Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F28 I1 R1
|
124 |
90.1 |
3003320 |
99.2% |
2979293 |
139.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,220,971 |
G→A |
pseudogene (1371/2648 nt) |
ycgH → |
putative transporter component, N‑terminal fragment |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,220,971 | 0 | G | A | 100.0%
| 355.6
/ NA
| 99 | pseudogene (1371/2648 nt) | ycgH | putative transporter component, N‑terminal fragment |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (50/49); total (50/49) |
AATTCAGACAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAATCTCC > NC_000913/1220834‑1221102
|
aaTTCAGACAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGc < 2:950493/140‑1 (MQ=255)
ttCAGACAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTa > 2:973334/1‑140 (MQ=255)
gACAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGa < 2:354256/140‑1 (MQ=255)
gACAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGa < 2:189949/140‑1 (MQ=255)
gACAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGa < 1:503025/140‑1 (MQ=255)
aCAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGAc > 2:65955/1‑140 (MQ=255)
aCAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGAc < 1:121218/140‑1 (MQ=255)
aCAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGAc > 2:1110117/1‑140 (MQ=255)
aCAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGAc > 2:1080039/1‑140 (MQ=255)
aGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAg < 2:1433190/140‑1 (MQ=255)
tattatCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGAc > 1:1471313/1‑140 (MQ=255)
tattatCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGAc > 1:298400/1‑140 (MQ=255)
tattatCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGAc > 2:1109713/1‑140 (MQ=255)
ttatCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACtt > 1:1361462/1‑140 (MQ=255)
tatCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTa < 1:1210787/140‑1 (MQ=255)
tatCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTa < 1:773607/140‑1 (MQ=255)
tatCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTa < 2:148867/140‑1 (MQ=255)
tatCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTa < 2:634834/140‑1 (MQ=255)
aTCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTAttgtt < 2:1011560/140‑1 (MQ=255)
aTCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTAttgtt < 2:1133621/140‑1 (MQ=255)
aTCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTAttgtt > 1:739486/1‑140 (MQ=255)
aTCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTAttgtt > 1:628089/1‑140 (MQ=255)
aTCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTAttgtt < 1:948168/140‑1 (MQ=255)
tCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTAttgttg > 2:1130131/1‑140 (MQ=255)
cTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGa > 2:113866/1‑140 (MQ=255)
cTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGa > 1:1450560/1‑140 (MQ=255)
cTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGa > 1:888177/1‑140 (MQ=255)
cTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGa > 1:1425277/1‑140 (MQ=255)
ttCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAgg > 2:204987/1‑140 (MQ=255)
ttCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAgg > 2:70962/1‑140 (MQ=255)
cGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGAGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGt > 1:212511/1‑140 (MQ=255)
atgatgatgGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAAt < 1:261234/140‑1 (MQ=255)
tgatgGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACtt < 1:890144/140‑1 (MQ=255)
gatgGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTc < 2:1425277/140‑1 (MQ=255)
atgGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCg > 1:1276021/1‑140 (MQ=255)
atgGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCg > 1:1123615/1‑140 (MQ=255)
atgGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCg > 2:633375/1‑140 (MQ=255)
atgGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCg < 1:260315/140‑1 (MQ=255)
ggTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCggg < 2:1049515/140‑1 (MQ=255)
ggTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCggg < 2:747605/140‑1 (MQ=255)
ggTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCggg < 2:822899/140‑1 (MQ=255)
gTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTTGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGt > 2:25296/1‑140 (MQ=255)
gTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGt > 1:375073/1‑140 (MQ=255)
tCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGtt < 1:1080039/140‑1 (MQ=255)
tCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGtt < 1:1110117/140‑1 (MQ=255)
cAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTc < 1:1072064/140‑1 (MQ=255)
aaCATTTACCCAAGGTAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCaa < 2:1185759/140‑1 (MQ=255)
aaCATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCaa > 2:1116901/1‑140 (MQ=255)
aCATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAAc > 1:1024077/1‑140 (MQ=255)
cATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACt > 1:330511/1‑140 (MQ=255)
cATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACt < 2:1361462/140‑1 (MQ=255)
tACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCg > 1:1365866/1‑140 (MQ=255)
aCCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGt < 1:973334/140‑1 (MQ=255)
ggAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCaa < 1:1205835/127‑1 (MQ=255)
ggAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCaa > 2:1205835/1‑127 (MQ=255)
ggAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTAtgt > 2:702255/1‑140 (MQ=255)
tAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCt < 1:947866/140‑1 (MQ=255)
tAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCt < 1:70962/140‑1 (MQ=255)
aaCCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTg > 2:1252402/1‑140 (MQ=255)
tAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTggagga < 2:633850/140‑1 (MQ=255)
aaaaGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGaa < 1:200814/140‑1 (MQ=255)
tAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAgcggcg < 1:424638/140‑1 (MQ=255)
aaTTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAgcggcgc > 1:322829/1‑140 (MQ=255)
ttATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAgcggcgcgg > 1:1195469/1‑140 (MQ=255)
ttATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAgcggcgcgg < 2:298400/140‑1 (MQ=255)
tATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAgcggcgcggc < 1:691257/140‑1 (MQ=255)
tATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAgcggcgcggc < 2:398621/140‑1 (MQ=255)
tATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAgcggcgcggc < 1:478773/140‑1 (MQ=255)
tGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCa < 2:1450560/140‑1 (MQ=255)
tCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACg < 1:1109713/140‑1 (MQ=255)
tCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACg > 1:1012136/1‑140 (MQ=255)
ggTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCt > 1:1140051/1‑140 (MQ=255)
ggTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCt < 2:1225318/140‑1 (MQ=255)
gTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTa > 2:490105/1‑140 (MQ=255)
aataatGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTaaa < 2:330511/140‑1 (MQ=255)
aataatGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTaaa < 1:1116901/140‑1 (MQ=255)
tCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCg < 1:1130131/140‑1 (MQ=255)
cAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGa < 1:867054/140‑1 (MQ=255)
gCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAAc > 1:1201124/1‑140 (MQ=255)
cTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACt > 2:336795/1‑140 (MQ=255)
tAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCa < 2:1333140/140‑1 (MQ=255)
tAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCa < 2:1123615/140‑1 (MQ=255)
tAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCa < 1:633375/140‑1 (MQ=255)
tatCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATaa > 2:94041/1‑140 (MQ=255)
gCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACtgtg > 2:43934/1‑140 (MQ=255)
gCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACtgtg > 1:1348311/1‑140 (MQ=255)
gCACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACtgtg > 1:692161/1‑140 (MQ=255)
cACCGTATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGa < 2:173649/140‑1 (MQ=255)
tATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGc < 2:118285/140‑1 (MQ=255)
tATTAGGTGATGATAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGc > 1:902237/1‑140 (MQ=255)
gatgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtc > 2:523209/1‑140 (MQ=255)
gatgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtc > 1:929403/1‑140 (MQ=255)
gatgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtc > 1:183192/1‑140 (MQ=255)
tgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtctc > 2:627463/1‑140 (MQ=255)
tgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtctc < 2:640842/140‑1 (MQ=255)
tgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtctc > 2:19237/1‑140 (MQ=255)
tgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtctc > 1:963505/1‑140 (MQ=255)
tgatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAAtctc > 1:1016979/1‑140 (MQ=255)
gatAAATCAGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAATCTcc > 1:331762/1‑140 (MQ=255)
|
AATTCAGACAGTATTATCAATCTTTCGTATGATGATGGTCAAACATTTACCCAAGGAAAAACATTAACCGTAAAAGGTAATTATGTCGGTAATAATGGTCAGCTTAATATCCGCACCGTATTAGGTGATGATAAATCGGCTACGGACAGACTTATTGTTGAGGGTAATACTTCGGGTTCAACTACCGTCTATGTGAAAAATGCTGGAGGAAGCGGCGCGGCCACGCTAAACGGGATCGAACTCATAACTGTGAATGGCGATGAATCTCC > NC_000913/1220834‑1221102
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
