Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F60 I1 R1
|
11 |
83.2 |
2796804 |
99.4% |
2780023 |
139.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,534,809 |
T→G |
intergenic (‑134/‑206) |
yjhZ ← / → yjhR |
KpLE2 phage‑like element; putative acetyltransferase YjhZ/KpLE2 phage‑like element; PLD‑like domain‑containing protein YjhR |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,534,809 | 0 | T | G | 100.0%
| 340.4
/ NA
| 91 | intergenic (‑134/‑206) | yjhZ/yjhR | KpLE2 phage‑like element; putative acetyltransferase YjhZ/KpLE2 phage‑like element; PLD‑like domain‑containing protein YjhR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (43/48); total (43/48) |
ACAATGGCCAATTGAATATCGCGAGCAAGTGTAAGAACTCCCAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGTCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGTTTCAATAACATCATCGACTA > NC_000913/4534682‑4534942
|
aCAATGGCCAATTGAATATCGCGAGCAAGTGTAAGAACTCCCAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTg < 1:173561/140‑1 (MQ=255)
aaTGGCCAATTGAATATCGCGAGCAAGTGTAAGAACTCCCAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTgca > 2:985357/1‑140 (MQ=255)
aaTGGCCAATTGAATATCGCGAGCAAGTGTAAGAACTCCCAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTgca < 1:630074/140‑1 (MQ=255)
tGGCCAATTGAATATCGCGAGCAAGTGTAAGAACTCCCAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTgcagc > 1:927315/1‑140 (MQ=255)
tGGCCAATTGAATATCGCGAGCAAGTGTAAGAACTCCCAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTgcagc > 1:518568/1‑140 (MQ=255)
aTTGAATATCGCGAGCAAGTGTAAGAACTCCCAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTACTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTgg < 2:370849/140‑1 (MQ=255)
tGAATATCGCGAGCAAGTGTAAGAACTCCCAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCa < 2:268265/140‑1 (MQ=255)
atatCGCGAGCAAGTGTAAGAACTCCCAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCg < 1:985357/140‑1 (MQ=255)
tatCGCGAGCAAGTGTAAGAACTCCCAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGt > 2:1198245/1‑140 (MQ=255)
cgAGCAAGTGTAAGAACTCCCAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGc > 1:96212/1‑140 (MQ=255)
cgAGCAAGTGTAAGAACTCCCAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGc > 2:364685/1‑140 (MQ=255)
cgAGCAAGTGTAAGAACTCCCAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGc > 1:1315806/1‑140 (MQ=255)
aGCAAGTGTAAGAACTCCCAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAg > 2:514806/1‑140 (MQ=255)
gCAAGTGTAAGAACTCCCAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCGGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAgg > 2:828793/1‑140 (MQ=255)
tgtAAGAACTCCCAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGcc < 2:1286920/140‑1 (MQ=255)
tgtAAGAACTCCCAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGcc < 2:902322/140‑1 (MQ=255)
aCTCCCAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCa > 2:379751/1‑140 (MQ=255)
cTCCCAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCaa < 1:1369934/140‑1 (MQ=255)
cTCCCAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCaa < 2:733381/140‑1 (MQ=255)
tCCCAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAAc > 2:564872/1‑140 (MQ=255)
tCCCAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCACTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAAc > 2:518324/1‑140 (MQ=255)
cccAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAAct > 2:483849/1‑140 (MQ=255)
cccAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAAct > 1:480843/1‑140 (MQ=255)
cccAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAAct > 2:525890/1‑140 (MQ=255)
cccAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAAct > 1:972252/1‑140 (MQ=255)
cccAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGAAGCCCAGTTCAAct > 1:480196/1‑140 (MQ=255)
cccAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAACGCAGGTAGCCCAGTTCAAct < 1:572139/140‑1 (MQ=255)
ccAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCaa < 1:64858/137‑1 (MQ=255)
ccAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCaa > 2:64858/1‑137 (MQ=255)
ccAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAAcac > 1:831293/1‑138 (MQ=255)
cAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAActct < 2:501224/140‑1 (MQ=255)
cAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAActct < 2:927315/140‑1 (MQ=255)
cAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAActct < 2:1315806/140‑1 (MQ=255)
cAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAActct > 1:785280/1‑140 (MQ=255)
aGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACtctc > 2:601322/1‑140 (MQ=255)
gACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCATCTCTCACTAc < 2:1364985/140‑1 (MQ=255)
gACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTAc < 1:514806/140‑1 (MQ=255)
gACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTAc < 1:385527/140‑1 (MQ=255)
aCCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTAcc < 2:545386/140‑1 (MQ=255)
cccTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCa > 1:204593/1‑140 (MQ=255)
ccTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAg > 2:1310491/1‑140 (MQ=255)
tGTAAATAACTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTa > 1:1106208/1‑140 (MQ=255)
tAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATg > 1:901086/1‑140 (MQ=255)
ataatTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATc > 1:1216450/1‑140 (MQ=255)
atTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCa > 1:345572/1‑140 (MQ=255)
ttCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCaa > 2:506389/1‑140 (MQ=255)
tgtgTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGtt > 1:656595/1‑140 (MQ=255)
tGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGcgcg < 1:564872/140‑1 (MQ=255)
cccACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGa < 1:525890/140‑1 (MQ=255)
cccACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGa < 2:972252/140‑1 (MQ=255)
cccACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGa < 1:188005/140‑1 (MQ=255)
cACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAAt < 1:1198245/140‑1 (MQ=255)
cGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGt < 2:204593/140‑1 (MQ=255)
gATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTa < 1:364685/140‑1 (MQ=255)
gATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTa < 1:1287826/140‑1 (MQ=255)
gATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTa > 1:1222978/1‑140 (MQ=255)
aTTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTAt < 2:480843/140‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTAt < 1:1056392/140‑1 (MQ=255)
ttAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATc < 1:719188/140‑1 (MQ=255)
aaGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGt > 2:7399/1‑140 (MQ=255)
ggCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAg < 2:219975/140‑1 (MQ=255)
ggCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAg > 1:260148/1‑140 (MQ=255)
ggCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAg > 1:871832/1‑140 (MQ=255)
ggCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAg > 2:1030475/1‑140 (MQ=255)
ggCCGCTCAGG‑GGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGc > 1:510390/1‑140 (MQ=255)
tCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCAtcgt < 1:753456/140‑1 (MQ=255)
aGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCAtcgtcg < 1:7399/140‑1 (MQ=255)
gTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGtt < 2:1216450/140‑1 (MQ=255)
gTCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGtt > 2:92053/1‑140 (MQ=255)
tCACCGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACACTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGttt < 2:831293/140‑1 (MQ=255)
cGTATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGTTTCAAt < 2:656595/140‑1 (MQ=255)
tATTCGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGTTTCAATaa > 2:946521/1‑140 (MQ=255)
cGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGTTTCAATAAcatc > 2:1322615/1‑140 (MQ=255)
cGATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGTTTCAATAAcatc < 1:379751/140‑1 (MQ=255)
gATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGTTTCAATAAcatca < 1:1030475/140‑1 (MQ=255)
gATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGTTTCAATAAcatca < 1:506389/140‑1 (MQ=255)
gATAATAAATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGTTTCAATAAcatca < 1:601322/140‑1 (MQ=255)
taataaATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGTTTCAATAACatcatc < 2:510390/140‑1 (MQ=255)
taataaATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGTTTCAATAACatcatc < 2:1106208/140‑1 (MQ=255)
aataaATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGTTTCAATAACATCATCg > 1:1324673/1‑140 (MQ=255)
aataaATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGTTTCAATAACATCATCg > 2:229242/1‑140 (MQ=255)
ataaATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGTTTCAATAACATCATCGa < 1:828793/140‑1 (MQ=255)
taaATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGTTTCAATAACATCATCGac < 1:518324/140‑1 (MQ=255)
taaATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGTTTCAATAACATCATCGac < 2:546691/140‑1 (MQ=255)
taaATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGTTTCAATAACATCATCGac < 2:1222978/140‑1 (MQ=255)
taaATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGTTTCAATAACATCATCGac < 2:901086/140‑1 (MQ=255)
taaATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGTTTCAATAACATCATCGac > 1:500731/1‑140 (MQ=255)
taaATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGTTTCAATAACATCATCGac > 1:833003/1‑140 (MQ=255)
taaATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGTTTCAATAACATCATCGac < 1:92053/140‑1 (MQ=255)
taaATGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGTTTCAATAACATCATCGac > 2:97586/1‑140 (MQ=255)
aaTGGGGCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGTTTCAATAACATCATCGacta < 1:271106/140‑1 (MQ=255)
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ACAATGGCCAATTGAATATCGCGAGCAAGTGTAAGAACTCCCAGCAAGACCCTGTAAATAATTCTGTGTAACTGCCCACGATTAAAGGTGGCCGCTCAGGCGGTCACCGTATTCGATAATAAATGGGTCTGGAAAAAGTGCAGCATCTGGCAGCGTAATGCAGGTAGCCCAGTTCAACTCTCACTACCAGTATGATCCCAAGTTCGAGCGCGGAATGTATCTGTATGAGCATCGTCGCTGTTTCAATAACATCATCGACTA > NC_000913/4534682‑4534942
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
