Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A25 F60 I1 R1
|
10 |
84.2 |
2855252 |
99.4% |
2838120 |
139.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC JC |
NC_000913 |
1,567,125 |
IS1 (+) +8 bp |
coding (9‑16/1383 nt) |
dosC ← |
diguanylate cyclase DosC |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
1567125 = | 1 (0.010) | 91 (1.070) |
54/278 |
0.2 |
98.9% |
coding (16/1383 nt) |
dosC |
diguanylate cyclase DosC |
| ? | NC_000913 |
1978503 = |
NA (NA) | noncoding (768/768 nt) |
IS1 |
repeat region |
| * |
? |
NC_000913 |
= 1567132 | 1 (0.010) | 93 (1.100) |
66/278 |
0.1 |
98.9% |
coding (9/1383 nt) |
dosC |
diguanylate cyclase DosC |
| ? | NC_000913 |
= 1979270 |
NA (NA) | noncoding (1/768 nt) |
IS1 |
repeat region |
TCGCTTATTTCTTTTCAGTATATCTTCATATTTCAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1567261‑1567125
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATG > NC_000913/1978503‑1978640
TCGCTTATTTCTTTTCAGTATATCTTCATATTTCAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGT > 1:837533/1‑140
CTTATTTCTTTTCAGTATATCTTCATATTTCAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAAT > 1:741660/1‑140
CTTATTTCTTTTCAGTATATCTTCATATTTCAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAAT > 2:802098/1‑140
CTTATTTCTTTTCAGTATATCTTCATATTTCAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAAT < 1:1145592/140‑1
CTTATTTCTTTTCAGTATATCTTCATATTTCAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAAT < 1:824826/140‑1
TTTCTTTTCAGTATATCTTCATATTTCAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACT < 2:707198/140‑1
TCTTTTCAGTATATCTTCATATTTCAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCC < 2:206312/140‑1
TCTTTTCAGTATATCTTCATATTTCAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCC < 1:146961/140‑1
TCTTTTCAGTATATCTTCATATTTCAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCC < 1:275708/140‑1
TCTTTTCAGTATATCTTCATATTTCAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCC < 2:145335/140‑1
TCTTTTCAGTATATCTTCATATTTCAGGAGAATATGGCGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGACGTATTTTAGGTAATGACTCC < 2:1032626/140‑1
TCAGTATATCTTCATATTTCAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTT < 2:794974/140‑1
TCAGTATATCTTCATATTTCAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTT < 2:16744/140‑1
TATATCTTCATATTTCAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTG > 2:1384072/1‑140
TATCTTCATATTTCAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGAT < 2:892965/140‑1
TATCTTCATATTTCAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGAT < 1:1110507/140‑1
TATCTTCATATTTCAGGAGAATATGGTGCAGTTAATCGATCTCGAACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAAGTAATGCCTCCAACTTATTGAT < 2:1237570/140‑1
ATCTTCATATTTCAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATA < 1:802098/140‑1
CTTCATATTTCAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT < 2:741660/140‑1
CATATTTCAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTT > 1:197344/1‑140
TATTTCAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT > 1:361530/1‑140
TATTTCAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT < 1:933537/140‑1
TCAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 2:140157/1‑140
CAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT > 1:739326/1‑140
AATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA < 2:1217584/140‑1
TATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT > 2:346404/1‑140
TGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG > 1:867127/1‑140
GCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA < 2:694392/140‑1
AGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG > 1:1105795/1‑140
AGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG < 2:1134219/133‑1
AGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG > 1:1134219/1‑133
GTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGA < 1:841152/140‑1
TTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC > 2:1334511/1‑140
TTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC > 2:167863/1‑140
TTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC > 2:993924/1‑140
TAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACT < 2:1264271/140‑1
TCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTG > 1:1227945/1‑140
CGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGT > 1:478229/1‑140
ATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAAGGGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTC > 1:1394831/1‑140
ATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCA > 2:602582/1‑140
CTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATG < 1:442543/140‑1
TCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGC > 1:523211/1‑140
CACGTTGTGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGC < 1:1334511/140‑1
TGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAC > 1:938509/1‑140
TGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAC > 1:965742/1‑140
TGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAC > 1:1128815/1‑140
TGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAC > 1:1219015/1‑140
CGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCG < 1:167863/140‑1
TTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAG > 1:927657/1‑140
ATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACG < 2:837533/140‑1
ATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACG < 2:568700/140‑1
GTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGC < 2:1317320/140‑1
GTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGC < 2:197344/140‑1
GTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGC < 1:242907/140‑1
TCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCG > 1:1399179/1‑140
TCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCG > 1:1294061/1‑140
ATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTT > 2:1028586/1‑140
TTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTC > 2:1329434/1‑140
TTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCC < 2:361530/140‑1
A‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCC < 2:1128815/140‑1
GGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAG > 2:746809/1‑140
GTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGG > 1:1260106/1‑140
GTGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGG > 2:1085601/1‑140
TGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGT > 1:167443/1‑140
TGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGT > 2:225689/1‑140
TGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGT > 1:1360897/1‑140
TGTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGT > 2:617037/1‑140
GTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTG < 1:1384072/140‑1
GTGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTG > 2:310273/1‑140
TGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGC > 2:14708/1‑140
TGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGC > 1:232999/1‑140
TGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGC > 2:1003277/1‑140
TGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGC > 1:592374/1‑140
TGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGC > 1:1140025/1‑140
TGAATTATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGC > 1:1411339/1‑140
TATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCT < 2:167443/140‑1
TATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCT < 1:602582/140‑1
TATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCT < 2:965742/140‑1
ATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTC > 2:1390003/1‑140
ATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTC > 1:1348256/1‑140
ATGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTC > 2:1283213/1‑140
TGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCA > 2:603084/1‑140
TGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCA > 2:1115603/1‑140
TGGAGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCA > 1:1111392/1‑140
AGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGAT < 1:14708/140‑1
AGATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGAT < 1:993924/140‑1
GATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATT < 1:1085601/140‑1
ATGTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTC > 1:852313/1‑140
GTATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAG > 2:583895/1‑140
TATTTTAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGG < 1:1390003/140‑1
TAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATG < 1:346404/140‑1
TCGCTTATTTCTTTTCAGTATATCTTCATATTTCAGGAGAATATGGTGCAGTTAGTCGATCTCGCACGTTGCGTTTCATTTTGATTCCGTCTGATTTCCCAGCCTTATAA‑GGGTGTGAATTATGGAGATGTATTTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1567261‑1567125
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATG > NC_000913/1978503‑1978640
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
