Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F210 I1 R1
|
4928 |
340.1 |
5480506 |
96.9% |
5310610 |
252.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
553,557 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 553,557 | 0 | A | T | 99.5%
| 862.4
/ NA
| 367 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (182/181); minor base C (2/0); total (184/183) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 553,558 | 0 | G | C | 98.9%
| 845.2
/ NA
| 367 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/1); new base C (178/182); total (184/183) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.70e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 553,559 | 0 | C | G | 99.2%
| 852.5
/ NA
| 367 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/1); new base G (181/182); total (184/183) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 367 total aligned reads displayed.
TAATTCAGACTATTTATCAGATGACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCAGCGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGAGTCGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAAAGCCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATAGCTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTAGCCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCATTAACTGTCCAGTCTGAATGCCCGGTAACGCTTAAGGATGTGAGCGACCTATGA > CP042583/553282‑553832
|||
gACTATTTATCAGATGACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCACTTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTTGGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAATAAGTCGCTGACGGAAGCAGAGTGTTTATGTCTGCACCAGCGCGTCTATGTACGAGc > 2:2576330/1‑288 (MQ=255)
aCTATTTATCAGATGACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTc > 2:2639682/1‑289 (MQ=255)
cTATTTATCAGATGACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCt < 1:1069871/287‑1 (MQ=255)
aGATGACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTTACCATTACTa > 1:2665636/1‑289 (MQ=255)
aTGACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATc > 2:274644/1‑289 (MQ=255)
gACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAg < 2:248462/272‑1 (MQ=255)
gACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATcac > 1:2051295/1‑289 (MQ=255)
gACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATca > 2:1638999/1‑288 (MQ=255)
atgatgGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTTTATGTACGAGCCCCCCATTACTAAcaacactg > 2:1767578/1‑283 (MQ=255)
aTGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGCCGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTCTGTCCGAGCCTACCATTACTCTACCAACTCGCTGCACTa > 2:1207046/1‑289 (MQ=255)
gCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTAtt > 1:2329707/1‑289 (MQ=255)
tAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCta < 1:2563015/289‑1 (MQ=255)
tAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCta < 1:2639682/289‑1 (MQ=255)
tAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAAGTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCta > 1:103085/1‑289 (MQ=255)
ggCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCtattcgt < 1:546554/289‑5 (MQ=255)
gCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCGGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCCCACCATTACTCTCACAGCGGGACGCACCATATTTCCCCCtattcgtt > 2:2701799/1‑284 (MQ=255)
cTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTTGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGGTGCACTATTTTTCCGCCtattcgtta > 2:341446/1‑283 (MQ=255)
atCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCt > 1:1907723/1‑236 (MQ=255)
atCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCt < 2:1907723/236‑1 (MQ=255)
aTGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTAc < 2:2542044/289‑1 (MQ=255)
ggCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACATGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTg > 2:299100/1‑289 (MQ=255)
ggCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCAcc < 2:2293815/231‑1 (MQ=255)
cATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGGCTATGTACGAGCCCACCATTACTTTCACAGCTGGATGCACTATTTTGCCGTCTTTTCGTTAGGACGTCTCTaactg > 2:141456/1‑284 (MQ=255)
gCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTa < 1:735345/211‑1 (MQ=255)
gCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTa > 2:735345/1‑211 (MQ=255)
ttCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAAtcttct < 1:1396371/289‑1 (MQ=255)
tCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCt > 2:2512078/1‑205 (MQ=255)
tCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTtctc > 1:905937/1‑289 (MQ=255)
aaGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGa > 1:476334/1‑289 (MQ=255)
aaGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGa > 1:1333701/1‑289 (MQ=255)
tGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCt > 2:1361503/1‑204 (MQ=255)
tGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGaca > 1:2386685/1‑289 (MQ=255)
aaaGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGacaaca > 1:1775336/1‑289 (MQ=255)
cATTAATTGCTGGTGGCTCTGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATg < 2:1331129/221‑1 (MQ=255)
tAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCa < 2:2111564/196‑1 (MQ=255)
tggtggCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGa < 1:2702150/288‑1 (MQ=255)
tggtggCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGa < 2:476334/288‑1 (MQ=255)
ggtggctcggagagaGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTTACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGc > 1:613797/10‑264 (MQ=255)
gagGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGt < 2:2051295/288‑1 (MQ=255)
gagGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGt < 1:2286557/288‑1 (MQ=255)
gagGGTTGATTTATACCCAAGTCTTTGCCCCAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGt < 2:2665636/288‑1 (MQ=255)
agGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGc < 1:1997850/250‑1 (MQ=255)
ccgtaTTCGTTACCCATGCCGTGATGGGCGGTGGGTAAAGGGGAATCTAAGCCTGTGATTATGTTCGAATGGGATTTCTGTCACGGGTGGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGGAATCGCGCGTCTATGTACGATCTCACCCTTACTTTCACAGCTTGATGCACTATTTTTCCGCCGATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAgcgc < 2:1702039/285‑1 (MQ=255)
cAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCg < 1:2518584/289‑1 (MQ=255)
aaTTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCgg > 1:1480446/1‑289 (MQ=255)
ttCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAAcc < 1:945149/264‑1 (MQ=255)
ttCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAAcc > 2:945149/1‑264 (MQ=255)
tGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGACGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTCTATGGTTGCAATAGCGCGTCTATGTAAGAGTTAACCACTAATATACCATCTTGATGCACTATTTTTCAGTCTATTCGTTAGGACGTCTATACTGGCACTTTTCTCAGTTCCATGACAACACTTCGCTACGCAAGGCGCTAACTCTGCACAAATCCTATACGCCCGGGacgact > 2:1491831/1‑284 (MQ=255)
aagagatgtgCTATGTGGTATGGGGTGGGGGGGATCAGTGCCTGGGATTATGTTCGAATTGGGTTTCTGTCACGGGTCGTTGTGCTCAACAAGTGGCGGACGAAAGAAGGGAGTTTATGGCTGAAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTa < 2:508856/280‑1 (MQ=255)
ccAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATg > 2:1922596/1‑289 (MQ=255)
tgCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTg < 2:631850/288‑1 (MQ=255)
tgtgGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCt > 1:1192422/1‑236 (MQ=255)
tgtgGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCgg > 1:1737908/1‑263 (MQ=255)
tgGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGa > 2:901842/1‑210 (MQ=255)
tgGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAaga > 1:508856/1‑279 (MQ=255)
tgGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCg > 1:1974304/1‑289 (MQ=255)
ggAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGa > 1:1492568/1‑289 (MQ=255)
aaGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCta > 2:216743/1‑163 (MQ=255)
ggggAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTAGGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGa > 2:539333/1‑289 (MQ=255)
ggAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGa < 2:1118703/218‑1 (MQ=255)
ggAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCa < 2:1525891/276‑1 (MQ=255)
ggAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCa > 1:1525891/1‑276 (MQ=255)
ggAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATc > 2:373421/1‑289 (MQ=255)
ggAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGGTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCAGTACTATCACACCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACAGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGCGCGTCGTATGTTCGAACGGCTGGCACCGGGAAGccgac > 2:1989410/1‑285 (MQ=255)
aGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACtt < 1:1573126/200‑2 (MQ=255)
gATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACg < 1:2180223/288‑1 (MQ=255)
ttCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGt < 1:975689/210‑1 (MQ=255)
tCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTgg < 1:1440789/289‑1 (MQ=255)
gAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAg < 1:1006456/90‑1 (MQ=255)
ggTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTg > 1:2072885/1‑200 (MQ=255)
tgtcacgggtcggTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCATTAACTGt < 1:274644/284‑1 (MQ=255)
cgggtcggTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCATTAACTGTc > 2:1669288/1‑285 (MQ=255)
gtcggTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCAt > 2:1830541/1‑274 (MQ=255)
gtcggTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCAt < 1:1830541/274‑1 (MQ=255)
gtgtGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGa < 2:1935897/169‑1 (MQ=255)
tCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGATGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCATTAACTGTCCAGTCTGAATGCCCGGt > 1:2484891/1‑289 (MQ=255)
caacaaGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCATTAACTGTCCAGTCTGAATGCCCGGTa < 1:299100/289‑1 (MQ=255)
aacaaGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTat > 1:1941124/1‑168 (MQ=255)
acaaGTGGCTGACGGAAGAAGATAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGATCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTATACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCTATTAACTGTCCAGTCTGAATGCCCGGTAAc < 1:2437855/289‑1 (MQ=255)
caaGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCATTAACTGt < 1:2124555/267‑1 (MQ=255)
gTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATAGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCCGCCATTAACTGGCCAGTCTGAATGCCGCGCAACGc > 2:1455073/1‑287 (MQ=255)
tGGCTGACGGACGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTAACCATTACGATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCGCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCATTAACTGTCCAGTCTGAATGCCCGGTAACGCtt < 2:82848/288‑1 (MQ=255)
tgCTGACGGAAGAAGAGGTTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCATTAACTGTCCAGTCTGAATGCCCGGTAACGCTTa < 2:1044705/287‑1 (MQ=255)
ggCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCATTAACTGt > 1:1246995/1‑262 (MQ=255)
ggCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCATTAACTGt > 1:881958/1‑262 (MQ=255)
ggCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCATTAACTGt < 2:1246995/262‑1 (MQ=255)
gCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTg < 2:1994123/114‑1 (MQ=255)
gCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGGGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCATTAACTGTCCAGTCTGAATGCACGGTAACGCTTAAg > 1:166489/1‑289 (MQ=255)
tGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCCGCCATTAACTTTCCAGTCCGAATGCCCGGTAACGCTTAAGGa > 2:1564561/1‑289 (MQ=255)
tGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCATTAACTGTCCAGTCTGAATGCACGGTAACGCTTAAGGa > 1:792579/1‑289 (MQ=255)
aagagaggggTTTATGGCTGCACTCGCGCTTCTTTGTACGAGCTCACCATTACTATAACATCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCATTAACTGTCCAGTCTGAATGCCCGGTAACGCTTAAGGATGTGAg < 2:1958670/280‑1 (MQ=255)
agagagTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCATTAACTGTCCAGTCTGAATGCCCGGTAACGCTTAAGGATGTGAGCGAc < 1:1580325/289‑1 (MQ=255)
agagagTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCATTAACTGTCCAGTCTGAATGCCCGGTAACGCTTAAGGATGTGAGCGAc < 1:373421/289‑1 (MQ=255)
agTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTgg > 2:400733/1‑231 (MQ=255)
agTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTgg < 1:400733/231‑1 (MQ=255)
tttATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTgg < 1:1124206/229‑1 (MQ=255)
tttATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCATTAACTGTCCAGTCTGAATGCCCGGTa < 1:347485/262‑1 (MQ=255)
tttATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCATTAACTGTCCAGTCTGAATGCCCGGTAACGCTTaa > 1:687820/1‑270 (MQ=255)
tttATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCATTAACTGTCCAGTCTGAATGCCCGGTAACGCTTAAGGATGTGAGCGACCTATGa > 2:2442966/1‑289 (MQ=255)
aTGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTTCGCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGAt < 2:2365920/202‑1 (MQ=255)
|||
TAATTCAGACTATTTATCAGATGACTGATGATGGTCATGCCAATGATTTAGCTGGCTTATATCTGACATGGCATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCAGCGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGAGTCGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAAAGCCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATAGCTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAACACTAGCCTACGCGAGGCGCTAACCCTGTACAAATACGATAGCGCCGGGAGTCGTATGTTCGAAGAGCTGGCAGCGGGAAGCGATCGTTTCTATGCCACGCTTCCCTGGCAGCCATTAACTGTCCAGTCTGAATGCCCGGTAACGCTTAAGGATGTGAGCGACCTATGA > CP042583/553282‑553832
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
