga < 2:656354/286‑1 (MQ=255)
cAACTGTTGAGACCTGCATCCTCGAGCAGCTTTTCCAGGCCAACGCGACGCAAGATCTCCGACAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGaa < 2:546426/289‑1 (MQ=255)
cTGTTGAGACCTGCATCCTCGAGCAGCTTTTCCAGGCCAACGCGACGCAAGATCTCCGACAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATc > 2:1920350/1‑288 (MQ=255)
gagaCCTGCATCCTCGAGCAGCTTTTCCAGGCCAACGCGACGCAAGATCTCCGACAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCtata > 2:1149794/1‑289 (MQ=255)
agaCCTGCATCCTCGAGCAGCTTTTCCAGGCCAACGCGACGCAAGATCTCCGACAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTatat > 1:1032769/1‑289 (MQ=255)
gaCCTGCATCCTCGAGCAGCGTTGCCAGGCCAACGCGAAGCAAGATCTCCGACAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTatat < 2:1057116/288‑1 (MQ=255)
tGCATCCTCGAGCAGCTTTTCCAGGCCAACGCGACGCAAGATCTCCGACAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTc > 2:1357929/1‑288 (MQ=255)
tgttcccggggcagcTTTCCCCTGCCAAAGGAGCGGAAGATCTACGTCAGGGCCTCATCAGTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCGGCGTGGCGCTAAACCGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGTGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTccc < 2:313083/279‑1 (MQ=255)
gCATCCTCGAGCAGCTTTTCCAGGCCAACGCGACGCAAGATCTCCGACAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTccc < 2:872313/289‑1 (MQ=255)
gCATCCTCGAGCAGCTTTCCAAGGCCAACGCGACGCAAGATCTCCGACAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTccc < 1:788458/289‑1 (MQ=255)
cATCCTCGAGCAGCTTTTCCAGGCCAACGCGACGCAAGATCTCCGACAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCTCATCCGGTTCGCCCGAGAAGCGCCATATGTTaccc > 2:1241295/1‑289 (MQ=255)
cATCCTCGAGCAGCTTTTCCAGGCCAACGCGACGCAAGATCTCCGACAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTccc > 2:745438/1‑288 (MQ=255)
tCGAGCAGCTTTTCCAGGCCAACGCGACGCAAGATCTCCGACAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGt > 1:985767/1‑289 (MQ=255)
cGAGCAGCTTTTCCAGGCCAACGCGACGCAAGATCTCCGACAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGtt < 1:1531613/289‑1 (MQ=255)
agctggtCCAGGCCACCGCGACGACAGCACTCCTACCGCGGCTCAGCACTACTGACAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCGAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCGTCGTTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTGAGCAAAATCTCGCCATGTTGCGGGTGCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATACGGTTCACGCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTAc < 2:342243/281‑1 (MQ=255)
agcTTTTCCAGGCCAACGCGACGCAAGATCTCCGACAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTAc < 1:1338045/287‑1 (MQ=255)
ccAACGCGACGCAAGATCTCCGACAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAGTCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATc > 1:1000388/1‑288 (MQ=255)
ccAACGCGACGCAAGATCTCCGACAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAAt < 1:1036048/287‑1 (MQ=255)
cgcgACGCAAGATCTCCGACAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCttt > 1:202201/1‑289 (MQ=255)
cGCCAGATCTCACACAGAGCCTCAGCACGACTGCCAGGCGAGGCGCGTAAAAGATTATCACGCCGCGTGGCGCTCAAGAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGt < 2:1696361/288‑1 (MQ=255)
gaaaGATCTCCCACAGGGCCTCATCACCACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGATGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGc < 2:1396866/287‑1 (MQ=255)
gCAAGATCTCCGACAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGc < 1:576309/289‑1 (MQ=255)
cAAGATCTCCGACAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGcc < 2:808902/289‑1 (MQ=255)
ccgacAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTgaga < 1:422581/285‑1 (MQ=255)
cagacAGAGCCTCATCACTACTGCAAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGTTGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTgaga < 1:1696542/285‑1 (MQ=255)
cgacAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑t < 1:1723675/286‑1 (MQ=255)
cgacAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑t < 1:1177947/286‑1 (MQ=255)
agCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTTAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTcc > 2:1019685/1‑289 (MQ=255)
agCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTccc < 1:896982/239‑1 (MQ=255)
agCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTcc > 1:920620/1‑289 (MQ=255)
agCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTcc > 1:1201000/1‑289 (MQ=255)
agCCTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTcc > 1:301375/1‑289 (MQ=255)
