Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F210 I1 R1
|
4928 |
340.1 |
5480506 |
96.9% |
5310610 |
252.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP042583 |
738,481 |
3 bp→TCG |
intergenic (–/–) |
– / – |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP042583 | 738,481 | 0 | A | T | 99.7%
| 921.2
/ NA
| 383 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (188/194); minor base G (1/0); total (189/194) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.93e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
| * | CP042583 | 738,482 | 0 | G | C | 99.7%
| 917.9
/ NA
| 383 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (188/194); minor base A (1/0); total (189/194) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.93e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| * | CP042583 | 738,483 | 0 | C | G | 100.0%
| 924.4
/ NA
| 383 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (189/194); total (189/194) |
Only 100 of 383 total aligned reads displayed.
GAAAATTAGTAAAAGAGTAATTTACGTATGTCCAGAATCAATAAGTTCGTACTTACAGTCAGTCTGCTGATTTTTATCATGATTAGTGCAGTTGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACAGCGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTATCTCTTTTGACGGTAAAACCTTCGTCTATTACCTCTATCCGGTAACTCACAATCGTAGTCTGATATTTTTGCTTGGTCTGGAGCGTTTTTCTTTACTGAGTAAAAGCCTGGCGATGGACAGCGAGAACCTGATGTT > CP042583/738202‑738761
|||
ttAAAAGAGTAGTTTACGTATGTCCAGAATCATTAGTTTCGTACTTACAGTCAGTCTGCTTATTTTTATCATGATTTCTGCAGTTGCCTGCGGGATCTACACTCAACTGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTAt < 2:664512/288‑1 (MQ=255)
aaaaGAGTAGTTTACGTATGTCCAGAATCAATAAGTTCGTACTTACAGTCAGTCTGCTGATTTTTATCATGATTTCAGCAGTTGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTAt < 2:271870/287‑1 (MQ=255)
tagtttACGTATGTCCAGAATCAATAAGTTCGTACTTACAGTCAGTCTGCTGATTTTTATCATGATTTCAGCAGTTGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATTAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGAt > 1:811178/4‑289 (MQ=255)
ttACGTATGTCCAGAATCAATAAGTTCGTACTTACAGTCAGTCTGCTGATTTTTATCATGATTTCAGCAGTTGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGt < 1:2424502/287‑1 (MQ=255)
ttACGTATGTCCAGAATCAATAAGTTCGTACTTACAGTCAGTCTGCTGATTTTTATCATGATTTCAGCAGTTGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGt < 1:1548003/287‑1 (MQ=255)
aTGTCCAGAATCAATAAGTTCGTACTTACAGTCAGTCTGCTGATTTTTATCATGATTTCAGCAGTTGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCtt > 2:1627524/1‑289 (MQ=255)
aTAAGTTCGTACTTACAGTCAGTCTGCTGATTTTTATCATGATTTCAGCAGTTGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTAt > 2:2645107/1‑257 (MQ=255)
tCGTACTTACAGTCAGTCTGCTGATTGTTATCATGATTTCAGCAGTTGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGa < 2:1931007/289‑1 (MQ=255)
cGTACTTACAGTCAGTCTGCTGATTTTTATCATGATTTCAGCAGTTGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGTTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGaa > 1:2682015/1‑289 (MQ=255)
cGTACTTACAGTCAGTCTGCTGATTTTTATCATGATTTCAGCAGTTGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGaa < 1:1807659/289‑1 (MQ=255)
gTACTTACAGTCAGTCTGCTGATTTTTATCATGATTTCAGCAGTTGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAAt < 2:2424296/289‑1 (MQ=255)
ttACAGTCAGTCTGCTGATTTTTATCATGATTTCAGCAGTTGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGCCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTAt < 1:1230489/289‑1 (MQ=255)
cagtcagtCTGCTGATTTTTATCATGATTTCAGCAGTTGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCACACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGATTGTCTTCa > 1:2120304/1‑289 (MQ=255)
tcTGCTGATTTTTATCATGATTTCAGCAGTTGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGt < 1:579309/246‑1 (MQ=255)
tcTGCTGATTTTTATCATGATTTCAGCAGTTGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAg > 1:516268/1‑289 (MQ=255)
ctgATTTTTATCATGATTTCAGCAGTTGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTAt > 1:455048/1‑275 (MQ=255)
ctgATTTTTATCATGATTTCAGCAGTTGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTAt < 2:455048/275‑1 (MQ=255)
ttttATCATGATTTCAGCAGTTGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCgag < 1:882707/289‑1 (MQ=255)
tgatttcagCAGTTGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAatta < 2:2462225/281‑1 (MQ=255)
atGCAGTTGCCTGCGGGGTTTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGc < 2:1111710/288‑1 (MQ=255)
agCAGTTGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTAt < 1:750966/254‑1 (MQ=255)
gTTGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGata > 1:376865/1‑289 (MQ=255)
ttGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGCGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGatat > 1:2045642/1‑289 (MQ=255)
ttGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTAt < 1:1304487/250‑1 (MQ=255)
ttGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTAt > 2:1304487/1‑250 (MQ=255)
ttGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGatat > 2:207009/1‑289 (MQ=255)
ttGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGatat > 2:1684266/1‑289 (MQ=255)
gCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGt < 1:2645924/215‑1 (MQ=255)
tGCGGGATCTACACTGTAATGGTAAGGGATCGGTTGTATAGCCTGAACCAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGGTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGc < 2:93573/289‑1 (MQ=255)
tGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGc < 2:736298/289‑1 (MQ=255)
tCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTtgt < 2:516268/289‑1 (MQ=255)
cTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTtgtg < 1:1700/289‑1 (MQ=255)
acTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACg < 2:1651183/196‑1 (MQ=255)
acTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACg > 1:1970222/1‑196 (MQ=255)
aaaTGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTAt > 1:1440798/1‑229 (MQ=255)
aaaTGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGCTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGc > 2:342039/1‑273 (MQ=255)
aaTGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGa < 1:978885/289‑1 (MQ=255)
gTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTAt < 1:412191/224‑1 (MQ=255)
aGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCaa < 2:230786/289‑1 (MQ=255)
aCGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCa > 1:1928722/1‑284 (MQ=255)
ggTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCTTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGaaa > 2:1054341/1‑235 (MQ=255)
ccTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGCGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTTAAGTATCCACATTTCAAAATTACAGGGTTTac > 2:2477869/1‑287 (MQ=255)
cttaaaCAGTCCTTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTTAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTAt < 2:2120304/284‑1 (MQ=255)
tGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACAt > 1:187384/1‑266 (MQ=255)
tGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTAtc > 1:431926/1‑287 (MQ=255)
tGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTAtc > 1:705604/1‑287 (MQ=255)
tGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTAtc > 1:1420934/1‑287 (MQ=255)
aaCAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACAt < 2:839174/263‑1 (MQ=255)
tCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTcc > 1:175127/1‑167 (MQ=255)
tCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGCATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATtgtg > 2:1986926/1‑226 (MQ=255)
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tCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGAAGGTTGGGAAGTATCGACATGTCAAAAATACCGGGTTAATCCTTTTTGatg > 2:745935/1‑287 (MQ=255)
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tGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTATCTCTTTTGACGGTAAAACCTTCg > 1:103101/1‑287 (MQ=255)
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ttttGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTATCTCTTTTGACGGTa > 1:1636023/1‑275 (MQ=255)
ttGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGc > 2:1495570/1‑208 (MQ=255)
gCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATa < 2:292782/247‑1 (MQ=255)
aaTATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTATCTCTTTTGACGGTAAAACCTTCGTCTATTACCTCTATCCgg < 1:664475/289‑1 (MQ=255)
aaTATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTATCTCTTTTGACGGTAAAACCTTCGTCTATTACCTCTATCCgg < 2:431926/289‑1 (MQ=255)
