Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F28 I1 R1
|
258 |
142.3 |
4824480 |
99.1% |
4781059 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,859,352 |
G→A |
T293I (ACC→ATC) |
ydjK ← |
putative transporter YdjK |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,859,352 | 0 | G | A | 100.0%
| 597.1
/ NA
| 167 | T293I (ACC→ATC) | ydjK | putative transporter YdjK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (75/92); total (75/92) |
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
AGGATTAATAGCCCCACACCCATTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGGTCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGTTTCAGTAATACTCCTGTCAGTAAGGCTGAATACGGCACCGCTTGT > NC_000913/1859217‑1859483
|
tAATAGCCCCACACCCATTGTTTTACGCAGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAata > 1:40433/1‑140 (MQ=255)
aaTAGCCCCACACCCATTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAatat < 2:144275/140‑1 (MQ=255)
tAGCCCCACACCCATTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATAttg > 2:35639/1‑140 (MQ=255)
gCCCCACACCCATTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATAttgtt > 1:1175846/1‑140 (MQ=255)
gCCCCACACCCATTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATAttgtt < 1:579989/140‑1 (MQ=255)
cccACACCCATTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTgg > 2:1816777/1‑140 (MQ=255)
cccACACCCATTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTgg > 1:79745/1‑140 (MQ=255)
cccACACCCATTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGG‑AATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGc > 1:1010847/1‑140 (MQ=255)
ccACACCCATTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGc > 1:1053589/1‑140 (MQ=255)
cacaCCCATTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCa > 2:1205389/1‑140 (MQ=255)
cacaCCCATTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCa < 1:722288/140‑1 (MQ=255)
cacCCATTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCa < 2:2116505/138‑1 (MQ=255)
cacCCATTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAAc < 1:937146/140‑1 (MQ=255)
cacCCATTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAAc > 2:1687091/1‑140 (MQ=255)
cacCCATTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAAc > 1:2319593/1‑140 (MQ=255)
cacCCATTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATAACAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAAc < 1:467374/140‑1 (MQ=255)
cccATTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCa < 2:796048/140‑1 (MQ=255)
cccATTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCa < 1:1539688/140‑1 (MQ=255)
cccATTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCa < 1:91939/140‑1 (MQ=255)
accATTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCa < 1:450517/139‑1 (MQ=255)
ccATTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAg < 1:1525894/140‑1 (MQ=255)
aTTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGtt > 1:817803/1‑140 (MQ=255)
aTTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGtt > 1:889964/1‑140 (MQ=255)
ttGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCa < 1:1507250/132‑1 (MQ=255)
ttGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCa > 2:1507250/1‑132 (MQ=255)
ttGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTa > 1:1750891/1‑140 (MQ=255)
ttGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGG‑AATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTaa < 2:1010847/140‑1 (MQ=255)
tGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAAc > 2:1663255/1‑133 (MQ=255)
tGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAAc < 1:1663255/133‑1 (MQ=255)
tGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTaa > 2:1297496/1‑140 (MQ=255)
tGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTaa < 2:11508/140‑1 (MQ=255)
tGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTaa < 2:717911/140‑1 (MQ=255)
tGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTaa < 1:1297496/140‑1 (MQ=255)
tttACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTa < 1:100216/140‑1 (MQ=255)
tttACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTa < 1:145512/140‑1 (MQ=255)
ttACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAg > 2:1239798/1‑140 (MQ=255)
cgcgGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTaa > 1:83260/1‑133 (MQ=255)
cgcgGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTaa < 2:83260/133‑1 (MQ=255)
gcgGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAgtgtg < 2:519225/140‑1 (MQ=255)
aaTTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACt > 1:141924/1‑140 (MQ=255)
ttATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGTGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGcac < 2:1025742/140‑1 (MQ=255)
aTCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGtt > 2:2195998/1‑140 (MQ=255)
aTCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGtt > 2:2302348/1‑140 (MQ=255)
aTCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGtt > 2:1912435/1‑140 (MQ=255)
cACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCa < 2:40433/140‑1 (MQ=255)
gCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCa > 1:21331/1‑140 (MQ=255)
aTGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAAt < 2:319490/140‑1 (MQ=255)
aTGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAAt < 2:2063072/140‑1 (MQ=255)
ggCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCa > 1:785392/1‑140 (MQ=255)
ggCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCa > 1:150426/1‑140 (MQ=255)
ggCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCa > 1:548139/1‑140 (MQ=255)
cAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGc > 1:1099899/1‑140 (MQ=255)
aaTAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGca < 1:2280549/140‑1 (MQ=255)
aaTAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGca < 2:2230778/140‑1 (MQ=255)
aaTAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGca < 2:2015503/140‑1 (MQ=255)
aaaaaTACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGcacac > 1:1277609/1‑140 (MQ=255)
aaaaTACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGcacaca < 1:2071378/140‑1 (MQ=255)
aaaTACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACaa < 1:2302348/140‑1 (MQ=255)
aaaTACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACaa < 2:240523/140‑1 (MQ=255)
aaaTACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACaa < 2:1053589/140‑1 (MQ=255)
tACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAagag > 1:1677076/1‑140 (MQ=255)
aaTGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGc > 2:1321500/1‑136 (MQ=255)
aaTGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGc < 1:1321500/136‑1 (MQ=255)
aaTGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTCAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTaa > 1:965576/1‑140 (MQ=255)
tGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAata > 1:1102727/1‑140 (MQ=255)
cgcCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCa > 1:392417/1‑138 (MQ=255)
cgcCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCAcg < 1:1290438/140‑1 (MQ=255)
cgcCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCAcg < 1:1539301/140‑1 (MQ=255)
cgcCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCAcg > 2:1281894/1‑140 (MQ=255)
gcCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCAcgc < 1:32137/140‑1 (MQ=255)
cAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGt < 2:1099899/140‑1 (MQ=255)
cAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGt < 2:1677076/140‑1 (MQ=255)
cAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGt < 2:177752/140‑1 (MQ=255)
cAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGt < 2:384368/140‑1 (MQ=255)
aaaCATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGtt < 1:664946/140‑1 (MQ=255)
aaaCATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGtt < 1:96471/140‑1 (MQ=255)
aaCATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGttt < 2:497838/140‑1 (MQ=255)
aCATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGTTTc < 1:1687091/140‑1 (MQ=255)
aTACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGTTTCAg < 2:817803/140‑1 (MQ=255)
tACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGTTTCAGt < 1:365243/140‑1 (MQ=255)
cATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGTTTCAGTAATa < 1:1816777/140‑1 (MQ=255)
tGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCAcg > 1:1202536/1‑125 (MQ=255)
tGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCAcg < 2:1202536/125‑1 (MQ=255)
tGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGTTTCAGTAATACt < 2:785392/140‑1 (MQ=255)
tGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGTTTCAGTAATACt > 2:1489910/1‑140 (MQ=255)
ggTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATTTTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGTTTCAGTAATACTc > 2:1943026/1‑140 (MQ=255)
gTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGTTTCAGTAATACTcc > 1:1219629/1‑140 (MQ=255)
tATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGt > 2:2326533/1‑125 (MQ=255)
tATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGTTTCAGTAATACTCCt < 1:244985/140‑1 (MQ=255)
aTTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGTTTCAGTAATACTCCTg > 2:2276525/1‑140 (MQ=255)
tAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGTTTCAGTAATa > 1:2066609/1‑131 (MQ=255)
tAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGTTTCAGTAATa < 2:2066609/131‑1 (MQ=255)
aaCAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGTTTCAGTAATACTCCTGTCAGTa < 1:2030342/140‑1 (MQ=255)
aaTCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGTTTCAGTAATACTCCTGTCAGTAAgg < 2:1431637/140‑1 (MQ=255)
aaTCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGTTTCAGTAATACTCCTGTCAGTAAgg < 2:1510500/140‑1 (MQ=255)
aaTCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGTTTCAGTAATACTCCTGTCAGTAAgg > 1:1808870/1‑140 (MQ=255)
tCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGTTTCAGTAATACTCCTGTCAGTAAGGCt > 1:1392252/1‑140 (MQ=255)
tCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGTTTCAGTAATACTCCTGTCAGTAAGGCt > 1:987078/1‑140 (MQ=255)
tCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGTTTCAGTAATACTCCTGTCAGTAAGGCt > 2:1197351/1‑140 (MQ=255)
tCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGATCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGTTTCAGTAATACTCCTGTCAGTAAGGCt > 2:1796762/1‑140 (MQ=255)
|
AGGATTAATAGCCCCACACCCATTGTTTTACGCGGAATTTTATCCATCACCAGCATGGCAATAAAAATACCAAATGGCGCGCCAAACATACTCATGGTATTTAAAACAATCGAGTCTTTTAAATTAATCCCCTGGGTCATGAATATTGTTGGCAACCAGTTAATTAGTGTGTACTGCACAACGTTCATGGCAATCAGCACACAAGAGCCTAATATCACGCGTTTCAGTAATACTCCTGTCAGTAAGGCTGAATACGGCACCGCTTGT > NC_000913/1859217‑1859483
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
