Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F28 I1 R1
|
258 |
142.3 |
4824480 |
99.1% |
4781059 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,406,165 |
(T)6→5 |
intergenic (+180/‑25) |
purA → / → nsrR |
adenylosuccinate synthetase/DNA‑binding transcriptional repressor NsrR |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,406,160 | 0 | T | . | 100.0%
| 716.4
/ NA
| 166 | intergenic (+175/‑30) | purA/nsrR | adenylosuccinate synthetase/DNA‑binding transcriptional repressor NsrR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base . (89/77); total (89/77) |
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
AGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGACCAGTATTTCTGAAGTGACTGACGTCTA > NC_000913/4406026‑4406293
|
aGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTAtttttc > 1:1541821/1‑139 (MQ=255)
tgATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGa < 1:558191/140‑1 (MQ=255)
tACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGAttt > 2:1036053/1‑140 (MQ=255)
aTTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTccc > 1:271359/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCtt > 1:37146/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCtt > 2:481540/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCtt > 1:580705/1‑140 (MQ=255)
cTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCtttt > 2:34882/1‑140 (MQ=255)
gtgtCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGa > 1:2099775/1‑140 (MQ=255)
tgtCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAg > 1:1542864/1‑140 (MQ=255)
gtCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAgg < 2:510311/140‑1 (MQ=255)
tCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGt < 1:250186/140‑1 (MQ=255)
tCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGt > 1:181333/1‑140 (MQ=255)
ggTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGGTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGa > 2:2348136/1‑140 (MQ=255)
tAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGAtg > 1:1232101/1‑140 (MQ=255)
aGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGAtgtg < 1:1235845/140‑1 (MQ=255)
aGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGAtgtg < 1:818867/140‑1 (MQ=255)
gCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGc > 2:1272100/1‑140 (MQ=255)
gCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGc > 1:2214874/1‑140 (MQ=255)
cGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAAc < 2:768183/140‑1 (MQ=255)
tCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGtt > 2:1765038/1‑140 (MQ=255)
tCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGtt < 2:1232101/140‑1 (MQ=255)
gACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCa < 2:1024460/140‑1 (MQ=255)
acacAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCAc < 1:1380826/140‑1 (MQ=255)
cacaGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACt < 2:181333/140‑1 (MQ=255)
aGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACg > 2:1131332/1‑128 (MQ=255)
aGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACg < 1:1131332/128‑1 (MQ=255)
tgtTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACg < 1:2162853/126‑1 (MQ=255)
tgtTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACg > 2:2162853/1‑126 (MQ=255)
tgtTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCAc < 1:1776958/134‑1 (MQ=255)
tgtTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCAc > 2:1776958/1‑134 (MQ=255)
tgtTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTgatta > 2:1602920/1‑140 (MQ=255)
tgtTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTgatta > 2:1467606/1‑140 (MQ=255)
tgtTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTgatta > 1:829968/1‑140 (MQ=255)
tgtTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTgatta > 2:2184262/1‑140 (MQ=255)
tgtTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTgatta > 2:1802245/1‑140 (MQ=255)
tgtTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTgatta > 2:1819964/1‑140 (MQ=255)
tgtTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTgatta > 1:2120728/1‑140 (MQ=255)
ccTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTgattacggattac < 2:271359/140‑1 (MQ=255)
cTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTgattacggattacg > 1:1901665/1‑140 (MQ=255)
tCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACt > 1:544229/1‑125 (MQ=255)
tCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACt < 2:544229/125‑1 (MQ=255)
tCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGt > 2:947575/1‑140 (MQ=255)
tCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGt > 1:1435475/1‑140 (MQ=255)
tCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGt > 2:661692/1‑140 (MQ=255)
tCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGt > 2:602394/1‑140 (MQ=255)
tCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGt > 1:1761196/1‑140 (MQ=255)
tCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGt > 2:399528/1‑140 (MQ=255)
cGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTg < 2:1542864/140‑1 (MQ=255)
cTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTgcg < 2:1423904/140‑1 (MQ=255)
cTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTgcg < 2:1435475/140‑1 (MQ=255)
cTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTgcg < 2:714955/140‑1 (MQ=255)
cTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTgcg < 1:1036053/140‑1 (MQ=255)
cTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTgcg < 2:1790896/140‑1 (MQ=255)
cTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTgcg < 1:841071/140‑1 (MQ=255)
cTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTgcg < 1:763713/140‑1 (MQ=255)
cTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTgcg < 1:1447847/140‑1 (MQ=255)
cTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTgcg < 1:1811037/140‑1 (MQ=255)
cTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTgcg < 1:512678/140‑1 (MQ=255)
cTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTgcg < 1:481540/140‑1 (MQ=255)
cTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTCTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTgcg < 2:2120728/140‑1 (MQ=255)
tttCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGCGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGa > 2:2310015/1‑140 (MQ=255)
tccCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACa < 1:36490/140‑1 (MQ=255)
ccccGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACAt > 2:2173124/1‑140 (MQ=255)
gAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCg < 1:2284439/140‑1 (MQ=255)
aCTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTc < 1:2208933/140‑1 (MQ=255)
tGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCAt < 2:829968/140‑1 (MQ=255)
aaataaatTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCGCTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTg > 1:755421/1‑140 (MQ=255)
aaataaatTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTg > 2:413404/1‑140 (MQ=255)
aaataaatTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTg > 2:32918/1‑140 (MQ=255)
aaatTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAg < 1:2320235/140‑1 (MQ=255)
aatTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGa < 1:34882/140‑1 (MQ=255)
aatTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGa > 2:2009678/1‑140 (MQ=255)
gCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGc > 2:1557764/1‑140 (MQ=255)
gCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGc > 1:2307275/1‑140 (MQ=255)
cGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCg < 1:1602920/140‑1 (MQ=255)
gACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCgg < 2:1901665/140‑1 (MQ=255)
aGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGAc < 2:2283885/140‑1 (MQ=255)
aGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGAc < 1:63769/140‑1 (MQ=255)
cTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGACCa > 1:504074/1‑140 (MQ=255)
cTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGACCa > 1:1642932/1‑140 (MQ=255)
ttGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCGCTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGACCAg < 2:755421/140‑1 (MQ=255)
ttGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGACCAg < 2:1642932/140‑1 (MQ=255)
ttGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGACCAg < 1:947575/140‑1 (MQ=255)
ttGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGACCAg < 1:1557764/140‑1 (MQ=255)
ttGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGACCAg < 1:2009678/140‑1 (MQ=255)
ttGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGACCAg < 1:1765038/140‑1 (MQ=255)
tGGTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGACCAGTATTTCt > 1:1002478/1‑140 (MQ=255)
gTTTATCATCAATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGACCAGTATTTCTGa > 2:1670628/1‑140 (MQ=255)
tcatcaATATAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGACCAGTATTTCTGAAGtga < 2:549910/140‑1 (MQ=255)
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atatAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGACCAGTATTTCTGAAGTGACTGACg > 1:1834006/1‑140 (MQ=255)
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atatAAATGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGACCAGTATTTCTGAAGTGACTGACg > 1:1466626/1‑140 (MQ=255)
aaaTGTA‑TTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGACCAGTATTTCTGAAGTGACTGACGTCTa > 1:238199/1‑140 (MQ=255)
|
AGTGTGATACATTGCTGTGTCGGGTAAGCCATTACGCTATCCGACACAGTGTTAAATCCTCGCTTTTTTCCTTCCCCGAACTGAAATAAATTAGCGACACAGCTTGTGGCTGGTTTATCATCAATATAAATGTATTTTTTCCCGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGTCATTGCCAGAAGGGCGGATGACCAGTATTTCTGAAGTGACTGACGTCTA > NC_000913/4406026‑4406293
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
