Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F28 I0 R1
|
43 |
55.9 |
1320120 |
86.3% |
1139263 |
218.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,609,767 |
T→G |
24.6% |
G118G (GGT→GGG) |
prfC → |
peptide chain release factor RF‑3 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,609,767 | 0 | T | G | 24.6%
| 73.9
/ 3.0
| 55 | G118G (GGT→GGG) | prfC | peptide chain release factor RF‑3 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (16/21); new base G (12/3); total (31/24) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.99e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AAAAGGCCGTGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGACGAAACCTATCTC > NC_000913/4609551‑4609989
|
aaaaGGCCGTGGGTCCAACCAGTCCGGTAAGGCGGGCTGGATGGAGGTGGAAAAGCAGCGTGGGATCGCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCg < 2:642081/228‑1 (MQ=255)
tGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGTTACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTCCCTGTTGGTTTTCGACGCCGCCAAGGGGGTGGAAGATCGTACCCCTaa > 2:119087/1‑228 (MQ=255)
tGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGGGGACTCCTGCCTGATGGTTATCGACTCCGCAAAAGGGGTTGAGGATCGTAccccaca > 1:651544/1‑224 (MQ=255)
tGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTAACGGCGTTGGACGGCTGCCTGATGGTTACCGACCCCGCAAAAGGGGTTGAGAATCGTACCCGTaa > 2:651452/1‑228 (MQ=255)
tGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCCGACGGCGGTGGCATTCTGACGTGTGGTGATGGACGCTGCAAAAGGCGTTGCAGAGCgacccccg > 1:364884/1‑219 (MQ=255)
tGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGCACCCTGACGGCGGTGGACGGCTGCCTGATGGTTATCGACTCCGCACAAGGGTTTGCAGATCGTACCCGGaa > 1:83436/1‑228 (MQ=255)
cACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGtt > 1:557843/1‑228 (MQ=255)
aCTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGCGGACTGCTGCCTGCTGGTTATCGACGCCGCCAAAGGAGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTccgc > 1:343102/1‑227 (MQ=255)
tggagatggaAAAGGGGGGGGGGTCCTCCATTTCTTCGCCTGGGATTCAGTTTCCGT‑TCACCGATTGCCGGGTTAACCGGCTCCACACCCCGGGGCACGAAGACTTCCCGGAAGTTACCTATCTTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTCCCCGTCTGCGCGACACGc < 2:557340/228‑1 (MQ=255)
gagatggaAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCGGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGcc < 1:32956/227‑1 (MQ=255)
gaAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGCCGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTTGGCGGGACACGCCGGTCCTc > 1:241131/1‑228 (MQ=255)
aaaaGCAGCGTGGGATCCCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACCCCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAGGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCa < 1:119087/228‑1 (MQ=255)
aaaaGCAGCGTGGAATCTCCATTACTTCGTCTGGTATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTTGTTAACCTGCTAGACACCCCGGTGCACGAAGACTTCTCGGAAGATTCCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCa < 1:358794/228‑1 (MQ=255)
gTGGGATCTCCATTACGACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATg < 1:382743/185‑1 (MQ=255)
ggctctcCTTTACTTCGGTTGTGGTGCGTGTTCCGTATCC‑CGCTTCCCTGGTTACCCGGCTCGCCACCCCGGGGATCGAAGTTGTCTCGGACTATATCGATCGTACCTGTACTGCGTTTGACTGCTGCCTGATGGTGATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGAAGATCGTACCCTTAATCTGATGGAAGTTCCCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCGCCTTTATGAAc < 2:435966/224‑1 (MQ=255)
ctcCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGCCTGATGCCCGATTGTTATCGACTCCGCAAAAGGTGTTGACGAGCGCACCCGTAAGCTGACGGAAGTTACCAGTCTGCGCGCAACGCCCACTCTGCCCCTTCAGAACAAACt > 2:239820/1‑228 (MQ=255)
ttcttcGTCTGGTATGGAGTTCCCGTATCA‑CGTTTGCCTGGTTACCCTGCTCGACCCCCCGGGGCACGAAGGCTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGGGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCg < 2:607790/223‑1 (MQ=255)
cGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGCGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGGGCGCCACCCCGCTCCCCCCCTTTTTGAAACAAATTTACCgggtaa > 2:445492/1‑223 (MQ=255)
cGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTCCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCACAACGCCAATCCCAACCATTATGAAAAAAATTGAcctgacaa > 2:11400/1‑222 (MQ=255)
tCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACACGTCTGCTCGACACGCCGATCCTCACCCTTATGAACAAACTTGACCGTGAGATc > 1:362558/1‑228 (MQ=255)
tCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGAAAGTTACCCGTCTGCCGGACCCGCCGTTCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATc > 1:468743/1‑228 (MQ=255)
tCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGGAGATCGTACCCCTAAGCTGATGGAAGTTACCCGCCTGCGCGCCCCCCCGAGCCCCACCTTTTTGAACAAACTTCACCGGGAAATc > 2:599114/1‑228 (MQ=255)
tCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCCGATGGTTATCGACGCCCCAAAAGGTGTTGACGATCGTACCCGGAAGCCGATGGAAGCTCCCCGCCTACGCGAAACCCCCCACCACACATTTATGACCAAACTTGACCGCGATATc > 2:55621/1‑228 (MQ=255)
tCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGGGGACTGCTGCCTGATTGTTATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGACGTTACCCGTACGGCCGCCACGCCGACCCCCCCCTTTATGAACCAACTTAACCGGGATATc > 2:394446/1‑228 (MQ=255)
tgATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGTTACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCACCGCCGCAAAAGTGGTTGAAGACCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCCGCGCTAAACACCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGAGATcgcc > 1:352612/1‑224 (MQ=255)
tgATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGACTGCGCGACACGCCGATCCTCACCCTTATTAACAAACTTTAACGTGATACCcgc > 1:412222/1‑227 (MQ=255)
tCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTTACCGTGATATCGACGACCCGATggc > 1:340991/1‑227 (MQ=255)
gctATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCCCGACCCCCCGGGGCACGAAGTCTTCTCGGAAGATACCTTTCGTTCCCTGACGGCGTTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGAAGGAg < 1:484370/225‑1 (MQ=255)
a‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAAATTGACCGTGATATCCGCGACCCCATGGAGCTGCTCg > 1:49246/1‑228 (MQ=255)
gATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCg < 1:11400/226‑1 (MQ=255)
ctttGCTTGGTTACCCTTCCCGCCCCCCCGGGTACCGAAGCCTTCTCGGAAGATACCGATCGTACCCTGACGGCGGGGGACTGCTGCCTGAAGGTTGTCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGACCGTACCCGTAAGCGGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGAt < 2:309160/226‑1 (MQ=255)
aatggCCGGGTTAACCTCGTGAACACCCCGGGGCACGAAGACTTCCAGGAAGGTACCTACCGTGCCCTGACGCGGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTTTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAGCCGATGGAGCTGCGCGAt < 2:390490/224‑1 (MQ=255)
aTTGCCTGGTTAACCTGCTCGACCCCCCGGGGCACGAAGTCTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGAt < 1:423108/227‑1 (MQ=255)
gTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGGCCTTCTCGATGAAGTTggg > 1:148189/1‑226 (MQ=255)
ttACCCTGTTCGACCCCTCGGGGCACGAAGACTTCTGGGAAGATCCCTATCGTGCCCGGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGGCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTgaga < 2:412222/228‑1 (MQ=255)
cccTGCCCGACACCCGGGGGCAGGAAGACTTCGCGGAAGATACCAGCCTTACCGTGAGGGCGGTGGCAGGCTGCCTGATGGTTAGCGAGGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGGCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCTACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACg < 2:455621/227‑1 (MQ=255)
tCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAAATTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGCACGAGCTGAAAATCGGCTGTGGGCCGGTCCCCCGGCCGATTgggcgggg > 1:306128/1‑222 (MQ=255)
tCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGAAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGAGGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGGCCCGATCACCTGGCCGATTGACTGCgg > 1:73296/1‑228 (MQ=255)
cctgggcgggggTGGCCTGCTCCCGTAGGGTTATCGGCGCCGAAAAGGGTGTTGAAGACCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTAGGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAg < 2:651544/221‑1 (MQ=255)
cccTGCCGGCTGTGGACTGCGGCCTTATTGTTAGCGACGCAGAAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTTATGGAAGTTACCCGTCTGGGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAg < 1:223238/227‑1 (MQ=255)
cccTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCCCCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGACGTTGGAAGCGAGATGCAAATCGGCTGTGACCCGACCACCTGGCGGATTGGCGGGGGCacca > 2:240443/1‑225 (MQ=255)
cccTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAACTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGTTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGGGCGGAGAACCTGCCCGATGGGCGGAGGAAAGc > 2:269992/1‑228 (MQ=255)
aCGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGGAGGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGtt > 1:357315/1‑227 (MQ=255)
aCGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGACCTGaaaa > 1:29098/1‑181 (MQ=255)
aCGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGGTGAGAACGAGCTGAAAAACCGCAGTGCGCCGGTCACCTGGCCGATTGGGCGCGGCAACCCGttt > 2:579154/1‑228 (MQ=255)
tgctgcCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTac < 1:445492/228‑1 (MQ=255)
gttcgcgtagggTTATCGCCCCCGCAAAGGGGGGTGAAGATCGTACCCGGAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCCGAGCGCCACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTac < 2:49246/217‑1 (MQ=255)
ctgcCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGAAGATCGTACCCGGAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTCCTCGATGAAATTGGGAACGAGCTGAAAATCGCCTGTGCGCCGATTACCTGGCGGATTGGGTGCGGCAAAAGGTTTAAAGGGGTTTaca > 2:600999/1‑226 (MQ=255)
cctgtaTGTTTTTCGACGCGGCAAAAGGTGTTGAAGACCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTCCCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTaccac < 2:241131/222‑1 (MQ=255)
aTCGATGCCGCAAAGGGGGTTGAAGATCGTACCCGTAAGGTGAGGGAAGTTCCCCGTCTGGGCGGCCCGGCGATCCTCCCCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGAc < 2:148189/228‑1 (MQ=255)
aTCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGAGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCAGCTGTGCGCCGAGCACCTGGCTGATTGGCTGCGGCAAGCGTGTTAAAGCCCTTTa > 1:137793/1‑212 (MQ=255)
tggACCCCTCAAAAGGTGTTGAAGATCTTCCCCGTAAGCGGATGAAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCCCCTTTATGAACAAACCTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGACg < 1:225100/226‑1 (MQ=255)
gcctcAAAAGGTGTTGAAGCTCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGACGAAAc < 1:599114/227‑1 (MQ=255)
cgcAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCTGTTACACCCTTTTTAAAAACGAAAccat > 2:442262/1‑226 (MQ=255)
aaaGGTTGTGAAGTTCTTCCCCGTAAGGTTATGGAGATTCCCCGTCGGGCCACCCCGCCGCTCCCCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGAGGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGACGAAACCTAtctc < 2:357315/228‑1 (MQ=255)
|
AAAAGGCCGTGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGACGAAACCTATCTC > NC_000913/4609551‑4609989
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
