Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F210 I1 R1
|
4927 |
250.2 |
4002508 |
96.7% |
3870425 |
266.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
784,564 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 784,564 | 0 | A | T | 99.2%
| 597.9
/ NA
| 255 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (124/128); minor base G (2/0); total (127/128) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.45e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
| * | CP042583 | 784,565 | 0 | G | C | 98.8%
| 592.0
/ NA
| 255 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (126/126); minor base A (1/2); total (127/128) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 784,566 | 0 | C | G | 100.0%
| 598.6
/ NA
| 255 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (127/128); total (127/128) |
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
CACCTGCCGTCAGCCAAAACCTGCGCCTGCGTTATAACAATGTTGATGTTGCTGCCAGTGCCAATGGCGTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGAGCATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGAGCT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTAGTCTGCGCCACGGAAAGAAGGATTTCTTTACCTGGAACATGGACGGCGTCTTGAAAACTGTTGAAAAGACCACACGTACTTTACAACTGTTTCTGACGCTGGTGGCGGTGATTAGCCTGGTGGTG > CP042583/784286‑784845
|||
cacCTGCCGTCTCGCAAAACCTGCGCCTGCGTTATAACAATGTTGATGTTGCTGCCAGTGCCAATGGCGTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTgg < 1:571428/289‑1 (MQ=255)
ccTGCCGTCTCGCAAAACCTGCGCCTGCGTTATAACAATGTTGATGTTGCTGCCAGTGCCAATGGCGTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGt > 2:1810797/1‑288 (MQ=255)
ccTGCCGTCTCGCAAAACCTGCGCCTGCGTTATAACAATGTTGATGTTGCTGCCAGTGCCAATGGCGTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGt < 1:1810797/288‑1 (MQ=255)
ccTGCCGTCTCGCAAAACCTGCGCCTGCGTTATAACAATGTTGATGTTGCTGCCAGTGCCAATGGCGTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTa > 2:1428347/1‑289 (MQ=255)
ccTGCCGTCTCGCAAAACCTGCGCCTGCGTTATAACAATGTTGATGTTGCTGCCAGTGCCAATGGCGTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTa > 1:64437/1‑289 (MQ=255)
cgtccggctcgcAAACCCTGCGCCTGCGTTATAACAATGTTGATGTTGCTGCCAGGGCCAATGGCGTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAg < 2:987063/278‑1 (MQ=255)
aaaaCCTGCGCCTGCGTTATAACAATGTTGATGTTGCTGCCAGTGCCAATGGCGTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGtgct < 1:1138224/289‑1 (MQ=255)
aaaaCCTGCGCCTGCGTTATAACAATGTTGATGTTGCTGCCAGTGCCAATGGCGTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGtgct < 1:443064/289‑1 (MQ=255)
cctgcgcctgcgTTATAACAATGTTGATGTTGCTGCCAGTGCCAATGGCGTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCgt > 1:102004/1‑289 (MQ=255)
gcgTTATAACAATGTTGATGTTGCTGCCAGTGCCAATGGCGTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTa < 1:1307880/289‑1 (MQ=255)
aaTTTTGATGTTGCTGCCAGTGGCAATGGCGGGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCa < 2:932870/289‑1 (MQ=255)
atgttgatgttgCTGCCAGTGCCAATGGCGTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGGCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCAc > 1:1069140/1‑289 (MQ=255)
atgttgatgttgCTGCCAGTGCCAATGGCGTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGCCGATGTTTGGTAGCCGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACCGcc > 2:1759424/1‑287 (MQ=255)
tgttgatgttgCTGCCAGTGCCAATGGCGTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACg > 1:348757/1‑289 (MQ=255)
tgttgatgttgCTGCCAGTGCCAATGGCGTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACg > 2:893956/1‑289 (MQ=255)
tgttgatgttgCTGCCAGTGCCAATGGCGTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACg > 1:590801/1‑289 (MQ=255)
tgttgatgttgCTGCCAGTGCCAATGGCGTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATAATCGCCGCCAGCTTTTCTCCCATAAAGCAGATGAGGTTTGCCAGGTGATCCCGGTCGGATATATGCGCGCAACAGTCACAGGTGTTGCGGAGGAAAATAAGTAGATGTTTGGCAGAAGTAAAGAGCTGCGTGTTGGGCTACCTTACAGCACg > 2:128796/1‑289 (MQ=255)
tgctgcCAGTGCCAATGGCGTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCggg < 1:482090/289‑1 (MQ=255)
gTGCCAATGGCGTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAATTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGACCGATGTCCGGGCGGTTTAt > 2:853806/1‑289 (MQ=255)
tGGCGTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGtgct > 1:1912665/1‑240 (MQ=255)
gTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCagtcgt > 2:140235/1‑285 (MQ=255)
tGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCg < 2:1489111/271‑1 (MQ=255)
tGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTGACAGCACGCTGTCCGGGCGCGTTATGGGCCagtcgtg > 2:290012/1‑284 (MQ=255)
ggcgATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCtt < 2:1214265/288‑1 (MQ=255)
cgATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTaa < 2:282087/288‑1 (MQ=255)
cgATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAG‑GCTGGGCTTaa > 2:1991003/1‑288 (MQ=255)
gATTGTTTTAATGTCTATGGCAGAACCTTCACTGAAAGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGGCCAGGTCGTAGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATACCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACt < 1:45121/289‑1 (MQ=255)
ttattTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTcc < 2:921654/289‑1 (MQ=255)
attTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACATTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCAt < 2:1699602/289‑1 (MQ=255)
attTTAATGTCTATGGCAGGACCTTCAGTGAAGGAAACCCCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCAt < 2:1155629/289‑1 (MQ=255)
tGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTc < 1:276884/289‑1 (MQ=255)
aTGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGt > 2:826619/1‑289 (MQ=255)
cATGACCTACAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGc < 1:258814/253‑1 (MQ=255)
aTGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAaag < 1:1991003/289‑1 (MQ=255)
aTGACCTGCAGTGAAGGAAACACCGTTAATCAGGGGCAGCTGAACGGGCGTGCGCAGGGCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAaag < 2:343242/289‑1 (MQ=255)
gACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTa > 1:2000147/1‑197 (MQ=255)
gACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCGGGGCGAGTTATGGGCCAGTGGT‑GGCTTACCTCCATTACTGTCAGGGGGAaagag > 2:703793/1‑288 (MQ=255)
gACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGt < 1:929672/282‑1 (MQ=255)
tCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCgtg > 2:1274245/1‑204 (MQ=255)
tCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCgtg < 1:1274245/204‑1 (MQ=255)
cAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGAttt > 2:536398/1‑289 (MQ=255)
aGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGa < 1:1496323/280‑1 (MQ=255)
aGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGATTGGTAGCAGAAAAGTGCTGCGTGACTGGCTACTTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTCATGTGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGGGTATAACGGATTTTACAgc > 2:40865/1‑289 (MQ=255)
aaCACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCg > 1:1721070/1‑289 (MQ=255)
gAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGt < 2:783709/165‑1 (MQ=255)
cagcTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTc > 1:1392771/1‑288 (MQ=255)
cTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACt > 1:163007/1‑229 (MQ=255)
cTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACt < 2:163007/229‑1 (MQ=255)
tGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCAcgcg < 1:826619/289‑1 (MQ=255)
tGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCAcg < 1:867415/287‑1 (MQ=255)
gaccGGTGGTGGGCAGTGCGGTGTTCTCGACAGTAATCATCGCCGCCAGCTTTTCCACCAGAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCAcgcg < 2:102004/285‑1 (MQ=255)
tCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACtt > 1:1287542/1‑289 (MQ=255)
gTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAg < 2:424854/145‑1 (MQ=255)
gTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAg > 1:424854/1‑145 (MQ=255)
gTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGCGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAACGAGGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCTTTTACtttc > 1:676779/1‑287 (MQ=255)
gTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACtttc > 2:1913516/1‑287 (MQ=255)
gTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGcc > 1:1201282/1‑289 (MQ=255)
gTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGcc > 1:89538/1‑289 (MQ=255)
tctcGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCa > 2:1533872/1‑164 (MQ=255)
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tcGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGCCACGGAaagaa > 1:186102/1‑289 (MQ=255)
