Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F28 I1 R1
|
258 |
142.3 |
4824480 |
99.1% |
4781059 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,708,091 |
T→C |
intergenic (‑386/+525) |
dppA ← / ← proK |
dipeptide ABC transporter periplasmic binding protein/tRNA‑Pro |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,708,091 | 0 | T | C | 100.0%
| 578.9
/ NA
| 160 | intergenic (‑386/+525) | dppA/proK | dipeptide ABC transporter periplasmic binding protein/tRNA‑Pro |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (76/84); total (76/84) |
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
TAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGA > NC_000913/3707956‑3708227
|
tAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTACGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGat > 1:1121670/1‑140 (MQ=255)
aaaaaaCTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGatat < 2:1688926/140‑1 (MQ=255)
aaaaaaCTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGatat > 2:1977533/1‑140 (MQ=255)
aaaaaaCTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGatat > 1:685384/1‑140 (MQ=255)
aaCTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTTTGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGa < 2:1831179/140‑1 (MQ=255)
aaCTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGa < 2:159434/140‑1 (MQ=255)
aaCTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGa < 2:1626413/140‑1 (MQ=255)
aaCTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGa < 1:572026/140‑1 (MQ=255)
cTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGc > 1:253272/1‑140 (MQ=255)
cTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGc > 2:2357737/1‑140 (MQ=255)
tCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGa < 1:1329766/140‑1 (MQ=255)
tCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGa < 1:391110/140‑1 (MQ=255)
tCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGa > 2:583473/1‑140 (MQ=255)
cAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGAt < 1:583473/140‑1 (MQ=255)
cTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATAcc > 2:1297832/1‑140 (MQ=255)
tATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCa > 2:2286642/1‑140 (MQ=255)
tttGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATg < 1:1796655/140‑1 (MQ=255)
cagAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTa < 1:2220356/140‑1 (MQ=255)
cagAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTa > 1:1281090/1‑140 (MQ=255)
aaaTTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACg < 2:243815/140‑1 (MQ=255)
tttGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGcac < 2:2060022/140‑1 (MQ=255)
gCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCgg > 1:1899955/1‑140 (MQ=255)
gCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCgg > 1:1186767/1‑140 (MQ=255)
gCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCgg > 1:1028588/1‑140 (MQ=255)
cTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGa < 1:1932651/140‑1 (MQ=255)
tACACCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAACAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGaa < 1:1367574/140‑1 (MQ=255)
aCTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGaaa < 2:1899955/140‑1 (MQ=255)
aCTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGaaa < 1:2286642/140‑1 (MQ=255)
aCTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGaaa < 2:979439/140‑1 (MQ=255)
cTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGaaaa > 1:2075167/1‑140 (MQ=255)
aCATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCa > 2:1213499/1‑140 (MQ=255)
aCATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCa > 1:983879/1‑140 (MQ=255)
cATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAg > 1:1406444/1‑140 (MQ=255)
gACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGgc < 2:1409/140‑1 (MQ=255)
gACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGgc < 2:2075167/140‑1 (MQ=255)
gACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGgc < 1:2357737/140‑1 (MQ=255)
gACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGgc < 1:182367/140‑1 (MQ=255)
aCCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGgc < 2:2174944/139‑1 (MQ=255)
gAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGgc < 2:1356359/135‑1 (MQ=255)
aaCAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGgccagcca > 1:1070244/1‑140 (MQ=255)
aaCAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGgc < 2:1616686/134‑1 (MQ=255)
aaCAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGgc > 1:1616686/1‑134 (MQ=255)
tCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGgccagcc < 2:492498/134‑1 (MQ=255)
tCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGt > 2:1446874/1‑140 (MQ=255)
tCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGt < 1:1297832/140‑1 (MQ=255)
tCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGt > 1:467296/1‑140 (MQ=255)
cAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGgc < 1:1342304/128‑1 (MQ=255)
cTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATGCCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACg < 2:1171955/140‑1 (MQ=255)
ttAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGgc > 2:2358002/1‑124 (MQ=255)
ttAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGc > 2:1430834/1‑140 (MQ=255)
ttAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGc < 2:18538/140‑1 (MQ=255)
ttAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGc > 2:616227/1‑140 (MQ=255)
ttAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGc > 2:1333527/1‑140 (MQ=255)
ttAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGc > 1:171572/1‑140 (MQ=255)
atatTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCaaa > 1:817920/1‑140 (MQ=255)
atTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCaaaaa < 1:2074244/140‑1 (MQ=255)
tttAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCaaaaaa < 2:467296/140‑1 (MQ=255)
tAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAg > 1:142551/1‑140 (MQ=255)
aGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGa > 1:1218314/1‑140 (MQ=255)
aGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGa > 1:319388/1‑140 (MQ=255)
aGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGa > 2:1927781/1‑140 (MQ=255)
aGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGa > 2:578074/1‑140 (MQ=255)
cATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCaaaaa > 1:895970/1‑131 (MQ=255)
cATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATACCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTaa > 2:2261532/1‑140 (MQ=255)
tttGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCaaaaa < 1:2002923/129‑1 (MQ=255)
tttGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCaaaaa > 2:2002923/1‑129 (MQ=255)
tttGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGc < 2:1517158/140‑1 (MQ=255)
ggTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCaaa < 2:2256441/140‑1 (MQ=255)
tGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAata < 2:1028588/140‑1 (MQ=255)
tGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAata < 1:340864/140‑1 (MQ=255)
ttAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATaa > 1:29899/1‑140 (MQ=255)
tAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATaaa > 1:1507817/1‑140 (MQ=255)
tAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATaaa > 1:2109056/1‑140 (MQ=255)
aaGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATaaaa < 2:1070244/140‑1 (MQ=255)
ttttATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATaaaaaaa < 1:1655690/140‑1 (MQ=255)
ttATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGa > 1:1503167/1‑140 (MQ=255)
aTGCATTTAAAGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAACACCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACa < 2:1379410/140‑1 (MQ=255)
tGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACaa > 2:1240865/1‑140 (MQ=255)
cATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATg < 1:1588199/140‑1 (MQ=255)
ttAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGtt > 1:677203/1‑140 (MQ=255)
ttAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGtt > 2:737281/1‑140 (MQ=255)
aaTGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTc < 1:1018643/140‑1 (MQ=255)
aaTGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTc < 1:2254933/140‑1 (MQ=255)
tGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTg > 1:2410630/1‑140 (MQ=255)
aaTCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACaaa < 2:1503167/140‑1 (MQ=255)
aaTCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACaaa < 2:319388/140‑1 (MQ=255)
aaTCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACaaa < 1:1980269/140‑1 (MQ=255)
aTCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAAt < 2:1281090/140‑1 (MQ=255)
tCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATc < 2:1507817/140‑1 (MQ=255)
tCTGAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATc < 2:1121670/140‑1 (MQ=255)
tCTGAGGAAAAGGCGGAAATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCGCAAATc < 2:2109056/140‑1 (MQ=255)
gAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAGAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGt > 1:655289/1‑140 (MQ=255)
gAGGAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGt > 1:2177500/1‑140 (MQ=255)
ggAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTa < 2:555934/140‑1 (MQ=255)
ggAAAAGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTa > 1:885181/1‑140 (MQ=255)
aaaaGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAAt < 2:677203/140‑1 (MQ=255)
aaaGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATg < 1:2261532/140‑1 (MQ=255)
aaaGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATg < 2:2410630/140‑1 (MQ=255)
aGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGa < 2:655289/140‑1 (MQ=255)
aGGCGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGa < 2:885181/140‑1 (MQ=255)
|
TAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACCAGAACAATCAGCTTAATATTTAGCAACATTTGGTGATTAAGTTTTATGCATTTAATGAAAAAAATCTGAGGAAAAGGTGGATATCTGAGCGATTAATACCATGAACGCTAAAACGCACAGCGGAAAATGCCAGGGCCAGCCATAAGTAACGCAAAAAAAGATTTAAGCAAATATAAAAAAAGACAATGGTTTCTGTCACAAATCCGTTAATGGA > NC_000913/3707956‑3708227
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
