Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F80 I1 R1
|
130 |
60.2 |
1467357 |
98.1% |
1439477 |
216.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,384,304 |
G→A |
intergenic (‑36/‑399) |
mdh ← / → argR |
malate dehydrogenase/DNA‑binding transcriptional dual regulator ArgR |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,384,304 | 0 | G | A | 100.0%
| 324.6
/ NA
| 83 | intergenic (‑36/‑399) | mdh/argR | malate dehydrogenase/DNA‑binding transcriptional dual regulator ArgR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (50/33); total (50/33) |
GAGTCGCATCTTCACCAGAAAAACCTTTGATTTTCACAGCAGTAGGGATATGGCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATGTTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACATTCCAACAGGTGGTGACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGA > NC_000913/3384076‑3384517
|
gAGTCGCATCTTCACCAGAAAAACCTTTGATTTTCACAGCAGTAGGGATATGGCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCt > 1:93078/1‑239 (MQ=255)
tCGCATCTTCACCAGAAAAACCTTTGATTTTCACAGCAGTAGGGATATGGCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCcg < 1:629194/240‑1 (MQ=255)
tCGCATCATCACCAGAAAAACCTTTGATTTTCACAGCAGTAGGGATATGGCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCcg < 1:316607/240‑1 (MQ=255)
cGCATCTTCACCAGAAAGACCTTTGATTTTCACAGCAGTAGGGATATGGCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCcg < 2:17088/239‑1 (MQ=255)
aCCAGAAAAACCTTTGATTTTCACAGCAGTAGGGATATGGCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCcgc > 2:501180/1‑231 (MQ=255)
gAAAAACCTTTGATTTTCACAGCAGTAGGGATATGGCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCca < 1:567481/239‑1 (MQ=255)
cacaGCAGTAGGGATATGGCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACa < 1:713093/239‑1 (MQ=255)
gcagTAGGGATATGGCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGAc < 1:140118/240‑1 (MQ=255)
gcagTAGGGATATGGCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGAc < 1:566630/240‑1 (MQ=255)
agTAGGGATATGGCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACca < 1:684626/240‑1 (MQ=255)
atGGCTCAGATCGGCAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATc > 2:90148/1‑205 (MQ=255)
atGGCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGc > 1:378443/1‑189 (MQ=255)
atGGCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACaaa > 2:430140/1‑211 (MQ=255)
atGGCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACaa > 2:286591/1‑210 (MQ=255)
atGGCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCaac > 1:432845/1‑239 (MQ=255)
atGGCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCaa > 2:447375/1‑239 (MQ=255)
atGGCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCaa > 1:686357/1‑239 (MQ=255)
atGGCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCa > 2:124013/1‑238 (MQ=255)
atGGCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAg < 1:659499/240‑1 (MQ=255)
ggCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGa < 2:642048/239‑1 (MQ=255)
gCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGaa > 2:259335/1‑239 (MQ=255)
gCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGa > 2:346479/1‑238 (MQ=255)
gCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAAt > 1:362873/1‑240 (MQ=255)
gCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAAt > 1:171551/1‑240 (MQ=255)
gCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAAt > 1:617933/1‑240 (MQ=255)
tCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGANAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGt < 2:479706/209‑1 (MQ=255)
cAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCCCAt > 2:476968/1‑220 (MQ=255)
acacCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACca < 1:414157/212‑1 (MQ=255)
acCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGttt > 1:335675/1‑240 (MQ=255)
aGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGtt > 2:655445/1‑240 (MQ=255)
aGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGATTTTGACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGACAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAGGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTc > 2:303929/1‑224 (MQ=255)
aCTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTAt > 1:201276/1‑239 (MQ=255)
aCTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATg > 1:633013/1‑240 (MQ=255)
gATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACg < 2:31242/215‑1 (MQ=255)
tatCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCa < 1:640220/232‑1 (MQ=255)
tatCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCa > 2:640210/1‑232 (MQ=255)
atCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTg < 2:637028/239‑1 (MQ=255)
aTACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCg < 2:106933/239‑1 (MQ=255)
agagagTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACAt > 1:457482/1‑183 (MQ=255)
agagagTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAAtt > 2:123471/1‑229 (MQ=255)
agagagTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGcc > 1:213897/1‑232 (MQ=255)
agagagTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCa > 2:233054/1‑239 (MQ=255)
agagagTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAg > 1:255380/1‑240 (MQ=255)
agagagTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAg > 1:43400/1‑240 (MQ=255)
agagTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAgg > 2:453262/1‑239 (MQ=255)
agagTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGa > 2:430026/1‑240 (MQ=255)
agagTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGa > 2:241583/1‑240 (MQ=255)
ttCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGAc < 1:421322/172‑1 (MQ=255)
ttCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAAcc > 1:436311/1‑239 (MQ=255)
cTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAg > 2:601315/1‑204 (MQ=255)
gAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTa > 1:55303/1‑240 (MQ=255)
gTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACa < 2:551839/240‑1 (MQ=255)
ttGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAg < 1:66329/240‑1 (MQ=255)
gggTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGt < 2:407604/239‑1 (MQ=255)
tGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAgcgc > 2:279892/1‑240 (MQ=255)
tGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAgcgc > 1:124960/1‑240 (MQ=255)
cAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCaa > 2:182316/1‑240 (MQ=255)
cAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCaa < 1:503473/240‑1 (MQ=255)
aaGCGCCTGGTCAATACCGCCAGCAACGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCaa < 2:570934/239‑1 (MQ=255)
gcCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACAtt > 1:701974/1‑239 (MQ=255)
tGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACATTCCaa > 1:508905/1‑240 (MQ=255)
tGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTACTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACATTCCaa < 1:342671/240‑1 (MQ=255)
gCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGAAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTAt > 2:464380/1‑218 (MQ=255)
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gCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAGCTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCGCAtc < 2:117968/121‑1 (MQ=255)
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aCTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACATTCCAACAGGTGGTGACAATATACCCTACCGt < 1:501189/239‑1 (MQ=255)
tGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACATTCCAACAGGTGGTGACAATATACCCTACCGTTc > 2:514513/1‑239 (MQ=255)
aTCCTAAACTCCTAATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAAc < 2:359117/194‑1 (MQ=255)
aaCTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACAtt > 2:579707/1‑191 (MQ=255)
cTTATTATATTGATAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACATTCCAACAGGTGGTGACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGa > 2:20128/1‑240 (MQ=255)
aTAAACTAAGATATATTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACATTCCAACAGGTGGTGACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAaacaa > 2:571390/1‑217 (MQ=255)
|
GAGTCGCATCTTCACCAGAAAAACCTTTGATTTTCACAGCAGTAGGGATATGGCTCAGATCGACAGCCACACCGGGAGTCACTGGAGCGATATCATACAGAGAGAGTTCTGAACCTGAAGGCAGTTGGGTTTTTAACAGTAGTGCAAGCGCCTGGCCAATACCGCCAGCAGCGCCGAGGACTGCGACTTTCATCCTAAACTCCTTATTATATTGATAAACTAAGATATGTTGCTCCGCTGCCGCGACCTTAATCCACAAAATTGCCGTTTACAATGACCACATCTCAAGAATGTGTAGTCACGCAAGTTTAGCGTTTATGCATTTAATTGCCGTAATCAGGAACCTAACTTACGTAATTAACAGTCGCTTATGCATTAGCGCAACATTCCAACAGGTGGTGACAATATACCCTACCGTTCAGCCAAAACAACATCAATTTGA > NC_000913/3384076‑3384517
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
