Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F60 I1 R1
|
16 |
276.8 |
9669196 |
99.2% |
9591842 |
138.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,091,854 |
C→T |
A253V (GCT→GTT) |
hisD → |
histidinal/histidinol dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,091,854 | 0 | C | T | 100.0%
| 516.3
/ NA
| 149 | A253V (GCT→GTT) | hisD | histidinal/histidinol dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (75/74); total (75/74) |
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
GGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCC > NC_000913/2091719‑2091990
|
ggCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCt > 2:4196597/1‑140 (MQ=255)
gCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGG‑GAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGa < 2:4780262/140‑1 (MQ=255)
ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGa > 2:4563756/1‑140 (MQ=255)
ccGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGa > 1:282749/1‑140 (MQ=255)
gTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTg < 1:3788164/140‑1 (MQ=255)
gTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTg < 2:4172309/140‑1 (MQ=255)
gTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTg < 1:4724700/140‑1 (MQ=255)
gCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGctctc < 1:3168381/140‑1 (MQ=255)
gCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGctctc > 1:2088442/1‑140 (MQ=255)
ccTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGctctct < 2:154567/140‑1 (MQ=255)
cTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTg > 2:2247698/1‑133 (MQ=255)
cTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCtctctc < 2:2777592/140‑1 (MQ=255)
cTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCtctctc < 2:3504681/140‑1 (MQ=255)
cTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCtctctc < 1:4409394/140‑1 (MQ=255)
gTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGc < 1:3910921/140‑1 (MQ=255)
gTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTAGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGc < 1:1226281/140‑1 (MQ=255)
aCCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGTTCTCTCAGGCTGa > 1:3934460/1‑140 (MQ=255)
gAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCtctctc > 1:4760916/1‑130 (MQ=255)
gAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCtctctc < 2:4760916/130‑1 (MQ=255)
gAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCtctctc < 2:3425180/130‑1 (MQ=255)
gAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCtctctc > 1:3425180/1‑130 (MQ=255)
gAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAaca > 1:2841891/1‑140 (MQ=255)
gAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAaca < 2:3910751/140‑1 (MQ=255)
aGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACg > 2:3942460/1‑140 (MQ=255)
aGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACg > 1:2015258/1‑140 (MQ=255)
gCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACgg < 1:1542349/140‑1 (MQ=255)
gCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGCACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACgg < 2:3237731/140‑1 (MQ=255)
aaaCGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGccc < 1:4258646/140‑1 (MQ=255)
aaCGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCg < 1:120920/140‑1 (MQ=255)
tCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGcc > 1:3186813/1‑134 (MQ=255)
gTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTcaca > 2:1671400/1‑140 (MQ=255)
gTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTcaca < 2:4820518/140‑1 (MQ=255)
gTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTcaca < 2:2613210/140‑1 (MQ=255)
ccAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGa > 2:4234220/1‑140 (MQ=255)
gTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTa > 2:1539969/1‑140 (MQ=255)
tGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTg < 1:3862588/140‑1 (MQ=255)
ggACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAgg < 1:3791005/128‑1 (MQ=255)
ggACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAgg > 2:3791005/1‑128 (MQ=255)
cGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGc < 2:4562096/140‑1 (MQ=255)
cGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGc < 2:2891267/140‑1 (MQ=255)
ggTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGcc < 1:2707145/140‑1 (MQ=255)
ggTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGcc < 2:3789965/140‑1 (MQ=255)
ggTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGcc < 2:2088442/140‑1 (MQ=255)
ggTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGcc < 1:520400/140‑1 (MQ=255)
ggTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGcc < 2:1028491/140‑1 (MQ=255)
ggTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGcc < 1:4112410/140‑1 (MQ=255)
ggTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCGCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGcc < 1:4161699/140‑1 (MQ=255)
gTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGccc < 1:1378043/140‑1 (MQ=255)
tGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACt > 2:2588437/1‑132 (MQ=255)
tGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACt < 1:2588437/132‑1 (MQ=255)
tGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGAc < 2:1419899/135‑1 (MQ=255)
tGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGcc > 2:4123947/1‑138 (MQ=255)
tGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCg > 1:515914/1‑140 (MQ=255)
gcggcgATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCgc < 1:2216873/140‑1 (MQ=255)
gcggcgATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCgc < 2:4011285/140‑1 (MQ=255)
gcggcgATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCgc < 2:3058063/140‑1 (MQ=255)
gcggcgATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCgc < 2:4242819/140‑1 (MQ=255)
gcggcgATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCgc < 2:354360/140‑1 (MQ=255)
gatATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGcc < 1:4499028/128‑1 (MQ=255)
gatATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGatat > 2:4329324/1‑140 (MQ=255)
gCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGgcgc > 2:2242365/1‑140 (MQ=255)
cGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGcgcgtc > 2:1749722/1‑140 (MQ=255)
cGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGcgcgtc > 2:3272232/1‑140 (MQ=255)
cGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGcgcgtc > 2:1271821/1‑140 (MQ=255)
aGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGcgcgtcgcg > 2:744951/1‑140 (MQ=255)
ggCCCGTCGGAGGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTTCTGACGCCCGCTGCTGATATGGcgcgtcgcgt > 1:1575777/1‑140 (MQ=255)
cGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGcc > 2:2816456/1‑140 (MQ=255)
ggAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAgg < 1:3267019/140‑1 (MQ=255)
cTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGa > 1:2691267/1‑140 (MQ=255)
gATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGcc > 2:1723086/1‑140 (MQ=255)
aTTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCa < 2:3834087/140‑1 (MQ=255)
aTTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCa < 1:3029526/140‑1 (MQ=255)
ttGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCaa > 1:2400156/1‑140 (MQ=255)
tGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCg > 2:1917640/1‑131 (MQ=255)
tGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAAc > 2:3951411/1‑140 (MQ=255)
tGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGCGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTgg > 1:4234526/1‑140 (MQ=255)
aCAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCa < 2:2400156/140‑1 (MQ=255)
aGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGa > 2:2664931/1‑140 (MQ=255)
gcggcgCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCa > 2:3623441/1‑137 (MQ=255)
gcggcgCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCa < 1:3623441/137‑1 (MQ=255)
cggcgCTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAAc > 2:4261887/1‑140 (MQ=255)
cgcTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCa < 2:3219728/126‑1 (MQ=255)
cgcTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTgg > 1:98876/1‑131 (MQ=255)
cgcTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGc > 2:3407167/1‑140 (MQ=255)
cgcTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGc > 1:290732/1‑140 (MQ=255)
cgcTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGc > 1:4132069/1‑140 (MQ=255)
cgcTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGc > 2:2043489/1‑140 (MQ=255)
cTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCcg < 1:2523689/140‑1 (MQ=255)
cTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCcg < 1:2242365/140‑1 (MQ=255)
cTACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCcg < 1:1460749/140‑1 (MQ=255)
tACGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCcgc > 2:954469/1‑140 (MQ=255)
cGCCGGATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGt > 1:1473919/1‑140 (MQ=255)
gATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACt < 2:4634082/128‑1 (MQ=255)
gATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCcgcg < 2:2417483/134‑1 (MQ=255)
gATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCcgcg > 1:2417483/1‑134 (MQ=255)
gATTTCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGa > 2:94179/1‑140 (MQ=255)
ttCGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAAc > 2:3053185/1‑140 (MQ=255)
cGTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAAccg > 2:1982760/1‑140 (MQ=255)
gTGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAAccgc > 2:737084/1‑140 (MQ=255)
tGGTTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAAccgcc < 1:3407167/140‑1 (MQ=255)
|
GGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCGGAAGTGCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCC > NC_000913/2091719‑2091990
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
