Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F28 I1 R1
|
159 |
82.1 |
2830106 |
99.3% |
2810295 |
139.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,100,292 |
T→C |
D146G (GAC→GGC) |
ansB ← |
L‑asparaginase 2 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,100,292 | 0 | T | C | 100.0%
| 350.9
/ NA
| 94 | D146G (GAC→GGC) | ansB | L‑asparaginase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (47/47); total (47/47) |
TCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGTCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGTCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTC > NC_000913/3100155‑3100426
|
tCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGTCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCt < 2:903184/140‑1 (MQ=255)
cGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGTCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTg < 1:191113/140‑1 (MQ=255)
cGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGTCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTg < 1:1330722/140‑1 (MQ=255)
cGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGTCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTg > 2:192388/1‑140 (MQ=255)
gTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGTCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCa < 1:728200/140‑1 (MQ=255)
tCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGTCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCAt < 2:552639/140‑1 (MQ=255)
tGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGTCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGGTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTggac < 1:874998/140‑1 (MQ=255)
ggTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGTCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTggacg > 1:280028/1‑140 (MQ=255)
tttGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGTCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTggacggac > 2:1230113/1‑140 (MQ=255)
ggTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGTCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCa > 2:385378/1‑140 (MQ=255)
ggTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGTCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCa > 2:1206463/1‑140 (MQ=255)
cGTCACGGCCATCAAGCACGGTGTCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTgcg < 2:398953/140‑1 (MQ=255)
cGTCACGGCCATCAAGCACGGTGTCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTgcg < 2:1330732/140‑1 (MQ=255)
gTCACGGCCATCAAGCACGGTGTCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTgcgc > 2:1322324/1‑140 (MQ=255)
cACGGCCATCAAGCACGGTGTCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCg < 2:1161145/140‑1 (MQ=255)
aCGGCCATCAAGCACGGTGTCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGa < 2:480723/140‑1 (MQ=255)
ggCCATCAAGCACGGTGTCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGAcc < 2:873959/140‑1 (MQ=255)
ggCCATCAAGCACGGTGTCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGAcc < 1:524824/140‑1 (MQ=255)
ccATCAAGCACGGTGTCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCAt < 2:522985/140‑1 (MQ=255)
cGGTGTCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGt > 2:685068/1‑140 (MQ=255)
ggTGTCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGtt > 2:679927/1‑140 (MQ=255)
tgtCATTCATTACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTg > 1:1177467/1‑140 (MQ=255)
tgtCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTg > 1:853984/1‑140 (MQ=255)
tgtCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTg > 1:275938/1‑140 (MQ=255)
attcatCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGc < 2:182521/140‑1 (MQ=255)
attcatCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGc > 2:191415/1‑140 (MQ=255)
ttcatCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCa > 1:501009/1‑140 (MQ=255)
ttcatCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCa > 1:132765/1‑140 (MQ=255)
caCTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCAttt < 1:564505/138‑1 (MQ=255)
caCTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCa > 1:126868/1‑140 (MQ=255)
caCTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCa < 1:956822/140‑1 (MQ=255)
caCTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCa > 2:393080/1‑140 (MQ=255)
caCTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATAGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCAttt > 2:564505/1‑138 (MQ=255)
cTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTc < 2:1011718/137‑1 (MQ=255)
cTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTc > 1:1011718/1‑137 (MQ=255)
cTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCAcc > 1:785050/1‑140 (MQ=255)
aCCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGt > 2:1177721/1‑140 (MQ=255)
aCCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAAGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGt < 1:237361/140‑1 (MQ=255)
cACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTCCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGt > 2:1314908/1‑140 (MQ=255)
aCGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTc > 1:1180965/1‑140 (MQ=255)
gCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCgc > 2:54886/1‑139 (MQ=255)
ccACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGAATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAg > 1:501664/1‑140 (MQ=255)
cGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGaa < 2:1180965/140‑1 (MQ=255)
ggTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAg > 2:816369/1‑140 (MQ=255)
ggTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAg > 1:1088811/1‑140 (MQ=255)
ggTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAg > 1:886240/1‑140 (MQ=255)
ggCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAg < 2:275938/140‑1 (MQ=255)
ggCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAg > 1:886562/1‑140 (MQ=255)
cGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCa < 1:1173979/140‑1 (MQ=255)
gCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTttc < 2:645180/140‑1 (MQ=255)
gCTTTATAAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTttc > 1:1324918/1‑140 (MQ=255)
cTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGaa < 2:78174/127‑1 (MQ=255)
cTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGaa > 1:78174/1‑127 (MQ=255)
cTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGt > 1:1250195/1‑136 (MQ=255)
cTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGt < 2:1250195/136‑1 (MQ=255)
tATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTcc > 1:975951/1‑140 (MQ=255)
tATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTcc < 1:276478/140‑1 (MQ=255)
tCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCAt < 2:280028/140‑1 (MQ=255)
tCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCAt < 2:602261/140‑1 (MQ=255)
tCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCACATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCAt < 1:947653/140‑1 (MQ=255)
aGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCg < 1:432692/140‑1 (MQ=255)
cTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCgtg > 1:707365/1‑140 (MQ=255)
cTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCgtg > 1:1203206/1‑140 (MQ=255)
cTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCgtg > 1:1151749/1‑140 (MQ=255)
gCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTc > 2:934014/1‑140 (MQ=255)
cGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCg < 2:707365/140‑1 (MQ=255)
gTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGt < 2:1203206/140‑1 (MQ=255)
tCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTa < 1:393080/140‑1 (MQ=255)
aCTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTAcc < 1:583026/140‑1 (MQ=255)
cgcgTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTggg < 2:446058/140‑1 (MQ=255)
gcgTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGt < 2:641661/140‑1 (MQ=255)
gcgTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGt < 1:685068/140‑1 (MQ=255)
gcgTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGCTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGt > 2:924306/1‑140 (MQ=255)
cgTTATACAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTa > 1:985940/1‑140 (MQ=255)
taCAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGAc > 2:801501/1‑140 (MQ=255)
taCAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGAc > 1:755051/1‑140 (MQ=255)
cAGGTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGa < 1:679927/140‑1 (MQ=255)
gTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGc > 1:1064326/1‑140 (MQ=255)
gTTGAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGc > 1:1213471/1‑140 (MQ=255)
gAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCGTTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGt < 2:985940/140‑1 (MQ=255)
gAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGt < 2:501009/140‑1 (MQ=255)
gAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGt < 2:132765/140‑1 (MQ=255)
gAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGt < 2:773220/140‑1 (MQ=255)
gAATGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGt < 2:853984/140‑1 (MQ=255)
aaTGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATTACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTc < 1:385378/140‑1 (MQ=255)
aaTGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTc > 1:897866/1‑140 (MQ=255)
aaTGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTc < 1:1206463/140‑1 (MQ=255)
aTGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTggg > 2:1335837/1‑123 (MQ=255)
aTGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTggg < 1:1335837/123‑1 (MQ=255)
aTGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCg > 2:1354005/1‑140 (MQ=255)
aTGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCg > 1:516700/1‑140 (MQ=255)
tGGACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCgg > 2:643473/1‑140 (MQ=255)
gACCGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTc < 2:1324918/140‑1 (MQ=255)
ccGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGt < 2:473522/133‑1 (MQ=255)
ccGCCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTc < 2:1263988/134‑1 (MQ=255)
|
TCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGTCATTCATCACTACCAGCACGCCACGGTTGGCGGAGGCTTTATCAGCTGCGGTCACTACCGCGTTATACAGGTTGAATGGACCGTCTGCGCTCATAGACGTGGACGGACGCATTGCGCCGACCATCACCACCGGTTTGTCGCATTTCACCGTCAGGTCGAGGAAGTAAGCAGTTTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTC > NC_000913/3100155‑3100426
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
