Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A33 F60 I1 R1
|
11 |
96.2 |
3279560 |
99.2% |
3253323 |
139.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC JC |
NC_000913 |
3,931,171 |
IS4 (–) +12 bp |
intergenic (‑78/‑134) |
ravA ← / → kup |
regulatory ATPase RavA/K(+):H(+) symporter Kup |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
3931171 = | 0 (0.000) | 138 (1.420) |
67/278 |
0.1 |
100% |
intergenic (‑78/‑145) |
ravA/kup |
regulatory ATPase RavA/K(+):H(+) symporter Kup |
| ? | NC_000913 |
= 4503515 |
NA (NA) | noncoding (1/1426 nt) |
IS4 |
repeat region |
| * |
? |
NC_000913 |
= 3931182 | 0 (0.000) | 89 (0.930) |
60/276 |
0.2 |
100% |
intergenic (‑89/‑134) |
ravA/kup |
regulatory ATPase RavA/K(+):H(+) symporter Kup |
| ? | NC_000913 |
4502090 = |
NA (NA) | noncoding (1426/1426 nt) |
IS4 |
repeat region |
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
GTCTTTCGTTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3931309‑3931171
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACC < NC_000913/4503515‑4503377
GTCTTTCGTTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGT > 1:228119/1‑140
GTCTTTCGTTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGT > 1:1106722/1‑140
CTTTCGTTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAA > 1:171583/1‑140
TTTCGTTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAAT < 2:446342/140‑1
TTCGTTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATG < 2:1581464/140‑1
CGTTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCC > 1:895752/1‑140
CGTTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCC > 1:767520/1‑140
CGTTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCC > 2:701710/1‑140
CGTTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCC < 1:339065/140‑1
CGTTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGCAATGCC > 1:1504971/1‑140
TTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGA < 2:1329246/140‑1
TTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAAT‑CGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGAT < 2:756183/140‑1
TGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATC‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGAT < 2:595113/140‑1
TGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGAT < 1:1352139/140‑1
TGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGAT < 2:817166/140‑1
GAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATC > 1:1546551/1‑140
GAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATC < 1:1547441/140‑1
GAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATC < 2:116280/140‑1
GAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATC > 2:1025125/1‑140
ATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGT < 2:174020/140‑1
GAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAG < 2:872463/140‑1
ATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGAT < 1:376763/140‑1
TGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAG < 1:557702/140‑1
TGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAG < 1:1191952/140‑1
TGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAG > 2:1180671/1‑140
TGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAG > 2:129021/1‑140
TGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAG < 2:810729/140‑1
GTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGT > 2:803907/1‑140
TGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTT > 2:1001266/1‑140
TGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTT > 2:1554728/1‑140
GCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTG > 1:214005/1‑140
TTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGAC < 1:1633502/140‑1
TTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGAC < 2:214005/140‑1
TTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGAC < 1:129021/140‑1
TAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACC < 1:1398250/140‑1
TAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACC < 2:540340/140‑1
TAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACC < 1:411441/140‑1
TAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACC < 2:776152/140‑1
TAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACC < 2:1106722/140‑1
GTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGA > 1:568596/1‑140
GTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGA < 2:228119/140‑1
GTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGA > 2:1272999/1‑140
TCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGAT > 1:694143/1‑140
TTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAG < 1:1229900/140‑1
TGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGT < 2:568596/140‑1
TGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGT > 1:1143575/1‑140
TGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGT < 1:228297/140‑1
TGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGT > 1:1058508/1‑140
GCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGG < 2:902368/140‑1
GCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGG < 2:287147/140‑1
GCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGG < 2:444416/140‑1
GCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGG < 2:665901/140‑1
CCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGTGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATACCCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGG < 2:132992/140‑1
CCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAA‑CTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTG < 2:563408/140‑1
CAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTG > 1:815786/1‑140
AAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAA < 2:297746/140‑1
AAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAA < 1:1025125/140‑1
AAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGA < 2:171583/140‑1
AGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAA < 2:1403826/140‑1
AGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAA < 2:946977/140‑1
AGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAA < 1:511476/140‑1
AGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAA > 2:1291592/1‑140
ATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTT > 1:440146/1‑140
TAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGT > 2:1073509/1‑140
TAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGT > 1:1463213/1‑140
TAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGT > 2:430138/1‑140
TAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGT > 2:252392/1‑140
TAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGT > 2:246609/1‑140
AATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATT > 2:469895/1‑140
CTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCA > 1:921030/1‑140
CTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCA < 1:249689/140‑1
CTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCA > 1:737847/1‑140
AAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACA > 2:886590/1‑140
GGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGAC < 2:92867/140‑1
GGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGAC < 2:440146/140‑1
GCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACA < 2:1463213/140‑1
GCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACA < 1:434167/140‑1
GCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACA < 1:701710/140‑1
GCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACA < 2:1026376/140‑1
CCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAG > 2:1613901/1‑140
ACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGC < 1:1331213/140‑1
ACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGC < 2:1185970/140‑1
ACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGC < 2:737847/140‑1
AACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTG < 1:164343/140‑1
CTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATC > 2:1450135/1‑140
GGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTG < 1:803907/140‑1
GCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGG > 1:189459/1‑140
GCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGG > 2:279384/1‑140
AAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCC < 1:1450135/140‑1
AGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCC > 1:235385/1‑140
GAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGGCAGGCTCTTGATCTGGTATCCCG < 1:1291592/140‑1
GAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCG < 1:252392/140‑1
GAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCG < 1:1272999/140‑1
ATA‑CCCCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACG < 2:1607200/140‑1
CCCCCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATTCCGTTACGATTCT < 1:1001266/140‑1
CCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTG > 2:352500/1‑140
CCTTTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTG > 1:1065640/1‑140
TTGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGT < 2:831695/140‑1
TGAGTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTA < 2:1590614/140‑1
GTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACC < 2:189459/140‑1
GTCTTTCGTTGAAATATGAAATGTGTGCTTAGTCCCTTGGCCCACAAAAAAGCGCACAGTATGCACGATTAACGGCAAAATCGTACTCCTAAATGCGGCCACATTAACCTGGCTCAAAGAAAAATA‑CCCCCCCTTTGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3931309‑3931171
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACC < NC_000913/4503515‑4503377
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
