Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F210 I1 R1
|
4927 |
250.2 |
4002508 |
96.7% |
3870425 |
266.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
783,382 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 783,382 | 0 | A | T | 99.2%
| 586.3
/ NA
| 253 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (121/129); minor base G (2/0); total (124/129) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.37e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 783,383 | 0 | G | C | 99.6%
| 585.1
/ NA
| 253 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base C (122/129); total (124/129) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.88e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 783,384 | 0 | C | G | 99.2%
| 577.7
/ NA
| 253 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base G (123/127); total (124/129) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
CAAATTGTTGCGTAATGGTGAAACACGCGAGCGTGAAGTGACGATTGGCGCACGTAACGATACCGATGTTGAGATTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTAGCGGTTCCGGTAAAAGCACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTAGCCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGAGCGGAAACAGCGACTGCTTCGTGCCCAGGAGTTGCTGCAACGGCTGGGGCTGGAAGACCGTACAGA > CP042583/783103‑783656
|||
cAAATTGTTGCGTAATGGTGAAACACGCGAGCGTGAAGTGACGATTGGCGCACGTAACGATACCGATGTTGAGATTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCtga > 2:1395334/1‑289 (MQ=255)
aaTGGTGAAACACGCGAGCGTGAAGTGACGATTGGCGAACGTAACGATACCGATGTTGAGATTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCgg < 1:1385880/289‑1 (MQ=255)
gTGAAACACGCGAGCGTGAAGTGACGATTGGCGCACGTAACGATACCGATGTTGAGATTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCg > 1:823324/1‑284 (MQ=255)
gTGAAACACGCGAGCGTGAAGTGACGATTGGCGCACGTAACGATACCGATGTTGAGATTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCCGGTTCGGGTAAATCGACCCTGATGAATCTTCTCGGCTGt > 2:1695633/1‑289 (MQ=255)
tggaaatgccgggCGTGAAGTGACTATTGGCGCACGTAACGATGCGGATGTTGAGCTTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGGGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCGGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCGGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGt < 2:1983821/276‑1 (MQ=255)
cgcgAGCGTGAAGTGACGATTGGCGCACGTAACGATACCGATGTTGAGATTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGAT‑GTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAg > 1:1239788/1‑289 (MQ=255)
gAGCGTGAAGTGACGATTGGCGCACGTAACGATACCGATGTTGAGATTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATAGTTATTCGGGTGAGTTGGTCGCGATTGTTGGTGCTTAGGGTTCCGGGAAATCGACGCTGATGTATATTCTGGGTTGGCTGGCTaacg > 2:1628007/1‑286 (MQ=255)
gCGTGAAGTGACGATTGGCGCACGTAACGATACCGATGTTGAGATTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGcc < 2:823324/288‑1 (MQ=255)
cGTGAAGTGACGATTGGCGCACGTAACGATACCGATGTTGAGATTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTCCCGGTAAAGCGACCCTGATGAATATTCCCGGCCGTCTGGATAACGccac > 2:1332744/1‑289 (MQ=255)
aGTGACGATTGGCGCACGTAGCGATACCGATGTTGAGATTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGc < 1:1882517/288‑1 (MQ=255)
gACGATTGGCGCACGTAACGATACCGATGTTGAGATTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCgg < 1:1253490/287‑1 (MQ=255)
aCGATTGGCGCACGTAACGATACCGATGTTGAGATTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCa > 2:1639911/1‑288 (MQ=255)
aCGATTGGCGCACGTAACGATACCGATGTTGAGATTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCa > 1:1642399/1‑288 (MQ=255)
ttGGCGCACGTAACGATACCGATGTTGAGATTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTa > 1:1104912/1‑288 (MQ=255)
cgcACGTAACGATACCGATGTTGAGATTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATcgcg > 1:1873233/1‑289 (MQ=255)
aCGATACCGATGTTGGGAATGTGAAAGGGCTTGAAGCTGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGt < 2:1900961/289‑1 (MQ=255)
gATACCGATGTTGAGATTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCa < 1:841654/289‑1 (MQ=255)
tACCGATGTTGAGATTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAg < 2:317732/288‑1 (MQ=255)
aCCGATGTTGAGGTTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGa < 2:1126827/289‑1 (MQ=255)
cGATGTTGAGATTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGcca < 2:728488/256‑1 (MQ=255)
cGATGTTGAGATTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATg > 1:1313036/1‑289 (MQ=255)
aTGTTGAGATTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGtt > 2:1446466/1‑289 (MQ=255)
aTGTTGAGATTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGtt > 1:451436/1‑289 (MQ=255)
aTGTTGAGATTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGtt > 1:1672269/1‑289 (MQ=255)
aaggtacaaGGGCTTGGAGGGGGGGGTGGAGGGGGGATTGGGGAAGCCAAACCCGGGGCTGCACAATGGAGCCTTTGCTTGAATTAAAGGGTATTCGTCCGAGCTATCCCGGCGGTGATGGGGAGGTTGGGGTGCTGAAGGGGATCAGCCTTGATATTTATGCGGGGGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCCACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCAACAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCt < 2:303398/282‑1 (MQ=255)
gTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATa > 2:755451/1‑237 (MQ=255)
gTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTgg > 1:182114/1‑288 (MQ=255)
gTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATGAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGGTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCTTGATGACTATTCTCGGCTGTCTGGATAATGCCCCCAGCGGCACCTATCGCCTCGCCGGTCAGGTGGTTGCCAAGCggg > 2:1198251/1‑288 (MQ=255)
tGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCgg < 1:297135/215‑1 (MQ=255)
tGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCg < 2:1506829/214‑1 (MQ=255)
tGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCg > 1:1506829/1‑214 (MQ=255)
tGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATgcgc > 1:1706579/1‑289 (MQ=255)
tgATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCCGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGa > 1:1287616/1‑288 (MQ=255)
ggTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCAttt < 1:86296/289‑1 (MQ=255)
tGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCg > 1:1618859/1‑289 (MQ=255)
aGGCCAAACCAGGGGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCgg < 2:1876188/288‑1 (MQ=255)
aGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCCGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCg > 1:1789858/1‑287 (MQ=255)
ccggggCTGCACAATGGCGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGGGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTc < 2:1648883/284‑1 (MQ=255)
ccggggCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCTTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCAGGTGCGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCTCGAGCATTTCGGCTTTATTTTc < 1:1163573/284‑1 (MQ=255)
gCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGCCCGGATGTTGCCACGCGGGCGCCCGTGGCGCTGGCGCATCTGCGCCGCGAGCTTTTCTG‑TTTAtttttccggcttc > 2:1516522/1‑279 (MQ=255)
cacaATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCCGGACGCCGATGCGCTGGCGCACCGGCGCGGCCGGCAGTTCGGCTTGCTTTTCCAGCGttg > 2:1590065/1‑287 (MQ=255)
tggcGCCTTTGTTCGAATTAAAGGATGTTCGTCGCAGCTATCCGGCCGGTTATTGGGAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCAttt < 2:731405/286‑1 (MQ=255)
tGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGCTATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCGCCTATCGCGTCGCAGGTCAGGAGGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGAATTTCGGCTTTATTTTCGAGCGTTACCAttt > 1:98881/1‑289 (MQ=255)
tGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCAttt > 2:1962948/1‑289 (MQ=255)
tGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCAttt > 1:1832565/1‑289 (MQ=255)
aCGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCa < 2:1937237/206‑1 (MQ=255)
aCGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCa > 1:1937237/1‑206 (MQ=255)
gCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCtt < 1:1590065/289‑1 (MQ=255)
ccTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCtt > 1:1657543/1‑288 (MQ=255)
ttGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCtttcg > 1:1651653/1‑285 (MQ=255)
tCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCtttcgcattt < 1:372130/289‑9 (MQ=255)
aaTTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTaa > 1:1197593/1‑288 (MQ=255)
aTTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCCCTGGCGCCACGGCGCCGCGAGCATGTCGGTTTTATTTTCCAGCGTTATCATTTGCtttcgcatttcat > 2:746359/1‑277 (MQ=255)
tttacttgccAGATATGCTGCCGGTGATGGGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCGTGGATATTTAGGCGTGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCa < 2:632438/279‑1 (MQ=255)
tatTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCCACAGCCTCGATATTTATGCGGGCGAGATGGTCGAGATTGGTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATCTTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGCCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCGGGACGCCGATGCACTGGCGCAACTGCGCCGCGTGCATTGCGGCCTTATTCTTCAGCGGTAACATCTGCTTTCGCATTTAAccgccgcctag > 2:79508/1‑284 (MQ=255)
atTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCgg < 1:737491/161‑1 (MQ=255)
atTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGGCACTGCGGCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGAGTTACCATTTGCTTTCGCATGTAACTGCCGAGCAgg > 2:690874/1‑288 (MQ=255)
tcgCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGtt > 1:1364872/1‑289 (MQ=255)
cgCATCTATCCTGCCGGGGGTGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGGTATTTGTGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCATGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGtt < 2:1789858/288‑1 (MQ=255)
gCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCtt > 1:1552292/1‑260 (MQ=255)
gCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGTGCAGAACGTTGa > 1:1402414/1‑289 (MQ=255)
tCCTGCGGGTGATGGGCAGGTTGAGGGGCTGAAGGGCATCGGCCTGGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGAGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAGTCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGGTCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAGCCGCCGGGCAGAACGTTGAAGTAccc < 1:216764/289‑1 (MQ=255)
tCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTAacc > 1:1783439/1‑289 (MQ=255)
ccGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCtt < 1:313042/248‑1 (MQ=255)
cGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGt < 2:1665055/288‑1 (MQ=255)
ggTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGCTGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCTCGTCGCCGGTCAGGCTGTTGCCTCGCTGGACGCCGATGCGCGTGCGCGACTGCGCCGCCAGCGCTTCGGCTTTCTTTTACCGCGTTACCAGTTGCTTTCGCAGTTAACCGCCGAGCAGCACGTTACAGTCCCCCTCGTCt > 2:239711/1‑289 (MQ=255)
gatgaGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTAccc > 2:438150/1‑279 (MQ=255)
gatgaGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTAccc < 1:438150/279‑1 (MQ=255)
tgaGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGc < 1:1962948/288‑1 (MQ=255)
gTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTg > 1:668808/1‑289 (MQ=255)
ggTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGAGCgg > 1:229963/1‑289 (MQ=255)
cTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGAGCGGAAAc > 2:354514/1‑289 (MQ=255)
tGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGAGCGGAAACa > 1:4090/1‑289 (MQ=255)
cATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTATATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGAGCGGAAACAGCGACt > 1:1639137/1‑288 (MQ=255)
tCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTTAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGAGCGGAAACAGCGACTGCt > 1:527986/1‑289 (MQ=255)
tCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGAGCGGAAACAGCGACTGCt > 2:1271328/1‑289 (MQ=255)
tCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGAGCGGAAACAGCGACTGCt > 1:1909921/1‑289 (MQ=255)
cAGCCTCGATAGTTATGCGGGGGAGATGGTCCCAATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATGCTCGGCTGTCTGTATAAGGCCACCAGCTGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGAGCGGAAACAGCGACTGCt < 2:1287616/288‑1 (MQ=255)
cTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGATCGGAAACAGCGACTGCTTCGt > 1:728076/1‑288 (MQ=255)
cGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGAGCGGAAACAGCGACTGCTTCGTGcc < 2:1031072/289‑1 (MQ=255)
gATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACt > 2:1752141/1‑161 (MQ=255)
gATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACt < 1:1752141/161‑1 (MQ=255)
tGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGTTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAAccg > 2:220093/1‑212 (MQ=255)
tGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGAGCGGAAACAGCGACTGCTTCGTGCCCAGGAGTTGCTGCa < 1:1332744/288‑1 (MQ=255)
aTGGTCGCGATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTCTGCTGGTCTTGAGCGGAAACAGCGACTGCTTCGTGCCCAGGAGTTGCTGCAACggc > 1:969699/1‑289 (MQ=255)
ggtggtgATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCTACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGAGCGGAAACAGCGACTGCTTCGTGCCCAGGAGTTGCTGCAACggct < 2:941647/282‑1 (MQ=255)
cgcgATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTCTGCTGGTCTTGAGCGGAAACAGCGACTGCTTCGTGCCCAGGCGTTGCTGCAACggctggg > 1:1082638/1‑288 (MQ=255)
cgcgATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGAGCGGAAACAGCGACTGCTTCGTG‑‑CAGGAGTTGCTGCAACggct > 2:69819/1‑283 (MQ=255)
gATTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGAGCGGAAACAGCGACTGCTTCGTGCCCAGGAGTTGCTGCAACggctggggctg < 1:1486317/289‑1 (MQ=255)
aTTGTTGGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGAGCGGAAACAGCGACTGCTTCGTGCCCAGGAGTTGCTGCAACggctggggctg < 2:1832565/288‑1 (MQ=255)
ttgttgGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCGACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGAGCGGAAACAGCGACTGCTTCGTGCCCAGGAGTTGCTGCAACGGCTGGGGCTGGa < 2:451436/289‑1 (MQ=255)
ttgttgGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGAGCGGAAACAGCGACTGCTTCGTGCCCAGGAGTTGCTGCAACGGCTGGGGCTGGa < 2:1364872/289‑1 (MQ=255)
ttgGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAg < 2:109863/194‑1 (MQ=255)
tgGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGAGCGGAAACAGCGACTGCTTCGTGCCCAGGAGTTGCTGCAACGGCTGGGGCTGGAAGa < 1:931588/288‑1 (MQ=255)
tgGCGCTTCGGGTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGAGCGGAAACAGCGACTGCTTCGTGCCCAGGAGTTGCTGCAACGGCTGGGGCTGGAAGa < 1:1021915/288‑1 (MQ=255)
gcttcggggtCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGAGCGGAAACAGCGACTGCTTCGTGCCCAGGAGTTGCTGCAACGGCTGGGGCTGGAAGACCGTa < 1:1743761/280‑1 (MQ=255)
ttcgggTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCa < 1:1001768/185‑1 (MQ=255)
ttcgggTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCTCCGTCCATGCTGGTCTTGATCGGACACAGCGCCTGCTTCGTGCCCAGGAGTTGCTGCCCCCGCTGGGGCTGGAACACCGTAcc > 2:1804051/5‑288 (MQ=255)
gcgggTTCCGGTAAATCGACCCTGATGGATATTCTCGGCTGGCTTGGTAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGAGCGGAAACAGCGACTGCTTCGTGCCCAGGAGTTGCTGCAACGGCTGGGGCTGGAAGACCGTACa < 2:523196/285‑1 (MQ=255)
cgggTTCCGGTAAATCGACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTAGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTTCGCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGAGCGGAAACAGCGACTGCTTCGTGCCCAGGAGTTGCTGCAACGGCTGGGGCTGGAAGACCGTACaga < 1:790169/287‑1 (MQ=255)
|||
CAAATTGTTGCGTAATGGTGAAACACGCGAGCGTGAAGTGACGATTGGCGCACGTAACGATACCGATGTTGAGATTGTCAAAGGGCTTGAAGCGGGCGATGAAGTGGTGATTGGTGAGGCCAAACCAGGAGCTGCACAATGACGCCTTTGCTCGAATTAAAGGATATTCGTCGCAGCTATCCTGCCGGTGATGAGCAGGTTGAGGTGCTGAAGGGCATCAGCCTCGATATTTATGCGGGTGAGATGGTCGCGATTGTTGGCGCTAGCGGTTCCGGTAAAAGCACCCTGATGAATATTCTCGGCTGTCTGGATAAGGCCACCAGCGGCACCTATCGCGTCGCCGGTCAGGATGTTGCCACGCTGGACGCCGATGCGCTGGCGCAACTGCGCCGCGAGCATTTCGGCTTTATTTTCCAGCGTTACCATTTGCTTAGCCATTTAACCGCCGAGCAGAACGTTGAAGTACCCGCCGTCTATGCTGGTCTTGAGCGGAAACAGCGACTGCTTCGTGCCCAGGAGTTGCTGCAACGGCTGGGGCTGGAAGACCGTACAGA > CP042583/783103‑783656
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
