Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F28 I1 R1
|
260 |
73.5 |
2514320 |
99.3% |
2496719 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,375,895 |
(G)6→7 |
coding (1027/1368 nt) |
dcuD → |
putative transporter DcuD |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,375,889 | 1 | . | G | 100.0%
| 205.7
/ NA
| 58 | R341G (AGG→GGG) | dcuD | putative transporter DcuD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base G (28/30); total (28/30) |
CGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCA‑GGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATC > NC_000913/3375754‑3376023
|
cgcgAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGTGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCA‑gggg > 2:697797/1‑140 (MQ=255)
cgcgAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCA‑gggg > 1:509707/1‑140 (MQ=255)
cgcgAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCA‑gggg > 1:442545/1‑140 (MQ=255)
cgAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCA‑gggggg < 2:442545/140‑1 (MQ=255)
aaaCAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGTGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCA‑gggggggc < 1:697797/140‑3 (MQ=255)
aaaCAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCA‑gggggggc > 1:615107/1‑138 (MQ=255)
aCAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCA‑gggggggcgg > 1:170629/1‑136 (MQ=255)
cAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCA‑gggggggcgga < 2:615107/140‑6 (MQ=255)
gATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATtctg > 1:617942/1‑140 (MQ=255)
gATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATtctg > 2:264812/1‑140 (MQ=255)
gATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATtctg > 1:1013072/1‑140 (MQ=255)
gATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATtctg > 2:43078/1‑140 (MQ=255)
gATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCA‑gggggggcgga < 2:86408/132‑6 (MQ=255)
gATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCA‑gggggggcgga > 1:86408/1‑127 (MQ=255)
tgtgCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATtctggt > 2:503780/1‑140 (MQ=255)
tgtgCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATtctggt > 2:321334/1‑140 (MQ=255)
tgtgCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATtctggt < 1:1074319/140‑1 (MQ=255)
gtgCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCA‑gggggggcgga > 1:971394/1‑124 (MQ=255)
gtgCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCA‑gggggggcgga < 2:971394/129‑6 (MQ=255)
aGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTggg < 2:648488/140‑1 (MQ=255)
aGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTggg < 2:1067934/140‑1 (MQ=255)
aGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCA‑gggggggcgga > 2:237318/1‑120 (MQ=255)
aGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCA‑gggggggcgga < 1:237318/125‑6 (MQ=255)
gACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCg < 2:27444/140‑1 (MQ=255)
gACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCg < 2:1209489/140‑1 (MQ=255)
aCGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGt < 2:4039/140‑1 (MQ=255)
cGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGtg < 1:412303/140‑1 (MQ=255)
cGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGtg < 1:1161949/140‑1 (MQ=255)
gCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGtgat < 2:346642/140‑1 (MQ=255)
gCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGtgat < 1:1142072/140‑1 (MQ=255)
gCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATg < 1:264812/140‑1 (MQ=255)
gCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATg < 2:617942/140‑1 (MQ=255)
cAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATgg > 1:590178/1‑140 (MQ=255)
cAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATgg > 2:135377/1‑140 (MQ=255)
cAGTTTACCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGtgat > 1:929355/1‑129 (MQ=255)
cAGTTTACCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGtgat < 2:929355/129‑1 (MQ=255)
gTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGgcg < 2:287138/140‑1 (MQ=255)
tttGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGgcgc > 2:297600/1‑140 (MQ=255)
tGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTg > 1:939155/1‑140 (MQ=255)
tGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTg > 2:1207459/1‑140 (MQ=255)
gTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTg < 2:1013072/140‑1 (MQ=255)
gTAACGCTGGTGGTCGCGGGGGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCa > 1:834037/1‑140 (MQ=255)
tAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCAt < 2:780915/140‑1 (MQ=255)
cTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTtgtg < 1:135377/140‑1 (MQ=255)
tggtggTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGc > 1:212327/1‑140 (MQ=255)
ggtggtCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGcc > 1:274133/1‑140 (MQ=255)
gtggtCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCa < 2:509707/140‑1 (MQ=255)
tggtCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCAGTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTtg > 2:856238/1‑134 (MQ=255)
tggtCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTtg < 1:856238/134‑1 (MQ=255)
ggtCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCa > 1:93242/1‑138 (MQ=255)
ggtCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCa < 2:93242/138‑1 (MQ=255)
gcgGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGa < 1:503780/140‑1 (MQ=255)
gTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATggg > 2:602512/1‑140 (MQ=255)
gCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATg < 2:130328/140‑1 (MQ=255)
gAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATgcg < 1:602512/140‑1 (MQ=255)
gAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATgcg > 1:222458/1‑140 (MQ=255)
aGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTGTTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATgc > 1:455141/1‑136 (MQ=255)
aGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTGTTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATgc < 2:455141/136‑1 (MQ=255)
aGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATgc > 1:606910/1‑136 (MQ=255)
aGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATgc < 2:606910/136‑1 (MQ=255)
aGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCg > 1:503681/1‑140 (MQ=255)
ggCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGt < 2:503681/140‑1 (MQ=255)
aaCGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATg < 1:43078/140‑1 (MQ=255)
aaCGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATg > 1:1056727/1‑140 (MQ=255)
cgacgaTTGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTc < 2:274133/140‑1 (MQ=255)
ttGGCACTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGc > 1:1035166/1‑140 (MQ=255)
aCTGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTc < 1:321334/140‑1 (MQ=255)
tGTCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCtt < 2:590178/140‑1 (MQ=255)
tCGATGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTAt > 1:1041324/1‑140 (MQ=255)
tGCGGTTATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCg > 1:467707/1‑140 (MQ=255)
tATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATc > 2:605282/1‑140 (MQ=255)
tATCAGGGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATc > 2:596454/1‑140 (MQ=255)
|
CGCGAAACAATGGACGATGTGCAGGCGTTTTTTGACGGCATGGGTACGCAGTTTGCCAACGTGGTAACGCTGGTGGTCGCGGGTGAAATATTTGCGAAAGGCTTAACGACGATTGGCACTGTCGATGCGGTTATCA‑GGGGGGCGGAGCATTCTGGTCTGGGCGGTATTGGCGTGATGATTATTATGGCGCTGGTCATTGCCATTTGTGCCATTGTGATGGGCTCTGGCAATGCGCCGTTTATGTCATTTGCCAGTCTTATTCCGAATATC > NC_000913/3375754‑3376023
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
