Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F80 I1 R1
|
130 |
60.2 |
1467357 |
98.1% |
1439477 |
216.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,982,684 |
(C)8→9 |
noncoding (79/87 nt) |
leuT → |
tRNA‑Leu |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,982,676 | 1 | . | C | 100.0%
| 141.9
/ NA
| 39 | noncoding (71/87 nt) | leuT | tRNA‑Leu |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base C (27/12); total (27/12) |
GGGCGCGCCATTTAGTCCCGGCGCTTGAGCTGCGGTGGTAGTAATACCGCGTAACAAGATTTGTAGTGGTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGGGTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCAATTTTGAACCCCGCTTCGGCGGGGTTTTTTGTTTTCTGTGCATTTCGTCACCCTCCCTTCGCAATAAACGCCCGTAATAACTCATTGCCCC > NC_000913/3982442‑3982902
|
gggCGCGCCATTTAGTCCCGGCGCTTGAGCTGCGGTGGTAGTAATACCGCGTAACAAGATTTGTAGTGGTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑cccc < 2:686450/239‑1 (MQ=255)
tAGTCCCGGCGCTTGAGCTGCGGTGGTAGTAATACCGCGTAACAAGATTTGTAGTGGTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGcacca < 2:387476/240‑1 (MQ=255)
cccGGCGCTTGAGCTGCGGTGGTAGTAATACCGCGTAACAAGATTTGTAGTGGTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑cccc < 1:104020/223‑1 (MQ=255)
gcgcTTGAGCTGCGGTGGTAGTAATACCGCGTAACAAGATTTGTAGTGGTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCCCTCGCACCACGACttt > 1:718044/1‑240 (MQ=255)
gcgcTTGAGCTGCGGTGGTAGTAATACCGCGTAACAAGATTTGTAGTGGTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACttt > 1:571082/1‑239 (MQ=255)
aCCGCGTAACAAGATTTGTAGTGGTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑cccc > 1:214170/1‑194 (MQ=255)
cgcgTAACAAGATTTGTAGTGGTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAg > 2:593587/1‑239 (MQ=255)
cgcgTAACAAGATTTGTAGTGGTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAg > 1:199217/1‑239 (MQ=255)
gcgTAACAAGATTTGTAGTGGTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGc > 1:565384/1‑239 (MQ=255)
cgTAACAAGATTTGTAGTGGTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGaa > 2:113934/1‑216 (MQ=255)
cgTAACAAGATTTGTAGTGGTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCaaa > 2:224721/1‑234 (MQ=255)
cgTAACAAGATTTGTAGTGGTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCa > 1:144573/1‑239 (MQ=255)
cgTAACAAGATTTGTAGTGGTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCa > 1:517677/1‑239 (MQ=255)
cgTAACAAGATTTGTAGTGGTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAg > 1:32525/1‑240 (MQ=255)
cgTAACAAGATTTGTAGTGGTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAg > 1:393246/1‑240 (MQ=255)
cgTAACAAGATTTGTAGTGGTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAg > 1:630749/1‑240 (MQ=255)
cAAGATTTGTAGTGGTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTAttt > 1:289414/1‑240 (MQ=255)
tGTAGTGGTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAg < 1:545353/240‑1 (MQ=255)
aGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAg > 2:526512/1‑233 (MQ=255)
aGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTa > 2:498083/1‑240 (MQ=255)
ttGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCaa > 1:622573/1‑239 (MQ=255)
ttGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAAc > 1:180931/1‑240 (MQ=255)
gCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑ccccccccctt > 2:637349/1‑152 (MQ=255)
ccTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTggg > 2:648273/1‑239 (MQ=255)
ccTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTggg > 1:34598/1‑239 (MQ=255)
tgATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTggg > 1:582301/1‑239 (MQ=255)
tgATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTggg > 1:705816/1‑239 (MQ=255)
ccAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGGGTCGGa < 2:289411/239‑1 (MQ=255)
gggTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGGGTCGGa < 1:714239/228‑1 (MQ=255)
ccATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGGGTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGAc < 1:2812/240‑1 (MQ=255)
cATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGGGTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCAATTTTGAAccc > 1:674437/1‑240 (MQ=255)
aaGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGGGTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCAATTTTGAACCCCGCTTcgg > 1:460968/1‑239 (MQ=255)
gTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGGGTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCAATTTTGAACCCCGCTTcggcg < 1:625101/239‑1 (MQ=255)
aCAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGGGTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCAATTTTGAACCCCGCTTCGGCGGGGtttt > 1:303569/1‑240 (MQ=255)
aTTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGGGTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCAATTTTGAACCCCGCTTCGGCGGGGTTTTTTGTTTTCTGTGCATTTCg < 1:224724/240‑1 (MQ=255)
aGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAg < 1:668107/120‑1 (MQ=255)
gACGGGCTCGCCTCAGGTGTTAGGGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGc < 2:482091/113‑1 (MQ=25)
cgcgCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGGGTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCAATTTTGAACCCCGCTTCGGCGGGGTTTTTTGTTTTCTGTGCATTTCGTCAccctcc > 1:137245/1‑240 (MQ=255)
gcTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGGGTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCAATTTTGAACCCCGCTTCGGCGGGGTTTTTTGTTTTCTGTGCATTTCGTCACCCTCCCtt < 2:674425/240‑1 (MQ=255)
gtTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGGGTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCAATTTTGAACCCCGCTTCGGCGGGGTTTTTTGTTTTCTGTGCATTTCGTCACCCTCCCTTCGCAATAAACGcc < 2:711831/240‑1 (MQ=255)
ttAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGGGTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCAATTTTGAACCCCGCTTCGGCGGGGTTTTTTGTTTTCTGTGCATTTCGTCACCCTCCCTTCGCAATAAACGcc < 1:677574/239‑1 (MQ=255)
tGGGGGTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGGGTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCAATTTTGAACCCCGCTGCGGCGGGGTTTTTTGTTTTc > 2:377232/1‑185 (MQ=255)
gggggTTCAAGTC‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGGGTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCAATTTTGAACCCCGCTTCGGCGGGGTTTTTTGTTTTCTGTGCATTTCGTCACCCTCCCTTCGCAATAAACGCCCGTAATAACTCATTGcccc > 1:574766/1‑239 (MQ=255)
|
GGGCGCGCCATTTAGTCCCGGCGCTTGAGCTGCGGTGGTAGTAATACCGCGTAACAAGATTTGTAGTGGTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑‑CCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAATTGAACTAAAAATTCAAAAAGCAGTATTTCGGCGAGTAGCGCAGCTTGGTAGCGCAACTGGTTTGGGACCAGTGGGTCGGAGGTTCGAATCCTCTCTCGCCGACCAATTTTGAACCCCGCTTCGGCGGGGTTTTTTGTTTTCTGTGCATTTCGTCACCCTCCCTTCGCAATAAACGCCCGTAATAACTCATTGCCCC > NC_000913/3982442‑3982902
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
