Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F210 I1 R1
|
4929 |
268.4 |
3907572 |
96.3% |
3762991 |
273.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
1,944,483 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 1,944,483 | 0 | A | T | 99.2%
| 628.3
/ NA
| 267 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/2); new base T (128/136); total (128/139) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 1,944,484 | 0 | G | C | 99.2%
| 621.2
/ NA
| 267 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base C (128/136); total (128/139) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 1,944,485 | 0 | C | G | 99.2%
| 619.6
/ NA
| 267 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base G (127/137); total (128/139) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
CGTCATTATTGCCAGTGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTGCGGCGAGTCATCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTAGTATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTAGCCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCGCTGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGGCTGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCGCAGAGCAT > CP042583/1944206‑1944769
|||
cGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTGCGGCGAGTCATCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTCGCTTTTGGCCTGAATGCCCGGATACTGTTACTTGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTGTGTTGGTATAAAAGGCTTCATAAACTTTCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGGCTGGATTTCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAGGGGACTTTTTCCCTGAAAGc > 1:687671/1‑288 (MQ=255)
cGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTGCGGCGAGTCATCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGc > 2:1560793/1‑288 (MQ=255)
gTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTGCGGCGAGTCATCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGc < 1:89099/287‑1 (MQ=255)
gttagtgcctcagtTGCTAAATTTAGCTGGGGTTTGGCGGCGAGTCACTTGCCGTCGATGGCGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCCCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCactac < 2:1046630/277‑1 (MQ=255)
tgcctcagtTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTGCGGCGAGTCATCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGa < 1:1650172/282‑1 (MQ=255)
tgcctcagtTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTGCGGCGAGTCATCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGa < 2:772970/282‑1 (MQ=255)
agtTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTGCGGCGAGTCATCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTATTGGGAGTAGc > 2:138532/2‑288 (MQ=255)
agtTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTGCGGCGAGTCATCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAg > 1:880855/2‑287 (MQ=255)
agtTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTGCGGCGAGTCATCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGcc < 2:1951666/288‑1 (MQ=255)
agtTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTGCGGCGAGTCATCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGCATGAGTTATGTGCTGGTAGGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGAGTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGCGTAga > 2:1289673/2‑287 (MQ=255)
aggtGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTGCGGCGGGTCATCTGCCGCCGAGGACGCACTTTTGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGcc < 2:1309466/286‑1 (MQ=255)
cAATTAAGCCTGGGTTTTGCGGCGAGTCATCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGGAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGtatta > 1:1525189/1‑289 (MQ=255)
cAATTAAGCCTGGGTTTTGCGGCGAGTCATCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATCGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGtatta > 1:691125/1‑289 (MQ=255)
ttAAGCCTGGGTTTTGCGGCGAGTCATCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGa > 1:1937665/1‑289 (MQ=255)
gTTTTGCGGCGAGTCATCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGAt > 1:1819871/1‑289 (MQ=255)
tGCGGCGAGTCATCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGGCTTTTTCGCTGAAAGCATTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGGTGATGcgg > 2:40921/1‑287 (MQ=255)
gcggcgAGTCATCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGa < 1:322141/289‑1 (MQ=255)
ggtgagcTGCCGCCGGTGACGCAATTATGGGATTTGATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGCTGCCCGGAGACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTc < 2:1626233/282‑1 (MQ=255)
aTCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGcc < 1:1401548/289‑1 (MQ=255)
aTCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGcc < 1:1373852/289‑1 (MQ=255)
cgccgATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAATCTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGa < 2:864711/288‑1 (MQ=255)
ccgATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATTCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTTCGCTAATCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGCAGGGACTGTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGATTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATGTTGCTGCCCCCGGCaa > 2:1187979/1‑289 (MQ=255)
aTGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAaac > 1:1755299/1‑289 (MQ=255)
gACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAaacaa > 2:419731/1‑289 (MQ=255)
aCTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGTCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTTCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTa < 1:1173556/289‑1 (MQ=255)
ttATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGtt > 1:1485431/1‑286 (MQ=255)
ttATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAg < 1:813371/207‑1 (MQ=255)
ttATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCt > 1:25483/1‑225 (MQ=255)
ttATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTccc < 1:40921/289‑1 (MQ=255)
ttATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTcc > 2:1207479/1‑288 (MQ=255)
ttATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTc > 2:1323899/1‑287 (MQ=255)
ttATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTGTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTccc < 2:1360278/289‑1 (MQ=255)
aTCGCGGCTTTGTTAGCTTTTGGCCTGGCTGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTg < 2:743000/289‑1 (MQ=255)
aGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGc < 1:6154/289‑1 (MQ=255)
ttttGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGt > 2:824627/1‑289 (MQ=255)
tGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCa < 2:955950/272‑1 (MQ=255)
tGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTc > 1:1014994/1‑288 (MQ=255)
ccTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCa < 1:345729/288‑1 (MQ=255)
ggATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCa > 1:1043643/1‑289 (MQ=255)
aTACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCta < 2:582340/288‑1 (MQ=255)
ttACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGATGGTATGGATTGCTCCAATGGTACTTCCCGGCTGGGCAGGGCCTTTTTCGCCGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTCCATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCCCTTTACACCGCCGTTACAACCCACCGGGTCTATAAccc > 2:1685253/1‑286 (MQ=255)
aCTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCtt < 2:1450599/289‑1 (MQ=255)
