Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F210 I1 R1
|
4929 |
268.4 |
3907572 |
96.3% |
3762991 |
273.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
827,895 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 827,895 | 0 | A | T | 98.9%
| 618.0
/ NA
| 267 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (3/0); new base T (133/130); total (137/130) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.48e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
| * | CP042583 | 827,896 | 0 | G | C | 99.2%
| 624.7
/ NA
| 267 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (135/129); minor base T (1/1); total (137/130) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 827,897 | 0 | C | G | 99.6%
| 624.8
/ NA
| 267 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (136/129); total (137/130) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
TCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCTTTGATAGCCAGCGTTATGCCATTGCCCAGCATCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGAGTCTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATAAGCGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTG > CP042583/827618‑828171
|||
tGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCTTTGATAGCCAGCGTTATGCCATTGCCCAGCATCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATc > 1:1377558/1‑289 (MQ=255)
tGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCTTTGATAGCCAGCGTTATGCCATTGCCCAGCATCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTAAAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCACAAACAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATc > 1:1010733/1‑289 (MQ=255)
tCATGGCCAGCTTAATGGTGGCGGCTTTGATAGCCGGCGTTATGCCATTGCCCAGCATCGGCCGCTCACCTGCCGTTATCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCtttt < 1:1101290/289‑1 (MQ=255)
ggCCAACTTAATGATGGCGGCTTTGATAGCCAGCGTTATGCCATTGCCCAGCATCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTgcgg > 2:656645/1‑289 (MQ=255)
aCTTAATGATGGCGGCTTTGATAGCCAGCGTTATGCCATTGCCCAGCATCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGtt > 2:1664115/1‑288 (MQ=255)
ttAATGATGGCGGCTTTGATAGCCAGCGTTATGCCATTGCCCAGCATCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTgct < 1:1593281/289‑1 (MQ=255)
tAATGATGGCGGCTTTGATAGCCAGCGTTATGCCATTGCCCAGCATCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTgctg < 1:474067/289‑1 (MQ=255)
tgGCGGCTTTGGTTGGCGGCGTTATGCCATTGCCCAGCATCAGCCGCTCACCTGCCGTTTACTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTCGCCTTCGTGCACAGTATCTGGTGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAATAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGc < 2:864621/288‑1 (MQ=255)
gcggcTTTGATAGCCAGCGTTATGCCATTGCCCAGCATCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATGGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCgg > 1:796366/1‑289 (MQ=255)
aGCCAGCGTTATGCCATTGCCCAGCATCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTTTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCa < 1:1522586/289‑1 (MQ=255)
aGCCAGCGTTATGCCATTGCCCAGCATCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCa < 1:22806/289‑1 (MQ=255)
cGTTATGCCATTGCCCAGCATCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGAc > 2:1583278/1‑289 (MQ=255)
gTTATGCCATTGCCCAGCATCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGAc < 1:400605/288‑1 (MQ=255)
ttGCCCAGCATCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCt > 2:1732059/1‑289 (MQ=255)
gCCCAGCATCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCCGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCtttt > 2:1074484/1‑240 (MQ=255)
cccAGCATCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTCCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTccg > 2:508456/1‑285 (MQ=255)
aTCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGgc < 1:1502052/288‑1 (MQ=255)
aTCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGgc < 1:656645/288‑1 (MQ=255)
gCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTgg > 1:1905717/1‑289 (MQ=255)
gCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATc < 2:535222/289‑1 (MQ=255)
tCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATcc > 2:496277/1‑288 (MQ=255)
tCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATcc > 1:1633371/1‑288 (MQ=255)
tCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCa < 2:952851/289‑1 (MQ=255)
ggCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGc < 2:1269263/289‑1 (MQ=255)
gCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCCCTACAAACAACGCTGCAACCCTCGCCGTGGAATGCGGTTACTCTTGGCTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCCTGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATTGCTTTTGCGCCGTTGCTGGCTGCCGGCTTCATTCTCAGTGGACAACTTTTTTTTCCTTGGCGATGGCTCCACTgact > 2:1124162/1‑286 (MQ=255)
cAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTaa > 2:331809/1‑289 (MQ=255)
aGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTaa < 2:1214606/288‑1 (MQ=255)
cGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAGCAACGCTGCAACCCTAGCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCtgctgtgc < 1:1709552/289‑1 (MQ=255)
cGTGCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGc < 2:246338/191‑1 (MQ=255)
gCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGt > 1:337721/1‑289 (MQ=255)
gCACAGTATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGt > 2:1322029/1‑289 (MQ=255)
tATCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACgg > 1:740066/1‑289 (MQ=255)
aTCTGGCGTCACTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCCGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCTCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGCATTGGCTGTGCTGCTTTTTCTGCCTTGTTTACggc > 2:1249929/1‑288 (MQ=255)
ggcgtcacTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAAt > 1:543423/8‑288 (MQ=255)
gttacTACAAACAACGCTGCAACTCTATCCGTGGGATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGGGGCGTTGCTGGCTGCCGGGCTCATTCGAAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGGGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCa < 2:130076/284‑1 (MQ=255)
gtcacTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCa < 1:27733/284‑1 (MQ=255)
gtcacTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCa < 1:32228/284‑1 (MQ=255)
gtcacTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCa > 1:524149/5‑288 (MQ=255)
gtaacTACAAACAACGCTGCAACCCAATCCGTGGAATGCGGTTATGCTTGGTTTAGGTAAGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCa < 2:1521811/284‑1 (MQ=255)
cacTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAAtttt < 1:1213646/197‑1 (MQ=255)
cacTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGTGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTTTGCCTGGTTTATGGGAATGCAAc > 2:1329893/3‑288 (MQ=255)
cacTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGCATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCaa > 1:1699997/3‑287 (MQ=255)
cacTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGACTGCAAc > 2:104491/3‑288 (MQ=255)
cacTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAAc > 2:387098/3‑288 (MQ=255)
cacTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGAATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAAc < 2:1620645/286‑1 (MQ=255)
cacTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCAAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAAc > 1:617129/3‑288 (MQ=255)
acTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAAcc > 1:1167086/2‑288 (MQ=255)
acaaacaaCGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAAcctcct < 1:212254/289‑1 (MQ=255)
cacaacGCTTGAACCCTATCCGTGAAATGCGAGTATTCTTGGTTTAGATATGGGGGAACGGTAATCCGTCCCAAAAGAAATCAAAAATATCAGGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGCTATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCa < 2:306639/288‑1 (MQ=255)
caacGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCAtt < 1:1254202/289‑1 (MQ=255)
cGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATctg < 2:1701871/238‑1 (MQ=255)
cGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCa > 2:172643/1‑284 (MQ=255)
cGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCa < 1:172643/284‑1 (MQ=255)
gCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCGCCAAAGAAATTAAAAATATTATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGGACCTGGATTCTGCGGCGTTGCAGACGCCAGCACTCATTCGCGGGTAAAAAATTGTTCTGCCTTGGTCGTGGATACAGTGGCACACTACATGAATTAGAGGAATCTGCTAGGCTGCTTTTTATGCCCGGTTGACGGGTGCGCATGCTCCTGTATTgtgt > 2:1393322/1‑289 (MQ=255)
gCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGt > 1:644840/1‑289 (MQ=255)
tGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCAtt < 1:1046601/283‑1 (MQ=255)
cAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCCTTGCGTACCa > 2:62440/1‑289 (MQ=255)
cccTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCAtgg < 1:413009/289‑1 (MQ=255)
tCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGgc > 1:1296121/1‑288 (MQ=255)
tCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGgc > 1:1406879/1‑288 (MQ=255)
ggAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCt < 2:1775817/183‑1 (MQ=255)
ggAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCt > 1:1775817/1‑183 (MQ=255)
ggAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCtt > 2:1924266/1‑287 (MQ=255)
attGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCt < 1:1852501/286‑1 (MQ=255)
ttATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTgggg < 2:1428571/289‑1 (MQ=255)
ttGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAACTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAGTGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCt < 2:543423/289‑1 (MQ=255)
tAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCttaagtt > 2:462162/1‑289 (MQ=255)
gTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCCTGGTGGCTCTTGCTACGTGGGGTATGCttaagttaag > 2:1505064/1‑289 (MQ=255)
gggggAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCCGGATCCACTGGCAAATACCTGTACTTGTCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGGGGCGCTTGCTGCGTGGGGAAGGCTTACGTTAAGTggg > 2:1692155/1‑289 (MQ=255)
gggagAACGGTTATCCGTTCCCAAAGAAATCAAAATTGTATAGCGCGATACTGGAACAGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTggg < 2:894680/289‑1 (MQ=255)
ggggAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGc > 1:1953054/1‑289 (MQ=255)
aaCGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCCTTTCGTACCATGGTGGCGCTTTCTACTTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTggctgacg > 2:1822877/1‑283 (MQ=255)
aTCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACagtggag > 1:1197704/1‑288 (MQ=255)
ccGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACagtggagtgg < 1:174301/289‑1 (MQ=255)
cGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGc < 1:1664115/289‑1 (MQ=255)
gTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCt < 1:9845/289‑1 (MQ=255)
ccccAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTg < 2:1171803/288‑1 (MQ=255)
ccccAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCCCCTGCATTGCGTACCATGGGGGCGCTTGCGACTGGGGGAGTGCTTAAGTTAAGTGGGCCACaggggggtggacgg > 2:9808/1‑285 (MQ=255)
cccAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTggg < 1:532481/289‑1 (MQ=255)
cccAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGAGACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTggg < 2:1041050/289‑1 (MQ=255)
cgaaGAAATCAAAAATATCATGCGCGGTACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGAt < 2:293461/287‑1 (MQ=255)
aaaGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGGGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATg < 2:1633371/289‑1 (MQ=255)
aaaGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATg < 1:817642/289‑1 (MQ=255)
aaaGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATg < 1:383278/289‑1 (MQ=255)
aGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTa < 2:1953054/289‑1 (MQ=255)
acaaaaagtgcATGCGCTGTACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGat < 2:1885174/279‑1 (MQ=255)
aaaaTATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATAtg < 2:437333/289‑1 (MQ=255)
tACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAAt < 1:62440/288‑1 (MQ=255)
tGGAACGGCGCATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCCTTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACTGGGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTTTATGTCGGCACtttt > 2:1717492/1‑288 (MQ=255)
gcgcATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGcc < 2:808255/153‑1 (MQ=255)
gcgcATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTTCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCGGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCGATTTTGCGGTTgg > 2:578326/1‑289 (MQ=255)
gcgcATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATg < 1:888553/253‑1 (MQ=255)
gcgcATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATgg > 1:1471246/1‑289 (MQ=255)
gcgcATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATgg > 1:1423815/1‑289 (MQ=255)
gcgcATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATgg > 1:1876444/1‑289 (MQ=255)
gcgcATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGGATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATgg > 1:1548423/1‑289 (MQ=255)
gcgcATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCGGGGATGTATGGATAGGTGTTCTGGCGGCCATTTTGCTGATgg > 2:147394/1‑289 (MQ=255)
gcgcATTTAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGGTGAGTGGCTGGGAGGTATGGGTTTGTTGTTTGGCGGGAGTTTTGCCTATgg > 2:1835517/1‑289 (MQ=255)
aTTTAATGGCGTTATTGGGATTGCCCATCGCTTTTGCGGCGTTGCGGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACCAATTGTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATcc < 2:690346/289‑1 (MQ=255)
ttAATGGCGATATCGGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGGATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGTTGGTTCCTg > 2:1407785/1‑289 (MQ=255)
|||
TCGTGCAGTTCATGGCCAACTTAATGATGGCGGCTTTGATAGCCAGCGTTATGCCATTGCCCAGCATCAGCCGCTCACCGGCCGTTTTCTGCAGGCAAGTGTCATTGAACCGAATTGTAGCCTGCGTGCACAGTATCTGGCGAGTCTACAAACAACGCTGCAACCCTATCCGTGGAATGCGGTTATTCTTGGTTTAGGTATGGGGGAACGGTTATCCGTCCCCAAAGAAATCAAAAATATCATGCGCGATACTGGAACGGCGCATTTAATGGCGATAAGCGGATTGCACATCGCTTTTGCGGCGTTGCTGGCTGCCGGACTCATTCGCAGTGGACAAATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTG > CP042583/827618‑828171
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
