Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F80 I1 R1
|
130 |
60.2 |
1467357 |
98.1% |
1439477 |
216.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,658,974 |
A→G |
Q302Q (CAA→CAG) |
ynfE → |
putative selenate reductase YnfE |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,658,974 | 0 | A | G | 100.0%
| 194.7
/ NA
| 52 | Q302Q (CAA→CAG) | ynfE | putative selenate reductase YnfE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (23/29); total (23/29) |
GCGGTGGTGGCATCACTTATCTTCTTGAAAAAGCGCGCGAGAAATCGAACGCCAAAATGATTGTTATCGATCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAACCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAACGCCGCAGTGGGCTTCGCAAATTACCGGTATCCCGGAGGACCGTATCATCAAACTGGCGCGTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGC > NC_000913/1658781‑1659193
|
gCGGTGGTGGCATCACTTATCTTCTTGAAAAAGCGCGCGAGAAATCGAACGCCAAAATGATTGTTATCGATCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCg < 1:499064/216‑1 (MQ=255)
gtggCATCACTTATCTTCTTGAAAAAGCGCGCGAGAAATCGAACGCCAAAATGATTGTTATCGATCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCa > 1:513201/1‑239 (MQ=255)
gtggCATCACTTATCTTCTTGAAAAAGCGCGCGAGAAATCGAACGCCAAAATGATTGTTATCGATCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAg > 1:722576/1‑240 (MQ=255)
ggCATCACTTATCTTCTTGAAAAAGCGCGCGAGAAATCGAACGCCAAAATGATTGTTATCGATCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCt < 2:251460/229‑1 (MQ=255)
tCACTTATCTTCTTGAAAAAGCGCGCGAGAAATCGAACGCCAAAATGATTGTTATCGATCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTAccc > 2:364701/1‑230 (MQ=255)
aCTTATCTTCTTGAAAAAGCGCGCGAGAAATCGAACGCCAAAATGATTGTTATCGATCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTtc < 1:606964/187‑1 (MQ=255)
aCTTATCTTCTTGAAAAAGCGCGCGAGAAATCGAACGCCAAAATGATTGTTATCGATCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTtc > 2:606954/1‑187 (MQ=255)
aCTTATCTTCTTGAAAAAGCGCGCGAGAAATCGAACGCCAAAATGATTGTTATCGATCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTAccc > 2:179185/1‑228 (MQ=255)
aCTTATCTTCTTGAAAAAGCGCGCGAGAAATCGAACGCCAAAATGATTGTTATCGATCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCAccc > 1:520753/1‑240 (MQ=255)
tcttGAAAAAGCGCGCGAGAAATCGAACGCCAAAATGATTGTTATCGATCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATgg < 2:52664/240‑1 (MQ=255)
cttGAAAAAGCGCGCGAGAAATCGAACGCCAAAATGATTGTTATCGATCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGt < 1:598561/240‑1 (MQ=255)
ttGAAAAAGCGCGCGAGAAATCGAACGCCAAAATGATTGTTATCGATCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTc < 1:160861/240‑1 (MQ=255)
ttGAAAAAGCGCGCGAGAAATCGAACGCCAAAATGATTGTTATCGATCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTc < 1:133147/240‑1 (MQ=255)
gAAAAAGCGCGCGAGAAATCGAACGCCAAAATGATTGTTATCGATCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCAc > 2:498027/1‑240 (MQ=255)
aGCGCGCGAGAAATCGAACGCCAAAATGATTGTTATCGATCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGt > 2:372112/1‑232 (MQ=255)
gagaAATCGAACGCCAAAATGATTGTTATCGATCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCta < 1:644433/239‑1 (MQ=255)
aaaTCGAACGCCAAAATGATTGTTATCGATCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATAtt < 1:234910/240‑1 (MQ=255)
cGCCAAAATGATTGTTATCGATCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATg < 2:166149/200‑1 (MQ=255)
aaaaTGATTGTTATCGATCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGt < 2:238041/240‑1 (MQ=255)
tGTTATCGATCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATaa > 2:723874/1‑240 (MQ=255)
ttATCGATCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTA‑CCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATaa < 2:79679/207‑1 (MQ=255)
tCGACCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCTGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGt < 2:21477/227‑1 (MQ=255)
gcgATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGt < 2:355508/220‑1 (MQ=255)
atatACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAAcg < 2:620439/238‑1 (MQ=255)
tACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAACGCCGCAGTGGGc > 1:722590/1‑240 (MQ=255)
cGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAACGCCGCAGTGGGCtt > 1:6328/1‑240 (MQ=255)
gCTGCCGGTCGTGATGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGACACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTAGTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGCTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAACCAGCGAAAACGCCGCAGTGGGCTTc > 1:301238/1‑239 (MQ=255)
gCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAACGCCGCAGTGGGCTTCGCaa > 2:527290/1‑240 (MQ=255)
ccGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGt > 1:277861/1‑170 (MQ=255)
ccGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGt < 2:277858/170‑1 (MQ=255)
tCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAAcg < 1:305116/217‑1 (MQ=255)
cGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAACGCCGCAGTGGGCTTCGCAAATTAc < 2:334369/239‑1 (MQ=255)
aaTGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAACGCCGCAGTGGGCTTCGCAAATTACCGGTATCCCgg < 1:271590/240‑1 (MQ=255)
aaTGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAACGCCGCAGTGGGCTTCGCAAATTACCGGTATCCCg < 1:675623/239‑1 (MQ=255)
aNGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTc < 2:35328/155‑1 (MQ=255)
cTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCATCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAACGCCGCAGTGGGCTTCGCAAATTACCGGTATCCCggagga < 2:124177/239‑1 (MQ=255)
cccTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAACGCCGCAGTGGGCTTCGCAAATTACCGGTATCCCGGAGGACCg < 2:174194/240‑1 (MQ=255)
tcccGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGCTGCACCCAAAAAt > 2:507484/2‑137 (MQ=255)
cccGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAACGCCGCAGt > 2:449472/1‑197 (MQ=255)
ggCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAACGCCGCAGTGGGCTTCGCAAATTACCGGTATCCCGGAGGACCGTATCATCAAACTg > 1:614/1‑240 (MQ=255)
tGGTTGCGGGTATTGCCTGTGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAACGCCGCAGTGGGCTTCGCAAATTACCGGTATCCCGGAGGACCGTATCATCAAACTGGCGCGTGAAATTGGc < 2:7238/239‑1 (MQ=255)
ggTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAACGCCGCAGTGGGCTTCGCAAATTACCGGTATCCCGGAGGACCGTATCATCAAACTGGCGCGTGAAATTGGcac < 2:570119/240‑1 (MQ=255)
gTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAACGCCGCAGTGGGCTTCGCAAATTACCGGTATCCCGGAGGACCGTATCATCAAACTGGCGCGTGAAATTGGcac > 1:712729/1‑239 (MQ=255)
ggTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATaa < 1:20850/119‑1 (MQ=255)
ggTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATaa > 2:20850/1‑119 (MQ=255)
gTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAACGCCGCAGTGGGCTTCGCAAATTACCGGTATCCCGGAGGACCGTATCATCAAACTGGCGCGTGAAATTGGCACAGCAAAAc < 1:591985/240‑1 (MQ=255)
gATTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAACGCCGCAGTGGGCTTCGCAAATTACCGGTATCCCGGAGGACCGTATCATCAAACTGGCGCGTGAAATTGGCACAGCAAAAcc > 1:284789/1‑225 (MQ=255)
aTTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAACGCCGCAGTGGGCTTCGCAAATTACCGGTATCCCGGAGGACCGTATCATCAAACTGGCGCGTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAg < 1:403576/240‑1 (MQ=255)
aTTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAACGCCGCAGTGGGCTTCGCAAATTACCGGTATCCCGGAGGACCGTATCATCAAACTGGCGCGTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAg > 1:606912/1‑240 (MQ=255)
aTTAACGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAACGCCGCAGTGGGCTTCGCAAATTACCGGTATCCCGGAGGACCGTATCATCAAACTGGCGCGTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAg > 1:238691/1‑240 (MQ=255)
aaCGAAAATCTCGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAACGCCGCAGTGGGCTTCGCAAATTACCGGTATCCCGGAGGACCGTATCATCAAACTGGCGCGTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGc > 1:695828/1‑240 (MQ=255)
ctcGTTGATCAGCCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAACGCCGCAGTGGGCTTCGCAAATTACCGGTATCCCGGAGGACCGTATCATCAAACTGGCGCGTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGc < 2:722710/215‑1 (MQ=255)
|
GCGGTGGTGGCATCACTTATCTTCTTGAAAAAGCGCGCGAGAAATCGAACGCCAAAATGATTGTTATCGATCCGCGATATACCGATACGGCTGCCGGTCGTGAAGACGAATGGCTCCCTATTCGCCCGGGCACCGATGCCGCGCTGGTTGCGGGTATTGCCTGGGTATTGATTAACGAAAATCTCGTTGATCAACCTTTTCTCGATAAATACTGCGTCGGCTATGACGAAAAAACCTTACCCGCAGATGCACCCAAAAATGGTCACTATAAAGCCTATATTCTTGGTGAAGGTGACGATAAAACAGCGAAAACGCCGCAGTGGGCTTCGCAAATTACCGGTATCCCGGAGGACCGTATCATCAAACTGGCGCGTGAAATTGGCACAGCAAAACCCGCTTATATCTGCCAGGGC > NC_000913/1658781‑1659193
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
