Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A12 F28 I1 R1
|
123 |
51.0 |
1731148 |
99.3% |
1719029 |
138.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,367,249 |
T→C |
Y108Y (TAT→TAC) |
yhcF → |
DUF1120 domain‑containing protein YhcF |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,367,249 | 0 | T | C | 100.0%
| 245.4
/ NA
| 68 | Y108Y (TAT→TAC) | yhcF | DUF1120 domain‑containing protein YhcF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (36/32); total (36/32) |
AGATTGGAACACGTAATATTAATATGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATATACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATAGCAACAACATTAGTGCCAGCAATGGTAGCCAGA > NC_000913/3367116‑3367385
|
aGATTGGAACACGTAATATTAATATGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTa > 1:532509/1‑140 (MQ=255)
aGATTGGAACACGTAATATTAATATGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTa > 2:251607/1‑140 (MQ=255)
aGATTGGAACACGTAATATTAATATGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGAATGACCACCGGAAAAGCTAGTGCGGGCCAGAGGGGTGTAAAAAACACCTTa > 2:828175/1‑140 (MQ=255)
aTTGGAACACGTAATATTAATATGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTaaa > 1:413862/1‑140 (MQ=255)
gAACACGTAATATTAATATGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGc < 2:456600/140‑1 (MQ=255)
gAACACGTAATATTAATATGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGc < 1:668397/140‑1 (MQ=255)
gAACACGTAATATTAATATGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGc < 2:218073/140‑1 (MQ=255)
aaCGCGTAATATTAATATGACTATATCTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCg < 1:828175/140‑1 (MQ=255)
aaCACGTAATATTAATATGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCg < 2:584316/140‑1 (MQ=255)
cGTAATATTAATATGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAgg < 1:251607/140‑1 (MQ=255)
gTAATATTAATATGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCg < 1:182255/135‑1 (MQ=255)
gTAATATTAATATGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCg > 2:182255/1‑135 (MQ=255)
atattaatatGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTtat < 1:839918/140‑1 (MQ=255)
atattaatatGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTtat < 2:532509/140‑1 (MQ=255)
tattaatatGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTtata < 2:214835/140‑1 (MQ=255)
tattaatatGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTtata < 2:713280/140‑1 (MQ=255)
aatatGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAg > 2:247690/1‑140 (MQ=255)
tatGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCg < 2:12547/125‑1 (MQ=255)
tatGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCg > 1:12547/1‑125 (MQ=255)
tatGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGcc > 1:668728/1‑140 (MQ=255)
aCTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGAc > 2:346583/1‑140 (MQ=255)
gCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTa > 2:186927/1‑140 (MQ=255)
gCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTa > 1:293566/1‑140 (MQ=255)
gCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTa > 2:15339/1‑140 (MQ=255)
cGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTAt > 1:260652/1‑140 (MQ=255)
cGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTAt > 1:305285/1‑140 (MQ=255)
gAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTAtt > 1:565961/1‑140 (MQ=255)
ccGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGc < 2:668728/140‑1 (MQ=255)
ccGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGat > 2:374881/1‑137 (MQ=255)
ccGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGat < 1:374881/137‑1 (MQ=255)
cTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATaaa > 1:598188/1‑140 (MQ=255)
cTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATaaa < 1:3054/140‑1 (MQ=255)
cTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATaaa < 2:113557/140‑1 (MQ=255)
cGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATaaaaa > 1:208900/1‑140 (MQ=255)
aTACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATc < 2:208900/140‑1 (MQ=255)
aaTGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGtt > 1:121563/1‑140 (MQ=255)
aTGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGTTAATAAAAATATCGGTAGTTa > 2:8878/1‑140 (MQ=255)
tGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTAt > 1:91214/1‑140 (MQ=255)
tGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTAt > 1:238968/1‑140 (MQ=255)
tGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTAt > 2:856560/1‑140 (MQ=255)
ggATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGTTAATAAAAATATCGGTAGTTATg < 1:8878/140‑1 (MQ=255)
gATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGc < 1:346583/140‑1 (MQ=255)
gATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGc < 2:238968/140‑1 (MQ=255)
gACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTaa < 2:565961/140‑1 (MQ=255)
gACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTaa < 2:666732/140‑1 (MQ=255)
ccaccGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAAtt > 2:118403/1‑140 (MQ=255)
ccaccGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAAtt > 2:865551/1‑140 (MQ=255)
ccGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGAt < 1:14478/140‑1 (MQ=255)
cGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATa > 1:412183/1‑140 (MQ=255)
cGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATa < 1:118403/140‑1 (MQ=255)
cGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATa > 2:589238/1‑140 (MQ=255)
ggAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATAg > 2:117614/1‑140 (MQ=255)
ggAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATAg > 2:658590/1‑140 (MQ=255)
ggAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATAg > 2:655229/1‑140 (MQ=255)
ggAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATAg > 1:376747/1‑140 (MQ=255)
ggAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATAg > 1:84617/1‑140 (MQ=255)
aaaGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATAGcaa < 2:91214/140‑1 (MQ=255)
tAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATAGCAacaaca < 2:121563/140‑1 (MQ=255)
aGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATAGCAACAACAt < 2:413862/140‑1 (MQ=255)
tGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATAGCAACAACATTa > 1:574056/1‑140 (MQ=255)
tGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATAGCAACAACATTa > 1:550532/1‑140 (MQ=255)
ggggTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATAGCAACAACATTAGt < 1:865551/140‑1 (MQ=255)
ggggTCAGAGTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATAGCAACAACATTAGt < 2:412183/140‑1 (MQ=255)
agTGGTGTAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATAGCAACAACATTAGTGCCAGCaa < 1:186927/140‑1 (MQ=255)
gtgtAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATAGCAACAACATTAGTGCCAGCAATGGt < 2:84617/140‑1 (MQ=255)
tgtAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATAGCAACAACATTAGTGCCAGCAATGGTa > 1:595921/1‑140 (MQ=255)
tgtAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATAGCAACAACATTAGTGCCAGCAATGGTa > 2:57615/1‑140 (MQ=255)
tAAAATACTCCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAACATATCGGTAGTTATGCCGTGTGAATTGATAGCAACAACATTAGTGCCAGCAATGGTAGc < 2:598188/140‑1 (MQ=255)
tAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATAGCAACAACATTAGTGCCAGCAATGGTAGc < 1:658590/140‑1 (MQ=255)
tAAAATACACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATAGCAACAACATTAGTGCCAGCAATGGTAGc > 2:449510/1‑140 (MQ=255)
atacACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATAGCAACAACATTAGTGCCAGCAATGGTAGCCAGa < 1:15339/140‑1 (MQ=255)
|
AGATTGGAACACGTAATATTAATATGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATATACCTTAAATGGCGGAGGTTATATTAGCCAGACAACGCGCTTATTCGGCTTAGGGAAAACAAAAGATAATAAAAATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATAGCAACAACATTAGTGCCAGCAATGGTAGCCAGA > NC_000913/3367116‑3367385
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
