Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F210 I1 R1
|
4927 |
250.2 |
4002508 |
96.7% |
3870425 |
266.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
645,603 |
3 bp→TCA |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 645,603 | 0 | A | T | 99.7%
| 692.4
/ NA
| 294 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (164/129); minor base C (1/0); total (165/129) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 645,604 | 0 | G | C | 99.3%
| 689.9
/ NA
| 294 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (164/128); minor base A (1/1); total (165/129) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
| * | CP042583 | 645,605 | 0 | T | A | 100.0%
| 701.7
/ NA
| 294 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (165/129); total (165/129) |
Only 100 of 294 total aligned reads displayed.
GTCGTCGTCTACGCCAACACTTCTGCTGCGGTAAAAGCGCGCGCAGATTGGGTGGTAACTAGTAGCATTGCCGTCGAACTTATTGATCATCTTGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAAAGTCCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGCGCATTGTCCGTGGATGGCCATGAATGGCCTTCAGGCCATCGCAGAGGCATTAGAACAGGAAGGAAGCAATCACGAGGTTCAT > CP042583/645324‑645884
|||
gtcgtcgtcTACGCCAACACTTCTGCTGCGGTAAAAGCGCGCGCAGATTGGGTGGTAACTTCAAGCATTGCCGTCGAACTTATTGATCATCTTGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACaa > 1:1241270/1‑288 (MQ=255)
gtcgtcTACGCCAACACTTCTGCTGCGGTAAAAGCGCGCGCAGATTGGGTGGTAACTTCAAGCATTGCCGTCGAACTTATTGATCATCTTGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTa > 1:40275/1‑289 (MQ=255)
gtcTACGCCAACACTTCTGCTGCGGTAAAAGCGCGCGCAGATTGGGTGGTAACTTCAAGCATTGCCGTCGAACTTATTGATCATCTTGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAA‑CCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTg > 2:693389/1‑288 (MQ=255)
tcTACGCCAACACTTCTGCTGCGGTAAAAGCGCGCGCAGATTGGGTGGTAACTTCAAGCATTGCCGTCGAACTTATTGATCATCTTGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTg > 2:391701/1‑288 (MQ=255)
cGCCAACACTTCTGCTGCGGTAAAAGCGCGCGCAGATTGGGTGGTAACTTCAAGCATTGCCGTCGAACTTATTGATCATCTTGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAg < 2:832933/278‑1 (MQ=255)
cGCCAACACTTCTGCTGCGGTAAAAGCGCGCGCAGATTGGGTGGTAACTTCAAGCATTGCCGTCGAACTTATTGATCATCTTGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGat > 2:1470518/1‑289 (MQ=255)
cGCCAACACTTCTGCTGCGGTAAAAGCGCGCGCAGATTGGGTGGTAACTTCAAGCATTGCCGTCGAACTTATTGATCATCTTGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGat > 1:155918/1‑289 (MQ=255)
cGCCAACACTTCTGCTGCGGTAAAAGCGCGCGCAGATTGGGTGGTAACTTCAAGCATTGCCGTCGAACTTATTGATCATCTTGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGat > 1:1250890/1‑289 (MQ=255)
cacTTCTGCTGCGGTAAAAGCGCGCGCAGATTGGGTGGTAACTTCAAGCATTGCCGTCGAACTTATTGATCATCTTGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCg > 1:119300/1‑289 (MQ=255)
gTAAAAGCGCGCGCAGATTGGGTGGTAACTTCAAGCATTGCCGTCGAACTTATTGATCATCTTGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑cggtcggt > 1:1969872/1‑288 (MQ=255)
gcgcAGATTGGGTGGTAACTTCAAGCATTGCCGTCGAACTTATTGATCATCTTGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCa > 2:146619/1‑289 (MQ=255)
cgcAGATTGGGTGGTAACTTCAAGCATTGCCGTCGAACTTATTGATCATCTTGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATCCCGCCATACTGGTGCATCCAGAACCACAACACGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCCGTCa > 2:1076479/1‑288 (MQ=255)
aacttcaagCATTGCCGTCGAACTTATTGATCATCTTGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACCGAACgcgtccgcc > 2:1552860/8‑282 (MQ=255)
cttcaagCATTGCCGTCGAACTTATTGATCATCTTGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑cgg < 1:1660768/250‑1 (MQ=255)
aTTGCCGTCGAACTTATTGATCATCTTGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGc < 1:436309/289‑1 (MQ=255)
gCCGTCGAACTTATTGATCATCTTGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTccac > 1:1817512/1‑254 (MQ=255)
gCCGTCGAACTTATTGATCATCTTGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCcac > 2:541305/1‑289 (MQ=255)
gCCGTCGAACTTATTGATCATCTTGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTACACTGAGCCTGGCGGCGAAACCATTGcacc > 2:1060538/1‑286 (MQ=255)
cGAACTTATTGATCATCTTGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCa < 1:478433/288‑1 (MQ=255)
cGAACTTATTGATCATCTTGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CAGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCa < 2:955395/288‑1 (MQ=255)
tatcTTGATAGGTTGGGTGAAAAAATAATCTGGGCACCCGACAAACCTCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGGCTGTATTGTGCATGACGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTgg < 2:1400717/288‑1 (MQ=255)
catcTTGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTgg > 2:280292/1‑289 (MQ=255)
tattGATAGTTTGGGTGAAAAAATCCTCTAGGCACCCGACCAACATCTGGGGCGTTACGTGAAAAAACAGACTGGTGGAGACATTCTAGGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATGTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGTATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAGGCTATTGTCGAGATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCa < 2:1105438/287‑1 (MQ=255)
tGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAAcc > 1:508783/1‑289 (MQ=255)
aGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCACCCGCTc > 2:1255814/1‑289 (MQ=255)
tGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTccacca < 1:90862/225‑1 (MQ=255)
tGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGAACcggg > 1:1857724/1‑289 (MQ=255)
tGGGCGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGCAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGCATCACCACAAGCTAGTGTCGATATGGCGGATG‑CCGTCGGTTCCACCAGTCAACTGAACGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTCATTGTGGCAACCGCTCgggg > 2:1170510/1‑289 (MQ=255)
aaaaTCATCTGGGCACCCAACAAACATCTGGGGCGTTACGTGAAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGTATACTGCCATACTGGTGAATCCAGAATCACCACAAGCTATTAACGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACGGATCGCTGCGGCGAAAACATTGCCACACTA‑GAGGCTTATTTGTGCAACCGATCGGGGTAttttat > 2:612401/1‑287 (MQ=255)
atcatcTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACa < 1:1470518/289‑1 (MQ=255)
tGGGGACCCGACAAACAACTGGGGCGGTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATg < 2:780439/288‑1 (MQ=255)
gCACCCGACAAACAGCTGGGGCGTTACGATCAAATACAGACGGGTGGAGACATTCTTTGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCATGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATgcag < 2:1574066/288‑1 (MQ=255)
aaaCATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCTTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GGGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGc < 2:1598450/289‑1 (MQ=255)
aaaCATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGc < 2:119300/289‑1 (MQ=255)
aaaCATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCCTATTTTGGCAACCGAACGGGGTAATTTCTCAAAAAGTCAGCAgggcggg > 2:48282/1‑283 (MQ=255)
cTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATa < 1:766289/289‑1 (MQ=255)
ggggCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCa < 1:1172057/241‑1 (MQ=255)
ggggCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATaaa > 2:183080/1‑289 (MQ=255)
ggCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGc < 1:391065/279‑1 (MQ=255)
ttACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGtt > 1:228594/1‑288 (MQ=255)
aCGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGcc < 2:659238/211‑1 (MQ=255)
tGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCG‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTAAAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGTAAAAGAGGTACTGGa > 2:1802392/1‑289 (MQ=255)
gTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCA‑‑‑CA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTg < 1:1830010/288‑1 (MQ=255)
gagaCATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTg < 2:1817881/288‑1 (MQ=255)
aTTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGTTGCATCCAGAATCACCACAACCTATTGTCGCTATGGCGGATT‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGACAACATTGCCA‑ATCACGGGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAACAGGCGGCGCCAGATAACGTTGTACTGGATGCCCCACCCGCAGGTGCGGGt > 2:1349503/1‑288 (MQ=255)
tCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGa < 2:353994/282‑1 (MQ=255)
tCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCa > 1:745210/1‑289 (MQ=255)
ggCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGcc > 1:1019520/1‑288 (MQ=255)
gCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCa > 1:1489675/1‑259 (MQ=255)
aGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCa < 1:280292/288‑1 (MQ=255)
gTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCt > 1:722755/1‑288 (MQ=255)
tGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTg < 2:1983460/288‑1 (MQ=255)
gTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGCGCa < 1:189425/289‑1 (MQ=255)
gTATGGTGAATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCGTGAAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGCGCa < 2:1938589/289‑1 (MQ=255)
tATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGTTTCTCCCTGCCGCAGCTCCGCGCAt < 1:809591/289‑1 (MQ=255)
ttGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGCGCATTg > 1:1581188/1‑289 (MQ=255)
gtgCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGc > 1:1730569/1‑220 (MQ=255)
gtgCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGc < 2:1730569/220‑1 (MQ=255)
gtgCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAagag > 1:1280795/1‑231 (MQ=255)
gtgCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCCCCAACCGTCGGTGAGGGTGCAACCGGCAGCAGCTTCGCGCCTTgc > 2:1741390/1‑287 (MQ=255)
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gtgCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCAGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCATACTCACCACAAGCTATTGTCGATCTGGCGGCTG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGCACACTGCTGCGAAAACATTGACACATCA‑GAGGCGTAGTGTGGCAACCGATCGGGGTAATTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGACAACGATGTACTGGTAACACCAATCGCAGGCGAGGGGTCAAACTTGCGCAGCCGAGAGCATTGt > 2:1448586/1‑288 (MQ=255)
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tgCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTgcg < 1:1999348/279‑1 (MQ=255)
tgCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGCGCa > 1:1429475/1‑283 (MQ=255)
tctgaATGTAAGAGTCCGTAGTTAAGACTATTGAAAGAAGGTTACCCGGCTGCTGCGATACTGGGGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGCGTCCACCAGTGAACTGATCGCTGCTGCGAAAATATTGCCAAATCA‑TGGGCTTATTGTGGCAACCGGTCGGCGTATTTTCTACAATATGCAGCAGGCGGTGCCAGACAACGAGTTACGTGAAGCACCAACCGCGCGTTAGGGTGCTACCTGCCGCAGTTGCACGCATTGTCCGTggc < 2:1511339/287‑2 (MQ=255)
gatgaATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTAtt < 1:1761483/189‑1 (MQ=255)
gatgaATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTAtt > 2:1761483/1‑189 (MQ=255)
tgaATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTAACGGAAGCAACAACCGCAGGTGTGGGGGCAACATGCCGCAGCGccgcgccctatccctgggtg > 2:418621/1‑275 (MQ=255)
aTTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGa < 1:668235/174‑1 (MQ=255)
tCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGCGCATTGTCCGTGGATGGCCATGAATgg > 1:1140860/1‑288 (MQ=255)
tCAGGCGTTAACCCCCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGCGCa < 1:624627/264‑1 (MQ=255)
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gCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGCGCATTGTCCGTGGATGGCCATGAATGGCCtt < 2:508781/288‑1 (MQ=255)
