Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F999 I1 R1
|
225 |
156.4 |
11709729 |
83.8% |
9812752 |
75.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,544,357 |
+G |
coding (163/1314 nt) |
gntT → |
gluconate permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,544,356 | 1 | . | G | 99.1%
| 304.6
/ ‑3.7
| 112 | coding (162/1314 nt) | gntT | gluconate permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base G (57/54); total (58/54) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 |
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
CCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑G‑‑C‑GGA‑CG‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCA > NC_000913/3544281‑3544419
|
ccTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTc > 1:3824517/1‑76 (MQ=255)
ccTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTc > 1:4985139/1‑76 (MQ=255)
cTCGTGTCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTc‑g < 1:2243582/76‑1 (MQ=255)
cTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTc‑g < 2:3460270/76‑1 (MQ=255)
cTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTc‑g < 1:409165/76‑1 (MQ=255)
cTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTc‑g < 1:5267509/76‑1 (MQ=255)
cGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTc‑ggc > 1:1000142/1‑74 (MQ=255)
gTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTc‑ggcg > 1:4239359/1‑73 (MQ=255)
ggATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGcc < 2:2497904/76‑1 (MQ=255)
aTTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCtt < 1:139256/76‑1 (MQ=255)
aTTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCtt < 2:4282857/76‑1 (MQ=255)
aTTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCtt < 2:3473899/76‑1 (MQ=255)
aTTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCtt > 1:4190895/1‑76 (MQ=255)
aTTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCtt < 2:1866624/76‑1 (MQ=255)
aTTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCtt < 1:4607170/76‑1 (MQ=255)
aTTAACGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGGTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCtt > 1:4035020/1‑76 (MQ=255)
ttAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTg < 2:2768587/76‑1 (MQ=255)
aaTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGcc < 1:3145897/76‑1 (MQ=255)
aTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGccc > 1:2868821/1‑76 (MQ=255)
aTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGccc > 1:2521441/1‑76 (MQ=255)
aTGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGGAGCCTTGtcc > 1:3223225/1‑76 (MQ=255)
tGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCt > 1:2295828/1‑76 (MQ=255)
gCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTg > 1:4240413/1‑76 (MQ=255)
gCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTg > 1:3667360/1‑76 (MQ=255)
gCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTg < 2:1586554/76‑1 (MQ=255)
cAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGa < 1:4625560/76‑1 (MQ=255)
aaGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGAt < 2:2116731/76‑1 (MQ=255)
aaGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGAt > 1:5587924/1‑76 (MQ=255)
aaGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGAt < 1:251881/76‑1 (MQ=255)
aaGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGAt < 1:1938261/76‑1 (MQ=255)
aGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATc < 1:4948689/76‑1 (MQ=255)
ggAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGACCC‑CCGGTAGCCCTGCCCtcatca > 2:5480547/1‑76 (MQ=255)
ggAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCCGATCa > 2:4452916/1‑76 (MQ=255)
gAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCAt < 2:4440872/76‑1 (MQ=255)
aaTGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATg < 2:2631144/76‑1 (MQ=255)
tGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGGAGCCTTGCCCTGATCATggg > 1:5423375/1‑76 (MQ=255)
ccGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCCTGCCCTGATCATGGGtt > 2:4780317/1‑76 (MQ=255)
tgtGGATAATGATATTGGTGCCGTCAGAGCCGGGGTCGG‑‑CGGGA‑GGCTCGGTATCGTTGCCCTGATCATGGGtttt < 2:212245/74‑1 (MQ=255)
gCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGtttt < 2:630269/76‑1 (MQ=255)
cTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTg < 1:519394/76‑1 (MQ=255)
ggATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgc < 2:4771712/76‑1 (MQ=255)
ggATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgc < 2:4814330/76‑1 (MQ=255)
gATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgcg < 1:5618031/76‑1 (MQ=255)
gtAAAGTGGTGGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGG‑CGTTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTTgcgg < 2:579426/75‑2 (MQ=255)
aTAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgcgc > 1:5072361/1‑76 (MQ=255)
aTAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGgcgc > 2:673719/1‑76 (MQ=255)
aTAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑GGAG‑GGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCCTGGGGTTTGgcgc > 2:1329153/1‑76 (MQ=255)
tAAAGTTATTGGCTCCCTCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCa > 2:4004585/1‑76 (MQ=255)
tAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGCTCATGGGTTTTGGCGCa > 2:3958780/1‑76 (MQ=255)
tAAAGTTATTGGCGCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCa < 2:3918918/76‑1 (MQ=255)
tAAAGTTATGGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGTGTGTTGgcgaa < 2:1532820/76‑3 (MQ=255)
aaaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCaa > 1:1924857/1‑76 (MQ=255)
aaaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCaa > 1:3459738/1‑76 (MQ=255)
aaGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAAt < 1:2985884/76‑1 (MQ=255)
aGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATg < 1:933246/76‑1 (MQ=255)
gtgaTTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGc < 2:328401/73‑1 (MQ=255)
gTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGc > 2:4163251/1‑76 (MQ=255)
gTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGc < 1:2159679/76‑1 (MQ=255)
gTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGc < 1:3559093/76‑1 (MQ=255)
ttATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCt > 2:1753366/1‑76 (MQ=255)
ttATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCt > 1:909486/1‑76 (MQ=255)
ttATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGGTTTGGCGCAATGCt > 1:1638130/1‑76 (MQ=255)
ttATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCCGATCATGGGGTTTTGCGCAATGCt > 2:321815/1‑76 (MQ=255)
tATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTg < 1:3884097/76‑1 (MQ=255)
tATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTg < 2:5115693/76‑1 (MQ=255)
tATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTg > 1:5146332/1‑76 (MQ=255)
tATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTg < 1:2659045/76‑1 (MQ=255)
aTTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTgg < 1:1889284/76‑1 (MQ=255)
ttGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTggg < 2:3572832/76‑1 (MQ=255)
ttGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTggg > 1:2413846/1‑76 (MQ=255)
tGGCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGc > 2:2887020/1‑76 (MQ=255)
ggCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCa > 1:613195/1‑76 (MQ=255)
gCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaa > 1:534100/1‑76 (MQ=255)
gCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaa > 2:3447709/1‑76 (MQ=255)
gCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaa > 1:4370591/1‑76 (MQ=255)
gCTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCCGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaa > 2:3183513/1‑76 (MQ=255)
cTCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaa < 1:1468813/76‑1 (MQ=255)
tCCATCAGAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaaa < 2:1718865/76‑1 (MQ=255)
tCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaaa > 2:2338542/1‑76 (MQ=255)
tCCATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCaaaa > 1:4907051/1‑76 (MQ=255)
ccATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTTCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAt < 2:1022652/76‑1 (MQ=255)
ccATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAAt < 2:5076308/76‑1 (MQ=255)
cATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATg < 2:3864426/76‑1 (MQ=255)
cATCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATg > 2:4605687/1‑76 (MQ=255)
aTCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGc > 1:3901027/1‑76 (MQ=255)
aTCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGc > 1:425972/1‑76 (MQ=255)
aTCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGc < 1:5744834/76‑1 (MQ=255)
tCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCCTGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCt > 2:3133455/1‑76 (MQ=255)
tCAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCt < 1:4656250/76‑1 (MQ=255)
cAAAGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTg > 1:524487/1‑76 (MQ=255)
aaaGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTgg > 1:2106846/1‑76 (MQ=255)
aaaGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTgg > 2:2991023/1‑76 (MQ=255)
aaaGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTgg > 1:2980210/1‑76 (MQ=255)
aaaGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTgg < 1:3998541/76‑1 (MQ=255)
aaaGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTgg > 2:1290999/1‑76 (MQ=255)
aaaGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTgg > 1:5410459/1‑76 (MQ=255)
aaGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGc > 2:4444845/1‑76 (MQ=255)
aGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCCATGCTGGGCAAAATGCTGGCa > 2:1014804/1‑76 (MQ=255)
aGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCa > 1:4375502/1‑76 (MQ=255)
aGCCGGTGTCGG‑‑CGGGA‑CGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCa < 1:2173756/76‑1 (MQ=255)
|
CCTCGTGGCGCTTGCTGTTGGATTAATGCAAGGAATGCCGCTGGATAAAGTTATTGGCTCCATCAAAGCCGGTGTC‑G‑‑C‑GGA‑CG‑TCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCA > NC_000913/3544281‑3544419
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
