Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F28 I1 R1
|
258 |
142.3 |
4824480 |
99.1% |
4781059 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,663,259 |
G→A |
A22V (GCC→GTC) |
trmJ ← |
tRNA Cm32/Um32 methyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,663,259 | 0 | G | A | 100.0%
| 476.6
/ NA
| 134 | A22V (GCC→GTC) | trmJ | tRNA Cm32/Um32 methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (67/67); total (67/67) |
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
CGTCGAGCGTATCGACGATGTGAGCATTACCAATCACATCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGGCAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATAAAACGAAGACAGATGCCGATCTCGCTG > NC_000913/2663122‑2663391
|
cgtcgAGCGTATCGACGATGTGAGCATTACCAATCACATCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACa > 1:696477/1‑140 (MQ=255)
gtcgAGCGTATCGACGATGTGAGCATTACCAATCACATCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACaa > 2:1190252/1‑140 (MQ=255)
gtcgAGCGTATCGACGATGTGAGCATTACCAATCACATCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACaa < 1:1677978/140‑1 (MQ=255)
gTATCGACGATGTGAGCATTACCAATCACATCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAAcc > 2:526470/1‑140 (MQ=255)
gTATCGACGATGTGAGCATTACCAATCACATCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAAcc < 1:366059/140‑1 (MQ=255)
gaTGTGAGCATTACCAATCACATCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGc > 2:751747/1‑140 (MQ=255)
aTGTGAGCATTACCAATCACATCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGcc > 2:1059752/1‑140 (MQ=255)
aTGTGAGCATTACCAATCACATCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGcc > 1:889017/1‑140 (MQ=255)
gtgAGCATTACCAATCACATCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCgg > 2:26517/1‑140 (MQ=255)
tgAGCATTACCAATCACATCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGgt > 1:1060182/1‑140 (MQ=255)
aGCATTACCAATCACATCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGgtgt > 1:993550/1‑140 (MQ=255)
tACCAATCACATCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGAc > 1:1113527/1‑140 (MQ=255)
aCCAATCACATCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTg > 1:854213/1‑127 (MQ=255)
aCCAATCACATCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTg < 2:854213/127‑1 (MQ=255)
aCCAATCACATCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACg > 1:1459942/1‑140 (MQ=255)
aCCAATCACATCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACg > 1:1998063/1‑140 (MQ=255)
cAATCACATCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGtc > 2:1640577/1‑140 (MQ=255)
cAATCACATCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGtc < 2:1086926/140‑1 (MQ=255)
cacaTCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTcca > 1:860422/1‑140 (MQ=255)
acaTCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGcc > 2:1978151/1‑122 (MQ=255)
acaTCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGcc < 1:1978151/122‑1 (MQ=255)
acaTCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGtc > 2:1771439/1‑135 (MQ=255)
acaTCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGtc < 1:1771439/135‑1 (MQ=255)
acaTCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTccac < 1:2028874/140‑1 (MQ=255)
acaTCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTccac < 1:759530/140‑1 (MQ=255)
aTCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGtc < 1:755109/133‑1 (MQ=255)
aTCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTccacca > 2:824890/1‑140 (MQ=255)
aTCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTccacca > 2:566123/1‑140 (MQ=255)
cGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGGTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGc > 2:753438/1‑140 (MQ=255)
gCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGca < 1:26517/140‑1 (MQ=255)
gCTGGACCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGCGTCGGGTCTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGca < 2:2129818/140‑1 (MQ=255)
cTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGcac < 2:696477/140‑1 (MQ=255)
gCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCGTTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAAt > 2:1916837/1‑140 (MQ=255)
gCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAAt > 2:921208/1‑140 (MQ=255)
ctgctgCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGa < 2:2410010/140‑1 (MQ=255)
tgctgcCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGaa > 1:629101/1‑140 (MQ=255)
ctgcCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAata > 1:2175880/1‑140 (MQ=255)
cAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATAtttt < 2:1074161/140‑1 (MQ=255)
cAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTgcagc < 2:1113527/140‑1 (MQ=255)
aaTCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTgcagca < 2:860422/140‑1 (MQ=255)
aTCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCAt < 1:1257009/140‑1 (MQ=255)
aTCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCAt < 1:526470/140‑1 (MQ=255)
aTCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCAt < 2:1464251/140‑1 (MQ=255)
cGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTg > 2:1511698/1‑140 (MQ=255)
gAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGtctttct < 2:424422/140‑1 (MQ=255)
gAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGtctttct < 2:1060182/140‑1 (MQ=255)
aGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGtctttctt < 2:1998063/140‑1 (MQ=255)
cGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCAt > 2:1966075/1‑140 (MQ=255)
ggTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCt < 2:1647804/140‑1 (MQ=255)
tttCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTaa < 1:1610700/140‑1 (MQ=255)
ttCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTaaa > 1:1245886/1‑140 (MQ=255)
tCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGtctttc > 2:1243249/1‑129 (MQ=255)
tCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAg > 1:680142/1‑140 (MQ=255)
cACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGa < 1:1640577/140‑1 (MQ=255)
aCCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGat > 1:2348259/1‑140 (MQ=255)
gTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGattatt > 2:2365479/1‑140 (MQ=255)
tGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTc > 2:45990/1‑140 (MQ=255)
aTTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACg < 1:921208/140‑1 (MQ=255)
aTTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACg < 2:2348259/140‑1 (MQ=255)
aTTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACg < 1:1966075/140‑1 (MQ=255)
aCCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCa > 1:1644328/1‑134 (MQ=255)
aCCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCa < 2:1644328/134‑1 (MQ=255)
aCCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATc > 2:2117204/1‑140 (MQ=255)
aCCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATc > 2:1816539/1‑140 (MQ=255)
aCCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATc > 2:753353/1‑140 (MQ=255)
ccAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCt < 1:753353/140‑1 (MQ=255)
cAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCtt > 1:2090792/1‑140 (MQ=255)
aGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGTCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTa > 2:656805/1‑140 (MQ=255)
ccACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATc > 2:713792/1‑140 (MQ=255)
ccACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATc > 1:95976/1‑140 (MQ=255)
ccACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATc > 2:1226764/1‑140 (MQ=255)
acaGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGTCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCAt < 1:656805/140‑1 (MQ=255)
acaGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCAt < 1:1059752/140‑1 (MQ=255)
acaGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCAt < 1:1816539/140‑1 (MQ=255)
acaGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCAt < 1:794732/140‑1 (MQ=255)
gATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATaaa < 1:1353757/140‑1 (MQ=255)
gTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCtt > 1:114613/1‑127 (MQ=255)
gTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATAAAACGaa > 1:371690/1‑140 (MQ=255)
gTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATAAAACGaa > 1:106151/1‑140 (MQ=255)
gTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCAT‑AAACGAAg > 1:641190/1‑140 (MQ=255)
aaTCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATAAAACGAAGAc < 1:1190252/140‑1 (MQ=255)
aTCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATAAAACGAAGACa < 1:1916837/140‑1 (MQ=255)
aTCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATAAAACGAAGACa > 2:657231/1‑140 (MQ=255)
aTCCCATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATAAAACGAAGACa < 2:1324874/140‑1 (MQ=255)
cATTGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATAAAACGAAGACAGATg < 1:2172433/140‑1 (MQ=255)
ttGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATAAAACGAAGACAGATGcc > 1:2121794/1‑140 (MQ=255)
ttGTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATAAAACGAAGACAGATGcc > 2:893067/1‑140 (MQ=255)
gTTTTCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCAT‑AAACGAAGACAGATGCCGAt < 2:641190/140‑1 (MQ=255)
ttttCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATAAAACGAAGACAGATGCCGAt < 2:1459942/140‑1 (MQ=255)
ttttCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATAAAACGAAGACAGATGCCGAt < 1:1287210/140‑1 (MQ=255)
ttCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATAAAACGAAGACAGATGCCGAtct > 1:829313/1‑140 (MQ=255)
ttCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATAAAACGAAGACAGATGCCGAtct < 2:629101/140‑1 (MQ=255)
ttCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATAAAACGAAGACAGATGCCGAtct < 2:2175880/140‑1 (MQ=255)
ttCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATAAAACGAAGACAGATGCCGAtct > 2:2036611/1‑140 (MQ=255)
ttCATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATAAAACGAAGACAGATGCCGAtct > 1:2404244/1‑140 (MQ=255)
cATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATAAAACGAAGACAGATGCCGATCTCg < 2:683040/140‑1 (MQ=255)
cATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATAAAACGAAGACAGATGCCGATCTCg < 2:371690/140‑1 (MQ=255)
cATGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATAAAACGAAGACAGATGCCGATCTCg < 1:566123/140‑1 (MQ=255)
aTGGCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATAAAACGAAGACAGATGCCGATCTCgc < 1:2365479/140‑1 (MQ=255)
ggCACGGACAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATAAAACGAAGACAGATGCCGATCTCgctg > 2:1325597/1‑140 (MQ=255)
|
CGTCGAGCGTATCGACGATGTGAGCATTACCAATCACATCGCTGGCCCCTGCTGCCAGGGCAATCGCCTGGGAGTCGGGTTTCACCAGTGGATTAACCAGCCACAGATTGGTTAATCCCATTGTTTTCATGGCACGGGCAACAGAACCCATATTGCCGGTGTGTGACGTCTCCACCAGCACAATTCGAATATTTTGCAGCATTGTCTTTCTTCATCTAAAGATTATTCACGCATCTTATCATAAAACGAAGACAGATGCCGATCTCGCTG > NC_000913/2663122‑2663391
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