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cGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGCGCATTGTCCGTGGATGGCCATGAATGGCCtt < 2:732483/287‑1 (MQ=255)
tAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGCGCATTGTCCGTGGATGGCCATGAATGGCCTTCAgg < 2:1140860/288‑1 (MQ=255)
tAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGCGCATTGTCCGTGGATGGCCATGAATGGCCTTCAgg < 1:787501/288‑1 (MQ=255)
gCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAgg < 1:1092965/225‑1 (MQ=255)
gCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGCGCATTGTCCGTGGATGGCCATGAATGGCCTTCAGGCCATCGc > 1:1911049/1‑289 (MQ=255)
cTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGc < 1:951660/238‑1 (MQ=255)
ttGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAGTCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGCGCa < 1:304143/248‑1 (MQ=255)
ttGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGCGCATTGTCCGTGGATGGCCATGAATGGCCTTCAGGCCATCGCa < 1:838414/288‑1 (MQ=255)
aagaaTACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACGTCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGCGCATTGTCCGTGGATGGCCATGAATGGCCTTCAGGCCATCGCAGAGGCAtt < 2:247264/289‑1 (MQ=255)
agaaTACCCGGATGCGGCCATACTGGTGCATCCCGAATAACCACAAGCTATTGTCGCGATGGC‑GATGACGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAGAACATTGCCACAGCA‑GAGGCGTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCCGCGAGCATTGTCCGTGGATGGCCATGAATGGCCTTCAGGCCATCGCAGAGGCAtt < 2:1241270/288‑1 (MQ=255)
aTACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGCGCATTGTCCGTGGATGGCCATGAATGGCCTTCAGGCCATCGCAGAGGCATTAg < 1:1836155/287‑1 (MQ=255)
tACCCGTATGCGTCCATACTGGAGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGCGCATTGTCCGTGGATGGCCATGAATGGCCTTCAGGCCATCGCAGAGGCATTAGAAc < 2:91914/289‑1 (MQ=255)
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tgcCATACTGGTACATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGCGCATTGTCCGTGGATGGCCATGAATGGCCTTCAGGCCATCGCAGAGGCATTAGAACAGgaaggaag < 1:98724/288‑1 (MQ=255)
gcCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGCGCATTGTCCGTGGATGGCCATGAATGGCCTTCAGGCCATCGCAGAGGCATTAGAACCGGAAGGAAGCa > 1:1631221/1‑289 (MQ=255)
ccATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATT‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGCGCATTGTCCGTGGATGGCCATGAATGGCCTTCAGGCCATCGCAGAGGGATTAGAACAGGAAGAGAGCaa > 2:98724/1‑289 (MQ=255)
cTGGGGCATCCAGAATCACCACTAGGTATTGTCGATATTGCGGATG‑CGTTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACAGTTCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGCGCATTGTCCGTGGATGGCCATGAATGGCCTTCAGGCCATCGCAGAGGCAGTAGAACAGGAAGGAAGCAATCACg < 2:1563488/289‑1 (MQ=255)
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gCATCCAGAATCACCCCAAGCAGTTGTGTATATGGCTGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGAACGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTCTTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAATAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGGGCATTGTCCGTGGATGGCAATGAATGGCCTTCAGGCCATCGCAGAGGCATTAGAACAGGAAGGAAGCAATCACGAGGt < 2:155918/288‑1 (MQ=255)
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tCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGCGCATTGTCCGTGGAGGGCCATGAATGGCCTTCAGGCCATCGCAGAGGCATTAGAACAGGAAGGAAGCAAGCAAGAGGttaca > 2:1845839/1‑286 (MQ=255)
|||
GTCGTCGTCTACGCCAACACTTCTGCTGCGGTAAAAGCGCGCGCAGATTGGGTGGTAACTAGTAGCATTGCCGTCGAACTTATTGATCATCTTGATAGTTTGGGTGAAAAAATCATCTGGGCACCCGACAAACATCTGGGGCGTTACGTGCAAAAACAGACGGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAAAGTCCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATG‑CGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCA‑GAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGTGCAACCTGCCGCAGCTGCGCGCATTGTCCGTGGATGGCCATGAATGGCCTTCAGGCCATCGCAGAGGCATTAGAACAGGAAGGAAGCAATCACGAGGTTCAT > CP042583/645324‑645884
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
