Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F13 I1 R1
|
24 |
670.1 |
22273598 |
98.8% |
22006314 |
140.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,496,387 |
A→G |
D367G (GAC→GGC) |
ydcJ → |
DUF1338 domain‑containing protein YdcJ |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,496,387 | 0 | A | G | 99.2%
| 2074.6
/ 2.0
| 501 | D367G (GAC→GGC) | ydcJ | DUF1338 domain‑containing protein YdcJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/3); new base G (267/228); total (270/231) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.41e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 |
Only 100 of 506 total aligned reads displayed.
TAATCTCACTCACCAAATGCATTTACAGGAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGACGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTGGGTAATGAAACGCAGACACGCAGTCACGGTAATGCCAGTCGC > NC_000913/1496241‑1496532
|
tAATCTCACTCACCAAATGCATTTACAGGAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGa > 1:3411056/1‑150 (MQ=255)
aaTCTCACTCACCAAATGCATTTACAGGAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTAGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGAt > 2:3411058/1‑150 (MQ=255)
aTCTCACTCACCAAATGCATTTACAGGAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGAt < 2:3410782/149‑1 (MQ=255)
tcactcacCAAATGCATTTACAGGAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCca > 1:3411067/1‑149 (MQ=255)
cactcacCAAATGCATTTACAGGAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCca > 1:3411073/1‑148 (MQ=255)
acCAAATGCATTTACAGGAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCt > 2:3411082/1‑150 (MQ=255)
ccAAATGCATTTACAGGAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGAGATCCACAGCCCt > 1:3411087/1‑149 (MQ=255)
cAAATGCATTTACAGGAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCtt < 1:3410465/149‑1 (MQ=255)
aaaTGCATTTACAGGACACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATcc < 2:3410635/139‑1 (MQ=255)
aTGCATTTACAGGAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAAtt < 2:3410955/150‑1 (MQ=255)
tGCATTTACAGGAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAAtt > 1:3411099/1‑149 (MQ=255)
gCATTTACAGGAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTa > 2:3411105/1‑145 (MQ=255)
cATTTACAGGAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGaa > 1:3411109/1‑150 (MQ=255)
aTTTACAGGAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAAc < 1:3410576/150‑1 (MQ=255)
aTTTACAGGAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTGCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAAc < 2:3410614/150‑1 (MQ=255)
tttACAGGAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACg > 2:3411115/1‑150 (MQ=255)
aCAGCAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTg < 2:3410504/149‑1 (MQ=255)
aGGAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGtt > 1:3411127/1‑150 (MQ=255)
ggAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTg > 2:3411128/1‑150 (MQ=255)
aaaCCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTACTTGACCGTGGTTgg > 1:3411133/1‑149 (MQ=255)
aaaCCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTggg < 1:3410543/150‑1 (MQ=255)
aaCCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGt < 1:3410202/150‑1 (MQ=255)
ccTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAg > 1:3411141/1‑150 (MQ=255)
ttCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTg > 2:3411147/1‑150 (MQ=255)
ccGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGgc > 1:3411154/1‑150 (MQ=255)
gCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTGTGACGCCTTAGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCNATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTgg > 2:3411161/1‑147 (MQ=255)
cACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGgcgc > 1:3411163/1‑149 (MQ=255)
aCTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCa < 1:3410563/149‑1 (MQ=255)
cTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTggg > 2:3411172/1‑138 (MQ=255)
ttttCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAAcc > 1:3411173/1‑150 (MQ=255)
ttttCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAAc < 2:3410677/149‑1 (MQ=255)
tCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCAt > 2:3411182/1‑150 (MQ=255)
ccTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCAt > 1:3411185/1‑149 (MQ=255)
cTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCa > 2:3411190/1‑150 (MQ=255)
tGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAAtt < 2:3410554/118‑1 (MQ=255)
tGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCAc > 1:3411195/1‑150 (MQ=255)
gACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTg > 2:3411198/1‑124 (MQ=255)
aCAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCAc < 1:3410641/148‑1 (MQ=255)
ggTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGGTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCt < 2:3410447/108‑1 (MQ=255)
aGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGAGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGt > 2:3411204/1‑128 (MQ=255)
gTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTggg < 2:3410649/126‑1 (MQ=255)
aGTTTTTAAGGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGaa < 2:3410606/149‑1 (MQ=255)
gTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGGGgcg > 2:3411213/1‑130 (MQ=255)
tttttAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGAt > 1:3411215/1‑150 (MQ=255)
ttttAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTAGCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAANGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGAtt > 2:3411219/1‑150 (MQ=255)
aaTGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCt < 1:3410522/149‑1 (MQ=255)
aTGAGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGCCGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCtt < 2:3410707/149‑1 (MQ=255)
tGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCAGACGACTTCGGGTGACGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGAGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGCAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGc > 2:3411230/1‑150 (MQ=255)
cGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGccc > 1:3411232/1‑150 (MQ=255)
gTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCg < 1:3410695/150‑1 (MQ=255)
tCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGt > 2:3411238/1‑150 (MQ=255)
tCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGt < 1:3410667/150‑1 (MQ=255)
cAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAgc > 2:3411247/1‑150 (MQ=255)
cAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAgc > 1:3411245/1‑150 (MQ=255)
cAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAgc < 1:3410843/150‑1 (MQ=255)
aaGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAgcg > 2:3411253/1‑150 (MQ=255)
aGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAgcgc < 1:3410599/150‑1 (MQ=255)
gggTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGcgcg > 2:3411260/1‑150 (MQ=255)
gggTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGcgcg > 1:3411261/1‑150 (MQ=255)
ggTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGcgcg < 1:3410509/149‑1 (MQ=255)
ttGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCgcggcg < 2:3410899/150‑1 (MQ=255)
ttGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCgcggcg < 2:3410693/150‑1 (MQ=255)
gCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTTGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCggg < 2:3410730/149‑1 (MQ=255)
gCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCgggg < 1:3410682/150‑1 (MQ=255)
cATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCggg > 1:3411273/1‑148 (MQ=255)
cATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGa > 2:3411269/1‑150 (MQ=255)
cATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGa < 1:3410710/150‑1 (MQ=255)
aTGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGAt < 1:3410744/150‑1 (MQ=255)
aTGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGAt > 2:3411276/1‑150 (MQ=255)
gTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCtt < 1:3410867/150‑1 (MQ=255)
gTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCt < 2:3410824/149‑1 (MQ=255)
ccGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTcc < 2:3410868/149‑1 (MQ=255)
ccGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTc > 1:3411283/1‑148 (MQ=255)
ggTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGt < 1:3410333/150‑1 (MQ=255)
cTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTg > 2:3411290/1‑150 (MQ=255)
cTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTg > 1:3411291/1‑150 (MQ=255)
gCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTGGGTaa < 1:3410852/150‑1 (MQ=255)
ccTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTGGGTAAt > 1:3411300/1‑150 (MQ=255)
ttCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTGGGTAATg > 2:3411305/1‑149 (MQ=255)
cGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTGGGTAATGaaa > 1:3411307/1‑150 (MQ=255)
cGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTGGGTAATGaa < 1:3410624/149‑1 (MQ=255)
aGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTGGGTAATGAAACGCAGa < 2:3410664/150‑1 (MQ=255)
aGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTGGGTAATGAAACGCAGa < 1:3410779/150‑1 (MQ=255)
aGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTGGGTAATGAAACGCAGa < 1:3410722/150‑1 (MQ=255)
gcgcATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTGGGTAATGAAACGCAGaca < 2:3410800/150‑1 (MQ=255)
gcgcATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTGGGTAATGAAACGCAGac < 1:3410798/149‑1 (MQ=255)
gcATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTGGGTAATGAAACGCAGACACg > 1:3411316/1‑150 (MQ=255)
cATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTaa < 1:3410819/43‑1 (MQ=255)
aTCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTg > 2:3411318/1‑128 (MQ=255)
gTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTGGGTAATGAAACGCAGACACGCAGTc < 1:3410943/150‑1 (MQ=255)
gTCAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTAAATTGAACGTGGTTGAGTAGGGGCGCAACCCATCACCTATGAAGAGTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGCTCTTCCTGTCAAATCTGGGTAATGAAACGCAGACACGCAGt > 2:3411323/1‑149 (MQ=255)
cAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATg < 2:3410342/76‑1 (MQ=255)
cAGGCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTGGGTAAt > 2:3411330/1‑129 (MQ=255)
gCGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTGGGTAATGAAACGCAGACACGCAGTCACGGt < 1:3410889/150‑1 (MQ=255)
cGATTCATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTGGGTAATGAAACGCAGACACGCAGTCACGGt > 1:3411336/1‑149 (MQ=255)
cATCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTGGGTAATGAAACGCAGACACGCAGTCACGGTAATGc > 1:3411342/1‑149 (MQ=255)
aTCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTGGGTAATGAAACGCAGACACGCAGTCACGGTAATGc > 2:3411344/1‑148 (MQ=255)
aTCCTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTGGGTAATGAAACGCAGACACGCAGTCACGGTAATGCCa < 2:3410917/150‑1 (MQ=255)
cTGGAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTGGGTAATGAAACGCAGACACGCAGTCACGGTAATGCCAGTc > 1:3411350/1‑150 (MQ=255)
ggAGGCGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTGGGTAATGAAACGCAGACACGCAGTCACGGTAATGCCAGTcgc > 2:3411355/1‑150 (MQ=255)
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TAATCTCACTCACCAAATGCATTTACAGGAAACCTTCCGCACTTTTCCTGACAGTGAGTTTTTAATGCGTCAGCAAGGGTTGGCATGGTTCCGGTACCGTCTGACGCCTTCGGGTGAGGCGCATCGTCAGGCGATTCATCCTGGAGACGATCCACAGCCCTTAATTGAACGTGGTTGGGTAGTGGCGCAACCCATCACCTATGAAGATTTCTTGCCCGTTAGCGCGGCGGGGATCTTCCAGTCAAATCTGGGTAATGAAACGCAGACACGCAGTCACGGTAATGCCAGTCGC > NC_000913/1496241‑1496532
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
