Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F28 I1 R1
|
146 |
75.3 |
2562504 |
98.6% |
2526628 |
139.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,407,691 |
A→G |
T29A (ACC→GCC) |
panF → |
pantothenate:Na(+) symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,407,691 | 0 | A | G | 100.0%
| 282.1
/ NA
| 77 | T29A (ACC→GCC) | panF | pantothenate:Na(+) symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (42/35); total (42/35) |
TGCTGGGCGATGGTGAAATTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATACGGG > NC_000913/3407555‑3407825
|
tgCTGGGCGATGGTGAAATTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCg > 2:889792/1‑140 (MQ=255)
tgCTGGGCGATGGTGAAATTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCg > 2:748143/1‑140 (MQ=255)
tgCTGGGCGATGGTGAAATTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCg > 2:465309/1‑140 (MQ=255)
tgCTGGGCGATGGTGAAATTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCg > 2:1266915/1‑140 (MQ=255)
tgCTGGGCGATGGTGAAATTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCg > 2:1183583/1‑140 (MQ=255)
tgCTGGGCGATGGTGAAATTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCg > 1:966066/1‑140 (MQ=255)
tgCTGGGCGATGGTGAAATTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCg > 1:820358/1‑140 (MQ=255)
tgCTGGGCGATGGTGAAATTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCg > 1:52647/1‑140 (MQ=255)
tgCTGGGCGATGGTGAAATTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCg > 1:375703/1‑140 (MQ=255)
tGGGCGATGGTGAAATTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCa < 2:406402/140‑1 (MQ=255)
gggCGATGGTGAAATTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCAc < 1:465309/140‑1 (MQ=255)
gggCGATGGTGAAATTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCAc < 1:257265/140‑1 (MQ=255)
ggCGATGGTGAAACTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCAcc > 2:970338/1‑140 (MQ=255)
tGGTGAAATTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCAccttcct > 2:192564/1‑140 (MQ=255)
tGGTGAAATTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCAccttcct > 1:919333/1‑140 (MQ=255)
tGGTGAAATTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTAGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCAccttcct > 1:1040134/1‑140 (MQ=255)
tGGTGAAATTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGAAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCAccttcct > 1:62971/1‑140 (MQ=255)
gTGAAATTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTa > 1:145497/1‑140 (MQ=255)
aaaTTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATg > 1:747543/1‑140 (MQ=255)
tctatcGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTAttt > 1:509154/1‑140 (MQ=255)
cgcgATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCg > 1:720543/1‑140 (MQ=255)
gcgATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCgg > 1:283906/1‑140 (MQ=255)
atatCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAg < 2:52647/140‑1 (MQ=255)
tatCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGc < 1:943315/140‑1 (MQ=255)
tCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCg < 1:1183583/140‑1 (MQ=255)
ccACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGct < 1:192564/140‑1 (MQ=255)
ccACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGct < 1:1119973/140‑1 (MQ=255)
aCTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGctct < 2:283906/140‑1 (MQ=255)
aCTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGctct < 1:210023/140‑1 (MQ=255)
tGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTAt < 1:237394/140‑1 (MQ=255)
tGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTAt > 1:269798/1‑140 (MQ=255)
gggaTGACGATGCAGCTGGAAGTAATTCTACCACTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGGGTTCGGTATCTCAGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAATATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATggg < 2:919333/139‑1 (MQ=255)
aggaTGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATggg < 2:123726/140‑1 (MQ=255)
gaTGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCg > 2:891634/1‑140 (MQ=255)
gaTGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCg > 1:1107416/1‑140 (MQ=255)
gaTGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCg > 1:263170/1‑140 (MQ=255)
tGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGa > 2:460824/1‑140 (MQ=255)
ttCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTc > 1:134846/1‑140 (MQ=255)
aCCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACcg < 1:52483/140‑1 (MQ=255)
aCCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACcg < 2:987950/140‑1 (MQ=255)
aCCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACcg < 2:84554/140‑1 (MQ=255)
aCCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACcg > 2:626517/1‑140 (MQ=255)
aCCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACcg < 2:375703/140‑1 (MQ=255)
aCCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACcg < 1:626517/140‑1 (MQ=255)
aCCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACcg < 1:1266915/140‑1 (MQ=255)
aCCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACcg < 1:970338/140‑1 (MQ=255)
aCCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTAGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACcg < 2:1040134/140‑1 (MQ=255)
ccGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACcgc > 1:658695/1‑140 (MQ=255)
cGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACcgcg < 2:145497/140‑1 (MQ=255)
tGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGAcc > 2:904930/1‑140 (MQ=255)
ggTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCt < 2:1107416/140‑1 (MQ=255)
ggTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCCATGCGTAAACGGAGCGGCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTACCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCt < 2:62971/140‑1 (MQ=255)
gTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACcg < 2:23848/133‑1 (MQ=255)
gTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACcg > 1:23848/1‑133 (MQ=255)
gTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCta > 1:976866/1‑140 (MQ=255)
cGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCtata < 2:263170/140‑1 (MQ=255)
gCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTatat < 2:223757/140‑1 (MQ=255)
gCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTatat < 1:891634/140‑1 (MQ=255)
tCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTg > 2:262121/1‑140 (MQ=255)
tggtggtgTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGt > 1:198541/1‑140 (MQ=255)
tggtggtgTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGt > 1:1166342/1‑140 (MQ=255)
gtgtTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGtt > 2:84471/1‑140 (MQ=255)
gtgtTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGtt > 2:225977/1‑140 (MQ=255)
tCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATc > 1:63942/1‑140 (MQ=255)
ggTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATcgg < 2:966066/140‑1 (MQ=255)
cGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCTGCGGGCCa > 1:838182/1‑140 (MQ=255)
gTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGATGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAgg > 1:1011962/1‑140 (MQ=255)
tttATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGa > 1:410742/1‑140 (MQ=255)
ttATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCTGCGGGCCAGGAg < 2:838182/140‑1 (MQ=255)
ttATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAg < 2:820358/140‑1 (MQ=255)
ttATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAg < 1:748143/140‑1 (MQ=255)
ttATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGCGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAg < 2:747543/140‑1 (MQ=255)
tATGCGATGCGTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAgc < 1:889792/140‑1 (MQ=255)
tgcgatgcgTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAgctg > 1:1118151/1‑140 (MQ=255)
tgcgatgcgTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAgctg < 2:720543/140‑1 (MQ=255)
tgcgatgcgTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAgctg < 2:509154/140‑1 (MQ=255)
tgcgatgcgTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGACAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCCgggggcg > 2:121691/1‑135 (MQ=255)
tgcgTAAACGGAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATAGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTtat > 2:1163142/1‑140 (MQ=255)
ggAGCGCCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATACggg < 1:460824/140‑1 (MQ=255)
|
TGCTGGGCGATGGTGAAATTTATCTATCGCGATATCCCACTGGAGGATGACGATGCAGCTTGAAGTAATTCTACCGCTGGTCGCCTATCTGGTGGTGGTGTTCGGTATCTCGGTTTATGCGATGCGTAAACGGAGCACCGGCACCTTCCTTAATGAGTATTTCCTCGGCAGCCGCTCTATGGGCGGTATTGTGCTGGCGATGACGCTCACCGCGACCTATATCAGTGCCAGTTCGTTTATCGGCGGGCCAGGAGCTGCTTATAAATACGGG > NC_000913/3407555‑3407825
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
