Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F80 I1 R1
|
130 |
60.2 |
1467357 |
98.1% |
1439477 |
216.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,193,379 |
G→A |
S66S (AGC→AGT) |
thiF ← |
ThiS adenylyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,193,379 | 0 | G | A | 100.0%
| 178.4
/ NA
| 46 | S66S (AGC→AGT) | thiF | ThiS adenylyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (22/24); total (22/24) |
CGTGTTGAGTGCCACGCAGGCGGCATTAATCTCCTGGCGAGTCGCCATATTGTCGGTACAGTCGAGCACCACATCGGCCCGTGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTGCTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGCAGCAGGTGTACCCAGCCCGCCCAGACCGATAATCAGCACCTGGCTGTCGAGCAGTTTTTGCTGCCCGTCCAGAGCGATATCGTCGAGCAGGATTTGGCGGCTATAACGCATAAAGTCACGGTCATTCATCGCCAACTCCTGCAATTTCCAGCAACT > NC_000913/4193145‑4193603
|
cgTGTTGAGTGCCACGCAGGCGGCATTAATCTCCTGGCGAGTCGCCATATTGTCGGTACAGTCGAGCACCACATCGGCCCGTGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTaa > 2:439927/1‑240 (MQ=255)
gtTGAGTGCCACGCAGGCGGCATTAATCTCCTGGCGAGTCGCCATATTGTCGGTACAGTCGAGCACCACATCGGCCCGTGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATg < 1:141099/240‑1 (MQ=255)
aGGCGGCATTAATCTCCTGGCGAGTCGCCATATTGTCGGTACAGTCGAGCACCACATCGGCCCGTGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCa < 1:347467/239‑1 (MQ=255)
tctcCTGGCGAGTCGCCATATTGTCGGTACAGTCGAGCACCACATCGGCCCGTGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTAcc > 2:8064/1‑239 (MQ=255)
cGCCATATTGTCGGTACAGTCGAGCACCACATCGGCCCGTGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCa < 2:136226/214‑1 (MQ=255)
gCCATATTGTCGGTACAGTCGAGCACCACATCGGCCCGTGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGcc > 1:587172/1‑239 (MQ=255)
atTGTCGGTACAGTCGAGCACCACATCGGCCCGTGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAgcgc < 2:690557/239‑1 (MQ=255)
cGGTACAGTCGAGCACCACATCGGCCCGTGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGcgcccgcc < 1:641011/239‑1 (MQ=255)
aCAGTCGAGCACCACATCGGCCCGTGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTa < 1:439934/240‑1 (MQ=255)
cAGTCGAGCACCACATCGGCCCGTGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTAc < 1:522650/240‑1 (MQ=255)
tCGAGCACCACATCGGCCCGTGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAg > 2:497985/1‑239 (MQ=255)
tCGAGCACCACATCGGCCCGTGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAg > 1:714591/1‑239 (MQ=255)
cGAGCACCACATCGGCCCGTGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAgcgc < 2:694248/225‑1 (MQ=255)
aGCACCACATCGGCCCGTGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGTTTTGTCGTTGCAGTTTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGt > 2:227772/1‑209 (MQ=255)
gCACCACATCGGCCCGTGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCgcag < 1:703533/240‑1 (MQ=255)
caccacATCGGCCCGTGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCATCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCgcag < 1:308688/239‑1 (MQ=255)
ccacATCGGCCCGTGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGcagcag < 1:497994/240‑1 (MQ=255)
cacaTCGGCCCGTGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGCTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGCAGCAgg < 1:619336/240‑1 (MQ=255)
cGTGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACTCCAGCGCCCGCCAGGTACAgccc > 2:433273/1‑222 (MQ=255)
cGTGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCgcag < 2:587162/226‑1 (MQ=255)
cGTGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGCAGCAGGTGTACCCAg > 1:360565/1‑239 (MQ=255)
tGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTACCGACGCCAGCGCCCGCCCgg > 2:571510/1‑214 (MQ=255)
gcgtCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGCAGCAGGTGTACCCAGCCCGCCCAGACCg < 2:304565/228‑1 (MQ=255)
tCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAgcgc > 1:546337/1‑184 (MQ=255)
tAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGCAGCAGGTGTACCCAGCCCGCCCAGACCGATAATCAGCACCTGGCTGTc > 1:322896/1‑240 (MQ=255)
aaCCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCGGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATGTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCgcag < 2:501906/193‑1 (MQ=255)
ccGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGCAGCAGGTGTACCCAGCCCGCCCAGACCGATAATCAGCACCTGGCTGTCGa < 2:701157/239‑1 (MQ=255)
ttgttgTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGCAGCAGGTGTACCCAGCCCGCCCAGACCGATAATCAGCACCTGGCTGTCGAGCAg > 1:274197/1‑240 (MQ=255)
ttgtAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGCAGCAGGTGTACCCAGCCCGCCCAGACCGATAATCAGCACCTGGCTGTCGAGCAGttt > 2:516435/1‑240 (MQ=255)
gTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGngcccgcc > 2:154043/1‑162 (MQ=255)
aGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGCAGCAgg < 2:201186/176‑1 (MQ=255)
cGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGCAGCAGGTGTACCCAGCCCGCCCAGACCGATAATCAGCACCTGGCTGTCGAGCAGTTTTTGCTGCCCGTCCAGAGCGatat > 1:68139/1‑240 (MQ=255)
ggATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGCAGCAGGTGTACCCAGCCCGCCCAGACCGATAATCAGCACCTGGCTGTCGAGCAGTTTTTGCTGCCCGTCCAGAGCGATAtcg < 1:8064/240‑1 (MQ=255)
tgtCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGCAGCAGGTGTACCCAGCCCGCCCAGACCGATAATCAGCACCTGGCTGTCGAGCAGTTTTTGCTGCCCGTCCAGAGCGATATCGTCGAGCAGGAt > 1:483458/1‑240 (MQ=255)
gTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGCAGCAGGTGTACCCAGCCCGCCCAGACCGATAATCAGCACCTGGCTGTCGAGCAGTTTTTGCTGCCCGTCCAGAGCGATATCGTCGAGCAGGATTTgg > 2:689649/1‑239 (MQ=255)
ttGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGCAGCAGGTGTACCCAGCCCGCCCAGACCGATAATCAGCACCTGGCTGTCGAGCAGTTTTTGCTGCCCGTCCAGAGCGATATCGTCGAGCAGGATTTGGCGGCtata > 1:574321/1‑240 (MQ=255)
cGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGCAGCAGGTGTACCCAGCCCGCCCAGACCGATAATCAGCACCTGGCTGTCGAGCAGTTTTTGCTGCCCGTCCAGAGCGATATCGTCGAGCAGGATTTGGCGGCTATAACGCATAAAGt < 2:448310/239‑1 (MQ=255)
gATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGCAGCAGGTGTACCCAGCCCGCCCAGACCGATAATCAGCACCTGGCTGTCGAGCAGTTTTTGCTGCCCGTCCAGAGCGATATCGTCGAGCAGGATTTGGCGGCTATAACGCATAAAGTCa < 2:22548/240‑1 (MQ=255)
gCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGCAGCAGGTGTACCCAGCCCGCCCAGACCGATAATCAGCACCTGGCTGTCGAGCAGTTTTTGCTGCCCGTCCAGAGCGATATCGTCGAGCAGGATTTGGCGGCTATAACGCATAAAGTCACGGtcatt < 1:715521/240‑1 (MQ=255)
atatCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGCAGCAGGTGTACCCAGCCCGCCCAGACCGATAATCAGCACCTGGCTGTCGAGCAGTTTTTGCTGCCCGTCCAGAGCGATATCGTCGAGCAGGATTTGGCGGCTATAACGCATAAAGTCACGGTCATTCATCGcc < 1:516444/240‑1 (MQ=255)
cAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGCAGCAGGTGTACCCAGCCCGCCCAGACCGATAATCAGCACCTGGCTGTCGAGCAGTTTTTGCTGCCCGTCCAGAGCGATATCGTCGAGCAGGATTTGGCGGCTATAACGCATAAAg > 2:439150/1‑215 (MQ=255)
aaGAGGATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGCAGCAGGTGTACCCAGCCCGCCCAGACCGATAATCAGCACCTGGCTGTCGAGCAGTTTTTGCTGCCCGTCCAGAGCGATATCGTCGAGCAGGATTTGGCGGCTATAACGCATAAAGTCACGGTCATTCATCGCCAACTCCTGCAATTTc > 2:128361/1‑240 (MQ=255)
gATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCAt < 1:64811/41‑1 (MQ=255)
gATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCAt > 2:64811/1‑41 (MQ=255)
gATTTGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGCAGCAGGTGTACCCAGCCCGCCCAGACCGATAATCAGCACCTGGCTGTCGAGCAGTTTTTGCTGCCCGTCCAGAGCGATATCGTCGAGCAGGATTTGGCGGCTATAACGCATAAAGTCACGGTCATTCATCGCCAACTCCTGCAATTTCCAGc > 2:252833/1‑239 (MQ=255)
ttGTCGTTGCAGATTACTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGCAGCAGGTGTACCCAGCCCGCCCAGACCGATAATCAGCACCTGGCTGTCGAGCAGTTTTTGCTGCCCGTCCAGAGCGATATCGTCGAGCAGGATTTGGCGGCTATAACGCATAAAGTCACGGTCATTCATCGCCAACTCCTGCAATTTCCAGCAACt < 1:395762/240‑1 (MQ=255)
|
CGTGTTGAGTGCCACGCAGGCGGCATTAATCTCCTGGCGAGTCGCCATATTGTCGGTACAGTCGAGCACCACATCGGCCCGTGCAACCGCATCTTTTAACGCCTCACCCGTTAACCGTTGTTGTAATGCTGTCAGTTGAATGTCGGGATTCAACTGTGTCAGTCGCTGTTGGCTGACCTGCGATTTCGGGCGATCGATATCTTCAGTGGTAAAGAGGATTTGTCGTTGCAGATTGCTTAAATGCACATCGTCGTCATCTGCCAGTACCAGCGTCCCGACGCCAGCGCCCGCCAGGTACAGCGCAGCAGGTGTACCCAGCCCGCCCAGACCGATAATCAGCACCTGGCTGTCGAGCAGTTTTTGCTGCCCGTCCAGAGCGATATCGTCGAGCAGGATTTGGCGGCTATAACGCATAAAGTCACGGTCATTCATCGCCAACTCCTGCAATTTCCAGCAACT > NC_000913/4193145‑4193603
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