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aaTATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTATCTCTTTTGACGGTAAAAc < 1:1354675/256‑1 (MQ=255)
aaTATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTATCTCTTTTGACGGTAAAAc > 2:1354675/1‑256 (MQ=255)
atgggggTAACGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTTTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTATCTCTTTTGACGGTAAAACCTTCGTCTATTACCTCTATCCGGTAACTCACAATCg < 2:2205433/283‑1 (MQ=255)
atCGGCGTAGCTTGGCAATTGCTCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTATCTCTTTTGACGGTAAAACCTTCGTCTATTACCTCTATCCGGTAACTCACAATCg < 2:2666146/289‑1 (MQ=255)
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gCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTATCTCTTTTGACGGTAAAACCTTCGTCTa > 2:541322/1‑258 (MQ=255)
gCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTATCTCTTTTGACGGTAAAACCTTCGTCTa < 1:541322/258‑1 (MQ=255)
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ttGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTATCTCTTTTGACGGTAAAACCTTCGTCTATTACCTCTATCCGGTAACTCACAATCGTAGTCTGATATTTTTGCt < 2:1808687/289‑1 (MQ=255)
gATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTtgtg < 1:2546779/183‑1 (MQ=255)
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cacGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTATCTCTTTTGACGGTAAAACCTTCg < 1:11320/227‑1 (MQ=255)
gCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTATCTCTTTTGACGGTAAAACCTTCGTCTATTACCTCTATCCGGTAACTCACAATCGTAGTCTGATATTTTTGCTTGGTCTGGAGCGtttt > 2:2685408/1‑289 (MQ=255)
tAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTATCTCTTTTGACGGTAAAACCTTCGTCTATTACCTCTATCCGGTAACTCACAATCGTAGTCTGATATTTTTGCTTGGTCTGGAGCGTTTTTc > 2:1026523/1‑289 (MQ=255)
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aCGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTATCTCTTTTGACGGTAAAACCTTCGTCTATTACCTCTATCCGGTAACTCACAATCGTAGGCTGATATTGTTGCTTGGTCTGGAGCGTTTTTCTTTACTgg > 2:2524302/1‑288 (MQ=255)
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cTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGATAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACAt < 2:2138769/159‑1 (MQ=255)
tGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTATCTCTTTTGACGGTAAAACCTTCGTCTATTACCTCTATCCGGTAACTCACAATCGTAGTCTGATATTTTTGCTTGGTCTGGAGCGTTTTTCTTTACTgtcaaaatcgc < 1:295576/285‑11 (MQ=255)
tGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTATCTCTTTTGACGGTAAAACCTTCGTCTATTACCTCTATCCGGTAACTCACAATCGTAGTCTGATATTTTTGCTTGGTCTGGAGCGTTTTTCTTTACTgtcaaaatcgc < 1:1001218/285‑11 (MQ=255)
ttggttTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTATCTCTTTTGACGGTAAAACCTTCGTCTATTACCTCTATCCGGTAACTCACAATCGTAGTCTGATATTTTTGCTTGGTCTGGAGCGTTTTTCTTTACTGTCAAAATCGCTGGCGATgg < 1:1658374/288‑1 (MQ=255)
gttTGCGCACAGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTATCTCTTTTGACGGTAAAACCTTCGTCTATTACCTCTATCCGGTAACTCACAATCGTAGTCTGATATTTTTGCTTGGTCTGGAGCGTTTTTCTTTACTGTCAAAATCGCTGGCGATGGACAg > 1:1086417/1‑289 (MQ=255)
caacaGCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGGTGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTATCTCTTTTGACGGTAAAACCTTCGTCTATTACCTCTATCCGGTAACTCACAATCGTAGTCTGATATTTTTGCTTGGTCTGGAGCGTTTTTCTTTACTGTCAAAATCGCTGGCGATGGACAGCgaga < 2:1435683/286‑1 (MQ=255)
gCTTACGCCGACTCGGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTATCTCTTTTGACGGTAAAACCTTCGTCTATTACCTCTATCCGGTAACTCACAATCGTAGTCTGATATTTTTGCTTGGTCTGGAGCGTTTTTCTTTACTGTCAAAATCGCTGGCGATGGACAGCGAGAACCTGa > 2:1711246/1‑289 (MQ=255)
|||
GAAAATTAGTAAAAGAGTAATTTACGTATGTCCAGAATCAATAAGTTCGTACTTACAGTCAGTCTGCTGATTTTTATCATGATTAGTGCAGTTGCCTGCGGGATCTACACTCAAATGGTAAAGGAACGGGTGTATAGCCTGAAACAGTCCGTTATTGATACTGCTTTTGCGGTGGCAAATATTGCTGAATATCGGCGTAGCGTGGCAATTGATCTTATCAACACGCTAAATCCCACGGAGGAACAGCTGTTGGTTGGTTTGCGCACAGCTTACGCCGACAGCGTTTCCCCCTCTTATTTGTACGATGTCGGTCCTTATCTGATTTCCAGTGACGAATGTATTCAGGTAAAGGAGTTCGAGAAAAATTATTGTGCAGATATTATGCAGGTTGTGAAGTATCGACATGTCAAAAATACAGGGTTTATCTCTTTTGACGGTAAAACCTTCGTCTATTACCTCTATCCGGTAACTCACAATCGTAGTCTGATATTTTTGCTTGGTCTGGAGCGTTTTTCTTTACTGAGTAAAAGCCTGGCGATGGACAGCGAGAACCTGATGTT > CP042583/738202‑738761
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
