Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F13 I1 R1
|
24 |
670.1 |
22273598 |
98.8% |
22006314 |
140.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,992,049 |
C→A |
intergenic (+290/‑45) |
ygeG → / → ygeH |
TPR repeat‑containing putative chaperone YgeG/putative transcriptional regulator YgeH |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,992,049 | 0 | C | A | 99.7%
| 3246.9
/ ‑5.4
| 718 | intergenic (+290/‑45) | ygeG/ygeH | TPR repeat‑containing putative chaperone YgeG/putative transcriptional regulator YgeH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base A (382/333); total (383/335) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 718 total aligned reads displayed.
ATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACA > NC_000913/2991902‑2992194
|
cTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGAtt > 2:6700859/1‑148 (MQ=255)
cTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTGCTATTGAtt > 1:6700861/1‑148 (MQ=255)
cTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTa < 1:6700210/146‑1 (MQ=255)
tttATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAg > 1:6700872/1‑150 (MQ=255)
tATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAgg > 2:6700877/1‑149 (MQ=255)
cAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATg > 2:6700889/1‑149 (MQ=255)
aaaaTTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGc > 1:6700893/1‑149 (MQ=255)
ttGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGaa < 2:6699818/150‑1 (MQ=255)
ttGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGa > 1:6700906/1‑149 (MQ=255)
tGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGaaa > 2:6700909/1‑150 (MQ=255)
gAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGaaa < 1:6700026/149‑1 (MQ=255)
aaTAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAAc > 1:6700918/1‑149 (MQ=255)
aTAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAAcc < 2:6700112/149‑1 (MQ=255)
tAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAACAAACCa > 2:6700927/1‑149 (MQ=255)
aGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAAt < 2:6700235/149‑1 (MQ=255)
aGGCTATTTCAAATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAAtt < 2:6700002/150‑1 (MQ=255)
cTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAAttttt > 1:6700938/1‑150 (MQ=255)
cTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAAttttt > 2:6700936/1‑150 (MQ=255)
tttCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAAtttttt < 2:6700302/148‑1 (MQ=255)
tttCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCa > 2:6700947/1‑150 (MQ=255)
tttCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCa < 1:6700172/150‑1 (MQ=255)
tCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCa > 1:6700951/1‑148 (MQ=255)
cAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATa < 2:6700385/149‑1 (MQ=255)
aGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACGCAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATNAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATaga < 1:6700381/150‑1 (MQ=255)
aTTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAgg > 1:6700962/1‑150 (MQ=255)
tACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGt < 1:6700528/149‑1 (MQ=255)
tACATCACTAAATTCCAAAGAGAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAACCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGt > 2:6700966/1‑149 (MQ=255)
aCATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGtt > 1:6700970/1‑149 (MQ=255)
tCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACt < 2:6700403/150‑1 (MQ=255)
tCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACt < 2:6700496/150‑1 (MQ=255)
cACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAAtttt > 2:6700983/1‑133 (MQ=255)
aCTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTaa > 1:6700984/1‑150 (MQ=255)
aaTTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATg < 1:6700328/148‑1 (MQ=255)
aaTTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATg < 2:6700456/148‑1 (MQ=255)
aaTTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGa > 1:6700995/1‑150 (MQ=255)
aaTTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGa < 1:6700256/150‑1 (MQ=255)
ttCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACt < 2:6700337/150‑1 (MQ=255)
ttCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACt < 1:6699267/150‑1 (MQ=255)
ccTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACtt < 2:6700416/149‑1 (MQ=255)
cTAAGATAAATTACTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTa < 1:6700284/149‑1 (MQ=255)
tAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATACATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAg > 2:6701010/1‑149 (MQ=255)
tAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAg > 1:6701008/1‑149 (MQ=255)
aaGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTa < 2:6700205/138‑1 (MQ=255)
aGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGa < 1:6700645/148‑1 (MQ=255)
aTAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGaaaa > 1:6701020/1‑149 (MQ=255)
aaTTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAaaataa < 2:6700181/149‑1 (MQ=255)
aTTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAaaataaat < 1:6700453/150‑1 (MQ=255)
aTTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAaaataa < 2:6700586/148‑1 (MQ=255)
ttAGTGAACACAACCATAGATATGTCATATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATagag < 2:6700280/122‑1 (MQ=255)
ttAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCTTAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATNTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAaaataaa > 2:6701028/1‑148 (MQ=255)
gTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATtctc < 2:6700540/150‑1 (MQ=255)
gTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATtct > 1:6701035/1‑149 (MQ=255)
tGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACCCATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACGAATGGACt > 2:6701038/1‑133 (MQ=255)
tGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCa < 1:6700398/150‑1 (MQ=255)
caACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAAtt < 2:6700619/140‑1 (MQ=255)
caACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCAt > 1:6701051/1‑150 (MQ=255)
aaCCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCAtt > 2:6701053/1‑150 (MQ=255)
aaCCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCAtt < 1:6700429/150‑1 (MQ=255)
aaCCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCAtt < 1:6700573/150‑1 (MQ=255)
aCCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCAttt < 1:6700611/150‑1 (MQ=255)
ccATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCAtttt < 2:6700569/150‑1 (MQ=255)
cATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTc < 1:6700506/150‑1 (MQ=255)
tAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCAttt > 2:6701068/1‑146 (MQ=255)
tAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCtt > 1:6701067/1‑150 (MQ=255)
tGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTcttt > 2:6701083/1‑94 (MQ=255)
tCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGAt > 1:6701084/1‑149 (MQ=255)
tCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGAt < 2:6700358/149‑1 (MQ=255)
aaaTGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTaa > 1:6701096/1‑150 (MQ=255)
aaaTGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTaa < 1:6700479/150‑1 (MQ=255)
aaTGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAAc < 1:6700359/150‑1 (MQ=255)
aTGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACg > 1:6701103/1‑150 (MQ=255)
tAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGTGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGc > 2:6701107/1‑148 (MQ=255)
aTTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCAc < 1:6699914/150‑1 (MQ=255)
ttCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACg > 1:6701118/1‑149 (MQ=255)
tCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAAtttttttt > 2:6701123/1‑79 (MQ=255)
ccTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACgg > 1:6701128/1‑148 (MQ=255)
cTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAAtttttttt > 2:6701141/1‑77 (MQ=255)
cTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACgg > 1:6701137/1‑147 (MQ=255)
tgaGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGAt > 2:6701150/3‑150 (MQ=255)
ttAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAaaataa > 2:6701163/1‑101 (MQ=255)
ttAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAAtt > 1:6701159/1‑150 (MQ=255)
aTGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCt > 1:6701170/1‑149 (MQ=255)
tGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTa < 2:6700796/150‑1 (MQ=255)
aTAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAg > 1:6701182/1‑150 (MQ=255)
aaTATGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGa > 2:6701189/1‑149 (MQ=255)
atatGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATgg < 2:6700683/132‑1 (MQ=255)
tatGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAAt > 2:6701197/1‑150 (MQ=255)
tGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAAt > 1:6701203/1‑148 (MQ=255)
tGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATg < 1:6700550/149‑1 (MQ=255)
tGAATAGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGa < 2:6700438/150‑1 (MQ=255)
aGCCATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTTTTTTTTTTTAACTAATGAACTTAGAAAATAAATTCTCATATCGTTTTCt > 2:6701213/1‑97 (MQ=255)
ccATAATTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGtt > 1:6701215/1‑150 (MQ=255)
aaTTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTtata > 2:6701230/1‑150 (MQ=255)
aaTTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTtata > 1:6701227/1‑150 (MQ=255)
aTTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTtata < 1:6700319/149‑1 (MQ=255)
aTTTCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTatat < 1:6700716/150‑1 (MQ=255)
tCTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTc < 1:6700120/149‑1 (MQ=255)
cTATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCca > 2:6701243/1‑150 (MQ=255)
tATTGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCca > 1:6701248/1‑149 (MQ=255)
ttGATTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTcc > 1:6701257/1‑146 (MQ=255)
|
ATCTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACA > NC_000913/2991902‑2992194
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
