Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F13 I1 R1
|
21 |
2440.9 |
80198605 |
99.5% |
79797611 |
141.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,893,438 |
T→C |
L261P (CTT→CCT) |
ygcN → |
putative oxidoreductase with FAD/NAD(P)‑binding domain |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,893,438 | 0 | T | C | 99.2%
| 10228.8
/ 30.2
| 2451 | L261P (CTT→CCT) | ygcN | putative oxidoreductase with FAD/NAD(P)‑binding domain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (8/11); new base C (1362/1070); total (1370/1081) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.52e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
Only 100 of 2476 total aligned reads displayed.
ATGACTTACCCGGCGGCGCATTTCTTTATACTAATCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCTTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGCGATGCGTTGCGCAGTTGCGTCAATACCGGAATTTCCGTGC > NC_000913/2893291‑2893584
|
tgaCTTACCCGGCGGCGCATTTCTTTATACTAATCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCGGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTAt > 2:24355170/1‑150 (MQ=255)
gaCTTACCCGGCGGCGCATTTCTTTATACTAATCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTAt > 1:24355173/1‑149 (MQ=255)
aCTTACCCGGCGGCGCATTTCTTTATACTAATCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCa < 1:24352372/150‑1 (MQ=255)
tACCCGGCGGCGCATTTCTTTATACTAATCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCaaa > 1:24355221/1‑149 (MQ=255)
cccGGCGGCGCATTTCTTTATACTAATCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCaaaaa < 1:24353979/149‑1 (MQ=255)
ccGGCGGCGCATTTCTTTATACTAATCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAaca > 2:24355239/1‑150 (MQ=255)
cggcggCGCATTTCTTTATACTAATCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAacac < 2:24352920/150‑1 (MQ=255)
cggcggCGCATTTCTTTATACTAATCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAacac < 1:24353802/150‑1 (MQ=255)
cggcggCGCATTTCTTTATACTAATCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAac < 2:24352589/148‑1 (MQ=255)
ggcgCATTTCTTTATACTAATCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGaa > 1:24355285/1‑150 (MQ=255)
gcgcATTTCTTTATACTAATCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAAt < 1:24353163/150‑1 (MQ=255)
cgcATTTCTTTATACTAATCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAAt > 2:24355299/1‑149 (MQ=255)
cATTTCTTTATACTAATCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCAc > 1:24355330/1‑150 (MQ=255)
aTTTCTTTATACTAATCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCa > 2:24355353/1‑148 (MQ=255)
tCTTTATACTAATCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTgg < 2:24353415/149‑1 (MQ=255)
tCTTTATACTAATCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTg > 1:24355387/1‑148 (MQ=255)
cTTTATACTAATCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCGAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGa > 2:24355400/1‑149 (MQ=255)
cTTTATACTAATCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGa < 1:24353292/149‑1 (MQ=255)
tataCTAATCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAg < 2:24353178/147‑1 (MQ=255)
ataCTAATCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTCTg > 1:24355450/1‑150 (MQ=255)
ataCTAATCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATg > 2:24355446/1‑150 (MQ=255)
aaTCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTgcg > 1:24355496/1‑150 (MQ=255)
aTCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTgcg < 2:24353061/149‑1 (MQ=255)
tCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCa > 2:24355512/1‑150 (MQ=255)
aacaaACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATc > 1:24355544/1‑150 (MQ=255)
caaACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTg < 1:24352033/150‑1 (MQ=255)
caaACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTg < 1:24353624/150‑1 (MQ=255)
caaACGCTCTCGTTAGGGANTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTg > 2:24355571/1‑150 (MQ=255)
aaaCGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTgg > 1:22720151/1‑150 (MQ=255)
aaCGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGt > 1:24355606/1‑150 (MQ=255)
aaCGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGt < 2:24352313/150‑1 (MQ=255)
aaCGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCAGCTgg > 2:24355612/1‑149 (MQ=255)
cGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTg < 1:24353719/149‑1 (MQ=255)
gCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTg > 1:24355653/1‑148 (MQ=255)
ctctCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGaa < 2:24353871/120‑1 (MQ=255)
ctctCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTg > 2:24355663/1‑136 (MQ=255)
ctctCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCa < 1:24353379/150‑1 (MQ=255)
ctcGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGt < 1:24352902/144‑1 (MQ=255)
gTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGGCTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAgg > 2:24355709/1‑150 (MQ=255)
gTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAgg > 1:24355711/1‑150 (MQ=255)
ttAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGGGCGCATCTGGTGCCAGAAGGt < 2:24353522/150‑1 (MQ=255)
tAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGGCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTg > 2:24355761/1‑150 (MQ=255)
tAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTg > 1:24355759/1‑150 (MQ=255)
aTTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTg > 2:24355807/1‑150 (MQ=255)
ttGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTg > 1:24355813/1‑149 (MQ=255)
tttGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCa > 2:24355853/1‑107 (MQ=255)
ttGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGcaca < 2:24351949/149‑1 (MQ=255)
tGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAg < 1:24354160/149‑1 (MQ=255)
gCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGt < 1:24352543/149‑1 (MQ=255)
gCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTa > 1:24355869/1‑150 (MQ=255)
ccGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATc > 2:24355897/1‑121 (MQ=255)
gCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGcc < 2:24353613/150‑1 (MQ=255)
ctctctTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCg > 1:24355926/1‑150 (MQ=255)
ctctTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCg > 2:24355967/1‑148 (MQ=255)
ctctTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCCAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGt > 1:24355960/1‑150 (MQ=255)
tCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGc > 2:24356014/1‑142 (MQ=255)
tCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCaa > 1:24356011/1‑150 (MQ=255)
cGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTa < 2:24352769/94‑1 (MQ=255)
cGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACg < 2:24353789/147‑1 (MQ=255)
cGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCg > 1:24356061/1‑150 (MQ=255)
cGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCg < 2:24353966/150‑1 (MQ=255)
cGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCg > 2:24356063/1‑150 (MQ=255)
cGCAAAGTCGTGCTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGcc < 2:24354362/149‑1 (MQ=255)
gCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGt < 1:24354432/138‑1 (MQ=255)
aaGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTgg > 2:24356107/1‑86 (MQ=255)
gTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCTTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACg < 1:24352755/150‑1 (MQ=255)
cGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACggc > 1:24356118/1‑150 (MQ=255)
ttCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACggctggc > 1:24356153/1‑150 (MQ=255)
ttCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACggctgg < 1:24353565/149‑1 (MQ=255)
gccGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTgg < 2:24354066/107‑1 (MQ=255)
cGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGc > 2:24356172/1‑126 (MQ=255)
cGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACggctggct < 2:24354196/148‑1 (MQ=255)
aaGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCtggt > 1:24356208/1‑150 (MQ=255)
aaGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCtgg > 2:24356215/1‑149 (MQ=255)
aGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCtggtg < 1:24354564/150‑1 (MQ=255)
gCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGAGCAATACGCCg < 2:24353692/129‑1 (MQ=255)
aGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGc > 1:24356256/1‑149 (MQ=255)
aGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGCg < 2:24353300/150‑1 (MQ=255)
gctgctGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGCg > 2:24356268/1‑149 (MQ=255)
gctgACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGCGATGc > 1:24356302/1‑150 (MQ=255)
ctgACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGCGATg < 1:24354772/148‑1 (MQ=255)
tgACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCtggtgg > 2:24356320/1‑141 (MQ=255)
cGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGCGATGCGTTgcg > 1:24356355/1‑149 (MQ=255)
gCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGCGATGCGTTGCGCa < 1:24353488/150‑1 (MQ=255)
cTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGgctggctg > 2:24356372/1‑127 (MQ=255)
tAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGCAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGCGATGCGTTGCGCAGTTg > 1:24356395/1‑150 (MQ=255)
aaaGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGCGATGCGTTGCGCAGTTg < 2:24354775/149‑1 (MQ=255)
aaaGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGCGATGCGTTGCGCAGTTg < 1:24354271/149‑1 (MQ=255)
aaGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGCGATGCGTTGCGCAGTTg > 2:24356417/1‑148 (MQ=255)
gcATCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGCGATGCGTTGCGCAGTTGCGTCaa < 2:24354524/150‑1 (MQ=255)
aTCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGCGATGCGTTGCGCAGTTGCGTCAAt > 1:24356463/1‑149 (MQ=255)
aTCCGGCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGCGATGCGTTGCGCAGTTGCGTCAATa > 2:24356458/1‑150 (MQ=255)
gCAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGCGATGCGTTGCGCAGTTGCGTCAATACCgg > 2:24356505/1‑149 (MQ=255)
cAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGCGATGCGTTGCGCAGTTGCGTCAATACCGGaa < 1:24354071/150‑1 (MQ=255)
cAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGCGATGCGTTGCGCAGTTGCGTCAATACCGGaa < 1:24353038/150‑1 (MQ=255)
cAGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGGGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGCGATg < 2:24350458/123‑1 (MQ=255)
aGTGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGCGATGCGTTGCGCAGTTGCGTCAATACCGGAAt > 1:24356526/1‑150 (MQ=255)
tGCGCCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGCGATGCGTTGCGCAGTTGCGTCAATACCGGAAttt < 1:24353901/150‑1 (MQ=255)
cgcccgccTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGCGATGCGTTGCGCAGTTGCGTCAATACCGGAATTTcc > 2:24356555/1‑150 (MQ=255)
gcCCGCCTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGCGATGCGTTGCGCAGTTGCGTCAATACCGGAATTTCCg > 1:24356566/1‑150 (MQ=255)
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ATGACTTACCCGGCGGCGCATTTCTTTATACTAATCAACAAACGCTCTCGTTAGGGATTGTTTGCCCGCTCTCTTCCCTTACGCAAAGTCGTGTTCCGGCAAGCGAGCTGCTGACTCGCTTTAAAGCGCATCCGGCAGTGCGCCCGCTTATCAAAAACACGGAATCACTGGAGTATGGTGCGCATCTGGTGCCAGAAGGTGGCTTGCACAGTATGCCGGTGCAATACGCCGGTAACGGCTGGCTGCTGGTGGGCGATGCGTTGCGCAGTTGCGTCAATACCGGAATTTCCGTGC > NC_000913/2893291‑2893584
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