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cAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGCCACGGAAAGAAGGa < 2:1875046/288‑1 (MQ=255)
cTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCagt < 1:998678/177‑2 (MQ=255)
cTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGtt < 1:619863/252‑1 (MQ=255)
cTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGtt > 2:619863/1‑252 (MQ=255)
tCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGGGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGCCACGGAAAGAAGGATTTCTTTAcc < 1:1540863/289‑1 (MQ=255)
gccgccAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGCCACGGAAAGAAGGATTTCt > 1:1664005/1‑282 (MQ=255)
gccgccAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGCCACGGAAAGAAGGATTTCt < 2:1664005/282‑1 (MQ=255)
gccgccAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGCCACGGAAAGAAGGATTTCTTTACCTg > 1:1561826/1‑289 (MQ=255)
cgccAGCTTTTCCCCCATAAAGCGGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGAAATATGCCCGCCGGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGGACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGCCACGGAAAGAAGGATTTCTTTACCTgg < 1:813884/288‑1 (MQ=255)
cgccAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTa > 2:20434/1‑135 (MQ=255)
cgccAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGCCACGGAAAGAAGGATTTCTTTACCTGGa > 1:1929474/1‑289 (MQ=255)
cgccAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGCCACGGAAAGAAGGATTTCTTTACCTGGa > 1:1874757/1‑289 (MQ=255)
cgccAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGCCACGGAAAGAAGGATTTCTTTACCTGGa > 2:1936045/1‑289 (MQ=255)
cgccAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGCCACGGAAAGAAGGATTTCTTTACCTGGa > 1:962119/1‑289 (MQ=255)
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aTGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCCTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGCAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGCCACGCACAGAAGGATTTCTTTACCTGGAACATGGACGTCTGCTATAAAACTGt > 2:1792069/1‑289 (MQ=255)
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ggTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGCCACGGAAAGAAGGATTTCTTTACCTGGAACATGGACGGCGTCTTGAAAACTGTTGaa > 2:1857373/1‑280 (MQ=255)
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ggTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGCCACGGAAAGAAGGATTTCTTTACCTGGAACATGGACGGCGTCTTGAAAACTGTTGAAAAGACcac < 2:367811/288‑1 (MQ=255)
gATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGCCACGGAAAGAAGGATTTCTTTACCTGGAACATGGACGGCGTCTTGAAAACTGTTGAAAAGACCACACg < 2:597472/288‑1 (MQ=255)
gttCTGGGCGGCAATAGGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGCCACGGAAAGAAGGATTTCTTTACCTGGAACATGGACGGCGTCTTGAAAACTGTTGAAAAGACCACACGTa < 2:480886/288‑1 (MQ=255)
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gTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGCCACGGAAAGAAGGATTTCTTTACCTGGAACATGGACGGCGTCTTGAAAACTGTTGAAAAGACCACACg < 2:1908488/281‑1 (MQ=255)
cAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGCCACGGAAAGAAGGATTTCTTTACCTGGAACATGGACGGCGTCTTGAAAACTGTTGAAAAGACCACACGTACTTTACAACt < 1:1757016/288‑1 (MQ=255)
tGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGCCACGGAAAGAAGGATTTCTTTACCTGGAACATGGACGGCGTCTTGAAAACTGTTGAAAAGACCACACGTACTTTACAACTGtt > 1:369383/1‑286 (MQ=255)
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gaaAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGCCACGGAAAGAAGGATTTCt < 2:1082164/193‑1 (MQ=255)
aaaaCAGTCGATGTTTGGTAGAAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGCCACGGAAAGAAGGATTTCTTTACCTGGAACATGGACGGCGTCTTGAAAACTGTTGAAAAGACCACACGTACTTTACAACTGTTTCTGACGCTGGTGGCGGTGATTTCGCtggtggtg < 1:1792069/289‑1 (MQ=255)
|||
CACCTGCCGTCAGCCAAAACCTGCGCCTGCGTTATAACAATGTTGATGTTGCTGCCAGTGCCAATGGCGTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGAGCATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGAGCT‑GGCTTAACTCCATTACTGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTAGTCTGCGCCACGGAAAGAAGGATTTCTTTACCTGGAACATGGACGGCGTCTTGAAAACTGTTGAAAAGACCACACGTACTTTACAACTGTTTCTGACGCTGGTGGCGGTGATTAGCCTGGTGGTG > CP042583/784286‑784845
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A