Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F13 I1 R1
|
21 |
2440.9 |
80198605 |
99.5% |
79797611 |
141.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,937,482 |
T→C |
R277R (CGT→CGC) |
yebK → |
DNA‑binding transcriptional repressor YebK |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,937,482 | 0 | T | C | 98.7%
| 9394.2
/ 40.2
| 2267 | R277R (CGT→CGC) | yebK | DNA‑binding transcriptional repressor YebK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (20/10); new base C (1024/1211); total (1046/1221) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.66e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 2332 total aligned reads displayed.
GGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGT > NC_000913/1937335‑1937628
|
gAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGcttt < 1:16279906/150‑1 (MQ=255)
aaGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTg < 2:16280236/150‑1 (MQ=255)
aaGATACTGACACTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGACTCGCGcttt > 2:16281611/1‑149 (MQ=255)
aGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGa < 1:16281200/150‑1 (MQ=255)
gATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGa > 1:16281623/1‑149 (MQ=255)
gATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGAt < 1:16279991/150‑1 (MQ=255)
cTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATATCTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGa > 2:16281662/1‑145 (MQ=255)
aCATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGcttt < 2:16278024/140‑1 (MQ=255)
aCATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGt < 1:16279470/150‑1 (MQ=255)
aCATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGt > 1:16281678/1‑150 (MQ=255)
tttATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTNATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTa < 1:16278690/149‑1 (MQ=255)
tataTGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACt > 2:16281722/1‑149 (MQ=255)
atatGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACtt > 1:16281729/1‑149 (MQ=255)
tatGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTa < 2:16278935/149‑1 (MQ=255)
tGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAAtt > 1:16281767/1‑150 (MQ=255)
gCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAAtt < 2:16280585/149‑1 (MQ=255)
cccATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAAttt > 2:16281779/1‑149 (MQ=255)
ccAGGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTaa < 2:16279737/150‑1 (MQ=255)
cATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAg < 1:16279292/150‑1 (MQ=255)
aTGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGCTACTTAAtt > 1:16281809/1‑145 (MQ=255)
gTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGa < 1:16279369/149‑1 (MQ=255)
gTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGAc < 2:16279814/150‑1 (MQ=255)
gTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGAc > 2:16281834/1‑150 (MQ=255)
ttCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACg < 2:16279978/149‑1 (MQ=255)
tctcGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGa < 1:16279576/149‑1 (MQ=255)
tctcGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGAt > 1:16281860/1‑150 (MQ=255)
ctcGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGAt > 2:16281875/1‑149 (MQ=255)
gACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATc < 1:16276883/147‑1 (MQ=255)
gACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGc > 2:16281915/1‑149 (MQ=255)
gACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGc < 2:16279534/149‑1 (MQ=255)
gACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGc < 1:16279667/149‑1 (MQ=255)
gACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCt < 2:16279260/150‑1 (MQ=255)
aCTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCt > 1:16281922/1‑149 (MQ=255)
aCTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTa < 2:16280418/150‑1 (MQ=255)
ccaGCTGAACGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCNCGTTTTGATAAGCAGTTAc < 2:16279903/121‑1 (MQ=255)
acaGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAAc > 2:16281961/1‑149 (MQ=255)
aGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCTACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGNGACGATCGCTAAAAACGac < 2:16279407/150‑1 (MQ=255)
aGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGac > 1:16281966/1‑150 (MQ=255)
cGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGactgtcact > 1:16282008/1‑150 (MQ=255)
cGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGactgtcac < 2:16279122/149‑1 (MQ=255)
cGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGactgtca > 2:16282013/1‑148 (MQ=255)
aTAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGactgtcactg < 1:16278958/147‑1 (MQ=255)
aGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCt > 1:16282053/1‑149 (MQ=255)
aTGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTaa < 2:16280490/149‑1 (MQ=255)
tgtgCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATc > 2:16282064/1‑150 (MQ=255)
tgCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCtt < 1:16280339/150‑1 (MQ=255)
tgCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCt < 1:16280508/149‑1 (MQ=255)
cTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTta > 1:16282093/1‑149 (MQ=255)
gACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGa > 1:16282126/1‑149 (MQ=255)
aCAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACa < 1:16280748/150‑1 (MQ=255)
aCAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACa > 2:16282129/1‑150 (MQ=255)
aGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATc < 1:16281446/150‑1 (MQ=255)
ggATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATcc > 1:16282170/1‑150 (MQ=255)
ggATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATcc < 1:16279734/150‑1 (MQ=255)
aTTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCg > 2:16282184/1‑149 (MQ=255)
ttACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGaa < 1:16279135/149‑1 (MQ=255)
tACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAAt < 2:16280806/149‑1 (MQ=255)
aCTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAAt > 1:16282220/1‑148 (MQ=255)
aCTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATg < 2:16281418/149‑1 (MQ=255)
cTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAAt > 2:16282227/1‑147 (MQ=255)
tttGCGACGCGGTGCAAAAGTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGNTAAGCAGTTACTTAATTTa < 2:16278683/91‑1 (MQ=255)
gACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAAt > 1:16282266/1‑150 (MQ=255)
gACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAAt < 1:16280958/150‑1 (MQ=255)
aCGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAAtt > 2:16282278/1‑150 (MQ=255)
gcgGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAAttt < 2:16280681/149‑1 (MQ=255)
gcgGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTa < 2:16280144/150‑1 (MQ=255)
gcgGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTa < 2:16280329/150‑1 (MQ=255)
gcgGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGACCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTta < 2:16278497/124‑1 (MQ=255)
cgGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTAt > 1:16282311/1‑150 (MQ=255)
tGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGc > 2:16282337/1‑150 (MQ=255)
gCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGc > 1:16282343/1‑149 (MQ=255)
aaaTTCAGAGATAACTCGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAAt < 2:16279652/130‑1 (MQ=255)
aTTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATcgc > 2:16282383/1‑150 (MQ=255)
ttCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATcgc > 1:16282393/1‑149 (MQ=255)
agagATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCgcggcg < 1:16279829/150‑1 (MQ=255)
agagATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCgcggcg < 1:16281060/150‑1 (MQ=255)
agagATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGAACGCTAAAAACGa > 2:16282425/1‑90 (MQ=255)
agaTAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGtt < 1:16280587/150‑1 (MQ=255)
aTAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTAt > 1:16282444/1‑150 (MQ=255)
cTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCa > 2:16282467/1‑150 (MQ=255)
ttGACGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATAAATTTATCGc < 1:16280130/131‑1 (MQ=255)
gAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTc > 1:16282495/1‑150 (MQ=255)
aaGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATcgcg > 2:16282508/1‑135 (MQ=255)
aaGCGAGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCAt < 1:16280198/147‑1 (MQ=255)
cGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGa < 2:16280918/149‑1 (MQ=255)
cGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGAt > 1:16282535/1‑150 (MQ=255)
ggTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGAtt < 2:16280048/149‑1 (MQ=255)
aaaGAAGCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATg > 2:16282563/1‑150 (MQ=255)
aagaagCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGt < 1:16280072/150‑1 (MQ=255)
aagCGCTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTc > 1:16282589/1‑149 (MQ=255)
cgcTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAg > 2:16282605/1‑149 (MQ=255)
cTGAAGGAATCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCaa < 1:16278182/150‑1 (MQ=255)
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aaTCGCGCTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTgg > 1:16282678/1‑150 (MQ=255)
|
GGAAGATACTGACATTTATATGCCCATGGTTTCTCGACTTGCACAGCTGACCGTGATAGATGTGCTGGCGACAGGATTTACTTTGCGACGCGGTGCAAAATTCAGAGATAACTTGAAGCGGGTCAAAGAAGCGCTGAAGGAATCGCGTTTTGATAAGCAGTTACTTAATTTAAGTGACGATCGCTAAAAACGACTGTCACTGTCCTAATCTTATACGACATCCGAATGAGATTAATTTATCGCCATCGCGGCGTTATTTCATTCGGATTTCATGTTCAAGCAACACCTGGTTGT > NC_000913/1937335‑1937628
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