tgctgGGTTTTCTGCTTTCCGTTTTTTTGTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTCAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGAACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTgccgagag < 2:231858/289‑7 (MQ=255)
tgctgGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGTTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTgccgagag < 2:6149/289‑7 (MQ=255)
tATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCGTAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTc > 1:1592977/1‑288 (MQ=255)
tATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTc > 1:525690/1‑288 (MQ=255)
tATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCa < 1:1323899/289‑1 (MQ=255)
tCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCa > 1:1738421/1‑289 (MQ=255)
tgttataAAACGCTTCATAAACTTGCGTTCAGCAAAGCCTATGCCTTGTTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTGTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGAt < 2:1485431/286‑1 (MQ=255)
tgGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGAt < 1:954828/289‑1 (MQ=255)
tgGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGAt < 1:44246/289‑1 (MQ=255)
tgaactgCTTCATAAACTTGCGGTAAGCAAAGCCTATGTCTTGCTCAGTATGAGTTATTTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATa < 2:309624/283‑1 (MQ=255)
taAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATa < 1:224650/289‑1 (MQ=255)
ttCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACtt > 1:1626039/1‑252 (MQ=255)
ttCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATaaa > 2:1587739/1‑288 (MQ=255)
ttCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATaaa > 2:912847/1‑288 (MQ=255)
ttCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCCGGGCTATAACTGCTTGCCGAGCGGACTTTTACCCTATGCACCTTTTAACGATCAATACAATaaa > 2:361273/1‑288 (MQ=255)
cgtaacattGCGCTGAGCAAATCCTATGCCTTGCTCAGTATGTGTTAGGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAgcg < 2:1853146/282‑1 (MQ=255)
cgcTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCTCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCaa > 1:1428970/1‑289 (MQ=255)
aatcAAGGCCGATGCCGTGCTCATTATTGTGTATGTGTTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGTAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAggc < 2:1525189/286‑2 (MQ=255)
aGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAggcg < 1:93413/289‑3 (MQ=255)
aGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAggcgagagt < 1:732700/289‑8 (MQ=255)
aTGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTc > 1:4742/1‑244 (MQ=255)
aTGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTc < 2:4742/244‑1 (MQ=255)
aTGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATCCAATAAAGCGCATGCTGCaaatgcgagaggaaat > 2:122718/1‑275 (MQ=255)
tATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTg < 2:789401/155‑1 (MQ=255)
tATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACg > 1:1934662/1‑289 (MQ=255)
gTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATc > 2:1235617/1‑178 (MQ=255)
gTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGAt > 1:965864/1‑231 (MQ=255)
gTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGaa > 1:166893/1‑289 (MQ=255)
gTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGa < 2:87348/288‑1 (MQ=255)
gTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTGTCGGTGGAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGa < 2:689261/288‑1 (MQ=255)
ttggtgCTTGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAg < 2:525690/285‑1 (MQ=255)
tATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAGt < 1:153923/289‑1 (MQ=255)
tATGTGATGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAg < 1:450404/288‑1 (MQ=255)
aTGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTaca < 1:1788959/157‑1 (MQ=255)
gtgCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTg > 2:921110/1‑102 (MQ=255)
gtgCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCTCCCACTTTATCGACGAAGTCa > 2:180379/1‑288 (MQ=255)
gtgCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAGTCa > 2:1894127/1‑288 (MQ=255)
gtgCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAGTCa > 1:122916/1‑288 (MQ=255)
gtgCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCAACTTTCACGGCGAAGTc > 1:201640/1‑287 (MQ=255)
tGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAGTCActct > 1:371188/1‑288 (MQ=255)
gTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCa < 2:979397/199‑1 (MQ=255)
cttcaaTGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACg > 1:809321/6‑208 (MQ=255)
cttcaaTGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACg < 2:809321/203‑1 (MQ=255)
ttcaaTGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGAt < 1:513234/284‑1 (MQ=255)
aCTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGATAGGACTTTCCCCGTATGCAGCTTTTCCCGAGTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAAAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCCAAGTCACCCTTCACTTCGCCGATCATTTGTac > 2:1766534/1‑287 (MQ=255)
aCTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCCCCGTATGCAGCTTTTCACGCTTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCAACTTTCACGGCGCAGTCACTCTTCACTTCGGCTATCTGTTTTATc > 2:1104316/1‑289 (MQ=255)
cTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGATCATTTTTATcg < 1:830152/289‑1 (MQ=255)
cTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGATCATTTTTATc > 1:1090249/1‑288 (MQ=255)
ggAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGc > 2:1528207/1‑288 (MQ=255)
gAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCa < 2:1653270/288‑1 (MQ=255)
aGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCg < 1:1207479/289‑1 (MQ=255)
aGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCg < 2:1755299/289‑1 (MQ=255)
ggACGTTTACGCTGAACGCACTACTTGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGTTGCTGATTTTCCTGCCAACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCGCa < 1:1698456/289‑1 (MQ=255)
gACTTTTTCGCTGAACGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCGc < 1:1289673/287‑1 (MQ=255)
gACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCGCa < 2:1428970/288‑1 (MQ=255)
gACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCGCa < 1:1578852/288‑1 (MQ=255)
ttttTGCCTGAAAGCACAACTGGGGGAAGCCTGTATTGTGAGCGGGTCTGTTCTGATTTACCTGCCCACGACAAAACATCGGTACTGCTTTTTCCCGGCCACTTTACACGGCCGTTCCCACTCGTCGGTGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTGCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTACTACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTGTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGGTCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCGCAGAGc < 2:687671/289‑1 (MQ=255)
tttAG‑CTGAAAGCACTACTGGGAGTAACCTGTATTAGGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCAGCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCGCAGAGCAt < 1:982141/289‑1 (MQ=255)
|||
CGTCATTATTGCCAGTGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTGCGGCGAGTCATCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTAGTATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTAGCCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCGCTGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGGCTGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGATCATTTTTATCGCGCCGCCAGCATCGCAGAGCAT > CP042583/1944206‑1944769
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
