Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F13 I1 R1
|
21 |
2440.9 |
80198605 |
99.5% |
79797611 |
141.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,254,452 |
A→G |
Q45R (CAG→CGG) |
yhaK → |
bicupin‑related protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,254,452 | 0 | A | G | 99.0%
| 8480.4
/ 38.9
| 2043 | Q45R (CAG→CGG) | yhaK | bicupin‑related protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (13/8); new base G (1110/910); total (1125/918) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.61e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Only 100 of 2057 total aligned reads displayed.
AGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCAGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAGGCAATCATGTTCAGGCCAGCGCCGGAGAGGCGTTGCTGCTCTC > NC_000913/3254305‑3254599
|
agGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGaa < 2:27549520/150‑1 (MQ=255)
tCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTg < 1:27550938/150‑1 (MQ=255)
tCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTg > 2:27552066/1‑150 (MQ=255)
cAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGc > 1:27552073/1‑150 (MQ=255)
gAATTATGATTACTACCCGAACTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTgg < 1:27549959/150‑1 (MQ=255)
aaTTATGATTACTACCCGAACTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGc > 1:27552123/1‑150 (MQ=255)
aaTTATGATTACTACCCGAACTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGc > 2:27552118/1‑150 (MQ=255)
tATGATTACTACCCGAACTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCt > 2:27552157/1‑144 (MQ=255)
tGATTACTACCCGAACTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAg < 1:27551016/150‑1 (MQ=255)
gATTACTACCCGAACTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTTCTGGCCCCAgg > 1:27552182/1‑150 (MQ=255)
aTTACTACCCGAACTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCCTGTGCTTAACCGGGAAGTGCt > 2:27552200/1‑140 (MQ=255)
actacCCGAACTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCa > 1:27552223/1‑144 (MQ=255)
ctacCCGAACTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTgccg < 1:27549334/150‑1 (MQ=255)
acCCGAACTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTgccgcc > 1:27552252/1‑150 (MQ=255)
cccGAACTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTgccgc < 2:27549726/148‑1 (MQ=255)
cccGAACTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCt > 2:27552265/1‑150 (MQ=255)
ccGAACTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTNCTGGCCCCAGGTGCCGCCt < 2:27550742/149‑1 (MQ=255)
cGAACTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCttt < 1:27549508/150‑1 (MQ=255)
gAACTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGccc > 2:27552304/1‑135 (MQ=255)
gAACTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCttt < 2:27550177/149‑1 (MQ=255)
aaCTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCttt > 1:27552309/1‑148 (MQ=255)
aCTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAg < 1:27546747/150‑1 (MQ=255)
cTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGc < 1:27550703/150‑1 (MQ=255)
tGCCAGGCAGTGTGGATAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCt < 2:27550619/143‑1 (MQ=255)
tGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGcc > 2:27552340/1‑150 (MQ=255)
ccAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCt < 1:27549864/141‑1 (MQ=255)
ccAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCcgc > 1:27552360/1‑150 (MQ=255)
ccAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCcgc < 1:27550528/150‑1 (MQ=255)
ccAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCcg < 1:27551155/149‑1 (MQ=255)
cAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGcc < 2:27549041/147‑1 (MQ=255)
ggCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGaa > 2:27552396/1‑150 (MQ=255)
gCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGt < 2:27550311/130‑1 (MQ=255)
gCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAAc < 2:27549929/150‑1 (MQ=255)
gCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAAc > 1:27552403/1‑150 (MQ=255)
tgtgGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTAt < 1:27549761/150‑1 (MQ=255)
tgtgGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTAt < 1:27550256/150‑1 (MQ=255)
gtgGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATc > 1:27552443/1‑150 (MQ=255)
tgGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATcc > 2:27552449/1‑150 (MQ=255)
tgGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATcc < 1:27550102/150‑1 (MQ=255)
aCAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCaa < 1:27550759/150‑1 (MQ=255)
cAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCaaa < 2:27550056/150‑1 (MQ=255)
aaGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCaaa > 1:27552481/1‑149 (MQ=255)
aGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGa > 2:27552499/1‑150 (MQ=255)
aCTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGata < 1:27550304/150‑1 (MQ=255)
aCGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATAttt > 1:27552533/1‑150 (MQ=255)
cGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATAttt < 1:27550463/149‑1 (MQ=255)
cGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCACCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATcc > 2:27552545/1‑135 (MQ=255)
aTGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTaaa > 1:27552564/1‑150 (MQ=255)
tGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGa > 1:27552596/1‑150 (MQ=255)
gCATGCCCCGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGata < 2:27550957/137‑1 (MQ=255)
cAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCNGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGAt < 1:27549040/149‑1 (MQ=255)
cAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATAttt > 2:27552607/1‑139 (MQ=255)
gCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCtt < 1:27549648/104‑1 (MQ=255)
cccGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCtgg < 1:27550884/150‑1 (MQ=255)
cccGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCtg > 1:27552631/1‑149 (MQ=255)
ccGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCtgga < 1:27551074/150‑1 (MQ=255)
cGGTATACTTTTTCTTTTTGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCtg > 2:27552652/1‑147 (MQ=255)
gTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCtggatgg < 1:27550185/150‑1 (MQ=255)
ataCTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCtggatg > 1:27552674/1‑147 (MQ=255)
cTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGaa > 1:27552706/1‑149 (MQ=255)
cTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGaa > 2:27552704/1‑149 (MQ=255)
tCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCagag > 1:27552747/1‑150 (MQ=255)
tCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCagag > 2:27552750/1‑150 (MQ=255)
tCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCaga < 1:27551278/149‑1 (MQ=255)
tttGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGCACCTATCCCAAAGTCGATATTTTa > 2:27552791/1‑120 (MQ=255)
tttGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTAt > 1:27552787/1‑150 (MQ=255)
tGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATc < 1:27551833/149‑1 (MQ=255)
cacTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGa > 1:27552831/1‑149 (MQ=255)
actactTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGa > 2:27552833/1‑148 (MQ=255)
ctactTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAg < 1:27550354/150‑1 (MQ=255)
actTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGc > 2:27552878/1‑149 (MQ=255)
actTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGc > 1:27552878/1‑149 (MQ=255)
ctTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGc < 1:27550609/148‑1 (MQ=255)
cGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAgg > 1:27552914/1‑150 (MQ=255)
gACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAgg > 2:27552925/1‑149 (MQ=255)
aCCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCg < 2:27550464/144‑1 (MQ=255)
ccGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAGGCAAt > 1:27552951/1‑150 (MQ=255)
cGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAGGCAAt > 2:27552969/1‑149 (MQ=255)
gAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAGGCAATCa < 1:27550644/150‑1 (MQ=255)
aaaTTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAGGCAATCAt > 1:27552992/1‑150 (MQ=255)
aaaTTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAGGCAATCAt < 1:27550046/150‑1 (MQ=255)
tGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAGGCAATCATGtt > 2:27553015/1‑149 (MQ=255)
gTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAGGCAATCATGtt > 1:27553027/1‑148 (MQ=255)
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ttAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAGGCAATCATGTTCAg < 1:27550400/150‑1 (MQ=255)
ggCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAGGCAATCATGTTCAGGc > 2:27553058/1‑149 (MQ=255)
cTATGCCTCCATGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGANGCAGAGTATCGCGATAGCGAAGGCAATCATGTTCAGGCCAg > 1:27553067/1‑150 (MQ=255)
tGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAGGCAATCATGTTCAGGCCa > 2:27553098/1‑146 (MQ=255)
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ccTCCCTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAGGCAATCATGTTCAGGCCAGCGCCg > 1:27553114/1‑150 (MQ=255)
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ccTGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAGGCAATCATGTTCAGGCCAGCGCCGgaga < 1:27550836/150‑1 (MQ=255)
tGCGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAGGCAATCATGTTCAGGCCAGCGCCGGAGAgg > 2:27553178/1‑150 (MQ=255)
cGTGTGCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAGGCAATCATGTTCAGGCCAGCGCCGGAGAGGCg > 1:27553194/1‑150 (MQ=255)
tgCTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATAtt > 2:27553224/1‑68 (MQ=255)
cTTAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAGGCAATCATGTTCAGGCCAGCGCCGGAGAGGCGTtgct < 2:27551722/149‑1 (MQ=255)
ttAACCGGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAGGCAATCATGTTCAGGCCAGCGCCGGAGAGGCGTtgctgc > 1:27553232/1‑150 (MQ=255)
|
AGAGGTCAAGAATTATGATTACTACCCGAACTGCCAGGCAGTGTGGACAAGCAGACTACGGATGGTTGCAGGCCCGGTATACTTTTTCCTTTGGACACTACTTCGACCCGAAATTGTTAGGCTATGCCTCCCTGCGTGTGCTTAACCAGGAAGTGCTGGCCCCAGGTGCCGCCTTTCAGCCGCGAACCTATCCCAAAGTCGATATTTTAAATGTGATTCTGGATGGAGAAGCAGAGTATCGCGATAGCGAAGGCAATCATGTTCAGGCCAGCGCCGGAGAGGCGTTGCTGCTCTC > NC_000913/3254305‑3254599
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
