Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F210 I1 R1
|
4929 |
268.4 |
3907572 |
96.3% |
3762991 |
273.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
819,800 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 819,800 | 0 | A | T | 99.6%
| 606.7
/ NA
| 255 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (124/130); total (125/130) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.90e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 819,801 | 0 | G | C | 100.0%
| 603.8
/ NA
| 255 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (125/130); total (125/130) |
| * | CP042583 | 819,802 | 0 | C | G | 100.0%
| 613.5
/ NA
| 255 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (125/130); total (125/130) |
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
CATGAAAATCACTTTAGTCGTACGGAAAGCGCGCAATAATACGGGTTTTATCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGAGCCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGAAGTGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGAGCAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATGGAGCTACGATTGCGTGGCG > CP042583/819524‑820079
|||
cATGAAAATCACTTTAGTCGTACGGAAAGCGCGCAATAATACGGGTTTTATCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGaa < 1:801061/288‑1 (MQ=255)
tGAAAATCACTTTAGTCGTACGGAAAGCGCGCAATAATACGGGTTTTATCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGtt > 1:1811726/1‑289 (MQ=255)
aaTCACTTTAGTCGTACGGAAAGCGCGCAATAATACGGGTTTTATCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTaa < 2:523826/289‑1 (MQ=255)
aCTTTAGTCGTACGGAAAGCGCGCAATAATACGGGTTTTATCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCAt > 1:1313440/1‑289 (MQ=255)
tgtgTCGTACGGAAAGCGCGAAATAAGACGGGTTTTATCTCAAATGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCt < 2:1395665/286‑1 (MQ=255)
gTACGGAAAGCGTGCAATAATACGGGTTTTATCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCt < 1:486674/289‑1 (MQ=255)
gTACGGAAAGCGCGCAATAATACGGGTTTTATCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCt < 2:1581641/289‑1 (MQ=255)
cgcAATAATACGGGTTTTATCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGatcagcggc > 1:587983/1‑281 (MQ=255)
cgcAATAATACGGGTTTTATCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGatcagcggc > 1:1512239/1‑281 (MQ=255)
aataatACGGGTTTTATCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCggg < 1:1171230/289‑1 (MQ=255)
taCGGGTTTTATCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGAtg < 2:1149893/289‑1 (MQ=255)
taCGGGTTTTATCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGAtg > 1:1337267/1‑289 (MQ=255)
gTTTTATCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCg > 1:645329/1‑289 (MQ=255)
gTTTTATCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCg > 1:1733021/1‑289 (MQ=255)
gTTTTATCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGACGCGGTTGGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGGGGCg > 1:615563/1‑289 (MQ=255)
tttATCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGtt < 2:93971/289‑1 (MQ=255)
aGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTatgatgat < 1:167013/289‑1 (MQ=255)
cgcTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGAtgt < 1:1000633/288‑1 (MQ=255)
aTCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGa < 2:166192/289‑1 (MQ=255)
tCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGAt < 2:199282/289‑1 (MQ=255)
gccgccATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTcc < 1:574606/289‑1 (MQ=255)
gccATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTATTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCgg < 1:1432048/289‑1 (MQ=255)
cATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATTACCGGAAGACGCGGTGTGCGGTAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGACCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTGTTATGATATTGGTCCGATTGTCCCGGt > 2:1006383/1‑288 (MQ=255)
gATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAATTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATc < 1:385154/289‑1 (MQ=255)
gATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATc < 2:1126349/289‑1 (MQ=255)
tGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGt < 2:1811726/289‑1 (MQ=255)
tGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTtta < 1:692303/289‑1 (MQ=255)
tGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTgg < 2:871609/289‑1 (MQ=255)
tGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTgg < 2:1313440/289‑1 (MQ=255)
tGCTATTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGGGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGGCGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTgg < 2:1890897/289‑1 (MQ=255)
gCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGc > 2:129318/1‑289 (MQ=255)
ttttAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGGGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCgt > 1:1451243/1‑289 (MQ=255)
ggATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTGGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTtata < 2:172810/289‑1 (MQ=255)
ggATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTtata < 1:1923390/289‑1 (MQ=255)
ggATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTtata < 2:645329/289‑1 (MQ=255)
gATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGTAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGGACGTATCGGTCTTATTTCTCTGGTgttgtttga > 2:583939/1‑285 (MQ=255)
aTAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTTCCGGTGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTTGCGTTGTTATAcc > 2:1557042/1‑289 (MQ=255)
cACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTgg < 1:1361016/289‑1 (MQ=255)
cACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTgg < 1:988769/289‑1 (MQ=255)
cGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTa < 1:1655510/289‑1 (MQ=255)
gTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGAt > 2:1412280/1‑236 (MQ=255)
gTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGAt < 1:1412280/236‑1 (MQ=255)
agatcctAAAAATTAAAGCTTTTGTTTCCCAACGTATGTCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGGAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCTGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAAtgtg < 2:314301/283‑1 (MQ=255)
agagCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTgg < 1:1585228/264‑1 (MQ=255)
gCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATTGCATTTGATAAAGTGCCGTTTGATTGCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGt < 2:571866/288‑1 (MQ=255)
cATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTg > 1:865569/1‑289 (MQ=255)
tAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGAt > 1:1500785/1‑289 (MQ=255)
tAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGAt > 2:1263834/1‑289 (MQ=255)
tAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGAt > 1:17783/1‑289 (MQ=255)
aaaaaTGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATg > 1:1297331/1‑289 (MQ=255)
aaTGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGgcg < 2:361147/289‑1 (MQ=255)
aaGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTg < 2:1505035/151‑1 (MQ=255)
ggCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGcc > 1:1753189/1‑263 (MQ=255)
tcCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGa < 2:1780829/289‑1 (MQ=255)
cACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACTTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAg < 2:123574/289‑1 (MQ=255)
tATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGTCGTTTTATGATGATGTGCCGTTGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGTGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGGTGGCGCTCGGTGaaaaagatgaaggactt > 2:45223/1‑277 (MQ=255)
tATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGt < 1:230838/257‑1 (MQ=255)
gCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTg < 2:490862/288‑1 (MQ=255)
cATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGa > 2:1710933/1‑289 (MQ=255)
ttGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAgg > 1:355500/1‑289 (MQ=255)
aGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAAt > 2:733439/1‑126 (MQ=255)
aGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCgg > 1:751961/1‑191 (MQ=255)
cTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGt < 1:274243/289‑1 (MQ=255)
tttGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGCTCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCa > 2:22661/1‑289 (MQ=255)
tttCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTtata < 1:1791043/213‑1 (MQ=255)
ccTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCg < 1:1881636/202‑1 (MQ=255)
ggCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATg > 2:175245/1‑289 (MQ=255)
aGTTGCCCTACGTAGTCTTGTTTCCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGAACGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAg < 2:1759217/289‑1 (MQ=255)
cACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATCCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGTGGAGCAGGGAGAAACGGGAGTATCTTCTGAGAGGCGAGCGGGTTCTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGc > 2:1493320/1‑289 (MQ=255)
cGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTggt < 1:1123263/289‑2 (MQ=255)
cGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTgg > 2:750750/1‑288 (MQ=255)
tAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGca < 2:540326/216‑1 (MQ=255)
tAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGca > 1:540326/1‑216 (MQ=255)
tAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTggtcg > 1:193592/1‑286 (MQ=255)
tCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAg > 1:1223621/1‑274 (MQ=255)
tCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTAGCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTTATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTGGTCATTATTGAAAATGGCGAGCTGGCCTgggcgaa > 2:271220/1‑283 (MQ=255)
tCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCATCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGTCGGGAGATGTGGCGTTTTATGTTGATGTGCAGATGGTCGCGGTACTTACCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGTCCAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAATGGCAGCCAGTTTTCATCATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTggtgacaa > 2:898137/1‑283 (MQ=255)
ataCCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCTCCTGGTAATGTGGTTGATGGCTCACAGTGAAAAATTGGAAGATCTTCTGTAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAAGTTGGGAgctgggctggtcgaacattgt > 2:1850843/1‑278 (MQ=255)
taCCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAAt < 1:1762409/289‑1 (MQ=255)
tttGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAAc > 1:448385/1‑288 (MQ=255)
tGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTatgatgat < 1:1717867/124‑1 (MQ=255)
tGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGt > 1:1541315/1‑150 (MQ=255)
tACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCaa > 2:687285/1‑289 (MQ=255)
cTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATg > 2:1360881/1‑253 (MQ=255)
gTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAg > 1:654487/1‑211 (MQ=255)
gTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATg > 1:1396149/1‑288 (MQ=255)
gTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGa > 2:1039364/1‑289 (MQ=255)
gTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCAGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTGCTGTAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATg > 2:1458512/1‑288 (MQ=255)
tttGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGaa > 1:1288326/1‑289 (MQ=255)
gTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAAttt < 1:29938/289‑1 (MQ=255)
tacTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGa < 1:1850843/287‑1 (MQ=255)
tCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGt < 2:1471502/115‑1 (MQ=255)
aTGATCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTa < 1:73497/289‑1 (MQ=255)
aTGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTa < 1:1710933/289‑1 (MQ=255)
ccGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTAATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACt > 1:1010510/1‑258 (MQ=255)
cgcgGTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCCCAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATGGAGCTACGAt > 1:394457/1‑289 (MQ=255)
ggTGTGCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATGGAGCTACGATTgc > 2:1735591/1‑289 (MQ=255)
gtgCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATGGAGCTACGATTgcgtg > 1:11903/1‑289 (MQ=255)
gtgCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATGGAGCTACGATTgcgtg < 2:394457/289‑1 (MQ=255)
gtgCGGCAGATGTCGCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGATCAGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGTCGAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATGGAGCTACGATTgcgtg > 2:376810/1‑289 (MQ=255)
|||
CATGAAAATCACTTTAGTCGTACGGAAAGCGCGCAATAATACGGGTTTTATCTCAAAGGCGCTATCACCGCCGCCATGCCGATGAACTGTTGACTATGCTTTTAGCGGATAAACCACGTTAAGAGCATAAAAATGAAGGCGTTCGATCTCCACCGTATGGCATTTGATAAAGTGCCTTTTGATTTCCTTGGCGAAGTTGCACTACGTAGTCTTTATACCTTTGTACTGGTCTTTTTGTTCCTCAAAATGACCGGAAGACGCGGTGTGCGGCAGATGAGCCTGTTTGAAGTTTTAATCATTCTGACGCTGGGAAGTGCGGCGGGAGATGTGGCGTTTTATGATGATGTGCCGATGGTCCCGGTACTTATCGTCTTTATTACTCTGGCGTTGTTATACCGCCTGGTAATGTGGTTGATGGCGCACAGTGAAAAACTGGAAGATCTTCTGGAAGGCAAGCCAGTTGTCATTATTGAAGATGGCGAGCTGGCCTGGAGCAAACTCAATAACTCCAACATGACGGAATTTGAGTTCTTTATGGAGCTACGATTGCGTGGCG > CP042583/819524‑820079
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
