Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F28 I1 R1
|
183 |
98.6 |
3427438 |
96.9% |
3321187 |
138.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,431,645 |
(G)5→4 |
coding (318/543 nt) |
yrdD ← |
putative DNA topoisomerase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,431,641 | 0 | G | . | 100.0%
| 406.2
/ NA
| 94 | coding (322/543 nt) | yrdD | putative DNA topoisomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (45/49); total (45/49) |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
CGGATAATGACACTCAGGGCATTCTCCAGCTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATTGGGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCTGGCGTAATACCAGATTTGCGCCACATGCAGGGCAA > NC_000913/3431504‑3431774
|
cGGATAATGACACTCAGGGCATTCTCCAGCTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATTggg < 1:41623/140‑1 (MQ=255)
cGGATAATGACACTCAGGGCATTCTCCAGCTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATTggg < 2:1647816/140‑1 (MQ=255)
ggATAATGACACTCAGGGCATTCTCCAGCTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATTgggg < 2:1224088/140‑1 (MQ=255)
ggATAATGACACTCAGGGCATTCTCCAGCTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATTgggg < 1:27736/140‑1 (MQ=255)
ggATAACGACACTCAGGGCATTCTCCAGCTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATTgggg < 2:370817/140‑1 (MQ=255)
aTGACACTCAGGGCATTCTCCAGCTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGt < 1:307733/140‑1 (MQ=255)
tGACACTCAGGGCATTCTCCAGCTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTa > 1:869705/1‑140 (MQ=255)
tGACACTCAGGGCATTCTCCAGCTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTa > 2:21398/1‑140 (MQ=255)
acTCAGGGCATTCTCCAGCTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATTgggg < 2:935728/130‑1 (MQ=255)
acTCAGGGCATTCTCCAGCTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATTgggg > 1:935728/1‑130 (MQ=255)
cTCAGGGCATTCTCCAGCTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGc > 1:1490550/1‑140 (MQ=255)
tCAGGGCATTCTCCAGCTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCt > 2:397757/1‑140 (MQ=255)
aGGGCATTCTCCAGCTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGt > 1:319457/1‑140 (MQ=255)
gggCATTCTCCAGCTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGtt < 2:158402/140‑1 (MQ=255)
ggCATTCTCCAGCTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGttt > 1:166395/1‑140 (MQ=255)
ttCTCCAGCTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTc > 1:176716/1‑140 (MQ=255)
ttCTCCAGCTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTc < 1:1201315/140‑1 (MQ=255)
ttCTCCAGCTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTc < 2:632762/140‑1 (MQ=255)
tctcCAGCTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTcc > 1:348350/1‑140 (MQ=255)
ctcCAGCTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCg > 2:1111549/1‑140 (MQ=255)
ccAGCTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGt < 2:1490550/140‑1 (MQ=255)
cTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTAt > 2:383436/1‑140 (MQ=255)
tGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGa > 2:504292/1‑140 (MQ=255)
tGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGa > 1:746572/1‑140 (MQ=255)
tGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGa > 2:529652/1‑140 (MQ=255)
tGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGa > 1:1392852/1‑140 (MQ=255)
tGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGCTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGa < 1:717478/140‑1 (MQ=255)
gggTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGAt < 1:21398/140‑1 (MQ=255)
ggTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATa > 1:1307758/1‑140 (MQ=255)
ggTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATa < 1:504292/140‑1 (MQ=255)
ggTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATa < 2:887675/140‑1 (MQ=255)
ggTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATa > 1:1355273/1‑140 (MQ=255)
tGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGtt < 1:197829/140‑1 (MQ=255)
gAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTc > 1:914352/1‑140 (MQ=255)
aaGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCg < 2:869705/140‑1 (MQ=255)
ttAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTAACGATAAGTTCGGTa < 2:1587725/140‑1 (MQ=255)
tAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATa < 2:30337/130‑1 (MQ=255)
tAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATa > 1:30337/1‑130 (MQ=255)
tGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGtt < 1:383436/140‑1 (MQ=255)
tGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGtt > 1:432357/1‑140 (MQ=255)
ggCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTc < 1:1111549/140‑1 (MQ=255)
ggCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTc < 1:731851/140‑1 (MQ=255)
aaTTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCAt < 2:746572/140‑1 (MQ=255)
aTTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCAtt < 1:1576713/140‑1 (MQ=255)
aTTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCAtt < 2:420988/140‑1 (MQ=255)
aTTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCAtt < 2:306/140‑1 (MQ=255)
aTTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCAtt > 1:681580/1‑140 (MQ=255)
acatTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAgg < 1:231380/140‑1 (MQ=255)
acacTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAgg < 1:886291/140‑1 (MQ=255)
acacTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAgg < 2:319457/140‑1 (MQ=255)
acacTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAgg > 2:577425/1‑140 (MQ=255)
acTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGt > 2:1220512/1‑140 (MQ=255)
tCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAg < 2:792835/140‑1 (MQ=255)
cGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCGGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGtt > 2:754617/1‑140 (MQ=255)
ggTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTaa > 2:924231/1‑140 (MQ=255)
ggTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTaa > 2:1546411/1‑140 (MQ=255)
aGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGc < 2:914352/140‑1 (MQ=255)
aGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGc < 2:176716/140‑1 (MQ=255)
aGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGc < 2:1355273/140‑1 (MQ=255)
gCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCa < 1:198023/140‑1 (MQ=255)
cGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCaa < 2:348350/140‑1 (MQ=255)
gATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGc > 2:927127/1‑137 (MQ=255)
gATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGc < 1:927127/137‑1 (MQ=255)
gATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAAc > 2:73194/1‑140 (MQ=255)
aTCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAAcc > 2:444309/1‑140 (MQ=255)
aTCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAAcc < 2:432357/140‑1 (MQ=255)
acaAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAgg < 2:533008/122‑1 (MQ=255)
acaAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAgg > 1:533008/1‑122 (MQ=255)
acaAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAAt > 1:1278025/1‑140 (MQ=255)
gAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATAc > 1:1250138/1‑140 (MQ=255)
gTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAg < 1:577425/140‑1 (MQ=255)
tttGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCg > 1:376922/1‑140 (MQ=255)
tttGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCg > 2:1098455/1‑140 (MQ=255)
tttGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGA‑AAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGt > 1:400640/1‑140 (MQ=255)
ccATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTccc < 1:1098455/140‑1 (MQ=255)
ccATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTccc < 1:1610003/140‑1 (MQ=255)
ccATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTccc < 2:166395/140‑1 (MQ=255)
cATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCt < 1:486647/140‑1 (MQ=255)
aaCGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCTGGc < 1:529652/140‑1 (MQ=255)
cgcTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCt > 1:1251835/1‑126 (MQ=255)
cgcTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCt < 2:1251835/126‑1 (MQ=255)
cgcTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCTGGCGTAATACCAGa > 2:715562/1‑140 (MQ=255)
cgcTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCTGGCGTAATACCAGa > 2:761606/1‑140 (MQ=255)
tGGACCAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCTGGCGTAATACCAGAttt < 1:98648/140‑1 (MQ=255)
ccAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCTGGCGTAATACCAGATTTgcgc < 1:1546411/140‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCCGTCTGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCTGGCGTAATACCAGATTTGCGcc < 2:905248/140‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCTGGCGTAATACCAGATTTGCGcc < 2:376922/140‑1 (MQ=255)
gATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCTGGCGTAATACCAGATTTGCGCcac > 2:538808/1‑140 (MQ=255)
gATGGCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCTGGCGTAATACCAGATTTGCGCcac > 2:1409619/1‑140 (MQ=255)
ggCCCGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCTGGCGTAATACCAGATTTGCGCCACATg < 1:1555199/140‑1 (MQ=255)
cccGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCTGGCGTAATACCAGATTTGCGCCACATGCa > 1:642819/1‑140 (MQ=255)
caggTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCTGGCGTAATACCAGATTTGCGCCACATg < 2:1403807/135‑1 (MQ=255)
caggTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCTGGCGTAATACCAGATTTGCGCCACATg > 1:1403807/4‑138 (MQ=255)
cGTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCTGGCGTAATACCAGATTTGCGCCACATGCAgg > 2:1317833/1‑140 (MQ=255)
gTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCTGGCGTAATACCAGATTTGCGCCACATGCAggg < 1:397757/140‑1 (MQ=255)
gTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCTGGCGTAATACCAGATTTGCGCCACATGCAggg < 1:754617/140‑1 (MQ=255)
gTCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCTGGCGTAATACCAGATTTGCGCCACATGCAggg < 1:73194/140‑1 (MQ=255)
tCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCTGGCGTAATACCAGATTTGCGCCACATg > 2:563818/1‑134 (MQ=255)
tCCGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCTGGCGTAATACCAGATTTGCGCCACATg < 1:563818/134‑1 (MQ=255)
cGACATT‑GGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCTGGCGTAATACCAGATTTGCGCCACATGCAGGGCaa > 2:1631462/1‑140 (MQ=255)
|
CGGATAATGACACTCAGGGCATTCTCCAGCTATGGGTTTGAAGTTAATGGCAAATTGACACTCCGGGTAGCGATCACAAGAGTGAAATGTTTTGCCATAACGGGAGCGGCGCTGGACCAGATGGCCCGTCCGACATTGGGGGCATGTAATTGCTGTTTCGTCCGGTTTATCGATAAGTTCGGTATGTTCGCATTCAGGGTAGTTAATGCAACCAATAAACATACCAAAGCGTCCCTGGCGTAATACCAGATTTGCGCCACATGCAGGGCAA > NC_000913/3431504‑3431774
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
