Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F13 I1 R1
|
24 |
670.1 |
22273598 |
98.8% |
22006314 |
140.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,275,871 |
A→G |
Y134C (TAC→TGC) |
pdeC → |
c‑di‑GMP phosphodiesterase PdeC |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,275,871 | 0 | A | G | 99.3%
| 2871.9
/ ‑1.4
| 700 | Y134C (TAC→TGC) | pdeC | c‑di‑GMP phosphodiesterase PdeC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/3); new base G (380/313); total (384/316) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.63e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 721 total aligned reads displayed.
ATATTATTCGTGGCTATCTTTATATTAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTACCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGAGTGAAGTGATGTCTGATGACCCGACATTGCAATGGGGTGTGTATGATACGGTGACGAAAA > NC_000913/4275724‑4276017
|
tattatTCGTGGCTATCTTTATATTAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCcg > 1:10100112/1‑150 (MQ=255)
ttattCGTGGCTATCTTTATATTAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCcgc < 2:10099448/149‑1 (MQ=255)
ttattCGTGGCTATCTTTATATTAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTACcgc > 1:10100124/1‑149 (MQ=255)
tattCGTGGCTATCTTAATATTAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCcgcg < 2:10099489/149‑1 (MQ=255)
ttCGTGGCTATCTTTATATTAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATa > 2:10100133/1‑150 (MQ=255)
ttCGTGGCTATCTTTATATTAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCGGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATAATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGAt < 2:10099519/149‑1 (MQ=255)
cGTGGCTATCTTTATATTAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACg > 1:10100139/1‑150 (MQ=255)
gTGGCTATCTTTATATTAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGc < 1:10099545/150‑1 (MQ=255)
tGGCTATCTTTATATTAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGc < 1:10099133/149‑1 (MQ=255)
tGGCTATCTTTATATTAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGAGACGcc > 1:10100150/1‑150 (MQ=255)
gCTATCTTTATATTAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCtt < 1:10099331/150‑1 (MQ=255)
tATCTTTATATTAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCtttt > 1:10100163/1‑150 (MQ=255)
aTCTTTATATTAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCttttt > 2:10100168/1‑150 (MQ=255)
tCTTTATATTAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCtttttt > 1:10100175/1‑150 (MQ=255)
tataTTAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTtctc > 2:10100188/1‑149 (MQ=255)
tataTTAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTctct > 1:10100185/1‑150 (MQ=255)
atatTAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATAc < 1:10099386/136‑1 (MQ=255)
tatTAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTgg < 1:10099912/150‑1 (MQ=255)
tatTAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTgg > 1:10100199/1‑150 (MQ=255)
tatTAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTgg < 2:10099867/150‑1 (MQ=255)
atTAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGc > 2:10100206/1‑150 (MQ=255)
tAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCta > 1:10100212/1‑150 (MQ=255)
aaTGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCta < 1:10098935/149‑1 (MQ=255)
aaTGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACAGCAATACGATTGCACCGGCCGGTTATAAGCGTGAACCTAACGCTTCTATCTATTATTGCcgc > 2:10100222/1‑126 (MQ=255)
aaTTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATaaaa > 1:10100232/1‑150 (MQ=255)
aaTTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTACCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATaaa < 2:10099889/149‑1 (MQ=255)
aTTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAAt < 1:10099798/150‑1 (MQ=255)
ttGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAAt > 1:10100239/1‑149 (MQ=255)
ttGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAAt > 2:10100240/1‑149 (MQ=255)
tCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGccc > 2:10100255/1‑149 (MQ=255)
tCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGAcc > 1:10100254/1‑149 (MQ=255)
tGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCtttttt < 2:10099264/126‑1 (MQ=255)
tGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGAcc < 2:10099678/145‑1 (MQ=255)
tGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCta < 2:10099320/147‑1 (MQ=255)
tGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCt < 1:10099708/146‑1 (MQ=255)
ccGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCTCTGATAGCGCCTGTAACCGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCGAACGTTTCTAGCTATTATTGCcgcgc > 2:10100279/1‑110 (MQ=255)
ccGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATg > 1:10100272/1‑148 (MQ=255)
tGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCg < 1:10099485/150‑1 (MQ=255)
tGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCg < 2:10099619/150‑1 (MQ=255)
aTAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCggg > 1:10100288/1‑150 (MQ=255)
aCCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGc > 2:10100296/1‑144 (MQ=255)
aTTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAAt > 1:10100302/1‑149 (MQ=255)
ttttttATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCgggg > 2:10100308/1‑144 (MQ=255)
ttttttATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAAt < 2:10099653/148‑1 (MQ=255)
tATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTAtgtg < 2:10099713/149‑1 (MQ=255)
tATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTAtgtg < 1:10099610/149‑1 (MQ=255)
aTGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATATGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTgg < 2:10100025/149‑1 (MQ=255)
aTGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGc > 1:10100322/1‑150 (MQ=255)
tGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTgg > 2:10100324/1‑148 (MQ=255)
cTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATGATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCgg < 2:10099368/149‑1 (MQ=255)
cATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGt < 1:10099420/148‑1 (MQ=255)
cATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGt > 2:10100337/1‑148 (MQ=255)
aTCGCTGATAGCGTCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTa < 1:10099750/149‑1 (MQ=255)
aTCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGtt < 1:10099444/148‑1 (MQ=255)
aTCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTa < 2:10099742/149‑1 (MQ=255)
aTCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTAt < 2:10099787/150‑1 (MQ=255)
aTCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTAt > 1:10100339/1‑150 (MQ=255)
cTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAAc > 2:10100351/1‑150 (MQ=255)
tGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAAcc > 1:10100354/1‑150 (MQ=255)
gATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAAccc > 1:10100365/1‑150 (MQ=255)
aTAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCct > 2:10100367/1‑150 (MQ=255)
gcgcCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCTATACGTCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCctct < 2:10099587/149‑1 (MQ=255)
gcCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCtctt > 2:10100383/1‑150 (MQ=255)
ccTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCtcttc > 1:10100386/1‑150 (MQ=255)
tGTACACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGCACCTAACGTCCCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATaaa > 2:10100394/1‑97 (MQ=255)
tGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTatat < 2:10099758/108‑1 (MQ=255)
aaaCGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGa > 1:10100402/1‑149 (MQ=255)
aCGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTACCAACCCTCTCTTCTGGagtg < 2:10100095/150‑1 (MQ=255)
gCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACGTAACGTTTCTATCTATTATTTCcgcgg > 2:10100409/1‑63 (MQ=255)
cTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGagtgaagt < 1:10100000/150‑1 (MQ=255)
taCGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGagtgaagtga < 1:10099637/149‑1 (MQ=255)
taCGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGagtgaagtg < 1:10099274/148‑1 (MQ=255)
aCGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGAGTGAAGTGATg > 1:10100420/1‑150 (MQ=255)
cGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTAt > 2:10100425/1‑121 (MQ=255)
tGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGAGTGAAGTGATGTCtga > 1:10100433/1‑150 (MQ=255)
tGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGAGTGAAGTGATGTCtg < 1:10099578/149‑1 (MQ=255)
ggCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGAGTGAAGTGATGTCTGATGAccc > 2:10100443/1‑150 (MQ=255)
ggCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGAGTGAAGTGATGTCTGATGAccc < 2:10099638/150‑1 (MQ=255)
ggCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGAGTGAAGTGATGTCTGATGAccc > 1:10100444/1‑150 (MQ=255)
gCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGAGTGAAGTGATGTCTGATGACCCg < 1:10099722/150‑1 (MQ=255)
gATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCt > 2:10100456/1‑76 (MQ=255)
taAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGAGTGAAGTGATGTCTGATGACCCGACATTGCa < 2:10099934/150‑1 (MQ=255)
aaGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGAGTGAAGTGATGTCTGATGACCCGACATTGCaa > 1:10100461/1‑150 (MQ=255)
gTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGTCTATAAAATAACCt > 2:10100471/1‑66 (MQ=255)
gTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGAGTGAAGTGATGTCtgat < 2:10099559/131‑1 (MQ=255)
tGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGAGTGAAGTGATGTCTGATGACCCGACATTGCAATggg > 1:10100473/1‑149 (MQ=255)
cTAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGAGTGAAGTGATGTCTGATGACCCGACATTGCAATGGGgtgtg > 1:10100484/1‑149 (MQ=255)
tAACGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGAGTGAAGTGATGTCTGATGACCCGACa < 1:10099847/133‑1 (MQ=255)
cGTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGAGTGAAGTGATGTCTGATGACCCGACATTGCAATGGGGTGTGTATg > 2:10100493/1‑149 (MQ=255)
gTTTCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGAGTGAAGTGATGTCTGATGACCCGACATTGCAATGGGgtgtgtgt > 1:10100495/1‑145 (MQ=255)
tttCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCta < 2:10099157/43‑1 (MQ=255)
tttCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGAGTGAAGTGATGTCTGATGACCCGACATTGCAATGGGGTGTGTATGATa < 1:10099517/150‑1 (MQ=255)
ttCTATCTATTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATGAAATATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGt > 2:10100505/1‑81 (MQ=255)
tatctatTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTTGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGAGTGAAGTGATGTCTGATGACCCGACATTGCAATGGGGTGTGTATGATACGGt > 1:10100510/1‑150 (MQ=255)
tctatTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTAt > 2:10100522/1‑68 (MQ=255)
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ctatTATTGCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGAGTGAAGTGATGTCTGATGACCCGACATTGCAATGGGGTGTGTATGATACGGTGAc > 1:10100524/1‑150 (MQ=255)
ttattgCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGAGTGAAGTGATGTCTGATGACCCGACATTGCAATGGGGTGTGTATGATACGGCGACGaa < 2:10099829/150‑1 (MQ=255)
tattgCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGAGTGAAGTGATGTCTGATGACCCGACATTGCAATGGGGTGTGTATGATACGGTGACGaa > 1:10100535/1‑149 (MQ=255)
tattgCCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGAGTGAAGTGATGTCTGATGACCCGACATTGCAATGGGGTGTGTATGATACGGTGACGaa < 1:10099679/149‑1 (MQ=255)
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ATATTATTCGTGGCTATCTTTATATTAATGAATTGATCTATGCCCGTGATAACCATTTTTTATGCTCATCGCTGATAGCGCCTGTAAACGGCTATACGATTGCACCGGCCGATTATAAGCGTGAACCTAACGTTTCTATCTATTATTACCGCGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCGGGGAAATTATGTGGCGGTTATCAACCCTCTCTTCTGGAGTGAAGTGATGTCTGATGACCCGACATTGCAATGGGGTGTGTATGATACGGTGACGAAAA > NC_000913/4275724‑4276017
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
