Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F80 I1 R1
|
119 |
143.3 |
3427330 |
99.1% |
3396484 |
212.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,530,108 |
A→G |
Y112C (TAC→TGC) |
hslO → |
molecular chaperone Hsp33 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,530,108 | 0 | A | G | 100.0%
| 394.7
/ NA
| 104 | Y112C (TAC→TGC) | hslO | molecular chaperone Hsp33 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (36/68); total (36/68) |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
AACCACGATTATCCGCAGCCCGTTAAAAACGTGCTGGCAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTACGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTAGACGGCAAACCGGCTGCAGGCGGTATGTTGTTGCAGGTAATGCCTGCGCAAAATGCCCAGCAGGACGACTTTGACCACCTGGC > NC_000913/3529873‑3530339
|
aaCCACGATTATCCGCAGCCCGTTAAAAACGTGCTGGCAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGTCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCgtg < 2:1659613/240‑1 (MQ=255)
aCCACGATTATCCGCAGCCCGTTAAAAACGTGCTGGCAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCgtg < 2:239821/239‑1 (MQ=255)
ccACGATTATCCGCAGCCCGTTAAAAACGTGCTGGCAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCgtgg > 1:1451742/1‑239 (MQ=255)
cGATTATCCGCAGCCCGTTAAAAACGTGCTGGCAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGAt < 2:232794/240‑1 (MQ=255)
cGATTATCCGCAGCCCGTTAAAAACGTGCTGGCAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGAt < 1:784223/240‑1 (MQ=255)
cGATTATCCGCAGCCCGTTAAAAACGTGCTGGCAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGAt < 1:604603/240‑1 (MQ=255)
gATTATCCGCAGCCCGTTAAAAACGTGCTGGCAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGAt < 2:24614/239‑1 (MQ=255)
gATTATCCGCAGCCCGTTAAAAACGTGCTGGCAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGAt < 1:1255826/239‑1 (MQ=255)
gATTATCCGCAGCCCGTTAAAAACGTGCTGGCAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGAt < 2:1451739/239‑1 (MQ=255)
gATTATCCGCAGCCCGTTAAAAACGTGCTGGCAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGAt < 2:1456059/239‑1 (MQ=255)
cGCAGCCCGTTAAAAACGTGCTGGCAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTa > 2:74216/1‑240 (MQ=255)
aGCCCGTTAAAAACGTGCTGGAAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGAt < 1:420074/229‑1 (MQ=255)
cccGTTAAAAACGTGCTGGCAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTAcccc > 2:608371/1‑239 (MQ=255)
gTTAAAAACGTGCTGGCAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGAt < 2:817253/224‑1 (MQ=255)
cGTGCTGGCAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCg < 1:778578/239‑1 (MQ=255)
gTGCTGGCAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGaa < 1:43268/240‑1 (MQ=255)
gTGCTGGCAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGaa < 1:135970/240‑1 (MQ=255)
gTGCTGGCAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTGTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGaa < 2:557538/240‑1 (MQ=255)
tGCTGGCAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGaa > 2:1212083/1‑239 (MQ=255)
gCTGGCAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAAc > 2:1226604/1‑239 (MQ=255)
gCTGGCAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACg < 1:914699/240‑1 (MQ=255)
gCAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTAt < 1:557945/240‑1 (MQ=255)
cAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTAt < 2:1646605/239‑1 (MQ=255)
aGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATc < 2:79249/239‑1 (MQ=255)
tgGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAg > 1:1269316/1‑240 (MQ=255)
ggTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAg < 2:826390/239‑1 (MQ=255)
tGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTg > 2:1055445/1‑239 (MQ=255)
gACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTc > 1:1107665/1‑239 (MQ=255)
cAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGa < 1:1353561/240‑1 (MQ=255)
cAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGa < 1:813600/240‑1 (MQ=255)
cAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGa < 1:1271041/240‑1 (MQ=255)
aGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGa < 1:597507/239‑1 (MQ=255)
cGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTg < 1:150070/226‑1 (MQ=255)
gCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCgtg < 1:528802/171‑1 (MQ=255)
gCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCgtg > 2:528801/1‑171 (MQ=255)
gCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTg > 1:140655/1‑240 (MQ=255)
tACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTgg > 1:777708/1‑239 (MQ=255)
aCGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGaa < 2:817745/198‑1 (MQ=255)
cGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTggcgg > 2:1190288/1‑240 (MQ=255)
cGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTggcgg > 2:1449622/1‑240 (MQ=255)
gCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTggcggc < 1:1368038/240‑1 (MQ=255)
cTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTggcggc < 1:1549703/239‑1 (MQ=255)
tGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTggcggc < 2:140655/238‑1 (MQ=255)
gAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGgcct < 1:1273887/239‑1 (MQ=255)
gTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGgcctgcct < 1:1708615/240‑1 (MQ=255)
tttGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGtctgcctg < 1:914988/240‑1 (MQ=255)
tGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAAGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCCgg > 2:31582/1‑239 (MQ=255)
aTGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTgg > 2:373989/1‑237 (MQ=255)
ggTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGa < 1:324704/239‑1 (MQ=255)
ggTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGa < 1:935415/239‑1 (MQ=255)
cACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTAt < 2:668038/240‑1 (MQ=255)
cACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTAt < 1:856540/240‑1 (MQ=255)
cACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTAt < 1:763088/240‑1 (MQ=255)
cGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGa > 2:258316/1‑171 (MQ=255)
tACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGtt > 2:519481/1‑240 (MQ=255)
cAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGaa < 2:139440/168‑1 (MQ=255)
gCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTg < 2:131028/239‑1 (MQ=255)
cTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAg > 2:1505175/1‑220 (MQ=255)
cAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGAt < 1:107232/137‑1 (MQ=255)
cAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGAt > 2:107232/1‑137 (MQ=255)
gggCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCt < 1:353173/240‑1 (MQ=255)
cGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCgtggtg < 2:1404155/127‑1 (MQ=255)
cGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGc > 1:1116481/1‑221 (MQ=255)
cGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGa < 1:578584/239‑1 (MQ=255)
cGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGcc < 1:652578/240‑1 (MQ=255)
tGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTg < 2:1409097/239‑1 (MQ=255)
ggCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCgtg > 1:657106/1‑109 (MQ=255)
ggCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCgtg < 2:657105/109‑1 (MQ=255)
cGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGc > 1:1394170/1‑239 (MQ=255)
tAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTa > 2:450282/1‑238 (MQ=255)
tAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTAGa > 2:390812/1‑240 (MQ=255)
tAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTGATTCGCACCGGCGACGTAg > 2:1251461/1‑239 (MQ=255)
gcagATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAg < 1:1436549/128‑1 (MQ=255)
gcagATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAg > 2:1436547/1‑128 (MQ=255)
agATGCGCGGTGTGGCGCGAGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATAACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGa < 1:921586/136‑1 (MQ=255)
aTGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTAGACGGCAAACCGGCTg > 2:1347312/1‑238 (MQ=255)
gcgcGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTAGACGGCAAACCGGCTGCAgg < 2:805701/240‑1 (MQ=255)
gcgcGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTAGACGGCAAACCGGCTGCAgg < 2:1708217/240‑1 (MQ=255)
gcgcGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTAGACGGCAAACCGGCTGCAgg < 1:1599172/240‑1 (MQ=255)
gcgcGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTAGACGGCAAACCGGCTGCAgg < 1:133933/240‑1 (MQ=255)
gcgcGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTAGACGGCAAACCGGCTGCAgg < 1:204250/240‑1 (MQ=255)
gcgcGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTACACGGCAAACCGGCTGCAgg < 1:520593/240‑1 (MQ=255)
gggtgGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCgtggtg < 2:494209/72‑1 (MQ=255)
tgGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTAGACGGCAAACCGGCTGCAGGCGGTAtg > 2:1643464/1‑239 (MQ=255)
gcgTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTAGACGGCAAACCGGCTGCAGGCGGTATGttgttg < 1:519482/239‑1 (MQ=255)
gcgTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTAGACGGCAAACCGGCTGCAGGCGGTATGttgttg < 1:913384/239‑1 (MQ=255)
gcgTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTAGACGGCAAACCGGCTGCAGGCGGTATGttgttg < 2:1506738/239‑1 (MQ=255)
gTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGAt > 1:80803/1‑65 (MQ=255)
gTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGAt < 2:80803/65‑1 (MQ=255)
gTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTAGACGGCAAACCGGCTGCAGGCGGTATGTTGTTGCAg > 2:333878/1‑240 (MQ=255)
gTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTAGACGGCAAACCGGCTGCAGGCGGTATGTTGTTGCAg > 2:592423/1‑240 (MQ=255)
gTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTAGACGGCAAACCGGCTGCAGGCGGTATGTTGTTGCAg > 1:1163344/1‑240 (MQ=255)
ccAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACgcgc < 2:1116480/165‑1 (MQ=255)
aaaaTGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTAGACGGCAAACCGGCTGCAGGCGGTATGTTGTTGCAGGTAATGCCTGCGCAAAATg < 2:1005779/240‑1 (MQ=255)
aacgCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTAGACGGCAAACCGGCTGCAGGCGGTATGttgttg < 1:639634/213‑1 (MQ=255)
gACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTAGACGGCAAACCGGCTGCAGGCGGt < 1:772746/201‑1 (MQ=255)
ccTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTAGACGGCAAACCGGCTGCAGGCGGTATGTTGTTGCAGGTAATGCCTGCGCAAAATGCCCAGCAgg < 1:1238954/239‑1 (MQ=255)
cGCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTAGACGGCAAACCGGCTGCAGGCGGTATGTTGTTGCAGGTAATGCCTGCGCAAAATGCCCAGCAGGACGACTTTg < 2:777707/240‑1 (MQ=255)
gCTGGTCGGCAATGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCATGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCAGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTAGACGGCAAACCGGCTGCAGGCGGTATGTTGTTGCAGGTAATGCCTGCGCAAAATGCCCAGCAGGACGACTTTg > 2:709953/1‑239 (MQ=255)
aaTGGTTGCGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTAGACGGCAAACCGGCTGCAGGCGGTATGTTGTTGCAGGTAATGCCTGCGCAAAATGCCCAGCAGGACGACTTTGACCACCTGGc < 1:1313538/239‑1 (MQ=255)
|
AACCACGATTATCCGCAGCCCGTTAAAAACGTGCTGGCAGAACTGCTGGTTGCGACCAGCCTGTTAACCGCTACGCTGAAGTTTGATGGTGATATCACCGTACAGCTGCAGGGCGACGGTCCGATGAATCTGGCGGTTATTAACGGTAACAATAACCAGCAGATGCGCGGTGTGGCGCGCGTGCAGGGCGAAATTCCAGAAAATGCCGACCTGAAAACGCTGGTCGGCAATGGTTACGTGGTGATCACCATTACCCCGAGCGAAGGCGAACGCTATCAGGGCGTAGTTGGTCTGGAAGGTGATACCCTGGCGGCCTGCCTGGAAGATTACTTTATGCGTTCTGAACAGCTGCCGACGCGCCTGTTTATTCGCACCGGCGACGTAGACGGCAAACCGGCTGCAGGCGGTATGTTGTTGCAGGTAATGCCTGCGCAAAATGCCCAGCAGGACGACTTTGACCACCTGGC > NC_000913/3529873‑3530339
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
