Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F28 I1 R1
|
258 |
142.3 |
4824480 |
99.1% |
4781059 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,997,971 |
T→C |
pseudogene (18/300 nt) |
ygeP ← |
protein YgeP |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,997,971 | 0 | T | C | 100.0%
| 508.1
/ NA
| 140 | pseudogene (18/300 nt) | ygeP | protein YgeP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (79/61); total (79/61) |
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
ATTCTTTCATAACCTTTATCTATGAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGTTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGGCTTTATCCAGATAAGCAATCAGCAGCGCAACCGACTTTAATCGGT > NC_000913/2997834‑2998107
|
aTTCTTTCATAACCTTTATCTATGAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCtc < 1:1369008/140‑1 (MQ=255)
cTTTCATAACCTTTATCTATGAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCtccag > 2:1541338/1‑140 (MQ=255)
tCATAACCTTTATCTATGAGGGGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCtccagtcc > 2:359057/1‑140 (MQ=255)
cATAACCTTTATCTATGAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCtc > 2:283947/1‑133 (MQ=255)
tAACCTTTATCTATGAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCaga > 2:789589/1‑140 (MQ=255)
aCCTTTATCTATGAGGCGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAgg > 2:599880/1‑140 (MQ=255)
ttATCTATGAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCAc < 1:140370/140‑1 (MQ=255)
tATCTATGAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCtccagtc < 2:1743380/129‑1 (MQ=255)
tATCTATGAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCAcc > 1:1029029/1‑140 (MQ=255)
tATCTATGAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCAcc > 1:753966/1‑140 (MQ=255)
tATCTATGAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCAcc > 1:568781/1‑140 (MQ=255)
tATCTATGAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCAcc > 1:1780233/1‑140 (MQ=255)
aTGAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGc < 1:1005657/140‑1 (MQ=255)
tGAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGc < 2:400422/139‑1 (MQ=255)
tGAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGc > 1:400422/1‑139 (MQ=255)
tGAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCa > 2:697467/1‑140 (MQ=255)
tGAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCa > 2:121166/1‑140 (MQ=255)
gAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCaa > 2:2274242/1‑140 (MQ=255)
gAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCaa > 1:813718/1‑140 (MQ=255)
gtggtTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACgg > 2:1727954/1‑140 (MQ=255)
gtTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAg < 1:695939/140‑1 (MQ=255)
gtTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAg < 1:697467/140‑1 (MQ=255)
gtTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAg > 1:866325/1‑140 (MQ=255)
gtTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAg > 2:1273627/1‑140 (MQ=255)
gtTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAg < 1:2274242/140‑1 (MQ=255)
gtTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAg > 1:2180391/1‑140 (MQ=255)
gtTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGAC‑AAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGa > 2:1384471/1‑140 (MQ=255)
ttCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAg > 1:242753/1‑139 (MQ=255)
ttCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAg < 2:242753/139‑1 (MQ=255)
ttCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGa < 2:866325/140‑1 (MQ=255)
ttCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGa > 1:134939/1‑140 (MQ=255)
tCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGAt > 1:2282706/1‑140 (MQ=255)
aCCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGAtgtg > 2:2010457/1‑140 (MQ=255)
tCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGttt > 2:837325/1‑140 (MQ=255)
gttgttGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTaa > 1:282507/1‑140 (MQ=255)
ttgttgAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAAt > 1:920994/1‑140 (MQ=255)
tgAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCggg < 1:1732413/140‑1 (MQ=255)
gAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAGACGCTGCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGc < 2:881320/140‑1 (MQ=255)
gAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGc < 1:611287/140‑1 (MQ=255)
gAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGc < 2:1920918/140‑1 (MQ=255)
gAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGc > 1:319443/1‑140 (MQ=255)
gagTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCAtct > 2:6580/1‑140 (MQ=255)
gagTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCAtct > 2:334209/1‑140 (MQ=255)
gagTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCAtct > 2:2200672/1‑140 (MQ=255)
tttCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCAtcttct > 1:267857/1‑140 (MQ=255)
ttCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATcttctt > 2:2239078/1‑140 (MQ=255)
cATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCT‑CAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTccc < 1:684286/140‑1 (MQ=255)
aTCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTccc < 1:1061138/140‑1 (MQ=255)
aTCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTccc < 1:789589/140‑1 (MQ=255)
aTCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTccc < 2:1780233/140‑1 (MQ=255)
tCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCa < 2:319443/140‑1 (MQ=255)
aGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGc > 1:1219591/1‑140 (MQ=255)
ttCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTc > 1:1587831/1‑140 (MQ=255)
ttCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTc > 1:1632022/1‑140 (MQ=255)
ttCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTc > 1:548900/1‑140 (MQ=255)
ttCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAATCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTc > 1:685678/1‑140 (MQ=255)
ttGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGa < 2:813718/140‑1 (MQ=255)
tGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGaa < 1:1727954/140‑1 (MQ=255)
aCTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATc < 2:548900/140‑1 (MQ=255)
tttAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCtt > 2:2301453/1‑140 (MQ=255)
ttAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGaa > 2:692804/1‑135 (MQ=255)
ttAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTc > 2:2341292/1‑140 (MQ=255)
ttAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTc > 1:931686/1‑140 (MQ=255)
aGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCa < 2:1069257/140‑1 (MQ=255)
aGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCa < 2:134939/140‑1 (MQ=255)
aGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCa < 2:753966/140‑1 (MQ=255)
aGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCa < 2:1610872/140‑1 (MQ=255)
gCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCAt < 2:1029029/140‑1 (MQ=255)
gCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCAt < 1:2341292/140‑1 (MQ=255)
gCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCAt < 1:869722/140‑1 (MQ=255)
cgcgTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACa < 1:1541338/140‑1 (MQ=255)
cgcgTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACa > 1:259187/1‑140 (MQ=255)
gcgTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACAt < 2:2170798/140‑1 (MQ=255)
agtaAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGaa > 2:1874858/1‑140 (MQ=255)
gtaAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGaaa > 2:788643/1‑140 (MQ=255)
taAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAAt < 1:788643/140‑1 (MQ=255)
taAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAAt < 1:1413254/140‑1 (MQ=255)
taAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAAt < 1:2200672/140‑1 (MQ=255)
cAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGGCt < 2:1224390/140‑1 (MQ=255)
agaCAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGGCTTTa > 1:2068685/1‑140 (MQ=255)
agaCAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGGCTTTa < 2:1632022/140‑1 (MQ=255)
gaCAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGGCTTTAt > 1:1912835/1‑140 (MQ=255)
aCAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGGCTTTATc > 1:1198459/1‑140 (MQ=255)
aaaaCAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGGCTTTATCCAg > 1:2162720/1‑140 (MQ=255)
aaaCAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATATTCCATAACATAGAAATTGGCTTTATCCAGa > 2:1096202/1‑140 (MQ=255)
agagTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGGCTTTATCCAGATAAg > 2:570185/1‑140 (MQ=255)
agTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGGCTTTATCCAGATAAGCa > 2:28504/1‑140 (MQ=255)
tctttcttCGAGAGTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGGCTTTATc > 1:51796/1‑128 (MQ=255)
gagTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGGCTTTATCCAGATAAGCAATCAGCAGCGCaa < 1:570185/140‑1 (MQ=255)
gagTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGGCTTTATCCAGATAAGCAATCAGCAGCGCaa < 2:650282/140‑1 (MQ=255)
gagTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGGCTTTATCCAGATAAGCAATCAGCAGCGCaa > 2:1833775/1‑140 (MQ=255)
gagTAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGGCTTTATCCAGATAAGCAATCAGCAGCGCaa < 2:1713518/140‑1 (MQ=255)
ttAGGTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAAGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGTCTTTATCCAGTTAAGCAATCAGCAGCGCAAcc < 2:2262934/139‑1 (MQ=255)
ggTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGGCTTTATCCAGATAAGCAATCAGCAGCGCAACCGAc > 1:752997/1‑140 (MQ=255)
gTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGGCTTTATCCAGATAAGCAATCAGCAGCGCaa > 1:1572311/1‑134 (MQ=255)
gTTTGACAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGGCTTTATCCAGATAAGCAATCAGCAGCGCaa < 2:1572311/134‑1 (MQ=255)
aCAAACGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGGCTTTATCCAGATAAGCAATCAGCAGCGCAACCGACTTTAAt > 2:484535/1‑140 (MQ=255)
aCGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGGCTTTATCCAGATAAGCAATCAGCAGCGCAACCGACTTTAATCGGt < 1:1833775/140‑1 (MQ=255)
aCGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGGCTTTATCCAGATAAGCAATCAGCAGCGCAACCGACTTTAATCGGt < 2:1410487/140‑1 (MQ=255)
aCGCTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGGCTTTATCCAGATAAGCAATCAGCAGCGCAACCGACTTTAATCGGt < 1:334209/140‑1 (MQ=255)
|
ATTCTTTCATAACCTTTATCTATGAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGTTCCAGTCCAGAGGTCACCAGTGCAACGGAAGATGTGTTTAATCGGGCATCTTCTTCCCATGCTCAGGAATCTTCCATAACATAGAAATTGGCTTTATCCAGATAAGCAATCAGCAGCGCAACCGACTTTAATCGGT > NC_000913/2997834‑2998107
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
