Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A24 F60 I1 R1
|
11 |
139.2 |
4733534 |
98.9% |
4681465 |
139.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,268,796 |
C→T |
P128S (CCA→TCA) |
yhaC → |
uncharacterized protein YhaC |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,268,796 | 0 | C | T | 100.0%
| 677.9
/ NA
| 189 | P128S (CCA→TCA) | yhaC | uncharacterized protein YhaC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (89/100); total (89/100) |
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
ATGTCTCGTCTCTTCGTCTGGATTTTTTAGGTTATAACGCCCAAATTATTCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATAAACAT > NC_000913/3268659‑3268930
|
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tctcgtctcTTCGTCTGGATTTTTTAGGTTATAACGCCCAAATTATTCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTa > 2:1513854/1‑140 (MQ=255)
cgtctcTTCGTCTGGATTTTTTAGGTTATAACGCCCAAATTATTCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTaaaa > 2:2145945/1‑140 (MQ=255)
cgtctcTTCGTCTGGATTTTTTAGGTTATAACGCCCAAATTATTCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTaaaa > 2:1377286/1‑140 (MQ=255)
tctcTTCGTCTGGATTTTTTAGGTTATAACGCCCAAATTATTCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGa > 1:2210968/1‑140 (MQ=255)
tCGTCTGGATTTTTTAGGTTATAACGCCCAAATTATTCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATAttt < 1:2363952/140‑1 (MQ=255)
tCGTCTGGATTTTTTAGGTTATAACGCCCAAATTATTCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATAttt < 2:1824094/140‑1 (MQ=255)
cGTCTGGATTTTTTAGGTTATAACGCCCAAATTATTCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTa < 2:1807036/140‑1 (MQ=255)
cTGGATTTTTTAGGTTATAACGCCCAAATTATTCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACaa > 2:1472093/1‑140 (MQ=255)
tGGATTTTTTAGGTTATAACGCCCAAATTATTCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAAt > 1:944298/1‑140 (MQ=255)
ggATTTTTTAGGTTATGACGCCCAAATTATTCAACGATCGAACAATACTTGTGACCTTACCATTAATTAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGGTCATTAAAAGATATTTACAATg < 2:2029897/140‑1 (MQ=255)
tttttAGGTTATAACGCCCAAATTATTCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAAt < 2:2275554/140‑1 (MQ=255)
tttAGGTTATAACGCCCAAATTATTCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCa < 2:358243/140‑1 (MQ=255)
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gTTATAACACCCAAATTATTCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAACGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCaggagg > 2:501396/1‑140 (MQ=255)
tataACGCCCAAATTATTCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGtt > 2:2259460/1‑140 (MQ=255)
ataACGCCCAAATTATTCAACGATCAGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTa > 2:1212288/1‑140 (MQ=255)
ccAAATTATTCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTaa > 1:1731957/1‑140 (MQ=255)
ccAAATTATTCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTaa > 2:791039/1‑140 (MQ=255)
ccAAATTATTCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTaa > 2:1789782/1‑140 (MQ=255)
cAAATTATTCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAAt > 1:704440/1‑140 (MQ=255)
cAAATTATTCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAAt > 1:2252085/1‑140 (MQ=255)
attattCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAAtttt > 1:1847338/1‑140 (MQ=255)
ttattCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAAttttt < 2:1028514/140‑1 (MQ=255)
ttattCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAAttttt < 1:613179/140‑1 (MQ=255)
ttattCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAAttttt < 1:1103368/140‑1 (MQ=255)
ttattCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAAttttt < 1:115640/140‑1 (MQ=255)
ttCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGt > 1:891427/1‑140 (MQ=255)
ttCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGt > 1:766936/1‑140 (MQ=255)
tCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGtt > 2:1104060/1‑140 (MQ=255)
cAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTtg < 1:928073/140‑1 (MQ=255)
cAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTtg < 2:648821/140‑1 (MQ=255)
cGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTgg < 1:2144050/140‑1 (MQ=255)
cGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTgg < 1:2047192/140‑1 (MQ=255)
gATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTggg < 1:2285114/140‑1 (MQ=255)
tCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGAc > 1:680773/1‑140 (MQ=255)
tCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGAc < 2:414316/140‑1 (MQ=255)
ggACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTg > 2:616759/1‑140 (MQ=255)
ggACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTg > 1:2329883/1‑140 (MQ=255)
ggACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTg > 1:1886721/1‑140 (MQ=255)
cAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTT‑AAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGgaga < 1:1277733/140‑1 (MQ=255)
aaTACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGgaga < 1:1832785/140‑1 (MQ=255)
aTACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGat < 1:1058307/140‑1 (MQ=255)
cTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATc > 1:1081107/1‑140 (MQ=255)
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ttGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCg < 1:1536388/140‑1 (MQ=255)
gtgAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGtt > 2:2118532/1‑140 (MQ=255)
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gtgAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGtt > 2:1286982/1‑140 (MQ=255)
gtgAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGtt < 2:324357/140‑1 (MQ=255)
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tgAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTg > 2:910382/1‑140 (MQ=255)
gAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATAGTTGa < 1:791039/140‑1 (MQ=255)
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tAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCctctc < 1:2014951/140‑1 (MQ=255)
tAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCctctc < 2:671374/140‑1 (MQ=255)
tGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTgg > 1:1559476/1‑140 (MQ=255)
aCCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACt > 2:1215899/1‑140 (MQ=255)
aCCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACt > 1:45317/1‑140 (MQ=255)
ccGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACtt > 2:884608/1‑140 (MQ=255)
ccGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACtt > 2:827372/1‑140 (MQ=255)
ccGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACtt > 2:117762/1‑140 (MQ=255)
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gTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTAc > 2:684678/1‑140 (MQ=255)
ttAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACg > 2:2288401/1‑140 (MQ=255)
ttAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACg > 2:1478342/1‑140 (MQ=255)
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aaCCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGt < 2:968376/140‑1 (MQ=255)
aaCCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGt < 1:1323023/140‑1 (MQ=255)
aaCCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGt < 2:1847338/140‑1 (MQ=255)
aaCCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGt < 1:593963/140‑1 (MQ=255)
ccAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCg > 1:1797479/1‑140 (MQ=255)
aGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGAt > 1:880408/1‑140 (MQ=255)
aGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGAt < 1:2006972/140‑1 (MQ=255)
aGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGAt > 1:818783/1‑140 (MQ=255)
atatCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGa < 2:2329883/140‑1 (MQ=255)
tAATATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGAtt > 2:1920559/1‑140 (MQ=255)
aaTATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGAttt < 2:346010/140‑1 (MQ=255)
aaTATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGAttt < 2:1559476/140‑1 (MQ=255)
aaTATCAATATTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGAttt < 2:2210968/140‑1 (MQ=255)
atatTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAt < 2:473636/140‑1 (MQ=255)
atatTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGAt < 1:2268911/140‑1 (MQ=255)
tatTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTcaca > 2:665948/1‑136 (MQ=255)
tatTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATa > 2:1973033/1‑140 (MQ=255)
tatTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATa > 1:959260/1‑140 (MQ=255)
tatTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATa > 1:1918209/1‑140 (MQ=255)
tatTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATa < 1:1869170/140‑1 (MQ=255)
tatTAATTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATa > 2:1899566/1‑140 (MQ=255)
aTTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATAAACat < 2:546267/140‑1 (MQ=255)
aTTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATAAACat < 2:1332357/140‑1 (MQ=255)
aTTGCTCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATAAACat > 1:545704/1‑140 (MQ=255)
|
ATGTCTCGTCTCTTCGTCTGGATTTTTTAGGTTATAACGCCCAAATTATTCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATAAACAT > NC_000913/3268659‑3268930
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