gCCTCGTCACTACTGCCAGGCGGGGCGAGTAAACGATTATCACGCAGCGTTGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCt < 2:446245/286‑1 (MQ=255)
acatcatcaCTACTGCCAAGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTTGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCt < 1:1800977/283‑1 (MQ=255)
cTCATCACTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCg < 1:1256998/287‑1 (MQ=255)
atcaCTACTGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATaa > 2:1188941/1‑289 (MQ=255)
ctactGCCAGGCGAGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGt > 2:731032/1‑287 (MQ=255)
ctGCCAGGCGAGGCGCGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATACAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCTGGTTCGTCCGAGAATCGCTATATTGTCCCCGCGGTTTAGCTGACGAGAAATCCCTTTACGTGACTGTTGACAGTTGC‑CCGGATAAGtgaact > 2:1544535/1‑289 (MQ=255)
ccaggcgaggCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCCGCCGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCCTCCGGTTCGCCCGAGAATCGCCATACGTTCCCCGCCCTGTACCTGCAGCTAAATCCCTTTAAGGGTCTGTTGCGA‑TCGCCCCGGATAAGcgacgcta > 2:1098854/9‑283 (MQ=255)
caggcgaggCGAGTAAAGGATTATCCCGCCGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGtgaactgaa < 2:920620/281‑1 (MQ=255)
aggcgaggCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACa > 1:1081385/7‑289 (MQ=255)
aggCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCGGTTGAGA‑TTGCTCCGGATACGTGAACGGAACATCCCg > 2:1414150/2‑289 (MQ=255)
ggCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCt > 1:658620/1‑263 (MQ=255)
tATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAgcgaaa > 2:1936454/1‑283 (MQ=255)
gggagtAAACCGGTGCAATCGCTGACGAACAACGCTGTTGGTCTGTCGGAGAGCCGCTGCATTCAGGCTGGCTAAGGGGCTATAGTTCAGCAAACTCGCGCCCGGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGGACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAac < 2:244910/283‑1 (MQ=255)
aaaCAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGtt < 1:192482/289‑1 (MQ=255)
aaaCAGATGCACTCGATGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGtt < 1:1308128/289‑1 (MQ=255)
aaCAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGttt > 1:1944958/1‑289 (MQ=255)
aaCAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCGTCATTCAGGCGGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGCGTTTATCTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGACGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCTGTATAAGTGAACTGAACATCGCGTAACGGCATCGACACGCGATCGGCAACACGAGttc > 2:1522374/1‑288 (MQ=255)
aaCAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGATCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGttt > 1:736414/1‑289 (MQ=255)
aCAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTg < 1:1920350/289‑1 (MQ=255)
aTGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATGGGCAACACGAGTTTGGGTa > 1:365851/1‑289 (MQ=255)
aTGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTa > 2:146053/1‑289 (MQ=255)
tGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTgg < 1:158046/285‑1 (MQ=255)
tGCACTCGCTGAGGAAAAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGt < 1:635969/287‑1 (MQ=255)
cTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGC‑TTGCTTCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAACCGTGAGCCGCAACACGAGGTTGGGTATCAgg > 2:1792413/1‑289 (MQ=255)
aGGAAAAAAGCTGTTGTTCTGGCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGt < 2:1440629/288‑1 (MQ=255)
cGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACAt > 1:1212713/1‑225 (MQ=255)
aTGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGttttt > 1:399079/1‑289 (MQ=255)
gTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGa < 1:1876771/288‑1 (MQ=255)
tCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCTGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCt < 2:1891272/133‑1 (MQ=255)
cGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCGGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCACATGCTCGCCCCGGTGCGTGTACCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACTGTGTTGATTTGCCGCCTCCGGTTCACACGAGAATAGCTATATGTTCCCTGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGGTCCGGATAAGTGAACTGATCATCCCGTAACGTAAGCGAAACGCGATCGGAAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGtt < 2:159167/288‑1 (MQ=255)
agggCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGt < 1:766121/286‑1 (MQ=255)
agagCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGt < 1:1907898/289‑1 (MQ=255)
ccGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTGTCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCaga > 1:729994/1‑289 (MQ=255)
cGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCagag < 2:1074633/289‑1 (MQ=255)
cGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCagag < 1:146053/289‑1 (MQ=255)
gCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCga > 2:1303417/1‑115 (MQ=255)
gCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAAt > 1:1517183/1‑155 (MQ=255)
gCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAAt > 1:937901/1‑155 (MQ=255)
gCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATACGTGAACTTAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCTATCGGCAACACGAGTTTGGGGATCAGGCAAGGGTACCTACGGTTTCTTATTCGTAAAGTCCgaga > 2:624158/1‑289 (MQ=255)
gCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGCGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCAgaga > 1:1134066/1‑289 (MQ=255)
gCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGt < 2:1856733/283‑1 (MQ=255)
gCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCAgaga > 1:129628/1‑289 (MQ=255)
cTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGCCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCg < 2:687927/276‑1 (MQ=255)
cTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGCCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCg > 1:687927/1‑276 (MQ=255)
ttcattcaGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCAGAGAt < 1:1844828/288‑1 (MQ=255)
tcattcaGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAac < 2:471345/230‑1 (MQ=255)
cattcaGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCAGAGAtacg < 2:200360/289‑1 (MQ=255)
ttcaGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTGTATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCAGAGAtacgta < 2:216492/289‑1 (MQ=255)
gctggctATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCAGAGATACGTACGGCa > 1:1405195/1‑289 (MQ=255)
gctggctATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCCCCCGAGCATCGCTATATGTTACCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCTGATAAGTGAATTGAACATCCAGTAACGTCAGCGACACGCGATCGGCAACACGAGTCTGCGTACCAGGAAAGGGGCCCCACGGTTTTTGATCCGTTACGTCATCAACCCGTACGGCa > 2:1641528/1‑289 (MQ=255)
gctATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCAGAGATACGTACGGCagag > 1:597539/1‑288 (MQ=255)
tATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACtt > 2:1325842/1‑288 (MQ=255)
aTCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTg > 1:1387053/1‑288 (MQ=255)
aaaTCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCAGGGATACTTACGGCAGAGGCAATGACTTTCCCCAGATGcgg > 2:36974/1‑287 (MQ=255)
ctcGCCCTGTTGCGGGTACCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAAt < 1:855308/289‑1 (MQ=255)
cGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGc < 1:110466/289‑1 (MQ=255)
gCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCa < 1:547816/289‑1 (MQ=255)
cccTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCa > 1:943442/1‑288 (MQ=255)
tGTTGCGGGTCCCAGGCGGGGTGCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTGGCCGCATCCGGTTCGCCCGGGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCg < 2:899602/289‑1 (MQ=255)
ttGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGa < 2:1257490/223‑1 (MQ=255)
ggTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCagag > 1:223549/1‑233 (MQ=255)
cgGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAaca < 2:954383/168‑1 (MQ=255)
cgGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGcccc < 1:1245575/252‑1 (MQ=255)
ggTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATGAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGCCTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGTTACTGGTCCCAGGGCTTCa > 1:502303/1‑289 (MQ=255)
gTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGTTACTGGTGCCAGTGCTTCaa > 1:1763876/1‑289 (MQ=255)
|||
GCGTCCGCCTTCACCTAACCAACTGTTGAGACCTGCATCCTCGAGCAGCTTTTCCAGGCCAACGCGACGCAAGATCTCGCTCAGAGCCTCATCACTACTGCCAGGGCTGGCGAGTAAAAGATTATCACGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTACTTTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGA‑TTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGGCTAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGTTACTGGTGCCAGTGCTTCAAACGCGGCTAAC > CP042583/790671‑791229
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A