Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A9 F28 I1 R1
|
151 |
87.4 |
2971636 |
99.2% |
2947862 |
138.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,017,429 |
(C)6→7 |
coding (876/1374 nt) |
fliI → |
flagellum‑specific ATP synthase FliI |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,017,423 | 1 | . | C | 100.0%
| 267.0
/ NA
| 76 | E290D (GAA→GAC) | fliI | flagellum‑specific ATP synthase FliI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base C (39/37); total (39/37) |
CTGCGAATGCAGGGTGCCGCCTATGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAA‑CCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTTATACCGTGCTCACTGAAGGCGATGACC > NC_000913/2017286‑2017556
|
cTGCGAATGCAGGGTGCCGCCTATGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAA‑cc > 1:637684/1‑140 (MQ=255)
cGAATGCAGGGTGCCGCCTATGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAA‑ccccc > 2:1075038/1‑140 (MQ=255)
cGAATGCAGGGTGCCGCCTATGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAA‑ccccc > 2:1153969/1‑140 (MQ=255)
aTGCAGGGTGCCGCCTATGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAA‑cccccccg < 1:1153969/140‑3 (MQ=255)
aTGCAGGGTGCCGCCTATGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAA‑cccccccg < 2:1182800/140‑3 (MQ=255)
ggggTGCCGCCTATGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGccac < 1:361052/139‑1 (MQ=255)
gggTGCCGCCTATGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGccacc < 1:1278229/140‑1 (MQ=255)
ggTGCCGCCTATGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGccacca > 2:98097/1‑140 (MQ=255)
gTGCCGCCTATGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCaa < 1:998334/140‑1 (MQ=255)
cgccTATGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGt > 2:116152/1‑140 (MQ=255)
tATGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATc < 2:717377/140‑1 (MQ=255)
tGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCa < 1:597395/140‑1 (MQ=255)
gCCACGCACATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCAc > 2:158940/1‑140 (MQ=255)
aCGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGt < 2:708237/140‑1 (MQ=255)
gcgcATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCaa < 1:1215063/124‑1 (MQ=255)
gcgcATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCaa > 2:1215063/1‑124 (MQ=255)
gcgcATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCg > 1:225424/1‑140 (MQ=255)
tGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAATGTTATCCACCGTCGGTGttt > 1:315833/1‑140 (MQ=255)
cGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCCCCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGcc < 1:158940/140‑1 (MQ=255)
aaGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCaa > 2:1167362/1‑140 (MQ=255)
ttCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTAcc < 2:996051/140‑1 (MQ=255)
tCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAg < 2:225424/140‑1 (MQ=255)
tCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAg > 2:691225/1‑140 (MQ=255)
cATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCa > 2:1147341/1‑127 (MQ=255)
cATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCa < 1:1147341/127‑1 (MQ=255)
cATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAg > 2:1433641/1‑136 (MQ=255)
cATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAg < 1:1433641/136‑1 (MQ=255)
cATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTg > 2:1412643/1‑140 (MQ=255)
cATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTg > 1:1273042/1‑140 (MQ=255)
gtgtTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCa > 2:1171127/1‑124 (MQ=255)
gtgtTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCa < 1:1171127/124‑1 (MQ=255)
gtgtTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCg < 1:1075038/140‑1 (MQ=255)
gtgtTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCg < 1:1412643/140‑1 (MQ=255)
tgtTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCgg > 1:505548/1‑140 (MQ=255)
gtTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAg < 2:795268/131‑1 (MQ=255)
gtTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAg > 1:795268/1‑131 (MQ=255)
tGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATgg > 1:820187/1‑140 (MQ=255)
tGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATgg > 1:929841/1‑140 (MQ=255)
tgggcTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAg > 2:472290/5‑140 (MQ=255)
tGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCAAGCGTGAAATTGCGTTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAg < 2:637684/140‑1 (MQ=255)
cccTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCa > 2:335132/1‑130 (MQ=255)
cccTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCa < 1:335132/130‑1 (MQ=255)
cccTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAgcggcgg > 2:186302/1‑140 (MQ=255)
cccTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAgcggcgg > 1:111255/1‑140 (MQ=255)
cccTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAgcggcgg > 1:928629/1‑140 (MQ=255)
cccTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAgcggcgg > 1:655690/1‑140 (MQ=255)
ccTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAgcggcggc > 1:669532/1‑140 (MQ=255)
ccTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAgcggcggc > 1:259899/1‑140 (MQ=255)
ccTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAgcggcggc > 1:29099/1‑140 (MQ=255)
cTCACCCGCTACGCGATGGCCCGGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAgcggcggcg > 2:395967/1‑140 (MQ=255)
cccccGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATGGCGCTGGCGTTTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCggcggcggc < 2:697857/138‑1 (MQ=255)
gCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGTTCGAt > 2:477017/1‑140 (MQ=255)
tACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGcggcggcgg < 2:6673/132‑1 (MQ=255)
tACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGcggcggcgg > 1:6673/1‑132 (MQ=255)
tACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTa > 1:194966/1‑140 (MQ=255)
tACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTa > 1:797824/1‑140 (MQ=255)
tACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTa > 1:944791/1‑140 (MQ=255)
tACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCCCGATTa > 2:1453494/1‑140 (MQ=255)
tACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCACCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTa > 2:1382471/1‑140 (MQ=255)
cgcgATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTAcc < 2:29099/140‑1 (MQ=255)
cgcgATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTAcc < 1:472290/140‑1 (MQ=255)
cgcgATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTAcc < 1:186302/140‑1 (MQ=255)
cgcgATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTAcc < 2:111255/140‑1 (MQ=255)
cgcgATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTAcc < 2:928629/140‑1 (MQ=255)
cgcgATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTAcc < 2:929841/140‑1 (MQ=255)
cgcgATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTAcc < 1:98097/140‑1 (MQ=255)
cgcgATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTAcc < 2:669532/140‑1 (MQ=255)
cgATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACcgc < 2:944791/140‑1 (MQ=255)
gCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGtttt < 2:1273042/140‑1 (MQ=255)
ccAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTtat < 2:655690/140‑1 (MQ=255)
aGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTTATAc < 1:1083703/140‑1 (MQ=255)
cGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTTATACCg > 1:909162/1‑140 (MQ=255)
tGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTTATACCGTg < 2:505548/140‑1 (MQ=255)
aaTTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTAcc < 1:1015042/122‑1 (MQ=255)
aaTTGCGCTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTAcc > 2:1015042/1‑122 (MQ=255)
cgcTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTTATACCGTg < 2:546455/132‑1 (MQ=255)
cgcTGGCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTTATACCGTg > 1:546455/1‑132 (MQ=255)
ggCGATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTTATACCGTGCTCACTGAAGGc > 1:1261750/1‑140 (MQ=255)
gATTGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTTATACCGTGCTCACTGAAGGCGAt < 2:797824/140‑1 (MQ=255)
tGGCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTTATACCGTGCTCACTGAAGGCGATGAc > 1:612484/1‑140 (MQ=255)
ggCGAACCCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTTATACCGTGCTCACTGAAGGCGATGAcc < 2:194966/140‑1 (MQ=255)
|
CTGCGAATGCAGGGTGCCGCCTATGCCACGCGCATTGCCGAAGATTTTCGCGATCGTGGTCAGCATGTGTTGCTGATTATGGACTCCCTCACCCGCTACGCGATGGCCCAGCGTGAAATTGCGCTGGCGATTGGCGAA‑CCCCCCGCCACCAAAGGTTATCCACCGTCGGTGTTTGCCAAATTACCGGCACTGGTCGAGCGTGCCGGAAATGGCATTAGCGGCGGCGGCTCGATTACCGCGTTTTATACCGTGCTCACTGAAGGCGATGACC > NC_000913/2017286‑2017556
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
