Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F28 I1 R1
|
120 |
93.5 |
3664254 |
88.3% |
3235536 |
136.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,190,941 |
A→G |
I235I (ATT→ATC) |
yehC ← |
putative fimbrial chaperone YehC |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,190,941 | 0 | A | G | 100.0%
| 369.6
/ NA
| 97 | I235I (ATT→ATC) | yehC | putative fimbrial chaperone YehC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (46/51); total (46/51) |
ACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTAATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAATTGACTTTGACATTATTAGCTTTGAC > NC_000913/2190809‑2191075
|
aCCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGAtata > 1:1512281/1‑138 (MQ=255)
ccTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAg > 1:339463/1‑138 (MQ=255)
ccTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAg > 1:1562662/1‑138 (MQ=255)
aTCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTg < 2:407632/138‑1 (MQ=255)
tCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGc < 2:14710/138‑1 (MQ=255)
tCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGc < 2:1502620/138‑1 (MQ=255)
tCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGc < 2:1493173/138‑1 (MQ=255)
cATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGcc > 2:1059754/1‑138 (MQ=255)
cATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGcc > 1:1273212/1‑138 (MQ=255)
aTAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGAtata > 1:1287287/1‑131 (MQ=255)
aTAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGAtata < 2:1287287/131‑1 (MQ=255)
tGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCa > 2:171913/1‑138 (MQ=255)
tATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTg > 1:309417/1‑125 (MQ=255)
tATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTg < 2:309417/125‑1 (MQ=255)
tATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGa > 1:460497/1‑138 (MQ=255)
tCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATa > 1:390624/1‑138 (MQ=255)
cAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATaa > 1:465512/1‑138 (MQ=255)
aaaGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATgg < 1:733500/127‑1 (MQ=255)
aaaGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATgg < 1:913556/127‑1 (MQ=255)
aaaGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATgg > 2:733500/1‑127 (MQ=255)
aaaGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATgg > 2:913556/1‑127 (MQ=255)
aaaGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCg < 1:1269539/133‑1 (MQ=255)
aaaGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCg > 2:1269539/1‑133 (MQ=255)
aaGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATg < 2:1445633/138‑1 (MQ=255)
ggTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGt < 2:339463/138‑1 (MQ=255)
ggTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGt < 2:1562662/138‑1 (MQ=255)
ttcttcAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGt < 2:1192218/135‑1 (MQ=255)
ttcttcAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGt > 1:1192218/1‑135 (MQ=255)
cttcAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGAt > 2:1798050/1‑138 (MQ=255)
cttcAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGAt > 2:1764376/1‑138 (MQ=255)
gCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTa < 1:171913/138‑1 (MQ=255)
gCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTa < 1:1330944/138‑1 (MQ=255)
gCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTa > 1:1375382/1‑138 (MQ=255)
gCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTa > 1:62128/1‑138 (MQ=255)
aTAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTAtt < 1:1764376/138‑1 (MQ=255)
aTAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTAtt < 2:1273212/138‑1 (MQ=255)
aTAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACACAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCTATAATGGTCAGATGCCAGTTAtt < 2:234552/138‑1 (MQ=255)
aGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGc > 1:1374316/1‑138 (MQ=255)
aGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGc > 1:843183/1‑138 (MQ=255)
ttCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCatt > 2:1312998/1‑138 (MQ=255)
ttCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCatt < 1:869173/138‑1 (MQ=255)
ttCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCatt < 1:1085993/138‑1 (MQ=255)
tGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTAc > 2:1587852/1‑138 (MQ=255)
ccGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCatt < 1:460524/131‑1 (MQ=255)
ccGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCatt > 2:460524/1‑131 (MQ=255)
ccGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACtt < 2:1512281/138‑1 (MQ=255)
ccGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACtt < 2:120746/138‑1 (MQ=255)
cAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGAc > 1:593975/1‑138 (MQ=255)
cAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGAc > 1:1469469/1‑138 (MQ=255)
cAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGAc > 1:376813/1‑138 (MQ=255)
aTAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACAt < 2:984413/138‑1 (MQ=255)
aCGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTAc < 1:135105/126‑1 (MQ=255)
aCGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTAc > 2:135105/1‑126 (MQ=255)
aCGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTaa > 2:1150415/1‑138 (MQ=255)
gCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAaca < 2:234689/138‑1 (MQ=255)
tACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACAct < 2:1375382/138‑1 (MQ=255)
gATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCt < 1:722527/138‑1 (MQ=255)
cAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAgg < 2:1238566/138‑1 (MQ=255)
cAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAgg < 2:626311/138‑1 (MQ=255)
cAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAgg < 2:460497/138‑1 (MQ=255)
aaGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAggg < 2:757113/138‑1 (MQ=255)
aGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAgggg < 1:1005265/138‑1 (MQ=255)
aGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAgggg < 1:1202081/138‑1 (MQ=255)
aGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAgggg < 2:1469469/138‑1 (MQ=255)
tGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAaca < 1:496209/118‑1 (MQ=255)
tGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAaca < 1:1209032/118‑1 (MQ=255)
tGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAaca > 2:1209032/1‑118 (MQ=255)
tGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAaca > 2:496209/1‑118 (MQ=255)
tGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGc < 2:465512/138‑1 (MQ=255)
ggggTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCa < 2:404728/138‑1 (MQ=255)
gTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATc < 1:1274288/138‑1 (MQ=255)
cATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCat > 2:1265016/1‑138 (MQ=255)
tcAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAg < 2:380343/138‑1 (MQ=255)
gCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCAt > 1:1212674/1‑135 (MQ=255)
gCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCAt < 2:1212674/135‑1 (MQ=255)
gCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAAt > 2:1304119/1‑138 (MQ=255)
gCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAAt > 1:252489/1‑138 (MQ=255)
cAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAAtt > 1:349072/1‑138 (MQ=255)
aGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAATTg > 1:682801/1‑138 (MQ=255)
gCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAATTGa > 2:1575487/1‑138 (MQ=255)
gCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAATTGa < 1:1312998/138‑1 (MQ=255)
ccTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCTTGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAATTGACtt < 1:1304119/138‑1 (MQ=255)
ccTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAATTGACtt < 2:390624/138‑1 (MQ=255)
ccTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTAATACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAATTGACtt < 1:1602280/138‑1 (MQ=255)
cTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAATTGACttt > 1:1331970/1‑138 (MQ=255)
cTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAATTGACttt < 1:21805/138‑1 (MQ=255)
cTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAATTGACttt < 2:1521590/138‑1 (MQ=255)
cTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAATTGACttt < 2:1331970/138‑1 (MQ=255)
cTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAATTGACttt > 2:890760/1‑138 (MQ=255)
cTGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAATTGACttt > 2:1120321/1‑138 (MQ=255)
tGCAATTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAATTGACTTTg > 1:91164/1‑138 (MQ=255)
aaTTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAATTGACTTTGACa > 1:440164/1‑138 (MQ=255)
aaTTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAATTGACTTTGACa > 1:981750/1‑138 (MQ=255)
aTTAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAATTGACTTTGACat > 2:643234/1‑138 (MQ=255)
ttAAATTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAATTGACTTTGACatt < 1:1120321/138‑1 (MQ=255)
aTTTTGTCACTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAATTGACTTTGACAttatta > 2:1118809/1‑138 (MQ=255)
aCTGATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAATTGACTTTGACATTATTAGCTTTGAc < 1:1588608/138‑1 (MQ=255)
|
ACCTATCATAAAATGGGTATCAAAGGTTTCTTCAGCTGCATAAGCTTCAATGCCGAGCAATAACGCTACGATTGCTGATGCAAGTGGGGTCATTCTCAACATAGGCAGCTCCTGCAATTAAATTTTGTCACTAATATAGTTGCCATGGTCATCGATAATGGTCAGATGCCAGTTATTTGCATTATTACTTTTGACATTAACACTCTGACTTTCTAAGGGGGCAATCATAATAGTTTCATAATTGACTTTGACATTATTAGCTTTGAC > NC_000913/2190809‑2191075
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
